Desarrollo de un diccionario electrónico para la detección automática de candidatos a término del dominio médico : Una aplicación con Smorph y MPS

El presente trabajo, enmarcado en el proyecto FONDECYT 11130469, describe la metodología de la elaboración de un diccionario médico electrónico, con el propósito de ser implementado en tareas de extracción automática. Se compilaron los lemas incluidos en Diccionario Mosby y Terminología Médica que se correspondían con las estructuras (i) nombre; (ii) nombre – adjetivo, y (iii) nombre – preposición de – nombre. Cada nombre y adjetivo fue cargado de manera separada y se le asignó a cada uno un modelo correspondiente con sus rasgos morfológicos. Posteriormente, se establecieron reglas de reagrupamiento a fin de conformar las estructuras (ii) y (iii). Para la implantación en máquina, se recurrió a los software Smorph y Módulo Post Smorph. Smorph permite analizar morfológicamente la cadena de caracteres, dando como salida la asignación categorial y morfológica correspondiente a cada ocurrencia de acuerdo con los rasgos declarados. MPS, por su parte, toma como input el output de Smorph y, a partir de reglas de recomposición, descomposición y correspondencia declaradas por el usuario, analiza la cadena de lemas resultante del análisis morfológico.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa (SADIO

Propuesta de extracción automática de candidatos a término del dominio médico procesando información lingüística. Descripción y evaluación de resultados

The description of a method for automatic extraction of term candidates from the medical field by applying linguistic information is presented. Lexicography, morphological and syntactic rules were used. First, the detection was performed by applying a standard dictionary that assigned the tag ‘MED’ (‘MEDICAL’) to the words that could be considered terms. Morphological and syntactic rules were used to try to deduce the part of speech of the words that were not considered in the dictionary (WNCD). Afterwards, nominal phrases that included WNCD and MED were gathered to extract them as term candidates of the field. Smorph, Post Smorph Module (MPS) – both working in groups – and Xfst were the software used. Smorph performs the morphological analysis of character strings and MPS works on local grammar. Xfst is a finite state tool that works on character strings assigning previously stated categories to allow the automatic analysis of expressions. This method was tested on a section of the corpus of clinical cases collected by Burdiles (CCCM - 2009) containing 217,258 words. The results showed 92.58% of precision, 95.02% of recall and 93.78% of F-measure.Se presenta la descripción de un método de extracción automática de candidatos a términos del área médica a partir del procesamiento de información lingüística. Para ello, se trabajó con reglas en el nivel léxico, morfológico y sintáctico. En primer lugar, se realizó la detección aplicando un diccionario estándar, el cual asignó a las palabras consideradas términos, la etiqueta MED (MÉDICO). Luego, para las palabras que no estaban contempladas en el diccionario (PNCD), se dedujeron las categorías gramaticales apelando a reglas morfológicas y sintácticas. Posteriormente, se procedió a la conformación de sintagmas nominales que involucraban PNCD y MED, para extraerlos como candidatos a términos del dominio. Se utilizaron los softwares Smorph y Módulo Post Smorph (MPS), que trabajan en bloque, y Xfst. Smoprh realiza el análisis morfológico y MPS trabaja sobre gramáticas locales. Xfst, por su parte, es una herramienta de estados finitos que opera sobre cadenas de caracteres, a las que asigna categorías previamente declaradas. El método se probó en una parte del corpus de casos clínicos compilado por Burdiles (2012), que contenía 217258 palabras, y los resultados arrojaron una precisión de 92,58%, una cobertura de 95,02% y una medida f de 93,78%

Elaboración de un aplicativo basado en web para uso en unidad de cuidado intensivo del consenso de uso de antimicrobianos en pacientes críticamente enfermos con falla renal o en riesgo de padecerla

Los pacientes atendidos en unidades de cuidado intensivo, reciben intervenciones de alta complejidad con la idea de aumentar su supervivencia. Sin embargo esas intervenciones pueden generar daño o complicaciones no intencionadas. Muchas de estas complicaciones son asociadas a medicamentos necesarios en la intervención terapéutica, algunos de los cuales tienen efecto tóxico a nivel renal. Es posible que estos efectos adversos sean susceptibles de prevenir o minimizar ajustando su dosificación. La gran barrera con la que nos encontramos muchos de los clínicos es que muchas de las investigaciones que realizamos tienen dificultades de tipo operativo o el desarrollo tecnológico para poderlas llevar a nuestros colegas y por ende a nuestros pacientes. Este trabajo implementa una herramienta basada en web en tiempo real para la aplicación de unas conclusiones de un Consenso de uso de antimicrobianos en pacientes críticamente enfermos con falla renal o en riesgo de padecerla.Abstract. Patients in intensive care units are highly intervened with the objetive of increasing their survival. However, these interventions can generate damage or unintended complications. Many of these complications are associated with drug administration, and some have toxic effects in the kidney. It is possible that these side effects are possible to prevent or to minimize by adjusting the dosage. The major barrier is that the research and its conclusions do not come to our colleagues and our patients. This work develops a Web-based tool for real-time implementation of conclusions of a Consensus for antimicrobial use in critically ill patients with renal failure or at risk of suffering it.Otr

