Supervised selective kernel fusion for membrane protein prediction

Membrane protein prediction is a significant classification problem, requiring the integration of data derived from different sources such as protein sequences, gene expression, protein interactions etc. A generalized probabilistic approach for combining different data sources via supervised selective kernel fusion was proposed in our previous papers. It includes, as particular cases, SVM, Lasso SVM, Elastic Net SVM and others. In this paper we apply a further instantiation of this approach, the Supervised Selective Support Kernel SVM and demonstrate that the proposed approach achieves the top-rank position among the selective kernel fusion variants on benchmark data for membrane protein prediction. The method differs from the previous approaches in that it naturally derives a subset of “support kernels” (analogous to support objects within SVMs), thereby allowing the memory-efficient exclusion of significant numbers of irrelevant kernel matrixes from a decision rule in a manner particularly suited to membrane protein prediction

Synergistic neurotrophic effects of piracetam and thiotriazoline

The paper considers the synergy between the nootropic drug piracetam and the metabolic agent thiotriazoline that maintains energy metabolism and survival of neurons and other types of cells. Piracetam, a nootropic drug, a chemical pyrrolidone derivative, is used in neurological, psychiatric, and narcological practice. There is evidence on the positive effect of piracetam in elderly and senile patients with coronary heart disease. This drug is supposed to stimulate redox processes, to enhance glucose utilization, and to improve regional blood flow in the ischemic brain regions. Due to its action, the drug activates glycolytic processes and elevates ATP concentrations in brain tissue. Thiotriazoline is a compound that has antioxidant, anti-ischemic properties. The co-administration of piracetam and thiothriazoline is an innovation area in the treatment of stroke and other brain damages, especially in insulin resistance and high blood glucose levels. The paper considers the neurobiological properties of thiotriazoline and piracetam, which synergistically exert neuroprotective and neurotrophic effects

Comparative evaluation of heart rate variability after septoplasty and tonsillectomy

The aim of the research was to determine the fluctuations of the autonomic nervous system based on the analysis of changes in certain heart rate variability (HRV) at patients after septoplasty and tonsillectomy. A study of Holter monitoring of 28 patients with nasal septum deviation and of 30 patients with chronic tonsillitis was conducted. Surgical procedures were performed under local infiltration anesthesia with 0,5% novocaine solution. We evaluated standard deviation of RR intervals (SDNN) - 24-hour monitoring, day and night data. After septoplasty for night and day validity period average SDNN did not differ (p < 0,05), but SDNN were significantly different (p < 0,05). Average values for the night and day were different from each other at the patients after tonsillectomy (p < 0,05). SDNN scatter was the same. SDNN in both groups did not differ per day both for average values and for variability (p < 0,05). Septoplasty provokes more pronounced stress response as compared with tonsillectomy. Local anesthesia for septoplasty and tonsillectomy causes a disturbance of adaptive reactions on the part of the autonomic nervous system. HRV analysis can be called an objective and individual method of diagnosis of acute stress conditions in the otorhinolaryngological surgery

Neurotrophic and antioxidant potential of neuropeptides and trace elements

Neurotrophic therapy with brain extract-based drugs has been performed for decades. The basis for their neurotrophic activity is amino acids and neuropeptides. However, incomplete information on the composition of these drugs precludes a detailed description of mechanisms through which their pharmacological effects occur. The review considers the results of the most recent molecular pharmacological investigations and the mechanisms of therapeutic action of cerebrolysin

Проблемные вопросы правового регулирования использования автомобилей с автоматизированной системой вождения

