Optimisation of bacillus amyloliquefaciens fe-k1 extracellular peptidase production by response surface methodology

In this study, it was aimed to optimise the extracellular peptidase production of Bacillus amyloliquefaciens FE-K1, previously isolated from ropy wholemeal bread, by using response surface methodology (RSM) based on central composite design (CCD). The temperature (20-45°C), initial pH of the enzyme production medium (pH 5-9) and inoculation level (1-5%, v/v) were used as the factors for RSM, and the fermentation time was determined for each trial separately. Results showed that the optimum peptidase production occurred at 33.4°C, pH 6.62 and 2.3% inoculation. It was determined that the fermentation time was only 7h, the crude enzyme had a peptidase activity of 49.17U/mL and a specific activity of 504.77U/mg under the optimised conditions.Bu çalışmada, daha önce sünmüş ekmekten izole edilmiş olan Bacillus amyloliquefaciens FE-K1’in ekstraselüler peptidaz üretiminin, merkezi kompozit tasarıma (MKT) dayalı yanıt yüzey yöntemi (YYY) ile optimize edilmesi amaçlanmıştır. Yanıt yüzey yönteminde sıcaklık (20-45°C), enzim üretim ortamının başlangıç pH değeri (pH 5-9) ve inokülasyon seviyesi (%1-5, v/v) faktör olarak kullanılmış, fermentasyon süresi her deneme için ayrı ayrı belirlenmiştir. Sonuçlar optimum peptidaz üretiminin 33,4°C, pH 6,62 ve %2,3 inokülasyon seviyesinde elde edildiğini göstermiştir. Optimum koşullar altında fermentasyon süresinin sadece 7 saat, ham enzimin aktivitesinin 49,17U/mL, spesifik aktivitesinin ise 504,77U/mg olduğu tespit edilmiştir

Partial Purification and Characterization of An Extracellular Metallopeptidase Produced by Bacillus Amyloliquefaciens Fe-K1

DergiPark: 647525trkjnatBu çalışmanın amacı, sünmüş ekmeklerden izole edilen Bacillus amyloliquefaciens (Fukumoto) (suş FE-K1) ile elde edilen peptidazı saflaştırmak ve karakterize etmektir. Peptidazlar ham enzim çözeltisinden afinite kromatografisi ile % 25 verim ve 1,53 saflaştırma katsayısı ile saflaştırılmıştır. Kısmi olarak saflaştırılmış peptidaz (PPPaz) çözeltisinin optimum pH değeri 7,5 olarak tespit edilmiş olup, pH 7,5-8,0 aralığında peptidaz, 37°C’de 2 saat inkübasyonun ardından başlangıç aktivitesini yaklaşık % 90 oranında korumuştur. PPPaz’ın optimum sıcaklığı 60°C’dir. PPPaz’ın yaklaşık molekül ağırlığı 36 kDa olarak belirlenmiştir. PPPaz’ın O-FEN ve EDTA varlığında inaktive olması, enzimin metallopeptidaz olduğunu göstermiştir. Ayrıca 5 mM K+1 ve 5 mM Mn+2, enzimin aktivitesini sırasıyla % 4 ve % 6,15 oranında artırmıştır. Hg+2, Fe+3 ve SDS (% 0,1-1,0 w/v) varlığı enzimin inaktivasyonuna neden olurken, % 0,1-1,0 (v/v) Triton X-100, Tween 20 ve Tween 80; ve % 1-20 (v/v) ksilen, etanol, aseton ve asetonitril varlığında enzim aktivitesini büyük ölçüde korumuştur. PPPaz’ın karakterizasyonu, enzimin bazı organik çözücü ve yüzey aktif maddelerle ile uyumlu nötr bir serin metalopeptidaz olduğunu ortaya çıkarmıştır.The aim of this study was to purify and characterize the peptidase of Bacillus amyloliquefaciens (Fukumoto) (strain FE-K1) isolated from ropey bread. Peptidases were purified from crude enzyme solution by affinity chromatography with an efficiency of 25 % and a purification coefficient of 1.53. The optimum pH of partially purified peptidase (PPPase) solution was determined as 7.5 and the peptidases retained approximately 90 % of their initial activity in the pH range 7.0-8.5 following incubation at 37°C for 2 h. The optimum temperature for the PPPase was 60°C. The approximate molecular weight of the PPPase was determined as 36 kDa. Inactivation of the PPPase in the presence of O-FEN and EDTA showed them to be metallopeptidases and 5 mM of K+1 and 5 mM of Mn+2 ions increased the enzyme activity by 4 % and 6.15 %, respectively. The presence of Hg+2, Fe+3 and SDS (0.1-1.0 % w/v) caused inactivation whereas the enzyme retained most of its activity in the presence of 0.1-1.0 % (v/v) Triton X-100, Tween 20 and Tween 80 and 1-20 % (v/v) xylene, ethanol, acetone and acetonitrile. Characterization of the PPPase revealed the enzyme as a neutral serine metallopeptidase compatible with some organic solvents and surfactants

