39 research outputs found

    五轴增减材混合加工中心集成开发技术研究

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    以实现复杂零部件快速增材和高精度减材的复合加工为目的,开发了五轴联动增减材混合加工中心。在此基础上阐述机床增材与减材的设计开发过程及增减材集成控制原理,分析机床整体精度的控制方法,进行了相关增减材试验。采用航空发动机叶轮和五轴机床验收标准中的圆锥台试件做减材试切加工,针对叶轮叶片及S试件进行增材加工的工艺算法优化和对应的增材试验,初步得到了较符合预期的加工效果

    Clinical application of CD11b determination by flow cytometry before and after PTCA and CA

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    目的探讨冠心病(CHD)患者经皮冠状动脉腔内成形术(PTCA)、冠状动脉造影(CA)手术前及术后中性粒细胞(PMN)和单核细胞CD11b表达变化及临床意义。方法选择66例CHD患者,其中41例行PTCA手术、25例行CA手术,23例健康体检者为研究对象。采用流式细胞仪检测健康体检者及CHD患者PTCA和CA手术前3d、手术当天、术后30min、术后1d、术后3d外周血PMN和单核细胞表面CD11b的表达。结果CHD患者外周血PMN和单核细胞CD11b平均荧光强度(MFI)较正常对照组明显升高,差异具有显著性(P0.05)。结论PMN和单核细胞表面CD11b含量评价选择平均荧光强度比选择百分率更能反映CD11b的变化。CHD患者PTCA术后确有炎症反应发生,CD11b表达可作为PTCA后炎症反应发生有临床应用价值的指标。Objective: To investigate changes in the expression of CD11b on neutrophils and monocytes before and after PTCA and CA in patients with coronary heart disease (CHD).Methods:Forty-one patient sunderwent percutaneous coronary angioplasty (PTCA). Twenty-five patients underwent coronary angiographic (CA). Twenty-three people were healthy as control. Peripheral venous blood samples were obtained at intraday, 30min, 24h and 72h before and after PTCA and CA. Flow-cytometric methods were used to measure CD11b on neutrophils and monocytes. Rsults: The levels of CD11b on neutrophils and monocytes were significantly higher in UA patients with CHD compared to controls (P0.05). Conclusion: The mean intensity of fluorescence is better than percentage to evaluate the content of CD11b on neutrophils and monocyte. PTCA triggers leukocytes activation in circulation. CD11b can reflect the acute inflammatory activity aridses which arises after PTCA

    计算机辅助测量联合3D打印技术在Taylor空间支架治疗小腿畸形中的应用

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    目的探讨运用计算机辅助测量联合3D打印技术在Taylor空间支架治疗小腿畸形中的可行性及临床效果。方法回顾性分析2016年5月至2018年10月在福建中医药大学附属厦门第三医院运用Taylor空间支架治疗小腿畸形的6例病人的临床资料。通过CT薄层扫描,3D打印技术制作骨模型和截骨导板。根据Taylor空间支架配套软件所需参数应用Mimics软件进行测量,按照配套软件的规划在3D打印模型验证矫形结果。术后参照Johner-Wruhs评定标准进行患肢功能评价。结果 6例病人均获得随访,随访时间为9~25个月,平均15.2个月。其中1例钉道感染,未发生神经、血管损伤和骨不连。拆除外固定时间为12~16周,平均13.7周。术后患肢无跛行。末次随访按照Johner-Wruhs评定标准,优5例,良1例。结论计算机辅助测量联合3D打印技术在Taylor空间支架治疗小腿畸形中可获得良好的临床疗效,并具有测量准确,截骨精确,矫形精准,调整方便等优势,是小腿复杂畸形精准化矫形的有效治疗方法

    Y型聚乙二醇干扰素琢-2b注射液治疗HCV基因2/3型慢性丙型肝炎患者疗效和安全性的多中心随机对照试验研究

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    目的以标准剂量的聚乙二醇干扰素(Peg IFN)α-2a联合利巴韦林作为阳性对照,评价新型试验药物Y型Peg IFNα-2b注射液联合利巴韦林治疗2型/3型慢性丙型肝炎(CHC)患者的疗效和安全性。方法采用多中心、随机开放、阳性药对照的Ⅲ期临床试验,筛选符合要求的2型/3型CHC患者,按照2:1的比例随机分配到Y型Peg IFNα-2b组和Peg IFNα-2a组,同时口服利巴韦林,疗程24 w,停药随访24 w。采用Abbott Real Time HCV Genotype II检测HCV基因型,采用Cobas Taq Man实时定量PCR法检测血清HCV RNA水平。详细记录不良事件。主要疗效指标为持续病毒学应答(SVR),并进行非劣效检验。结果本试验实际入组2型/3型CHC患者255例,实际治疗241例。全分析集(FAS)数据显示,158例试验组和83例对照组患者SVR分别为85.4%(95%CI 79.94%~90.94%)和79.5%(95%CI 70.84%~88.20%,P=0.2402);对符合方案分析集(PPS)人群分析显示,试验组和对照组患者SVR分别为87.9%(95%CI 82.45%~93.27%)和85.9%(95%CI 77.82%~94.01%,P=0.7060),率差的95%可置信区间均符合非劣效标准;对PPS人群分析显示,85.8%受试者获得了早期病毒学应答(RVR),RVR的阳性预测值为90.1%;试验组和对照组不良事件发生率相似,分别为95.6%和95.2%,严重不良事件发生率分别为3.8%和3.6%。结论应用Peg IFNα联合利巴韦林治疗2型/3型CHC患者,新型试验药物Y型Peg IFNα-2b具有与对照药物Peg IFNα-2a相似的疗效和安全性。国家科技部“十二五”重大专项(编号:2012ZX10002-003);“重大新药创制”十二五科技重大专项(编号:2012ZX09303019)

