Lung segmentation in CT scans of patients with lower respiratory tract infection: influence of respiratory physiotherapy

The goal of the study was to assess the effects of a respiratory physiotherapy intervention in the tracheobronchial tree (TBT) volume and lung function in patients with lower respiratory tract infection (LRTI). In this framework, a method for TBT segmentation in Computer Tomography (CT) images of patients with LRTI was implemented, allowing to obtain volumetric data and study their correlation with the lung function (spirometry) parameterspublishe

Differential expression of cysteine desulfurases in soybean

Background: Iron-sulfur [Fe-S] clusters are prosthetic groups required to sustain fundamental life processes including electron transfer, metabolic reactions, sensing, signaling, gene regulation and stabilization of protein structures. In plants, the biogenesis of Fe-S protein is compartmentalized and adapted to specific needs of the cell. Many environmental factors affect plant development and limit productivity and geographical distribution. The impact of these limiting factors is particularly relevant for major crops, such as soybean, which has worldwide economic importance. Results: Here we analyze the transcriptional profile of the soybean cysteine desulfurases NFS1, NFS2 and ISD11 genes, involved in the biogenesis of [Fe-S] clusters, by quantitative RT-PCR. NFS1, ISD11 and NFS2 encoding two mitochondrial and one plastid located proteins, respectively, are duplicated and showed distinct transcript levels considering tissue and stress response. NFS1 and ISD11 are highly expressed in roots, whereas NFS2 showed no differential expression in tissues. Cold-treated plants showed a decrease in NFS2 and ISD11 transcript levels in roots, and an increased expression of NFS1 and ISD11 genes in leaves. Plants treated with salicylic acid exhibited increased NFS1 transcript levels in roots but lower levels in leaves. In silico analysis of promoter regions indicated the presence of different cis-elements in cysteine desulfurase genes, in good agreement with differential expression of each locus. Our data also showed that increasing of transcript levels of mitochondrial genes, NFS1/ISD11, are associated with higher activities of aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, two cytosolic Fe-S proteins. Conclusions: Our results suggest a relationship between gene expression pattern, biochemical effects, and transcription factor binding sites in promoter regions of cysteine desulfurase genes. Moreover, data show proportionality between NFS1 and ISD11 genes expression

STABLE ISOTOPES ANALYSIS ON BALEEN WHALES (SUBORDER: MYSTICETI): A REVIEW UNTIL 2017

ABSTRACTStable Isotope Analysis (SIA) has provided information on ocean productivity, and ecological aspects related to whales’ habitat use and feeding ecology, stock structure, physiology, and evolution. We reviewed published studies using SIA on whales worldwide from November 1979 to June 2017. Gaps in geographical areas and heterogeneity amongst species studied using this methodology wereassessed. We also investigated which tissue was most frequently analysed, sources of variation in stable isotope values, how this methodology has been combined with other techniques, and how it can be useful for the conservation of the taxon and marine ecosystems. A total of 63 publications were found, and it was possible to detect a general increase in the number of publications along time, as 49% of the studies were from the last 7.5 years of the period analyzed. Almost 55% of studies focused on foraging ecology and habitat use. The baleen plate was the main tissue analyzed. Studies were related to 14 species, the most common being the fi n whale, Balaenoptera physalus (N=19) and the bowhead whale, Balaena mysticetus (N=18). Telemetry and SIA methodologies combined were helpful to understand geographical variations in stable isotope values. The methodology can also be valuable under the current scenario of climate change, for example providing information on feeding plasticity and changes in niche amplitude of diff erent species. Despite uncertainties related with stable isotopes distribution in the ocean, and with its incorporation rates for whales, for example, SIA provides primordial ecological information for effi cient management and conservation of this group. RESUMOA análise de isótopos estáveis (AIE) fornece informações sobre a produtividade do oceano e aspectos ecológicos de baleias relacionados ao uso do habitat e ecologia alimentar, estrutura de estoque, fi siologia e evolução. Foram revisados estudos publicados usando a AIE em baleias em todo o mundo entre novembro de 1979 e junho de 2017. Foram avaliadas lacunas nas áreas geográfi cas eheterogeneidade entre as espécies estudadas usando essa metodologia. Também investigamos quais tecidos foram mais utilizados para análise, as fontes de variação em valores de isótopos estáveis, a combinação desta metodologia com outras técnicas e como pode ser útil para a conservação deste táxon e dos ecossistemas marinhos. Um total de 63 publicações foi encontrado e foi possível detectar aumento no número de publicações, uma vez que 49% dos estudos foram realizados nos últimos 7 anos e meio do período analisado. Quase 55% dos estudos concentraram-se na ecologia de forrageio e no uso do habitat. As cerdas bucais foram o principal tecido analisado. Os estudos investigaram14 espécies, sendo mais comuns aqueles relacionados a baleia-fi n, Balaenoptera physalus (N=19) e a baleia-da-Groenlândia, Balaena mysticetus (N=18). As metodologias de telemetria e AIE combinadas foram úteis para entender as variações geográfi cas em valores de isótopos estáveis. Ametodologia pode também ter valor no cenário de mudanças climáticas fornecendo informações sobre plasticidade alimentar e amplitude de nicho de diferentes espécies, por exemplo. Apesar das incertezas relacionadas à distribuição dos valores de isótopos estáveis no mar e às taxas deincorporação em baleias, por exemplo, a AIE fornece informações ecológicas primordiais para o manejo e conservação desse grupo.Palavras-chave: Balaenopteridae; Balaenidae; Análise de isótopos estáveis; Ecologia da conservação.