Educación médica, modelo hegemónico y atención primaria de salud. Entrevista al doctor Eduardo L. Menéndez

Eduardo Luis Menéndez es argentino. Nació en la ciudad de 9 de Julio (Provincia de Buenos Aires), y fue uno de los primeros graduados en Antropología de la Universidad de Buenos Aires (1963), en donde también llevó a cabo su formación doctoral, en 1990. Adelantó su maestría en la Escuela de Salud Pública de México (1980). En el 2009 recibió un Doctorado Honoris Causa, de la Universidad Rovira i Virgili (Tarragona, España), y en el 2015 otro, de la Universidad Nacional de Rosario (Rosario, Argentina 2015). Se desempeñó como director del Departamento de Ciencias Antropológicas de la Universidad de la Provincia de Buenos Aires entre 1971 y 1975, y desde 1976 reside en Ciudad de México, donde ha realizado una extensa actividad como docente e investigador, dedicado fundamentalmente a la antropología médica. También ha dirigido numerosas tesis de licenciatura y de posgrado. Actualmente se desempeña como investigador y docente del Centro de Investigaciones y Estudios Superiores en Antropología Social (CIESAS)

De la farmacovigilancia al monitoreo crítico de los medicamentos. El proceso de registro de medicamentos en Colombia 2006

Existe una diversidad de problemas relacionados con la dinámica social que involucra a los medicamentos (PRDSM), que trascienden los aspectos técnico-biomédicos. A partir de la deconstrucción del concepto de farmacovigilancia se ponen en cuestión conceptos hegemónicos referidos a los PRDSM. Se demuestra que el modelo hegemónico tiene serias limitaciones para identificar, explicar, comprender e intervenir los PRDSM, aún desde su propia lógica. Se propone una comprensión del proceso de registro sanitario de medicamentos que trasciende lo técnico-legal. Se demuestra que los PRDSM están inmersos en un campo social en el que sujetos sociales diversos y desiguales se relacionan para producir, reproducir y transformar el campo. Se propone el monitoreo crítico, desarrollado por la corriente de la medicina social – salud colectiva, como una forma alternativa de participación popular en este campo social, para aportar a la superación de las desigualdades injustas desde una nueva praxis social en salud.Abstract. There is a diversity of problems related with social dynamics that involve medicines (PRDSM- Spanish acronym), which transcends technical biomedical issues. From the deconstruction of pharmacovigilance concept, hegemonic concepts referred to PRDSM are questioned. It demonstrates that the hegemonic model has serious limitations to identify, explain, understand and intervene on the PRDSM, even from its own logic. A way to understand drug sanitary registry process is proposed, which transcends the technical-legal approach. It‘s shown that PRDSM are immersed in a social field in which diverse and unequal social subjects are interrelated to produce, reproduce and transform the field. Critical monitoring, developed by social medicine – collective health movement, is proposed, as an alternative way of popular participation in this social field in order to contribute to overpass unfair social inequalities from a new social praxis in health.Doctorad

Investigación acerca de la efectividad en el desarrollo de aplicaciones y dispositivos en el campo tecnológico usando materiales basados en grafeno contra el virus Sars-cov-2 (Covid-19)