    Multi-GPU Paralleled MD and GPU-enabled Constraint Algorithms for GMD 2.0

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    分子动力学(Molecular Dynamics, MD)方法是分子模拟的一类方法,广泛应用于生物、材料等领域。由于计算强度大,目前MD可模拟的时空尺度还远不能满足真实体系物理过程对应的时空尺度。近6年来,随着图形处理器(Graphics Processing Unit, GPU)的峰值计算能力和带宽远超过同时期的中央处理器(Central Processing Unit, CPU),利用GPU提升MD计算性能的尝试成为国际上研究的热点之一。 本论文基于作者所在的中国科学院过程工程研究所高性能计算与化学信息学课题组业已建立的单GPU加速的分子动力学程序GMD 2.0和NVIDIA C2050 GPU,实现了基于GPU的LINCS键长约束算法(GMD_LINCS)和处理刚性水分子的SETTLE约束算法(GMD_SETTLE)以扩展GMD 2.0的功能。同时,为进一步提升GMD 2.0单节点的计算性能、扩大其可模拟体系的规模,本论文初步建立了基于单节点多GPU并行的分子动力学程序MGMD。主要工作包括: (1)本论文实现了基于GPU的MD约束算法包括GMD_LINCS和GMD_SETTLE,并通过合理地组织线程和高效地使用存储器等优化策略显著提升了二者的计算性能。采用国际主流的MD模拟软件GROMACS 4.5.3版本的单核CPU程序作为计算性能测试的基准程序,对189,054粒子规模的聚丙烯腈(PAN)算例的测试结果表明,GMD_LINCS可获得约17倍的加速比;对99,678粒子规模的水算例的测试结果表明,GMD_SETTLE可获得约30倍的加速比。本论文已将GMD_LINCS和GMD_SETTLE集成到GMD 2.0程序中,以很小的额外计算代价扩展了GMD 2.0进行约束动力学模拟的功能。 (2)本论文采用POSIX thread多线程共享内存编程模型实现了单节点多GPU并行的分子动力学程序MGMD,将邻居搜索、范德华力计算、成键力计算和粒子更新等MD的核心模块全部置于GPU端计算。通过复杂的粒子和成键作用等信息的迁移处理,大幅减少了GPU与CPU之间的数据通信时间,显著提升了MGMD的计算性能。采用国际主流的MD模拟软件GROMACS程序的近期版本作为计算性能测试的基准程序,对 27万粒子规模的聚乙烯(PE)算例的测试结果表明,基于6块GPU的MGMD与GROMACS 4.5.3版本的单核CPU相比,MGMD的范德华力和成键力模块可获得约260倍的加速比,邻居搜索可获得约90倍的加速比,MGMD的整体性能可获得50倍左右的加速比。对18万粒子规模的PE算例的测试结果表明,与最新的支持多GPU加速的GROMACS 4.6.1版本的GPU程序相比,均基于2块GPU计算时,MGMD的计算性能约为GROMACS 4.6.1的2.4倍;均基于4块GPU计算时,MGMD约为GROMACS 4.6.1的1.6倍。本论文的单节点多GPU并行策略特别是粒子和成键作用等信息迁移的复杂处理策略获得了计算性能的高回报,MGMD程序获得了显著的加速效果

    膀胱癌新型标志物BLCA-4蛋白的研究进展

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    膀胱癌是常见的恶性肿瘤之一,复发率高。传统的诊断方法多有创伤性,检删方法敏感性和特异性不高。随着分子生物学发展,近年来发现了6种新的膀胱癌特异性核基质蛋白,其中尿液BLCA-4蛋白对膀胱癌早期诊断具有较好的临床应用前景,现就BLCA-4蛋白研究现状进行综述。厦门市卫生局2004年度医学科研立项(厦卫科教中医2004-400号)

