Mechanism of robust circadian oscillation of KaiC phosphorylation in vitro

By incubating the mixture of three cyanobacterial proteins, KaiA, KaiB, and KaiC, with ATP in vitro, Kondo and his colleagues reconstituted the robust circadian rhythm of the phosphorylation level of KaiC (Science, 308; 414-415 (2005)). This finding indicates that protein-protein interactions and the associated hydrolysis of ATP suffice to generate the circadian rhythm. Several theoretical models have been proposed to explain the rhythm generated in this "protein-only" system, but the clear criterion to discern different possible mechanisms was not known. In this paper, we discuss a model based on the two basic assumptions: The assumption of the allosteric transition of a KaiC hexamer and the assumption of the monomer exchange between KaiC hexamers. The model shows a stable rhythmic oscillation of the phosphorylation level of KaiC, which is robust against changes in concentration of Kai proteins. We show that this robustness gives a clue to distinguish different possible mechanisms. We also discuss the robustness of oscillation against the change in the system size. Behaviors of the system with the cellular or subcellular size should shed light on the role of the protein-protein interactions in in vivo circadian oscillation

Ressources naturelles, innovation et développement économique : vers une nouvelle approche

Les ressources naturelles ont été souvent analysées dans la littérature économique comme étant non compatibles avec le développement économique (Auty, 2001 ; Gylfason, 2001 ; Sacks & Warner, 1995). L'objet de ce papier est de revenir sur l'analyse du lien qui caractérise les ressources naturelles et le développement économique. Pour ce faire, nous mobilisons une nouvelle approche basée sur les théories évolutionnistes et institutionnelle qui porte la focale sur l'importance de la dynamique d'apprentissage et de création de nouvelles connaissances notamment dans les économies riches en ressources naturelles. Les résultats obtenus dans notre étude sur près de 100 pays montrent que certaines des économies les plus avancés et les plus riches au monde sont des économies basées sur les ressources naturelles. Par conséquent, la malédiction serait davantage dans l'apprentissage et la construction de compétences que dans les ressources

Le Système National d’Innovation en Algérie : entre inertie institutionnelle et sous-apprentissage

International audienc

Stabilité du rythme circadien des cyanobactéries : <br />Investigation d'un couplage entre oscillateurs

The circadian clock is a self-sustained biological clock that can be found in many organisms such as mammals, insects, plants, and even cyanobacteria. This rhythm allows living organisms to coordinate their metabolic and behavioural activities with the Earth's daily rotation. The free-running period of this clock is close to 24h h.The cyanobacteria Synechococcus elongatus sp. PCC7942 is the simplest organism that has this circadian clock. And in spite of cellular division (up to 3 divisions per 24 h), the oscillations persist among a population of bacteria. Moreover, single-cell experiments showed that the oscillations were persisting with a correlation time of several months. We thus raised the question of the origin of such a robust oscillator. Indeed, the cyanobacteria are submitted to various sources of noise, and in spite of these fluctuations, the oscillations remain robust. We therefore investigate the potential coupling between oscillators, which could reinforce the stability of oscillations. By using strains carrying a luciferase reporter, we access to the circadian clock of cyanobacteria. We also used a theoretical model of week interaction between oscillators, this model taking into account the phase diffusion of oscillations. By confronting experimental measures with numerical simulations, we managed to estimate an upper limit to the potential coupling strength between oscillators. By comparing the phase diffusion constant with the coupling strength, we showed that the robustness of the circadian clock of cyanobacteria is a built-in property.Chez la majorité des organismes vivants, depuis certaines bactéries, jusqu'aux mammifères, de nombreux processus biologiques sont rythmés, comme par exemple l'alternance veille sommeil, ou encore le cycle d'hibernation. Le contrôle de ces rythmes biologiques est effectué grâce à des horloges biologiques, qui sont dans certains cas des oscillateurs auto-entretenus programmés génétiquement. Les oscillateurs biologiques dont la période est de proche de 24h sont dits circadiens. La cyanobactérie Synechoccocus elongatus sp. PCC7942 est l'un des plus simples organismes possédant cette horloge circadienne. Malgré la division cellulaire (jusqu'à 3 divisions par cycle), l'oscillation circadienne persiste au sein d'une population. De plus, des mesures faites sur cellules individuelles montrent la persistance de l'oscillateur circadien avec un temps de corrélation de plusieurs mois. Nous nous intéressons ainsi à l'origine de la robustesse de l'oscillateur : comment conserver une oscillation aussi stable malgré les sources de bruits (fluctuations internes et environnementales) auxquelles est soumis le réseau génétique ? Une telle stabilité pourrait être intrinsèque à l'oscillateur, ou alors être due à une interaction entre oscillateurs. Notre étude s'intéresse à la 2ème hypothèse ; ainsi, nous avons cherché l'existence potentielle d'un couplage entre 2 populations d'oscillateurs circadiens. Pour accéder à l'oscillation de l'horloge circadienne, nous avons utilisé une souche sauvage dans laquelle a été introduit le gène rapporteur de la luciférase. La souche mutée ainsi obtenue va présenter une luminescence oscillante, traduisant l'expression de la luciférase sous le contrôle du promoteur correspondant. Les souches mutées et non mutées ont une activité génétique régulée par l'horloge circadienne. L'interaction est étudiée en réalisant des mélanges de deux populations -souche mutante +souche sauvage- de cyanobactéries ayant initialement des phases d'oscillation différentes, avec un rapport de concentration 1:20. L'évolution temporelle de la bioluminescence donne ainsi accès à l'oscillation circadienne de la population minoritaire. Les éventuels effets du couplage sont analysés en étudiant la phase d'oscillation de la population minoritaire. Notre étude a montré qu'après une quarantaine de jours d'interaction potentielle, la phase d'oscillation des minoritaires n'est pas affectée de façon significative par la présence d'oscillateurs ayant une autre phase initiale. Au vu de ces résultats, nous avons établi un modèle théorique de couplage afin de majorer l'éventuel couplage entre oscillateurs cyanobactériens. Notre modèle est principalement décrit par le modèle de Kuramoto, qui donne une description pertinente de nombreux oscillateurs biologiques. Des simulations numériques ont montré qu'il était possible de faire des hypothèses simplificatrices concernant la forme des distributions de phase au sein de chacune des populations en interaction. Ainsi, nous avons établi une relation simple entre le changement de phase, et la constante de couplage. En tenant compte des incertitudes sur la phase calculée expérimentalement, nous estimons une borne supérieure de la constante de couplage entre oscillateurs cyanobactériens

