Disaggregating non-volatile memory for throughput-oriented genomics workloads

Massive exploitation of next-generation sequencing technologies requires dealing with both: huge amounts of data and complex bioinformatics pipelines. Computing architectures have evolved to deal with these problems, enabling approaches that were unfeasible years ago: accelerators and Non-Volatile Memories (NVM) are becoming widely used to enhance the most demanding workloads. However, bioinformatics workloads are usually part of bigger pipelines with different and dynamic needs in terms of resources. The introduction of Software Defined Infrastructures (SDI) for data centers provides roots to dramatically increase the efficiency in the management of infrastructures. SDI enables new ways to structure hardware resources through disaggregation, and provides new hardware composability and sharing mechanisms to deploy workloads in more flexible ways. In this paper we study a state-of-the-art genomics application, SMUFIN, aiming to address the challenges of future HPC facilities.This work is partially supported by the European Research Council (ERC) under the EU Horizon 2020 programme (GA 639595), the Spanish Ministry of Economy, Industry and Competitivity (TIN2015-65316-P) and the Generalitat de Catalunya (2014-SGR-1051).Peer ReviewedPostprint (author's final draft

Model for cryptography protection of confidential information

УДК 004.056 Борсуковський Ю.В., Борсуковська В.Ю. Модель криптографічного захисту конфіденційної інформації В даній статті проведено детальний аналіз вимог щодо формування моделі криптографічного захисту конфіденційної інформації. Розглянуто використання засобів криптографічного захисту інформації з метою реалізації організаційних та технічних заходів по запобіганню витокам конфіденційної інформації на об’єктах критичної інфраструктури. Сформульовані базові вимоги та рекомендації щодо структури та функціональних складових моделі захисту конфіденційної інформації. Формалізовані вимоги щодо створення, впровадження та експлуатації превентивних процедур управління багатоступінчатим захистом конфіденційної інформації. Наведено приклад використання моделі криптографічного захисту інформації для створення захищеної і прозорої в використанні бази аутентифікаційних даних користувача. Запропонована модель захисту дозволяє мати кілька ступенів програмного та апаратного захисту, що із однієї сторони спрощує їх використання при виконанні чинних політик безпеки і зменшує ймовірність дискредитації аутентифікаційних даних, а із іншої сторони підвищує ймовірність виявлення зловмисних дій третьої сторони за рахунок багатоступінчатої системи захисту. Враховано практичний досвід створення типових моделей захисту конфіденційної інформації для розробки, впровадження та управління сучасними політиками інформаційної безпеки щодо питань використання засобів криптографічного захисту конфіденційної інформації на підприємствах різних форми власності.UDC 004.056 Borsukovskyi Y., Borsukovska V. Model for Cryptography Protection of Confidential Information Current article provides the detailed analysis of requirements for creation of model for cryptography protection of confidential information. Article defines the use of information cryptography protection tools in order to ensure the application of organizational and technical actions to prevent leakage of confidential information at critical infrastructure assets. It provides the basic requirements for the structure and functional elements of model for protection of confidential information. Formalize requirements on creation, implementation and exploitation of preventive procedure in management of multi-level protection of confidential information. The article includes example of use of model for cryptography protection of information for creation of secure and transparent in use the authenticating data base of user. The presented model of protection ensures to have a few levels of firewalls, that, on one hand, simplifies its use in execution of acting security policies and decrease the probability of discrediting of authenticating data, and, on other hand, increase the probability to detect the criminal actions of third party by means of multi-level protection system. It considers the practical experience in creation of standard models for protection of confidential information for development, implementation and management of modern policies on information security in part of use of cryptography protection tools for confidential information at enterprises of different forms of incorporation

Performance Evaluation of Data-Intensive Computing Applications on a Public IaaS Cloud

[Abstract] The advent of cloud computing technologies, which dynamically provide on-demand access to computational resources over the Internet, is offering new possibilities to many scientists and researchers. Nowadays, Infrastructure as a Service (IaaS) cloud providers can offset the increasing processing requirements of data-intensive computing applications, becoming an emerging alternative to traditional servers and clusters. In this paper, a comprehensive study of the leading public IaaS cloud platform, Amazon EC2, has been conducted in order to assess its suitability for data-intensive computing. One of the key contributions of this work is the analysis of the storage-optimized family of EC2 instances. Furthermore, this study presents a detailed analysis of both performance and cost metrics. More specifically, multiple experiments have been carried out to analyze the full I/O software stack, ranging from the low-level storage devices and cluster file systems up to real-world applications using representative data-intensive parallel codes and MapReduce-based workloads. The analysis of the experimental results has shown that data-intensive applications can benefit from tailored EC2-based virtual clusters, enabling users to obtain the highest performance and cost-effectiveness in the cloud.Ministerio de Economía y Competitividad; TIN2013-42148-PGalicia. Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria; GRC2013/055Ministerio de Educación y Ciencia; AP2010-434

SYSTEM AND METHOD FOR BUILDING CONTAINER CLUSTER

The present disclosure provides a method and container management system for building container cluster. The container management system based on user requirement may automate hardening of operating system and configure network and storage for adding new container. The container management system obtains and configures load balancer VIP without any manual intervention. Thereafter, the container management system performs end-to-end validation by deploying test application and validating the test application. Thus, the present disclosure reduces time consumption for building container clusters based on the user requirement