El presente trabajo de investigación tuvo como finalidad comparar y estudiar la efectividad de dispositivos basados en grafeno o derivados de este, para detectar el SARS-COV-2, tomando en cuenta las extraordinarias propiedades fisicoquímicas y electrónicas de este nanomaterial. Se realizó una investigación exhaustiva para analizar cómo el grafeno y sus derivados pueden usarse en dispositivos biomédicos, biosensores para detectar virus. También se analizó la estructura, modo de infección y características del coronavirus tipo 2. Se utilizaron 137 fuentes académicas de información confiable, la gran parte publicaciones indexadas en revistas de alto impacto, y material bibliográfico complementario. Para filtrar la información se seleccionaron siete dispositivos reportados en artículos científicos, seis publicados en el 2020 y uno en el 2021. Para caracterizar y estudiar la efectividad de cada uno de ellos se establecieron seis parámetros: tipo de grafeno, tiempo de detección, límite de detección, cantidad de analitos detectados y costo. Con estos indicadores se pudo realizar un análisis en el cual se identificó el dispositivo desarrollado por investigadores de Caltech como el más eficiente, este consiste en un sensor de grafeno grabado con láser que posee seis electrodos, es capaz de obtener información a través de muestras de suero o saliva en un tiempo récord de menos de 10 minutos y con bajos límites de detección; además, de detectar cuatro analitos en un solo ensayo. Se concluye que el grafeno y sus derivados son nanomateriales en auge, indispensables en el campo biomédico gracias a su estructura molecular, propiedades físicas y electrónicas. Se recomienda que para filtrar la información se desarrolle una base de datos. Con la información recolectada se publicó un artículo científico el cual se indica en la parte de anexos de esta tesis de pregrado.The aim of this research work was to compare and study the effectiveness of graphene-based or graphene-derived devices for the detection of SARS-COV-2, taking into consideration the extraordinary physicochemical and electronic properties of this nanomaterial. An extensive investigation was carried out to analyse how graphene and its derivatives can be used in biomedical devices, biosensors to detect viruses. The structure, mode of infection and characteristics of the coronavirus were also analysed, mode of infection and characteristics of coronavirus type 2 were also analysed. We used 137 academic sources of reliable information, most of them indexed publications in high impact journals, and complementary bibliographic material. Seven devices reported in scientific articles were selected to filter the information, six published in 2020 and one in 2021. For characterise and study the effectiveness of each one of them, six parameters were established: type of graphene, detection time, detection limit, number of analytes detected and cost. With these indicators allowed an analysis to be carried out in which the device developed by Caltech researchers was identified as the most efficient, this laser-etched graphene sensor with six electrodes, which can obtain information from serum or saliva samples in a record time of less than 10 minutes and with low detection limits; Furthermore, it can detect four analytes in a single assay. It is concluded that graphene and its derivatives are emerging nanomaterials, indispensable in the biomedical field thanks to their molecular structure, physical and electronic properties. It is recommended that a database be developed to filter the information. With the information collected, a scientific article was published, which is indicated in the annexes. is indicated in the annexes of this undergraduate thesis

Análisis de la gestión de bienes en el sector salud 2014-2019

La presente investigación responde a analizar los factores que inciden en la gestión de los bienes en el sector salud, en lo que corresponde al equipamiento y los medicamentos, materiales e insumos médicos desde el año 2014 al 2019, que ayuden a entender los problemas subyacentes y latentes que afectan en los servicios que se da al ciudadano. El enfoque es cualitativo, de diseño estudio de caso, para lo cual se usó la técnica de la revisión sistemática de documentos y la entrevista de personas que han sido parte de la gestión con cargos directivos en el sector en estudio, para su posterior codificación y categorización. Entre los resultados obtenidos se tiene que los factores que inciden en la gestión son la adquisición y el mantenimiento para el equipamiento, así como la normatividad y la gestión de información referida a este punto. Así también el tema presupuestal que incide en su gestión. Por su parte, la articulación que debe existir en la gestión de los medicamentos, materiales e insumos médicos, el almacenamiento y su programación, la normatividad relacionada y la adherencia a las guías de práctica clínica como la prescripción médica, afectan como factores que se deben considerar para mejorar esta gestión

Análisis y evaluación de la herramienta MetaMap para el procesamiento de textos biomédicos

Evaluación de la nueva versión de MetaMap, MetaMap2009v2, herramienta que lleva a cabo un análisis de textos biomédicos y que presenta un elevado grado de configurabilidad que será presentando a lo largo de esta memoria en función de diversos ejemplos, obtenidos tras procesar una selección amplia de documentos médicos extraídos de la base de datos biomédica MedLine2010. Se va a realizar un estudio de las innovaciones y mejoras introducidas en esta nueva versión, centrándonos en su evolución desde las implementaciones iniciales.Ingeniería Técnica en Sistemas de Telecomunicació

Biomedical Term Extraction: NLP Techniques in Computational Medicine

Artificial Intelligence (AI) and its branch Natural Language Processing (NLP) in particular are main contributors to recent advances in classifying documentation and extracting information from assorted fields, Medicine being one that has gathered a lot of attention due to the amount of information generated in public professional journals and other means of communication within the medical profession. The typical information extraction task from technical texts is performed via an automatic term recognition extractor. Automatic Term Recognition (ATR) from technical texts is applied for the identification of key concepts for information retrieval and, secondarily, for machine translation. Term recognition depends on the subject domain and the lexical patterns of a given language, in our case, Spanish, Arabic and Japanese. In this article, we present the methods and techniques for creating a biomedical corpus of validated terms, with several tools for optimal exploitation of the information therewith contained in said corpus. This paper also shows how these techniques and tools have been used in a prototype