The preventive effect of exogenous adenosine triphosphate on methanol-induced cardiotoxicity in rats

Exposure to methanol can cause serious consequences such as permanent visual disturbances and death. The heart tissue is highly vulnerable to ATP deficiency. Our study aimed to investigate whether exogenous ATP administration may alleviate methanol-induced ATP deficiency and subsequent oxidative damage in rat heart tissue. A total of 30 rats were divided into equal five groups; Healthy Group (HG), Methotrexate (MXG), Methanol (MeOH), Methotrexate+Methanol (MXM), and Methotrexate+Methanol+ATP (MMA) groups. We inhibited tetrahydrofolate synthesis by methotrexate to induce methanol toxicity. Methotrexate was administered to MXG, MXM, and MMA group animals for seven days with a catheter directly to the stomach at a 0,3 mg/kg dose per day. At the end of this period, % 20 methanol at a dose of 3 g/kg was administered to MeOH, MMA and MXM group animals. Immediately after methanol application, MMA group animals were injected with ATP at a 4 mg/kg dose intraperitoneally. Blood samples and heart tissues were used for biochemical analysis and histopathological examination. Co-exposure to methanol and methotrexate substantially exacerbated cardiac damage, indicating the potent cardiotoxic effects of methanol. However, the administration of exogenous ATP to MMA group animals brought biochemical oxidative damage parameters and histopathological findings closer to HG

The correction of leg-length discrepancy after treatment in developmental dysplasia of the hip by using a percutaneous epiphysiodesis

The aims of this study were to determine factors that cause a leg-length discrepancy (LLD) to the extent that correction is indicated after treatment in developmental dysplasia of the hip and determine whether the LLD may be treated with a percutaneous epiphysiodesis. Twelve children were included in this study. The factors which caused LLD were avascular necrosis, femoral shortening and varus at reduction, and septic arthritis. Percutaneous epiphysiodesis of the contralateral limb reduced the mean predicted LLD from 3.8 to 1.2 cm at maturity. We concluded that LLD ( > 2.5 cm) might result from complications of developmental dysplasia of the hip and these patients can be treated with a percutaneous epiphysiodesis

The status of the exchange rate depreciation of turkish Lira from the perspective of the artisans in the Kusadası region