SAZONALIDADE DAS FENOFASES REPRODUTIVAS DE NECTANDRA LANCEOLATA NESS E NECTANDRA MEGAPOTAMICA (SPRENG.) MEZ (LAURACEAE)

A compreensão da dinâmica reprodutiva de espécies florestais nativas é crucial para o manejo adequado das florestas, uma vez que tanto a regeneração natural quanto a reposição antrópica são dependentes da fenologia apresentada pelos indivíduos/espécies. Tais informações se tornam ainda mais importantes para grupos com irregularidade na produção de sementes, como a família Lauraceae. Com o presente estudo, objetivou-se acompanhar aspectos do comportamento fenológico reprodutivo de duas espécies arbóreas regionais: Nectandra megapotamica e Nectandra lanceolata (Lauraceae). A pesquisa foi realizada em Joaçaba, SC, de março de 2013 a fevereiro de 2015, e foram delimitadas três áreas para o acompanhamento dos indivíduos das espécies. Foi realizada a coleta de dados com periodicidade mensal, enquanto em estádio vegetativo, e quinzenal, enquanto estádio reprodutivo. Para N. megapotamica, o início da floração variou entre as áreas, da segunda quinzena de julho à primeira quinzena de setembro. O início da frutificação se estendeu da primeira quinzena de setembro à primeira quinzena de novembro. Por meio da média angular (µ), verificou-se que a data média do período de botão floral foi 04/09 no ciclo 2013/2014 e 16/07 no ciclo 2014/2015, da antese foi 16/09 (2013/2014) e 14/08 (2014/2015) e da frutificação foi 30/10 (2013/2014) e 10/10 (2014/2015). O amadurecimento dos frutos ocorreu, em média, de 90 a 152 dias após a antese (DAA). Para N. lanceolata, o início da floração variou da primeira quinzena de setembro à primeira quinzena de novembro. O início da frutificação ficou entre a primeira quinzena de novembro e a primeira quinzena de janeiro. A média angular (µ) demonstrou que a data média do período de botão floral foi 23/10 (2013/2014) e 05/10 (2014/2015), da antese foi 07/11 (2013/2014) e 28/10 (2014/2015) e da frutificação foi 10/12 (2013/2014) e 16/11 (2014/2015). O amadurecimento dos frutos ocorreu, em média, de 44 a 86 DAA. Sugere-se que a diferença entre as fases reprodutivas nos dois ciclos esteja relacionada aos fatores ambientais, mas é necessário o acompanhamento por um período maior de tempo para confirmação dessa hipótese, assim como a visualização de eventos supra-anuais e a identificação de eventos gatilho da reprodução.Palavras-chave: Fatores climáticos. Canela preta. Canela amarela. Disponibilidade de sementes. Produção Vegetal

Simultaneous removal of o-and p-nitrophenol from contaminated water by wet peroxide oxidation using carbon-coated magnetic ferrite as catalyst

Groundwater is the most common source of drinking water worldwide and is currently facing contamination problems with the discharge of pollutants into aquatic systems through different means, namely through municipal, industrial and agricultural activities. Contaminants, such as herbicides, pharmaceuticals, phenolic compounds and personal care products are not removed by conventional treatments from wastewater treatment plants, leading to their accumulation in the environment. In this regard, o-nitrophenol (o-NP) and p-nitrophenol (p-NP), commonly used as raw materials in chemical and pharmaceutical engineering, represent a severe risk to humans and aquatic life, leading to the necessity to properly treat wastewaters containing these contaminants before discharge into the aquatic environment. Catalytic wet peroxide oxidation (CWPO) showed promising results for removing nitrophenols from wastewater in previous works. In this technology, H2O2 is used as an oxidant, and its interaction with a suitable catalyst leads to the formation of hydroxyl radicals under determined conditions already established in literature (pH and temperature have a strong influence) [1]. Typical catalysts employed have a transition metal in its structure. Carbon-based catalysts also have activity in this technology, mostly ascribed to the electronic properties of the carbonaceous surface. Furthermore, carbon-coated metal oxide materials (hybrid) have also demonstrated potential applications in CWPO. Those structures combine carbon and metal activities with the advantage of protecting the metal core from leaching, increasing the efficiency and stability of the catalysts.Adriano S. Silva thanks his doctoral Grant with reference SFRH/BD/151346/2021 financed by the Portuguese Foundation for Science and Technology (FCT), with funds from NORTE2020, under MIT Portugal Program. This work was financially supported by UIDB/00690/2020 (CIMO), LA/P/0045/2020 (ALiCE), UIDB/50020/2020, UI-DP/50020/2020 (LSRE-LCM) and the project RTChip4Theranostics, with the reference NORTE-01-0145-FEDER-029394. Fernanda F. Roman acknowledges the national funding by FCT through the individual research grant SFRH/BD/143224/2019info:eu-repo/semantics/publishedVersio