Determinants of innovation activities in the Algerian manufacturing firms'

Forthcomin

Analyse des pratiques professionnelles concernant la prescription des anti-inflammatoires non stéroïdiens chez les patients âgés de plus de 65 ans dans deux cabinets de médecine générale

BORDEAUX2-BU Santé (330632101) / SudocSudocFranceF

Impact de la politique de mise à niveau sur l’innovation : le cas des entreprises industrielles algériennes

Cet article se propose de vérifier l’effet de la politique publique de mise à niveau sur l’engagement des entreprises dans l’innovation. L’étude empirique, menée sur un échantillon d’entreprises industrielles algériennes, a permis de mettre en évidence un lien positif et significatif entre l’application de la politique de mise à niveau et l’innovation de produit dans les entreprises ayant participé à ce programme, par rapport à celles qui ne l’ont pas appliqué. En outre, l’amélioration des compétences des ressources humaines, l’utilisation des NTIC et le respect des critères de performance expliquent de manière significative les différences d’engagement dans l’activité d’innovation. Quant aux déterminants traditionnels, dépenses de R&D et taille de l’entreprise, ils ne constituent pas des facteurs influençant significativement l’innovation.Classification JEL : O32, D22, C34.This article aims to evaluate the effect of public upgrading policies on firms’ innovation activities. The empirical study carried out on a sample of Algerian manufacturing firms reveals that firms that have participated in the upgrading program are more likely to engage in product innovation compared to those that have not applied the policy. Furthermore, the improvement of human resources skills, the use of ICT, and compliance with performance criteria largely explain the differences in firms’ engagement in product innovation. The traditional factors of R&D expenditure and firm size do not seem to be significant predictors of innovation activity.JEL classification: O32, D22, C34

Impact de la politique de mise à niveau sur l’innovation : le cas des entreprises industrielles algériennes

International audienceCet article se propose de vérifier l’effet de la politique publique de mise à niveau sur l’engagement des entreprises dans l’innovation. L’étude empirique, menée sur un échantillon d’entreprises industrielles algériennes, a permis de mettre en évidence un lien positif et significatif entre l’application de la politique de mise à niveau et l’innovation de produit dans les entreprises ayant participé à ce programme, par rapport à celles qui ne l’ont pas appliqué. En outre, l’amélioration des compétences des ressources humaines, l’utilisation des NTIC et le respect des critères de performance expliquent de manière significative les différences d’engagement dans l’activité d’innovation. Quant aux déterminants traditionnels, dépenses de R&D et taille de l’entreprise, ils ne constituent pas des facteurs influençant significativement l’innovation