Turizm hem pazar büyüklüğü hem de sahip olduğu ekonomik potansiyel nedeniyle dünyanın en önemli sektörleri arasında yer almaktadır. Turizm destinasyonları genellikle turizm olayının gerçekleştiği dönemlerin dışında oldukça az bir nüfusa sahiptir ve yerel halkın gelirlerinin büyük bir kısmını turizm oluşturmaktadır. Bu nedenle, turizm destinasyonlarında yer alan esnaflar turizme bağımlı yapıdadır. Turizm, oldukça esnek bir yapıdadır ve özellikle ekonomik faktörlerden önemli ölçüde etkilenmektedir. Bu nedenle yapılan çalışmada Türk Lirası’nın yabancı paralar karşısında değer kaybetmesinin, turizm bölgelerinde yer alan esnaflar bakış açısıyla durumu saptamak amaçlanmıştır. Çalışmanın birinci bölümünde döviz ve devalüasyon kavramları ile ilgili kuramsal çerçeveler araştırılmış, ikinci bölümde ise milli paranın dış değer kaybının turizm sektörü üzerindeki etkileri incelenmiştir. Son bölümde de Kuşadası bölgesinde yer alan esnafların döviz kurlarında yaşanan değişimlerden nasıl etkilendiği ortaya konulmuştur.Tourism is one of the most important sector in the world due to its market size an its economic potential. Tourism destinations generally have a very small population outside the periods of tourism events and tourism constitutes a large part of local people income. For this reason, artisans in tourism destinations are dependent on tourism. Tourism has a very flexible structure and is particularly affected by economic factors. Therefore, in this study, it is aimed to determine the situation of the depreciation of Turkish Lira against foreign currencies from the perspective of tradesmen in tourism regions. In the first part of the study, theoretical frameworks related to the concepts of exchange rates and devaluation were investigated, and in the second part, the effects of the depreciation of the national currency on the tourism sector were exemined. In the last section, how the artisans in the Kuşadası region are affected by changes in exchange rates are revealed.İÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY SAYFASI........................................................................................... ii BİLİMSEL ETİK BİLDİRİM SAYFASI........................................................................ iii ÖZET.................................................................................................................................. iv ABSTRACT......................................................................................................................... v ÖNSÖZ................................................................................................................................ vi ŞEKİLLER DİZİNİ........................................................................................................... ix TABLOLAR........................................................................................................................ x GİRİŞ.................................................................................................................................... 1 1. DÖVİZ VE DEVALÜASYON KAVRAMLARINA GENEL YAKLAŞIM.............. 4 1.1 Döviz ve Döviz Piyasası................................................................................................. 4 1.1.1. Döviz ve Döviz Kuru Kavramları................................................................... 4 1.1.1.1. Döviz Kuru Çeşitleri......................................................................... 5 1.1.2. Döviz Piyasası................................................................................................. 8 1.1.3. Döviz Kuru Sistemleri..................................................................................... 9 1.1.3.1. Sabit Kur Sistemi............................................................................ 10 1.1.3.2. Esnek (Dalgalı) Kur Sistemi........................................................... 12 1.2. Devalüasyon Kavramı.................................................................................................. 14 1.2.1. Devalüasyonun Başarılı Olabilmesi İçin Gereken Koşullar......................... 16 1.2.2. Devalüasyonun Olumlu Etkileri.................................................................... 16 1.2.3. Devalüasyonun Olumsuz Etkileri.................................................................. 18 1.2.4. Milli Paranın Değer Kaybı ve Devalüasyon İlişkisi...................................... 19 1.2.5. Türkiye’de Uygulanan Döviz Kuru Politikaları............................................ 20 1.2.5.1. Türkiye’de Uygulanan Devalüasyon Operasyonları (1931- 1970).................................................................................................................................... 20 1.2.6. Türkiye’de 1980 Sonrası Döviz Kuru Politikaları........................................ 28 2. MİLLİ PARANIN DIŞ DEĞER KAYBININ TURİZM SEKTÖRÜ ÜZERİNDEKİ ETKİLERİ......................................................................................................................... 35 viii 2.1. Turizm Talebi Kavramı................................................................................................ 35 2.1.1. Turizm Talebinin Özellikleri......................................................................... 36 2.1.2. Turizm Talebini Etkileyen Faktörler............................................................. 36 2.2. Döviz Kurları ve Turizm Talebi İlişkisi....................................................................... 40 2.2.1. Döviz Kurlarının Turizm Sektörü Üzerindeki Etkileri................................. 41 2.2.2. Milli Paranın Değer Kaybetmesinin Turizmde Olumlu Etki Yaratabilmesi İçin Gereken Şartlar.................................................................................................................... 42 2.3. Turizmin Gelir Yaratıcı Etkisi...................................................................................... 43 2.3.1. Döviz Kurları ve Türkiye’nin Turizm Gelirleri............................................. 44 2.4. Döviz Kurlarının Turizm Sektöründeki Etkilerini Araştıran Diğer Çalışmalar........... 50 3. ESNAFLARIN TÜRK LİRASI’NIN YABANCI PARA BİRİMLERİ KARŞISINDA DEĞERİ HAKKINDAKİ GÖRÜŞLERİ........................................................................ 55 3.1. Araştırma Deseni.......................................................................................................... 54 3.2. Veri Toplama Yöntemi................................................................................................ 55 3.3. Anakütle – Örneklem................................................................................................... 57 3.4. Görüşme Formunun Hazırlanması............................................................................... 58 3.5. Araştırma Süreci.......................................................................................................... 59 3.6. Verilerin Analizi.......................................................................................................... 60 3.7. Araştırmanın Geçerliliği ve Güvenilirliği.................................................................... 61 3.8. Araştırmanın Bulguları................................................................................................. 62 4.SONUÇ VE TARTIŞMA............................................................................................... 76 5.KAYNAKLAR................................................................................................................ 83 6.EKLER............................................................................................................................ 94 ÖZGEÇMİŞ....................................................................................................................... 9