    Particle-Mesh-Ewald(PME)算法在GPU上的实现

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    分子动力学模拟(MD)是分子模拟的一类常用方法,为生物体系的模拟提供了重要途径。由于计算强度大,目前MD可模拟的时空尺度还不能满足真实物理过程的需要。作为CPU的加速设备,近年来,GPU为提高MD计算能力提供了新的可能。GPU编程难点主要在于如何将计算任务分解并映射到GPU端并合理组织线程及存储器,细致地平衡数据传输和指令吞吐量以发挥GPU的最大计算性能。静电效应是长程作用,广泛存在于生物现象的各个方面,对其精确模拟是MD的重要组成部分。Particle—Mesh.Ewald(PME)方法是公认的精确处理静电作用的算法之一。本文介绍在本实验室已建立的GPU加速分子动力学模拟程序GMD的基础上,基于NVIDIACUDA,采用GPU实现PME算法的策略,针对算法中组成静电作用的三个部分即实空间、傅立叶空间和能量修正项,分别采用不同的计算任务组织策略以提升整体性能。使用事实上的标准算例dhfr进行的测试结果表明,实现PME的GMD程序,性能分别是Gromacs4.5-3版单核CPU的3.93倍,8核CPU的1.5倍,基于OpenMM2.0加速的Gromacs4.5.3GPu版本的1.87倍

    液相色谱-串联质谱法测定纺织品中4种二苯甲酮类紫外吸收剂的最大迁移量

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    采用液相色谱-串联质谱法测定纺织品中二苯甲酮、2,4-二羟基二苯甲酮、2-羟基-4-甲氧基二苯甲酮和2-羟基-4-正辛氧基二苯甲酮等4种二苯甲酮类紫外吸收剂的最大迁移量。采用水、酸性汗液、碱性汗液、皂液等迁移模拟液。迁移模拟液加入到纺织品样品中后,采用水浴摇床振荡,振荡频率为80r·min~(-1),迁移时间为90min,在水及皂液中迁移时水温为常温,在酸性汗液及碱性汗液中迁移时水温为(37±2)℃,迁移模拟液采用乙腈液液萃取。以Waters Atlantis T3色谱柱为分离柱,以不同体积比的乙腈和水的混合液为流动相进行梯度洗脱,串联质谱分析中采用电喷雾离子源和多反应监测模式。4种二苯甲酮类紫外吸收剂的质量浓度在一定范围内与其对应的峰面积呈线性关系,方法的检出限(3S/N)为1~3μg·L~(-1),测定下限(10S/N)为3~10μg·L~(-1)。以空白样品为基体进行加标回收试验,所得回收率为85.5%~102%,测定值的相对标准偏差(n=6)为4.4%~8.4%。对纺织品样品中4种二苯甲酮类紫外吸收剂进行迁移评估,结果表明:4种二苯甲酮类紫外吸收剂的最大迁移比例为0.02%~3.65%,最大迁移时间为60~90min

    Particle-Mesh-Ewald(PME)算法在GPU上的实现

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    分子动力学模拟(MD)是分子模拟的一类常用方法,为生物体系的模拟提供了重要途径。由于计算强度大,目前MD可模拟的时空尺度还不能满足真实物理过程的需要。作为CPU的加速设备,近年来,GPU为提高MD计算能力提供了新的可能。GPU编程难点主要在于如何将计算任务分解并映射到GPU端并合理组织线程及存储器,细致地平衡数据传输和指令吞吐量以发挥GPU的最大计算性能。静电效应是长程作用,广泛存在于生物现象的各个方面,对其精确模拟是MD的重要组成部分。Particle—Mesh.Ewald(PME)方法是公认的精确处理静电作用的算法之一。本文介绍在本实验室已建立的GPU加速分子动力学模拟程序GMD的基础上,基于NVIDIACUDA,采用GPU实现PME算法的策略,针对算法中组成静电作用的三个部分即实空间、傅立叶空间和能量修正项,分别采用不同的计算任务组织策略以提升整体性能。使用事实上的标准算例dhfr进行的测试结果表明,实现PME的GMD程序,性能分别是Gromacs4.5-3版单核CPU的3.93倍,8核CPU的1.5倍,基于OpenMM2.0加速的Gromacs4.5.3GPu版本的1.87倍

    Particle-Mesh-Ewald(PME)算法在GPU上的实现

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    分子动力学模拟(MD)是分子模拟的一类常用方法,为生物体系的模拟提供了重要途径。由于计算强度大,目前MD可模拟的时空尺度还不能满足真实物理过程的需要。作为CPU的加速设备,近年来,GPU为提高MD计算能力提供了新的可能。GPU编程难点主要在于如何将计算任务分解并映射到GPU端并合理组织线程及存储器,细致地平衡数据传输和指令吞吐量以发挥GPU的最大计算性能。静电效应是长程作用,广泛存在于生物现象的各个方面,对其精确模拟是MD的重要组成部分。Particle—Mesh.Ewald(PME)方法是公认的精确处理静电作用的算法之一。本文介绍在本实验室已建立的GPU加速分子动力学模拟程序GMD的基础上,基于NVIDIACUDA,采用GPU实现PME算法的策略,针对算法中组成静电作用的三个部分即实空间、傅立叶空间和能量修正项,分别采用不同的计算任务组织策略以提升整体性能。使用事实上的标准算例dhfr进行的测试结果表明,实现PME的GMD程序,性能分别是Gromacs4.5-3版单核CPU的3.93倍,8核CPU的1.5倍,基于OpenMM2.0加速的Gromacs4.5.3GPu版本的1.87倍
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