The Results of the Treatment of Osteogenesis Imperfecta with Corkscrew Tipped Telescopic Nail

WOS: 000406930000004Aim: We aimed to evaluate the clinical and radiological results of an intramedullary fixation system used in surgeries for fractures and deformities of osteogenesis imperfecta where we applied a new design corkscrew tipped intramedullary nailing. Materials and Methods: Twenty extremities of 14 osteogenesis cases, who underwent surgery and to whom corkscrew tipped intramedullary treatment was applied, were retrospectively scanned. Ambulation, discrepancies in the lenght of extremities, deformities and joint mobility range were all noted before the operation. Postoperative union rates, complications and our experience regarding the nail were also evaluated. Results: Six tibia and 14 femurs were operated using corkscrew tipped telescopic nails. Two bones were operated due to non-union, while seven bones underwent surgery due to acute fractures and 11 bones due to deformities. All the bones were seen to have achieved the aimed union. No major complications were observed. Infection was present in two cases. Conclusion: Corkscrew tipped telescopic nail is a safe and effective method of fixation in patients with osteogenesis imperfecta

Osteogenezis İmperfektalı Olgularda Tirbuşon Uçlu Teleskopik Çivi ile Tedavi Sonuçları

Aim: We aimed to evaluate the clinical and radiological results of an intramedullary fixation system used in surgeries for fractures and deformities of osteogenesis imperfecta where we applied a new design corkscrew tipped intramedullary nailing.Materials and Methods: Twenty extremities of 14 osteogenesis cases, who underwent surgery and to whom corkscrew tipped intramedullary treatment was applied, were retrospectively scanned. Ambulation, discrepancies in the lenght of extremities, deformities and joint mobility range were all noted before the operation. Postoperative union rates, complications and our experience regarding the nail were also evaluated.Results: Six tibia and 14 femurs were operated using corkscrew tipped telescopic nails. Two bones were operated due to non-union, while seven bones underwent surgery due to acute fractures and 11 bones due to deformities. All the bones were seen to have achieved the aimed union. No major complications were observed. Infection was present in two cases.Conclusion: Corkscrew tipped telescopic nail is a safe and effective method of fixation in patients with osteogenesis imperfecta.Amaç: Kırık ve deformiteler nedeni ile cerrahi olarak tirbuşon uçlu kanal içi çivileme yöntemi uyguladığımız osteogenezis imperfektalı olguların klinik ve radyolojik sonuçlarını değerlendirmek istedik.Gereç ve Yöntemler: Tirbuşon uçlu kanal içi çivi uygulanarak cerrahi yapılan 14 osteogenezisli olgunun 20 ekstremitesi geriye yönelik olarak tarandı. Operasyon öncesindeki ambulasyon durumu, ekstremite boyları, deformiteler, eklem hareket genişlikleri not edildi. Operasyon sonrası kaynama oranları, komplikasyonlar ve çiviye ait deneyimlerimiz değerlendirildi.Bulgular: Altı tibia ve 14 femur, tirbuşon uçlu teleskopik çivi ile opere edildi. İkisi kaynamama, yedi kemikte akut kırık ve 11 kemik deformite nedeniyle opere edildi. Tüm kemiklerde kaynama elde edildi. Majör komplikasyon gözlenmedi. İki olguda enfeksiyon görüldü.Sonuç: Tirbuşon uçlu teleskopik çivi osteogenezis imperfektalı olgularda güvenli ve etkin uygulanabilecek bir yöntemdir

Improvement of popliteal angle with semitendinosus or gastrocnemius tenotomies in children with cerebral palsy

Objective: The aim of this study was to determine the efficacy of semitendinosus and gastrocnemius tenotomies on popliteal angle presenting knee flexion spasticity in children with cerebral palsy (CP)