In the context of a fundamental change in the fundamental approaches to building a traffic management system, traditionally based on establishing the driver’s duty to ensure constant control over the traffic situation and, accordingly, presuming his responsibility for harm caused by a source of increased danger, the problem of legal regulation of the use of highly automated vehicles equipped with an automated driving system that does not provide for participation of the driver in the dynamic control of the car becomes not only relevant in theoretical, but also especially significant from practical aspects.The objective of the comprehensive study being conducted by the authors was to identify and visualise key groups of problems of legal regulation of the operation of cars with an automated driving system, to formulate proposals for their solution as part of a subsequent systemic legal study. This article is devoted to the results of consideration of the first block of the identified issues.Using the methods of the system-legal approach, formal-logical and formal-dogmatic analysis, the authors have identified the most problematic issues of legalising the terminology used in positive law and scientific sources. In particular, options for identifying the essential features of highly automated cars are proposed with the purpose to further legislatively determine the cars that should be classified as highly automated, to reveal which software and hardware complex can be considered an automated driving system, etc.Based on the results of solving the scientific problem, which consists in determining the directions for adapting the legislation governing the requirements for safety of vehicles and the procedure for their admission to operation for the needs of the widespread introduction of highly automated vehicles, the research can be carried out in two directions at the same time: to develop upper-level, essential requirements to safety and to develop specific, purely technical requirements for automated driving systems, as well as to develop a methodology for testing them.As a part of the taxonomic analysis carried out by the authors to determine, on a fundamentally new basis, the range of rights and obligations of the participants in the relations under the study, it is proposed to highlight the problem of distinguishing between situations in which the driver needs to take an active part in driving a car from situations in which he is not required to be actively involved. into this process.When considering issues of liability for harm caused by a car with an automated driving system, the article focuses on the need to solve the problem of balancing the responsibility of the car owner and the manufacturer, which can be facilitated by the application of methods of comparative legal analysis.В условиях коренного изменения принципиальных подходов к построению системы организации дорожного движения, традиционно основанной на установлении обязанности водителя обеспечивать постоянный контроль за дорожной обстановкой и, соответственно, презюмировании его ответственности за вред, причинённый источником повышенной опасности, проблема правового регулирования применения высокоавтоматизированных транспортных средств, оснащённых автоматизированной системой вождения, не предусматривающей участия водителя в динамическом управлении автомобилем, становится не только актуальной в теоретическом, но и особо значимой в практическом аспектах.Целями ведущегося авторами комплексного исследования стали выявление и визуализация ключевых групп проблем правового обеспечения использования автомобилей с автоматизированной системой вождения, формулирование предложений по их решению в рамках последующего системно-правового исследования. В данной публикации приведены результаты рассмотрения первого блока обозначенных вопросов.С использованием методик системно-правового подхода, формальнологического и формально-догматического анализа авторами определены наиболее проблемные вопросы легализации терминологии, используемой в позитивном праве и научных источниках. В частности, предложены варианты выявления сущностных признаков высокоавтоматизированных автомобилей в интересах последующего законодательного определения того, какие автомобили должны быть отнесены к высокоавтоматизированным, какой программно-аппаратный комплекс может считаться автоматизированной системой вождения и т.п.По результатам решения научной задачи, состоящей в определении направлений адаптации законодательства, регулирующего требования к безопасности транспортных средств и процедуру их допуска к эксплуатации к потребностям широкого внедрения высокоавтоматизированных автомобилей, авторами сделан вывод, что данная работа может вестись в двух направлениях одновременно: по разработке верхнеуровневых, сущностных требований к безопасности и по выработке точечных, сугубо технических требований к автоматизированным системам вождения, а также по разработке методологии их испытаний.В рамках осуществления таксономического анализа, осуществлённого авторами в целях определения круга прав и обязанностей участников исследуемых отношений предлагается особо выделить проблему разграничения ситуаций, в которых водителю необходимо принимать активное участие в управлении автомобилем, от ситуаций, в которых от него не требуется активного вовлечения в этот процесс.При рассмотрении вопросов ответственности за вред, причинённый автомобилем с автоматизированной системой вождения, делается акцент на необходимость решения проблемы баланса ответственности владельца автомобиля и изготовителя, чему может способствовать применение методов компаративно-правового анализа

Vitamin D defi ciency and comorbid conditions in children 7-16 years of age: intelligent data analysis

The results of the analysis of the cohort of children and adolescents 7-16 years old from the central and northwestern regions of Russia (n=250) are presented. Levels 25(OH)D>30 ng/ml were observed no more than in 6% of participants. The diagnosis E55 «Vitamin D deficiency» was comorbid with diagnoses of bronchial asthma (P=0.003856), nasal congestion (P=0.003016), wheezing (P=0.000133), seasonal allergic rhinitis (

Хемомикробиомный анализ глюкозамина сульфата, пребиотиков и нестероидных противовоспалительных препаратов

Introduction. The pharmaceutical drugs used in the treatment of osteoarthritis (OA) differ not only in the mechanisms of anti-inflammatory action but also in the effects on the human microbiome.Purpose. Evaluation of the influence of some drugs used in the therapy of OA on the human microbiome by the method of chemoinformation analysis.Materials and methods. Сomparative chemomicrobiome analysis of glucosamine sulfate (GS), diclofenac, acetylsalicylic acid (ASA), and three prebiotics (lactose, lactulose, fructose) as molecules of comparison. For each substance, estimates of the area under the curve (AUC) were obtained for a representative sampling of human microbiota (38 commensal bacteria). The minimum inhibitory concentrations (MIC) were established for more than 120 pathogenic bacteria.Results. On average, according to a representative sampling of microbiota, the profile of the action of GS on the microbiome was almost identical to the profile of the action of lactose (AUC=0.23±0.18). The most effective growth of the microbiome was provided by fructose and lactulose (AUC=0.58±0.21). The effects of diclofenac and ASA on the commensals of microbiome were comparable to the effects of GS (AUC=0.27±0.22). However, the analysis of the obtained MIC values for pathogenic bacteria showed that diclofenac supported the growth of the pathogenic flora (MIC=35±1.4 μg/ml) to a greater extent than GS (MIC=16±1.5 μg/ml) and ASA (MIC=23±2.2 μg/ml).Conclusion. The effects of GS on the microbiome are comparable to the effects of the prebiotic lactose whereas the inhibitory effect of GS and ASA on pathogenic bacteria is more pronounced than that of diclofenac. The inhibition of pathogenic bacteria by the GS helps to reduce inflammation.Введение. Фармацевтические препараты, используемые в терапии остеоартрита (ОА), отличаются не только по механизмам противовоспалительного действия, но и различным воздействием на микробиом человека.Цель. Оценка воздействия на микробиом ряда препаратов, используемых в терапии ОА методом хемоинформационного анализа.Материалы и методы. Сравнительный хемомикробиомный анализ глюкозамина сульфата (ГС), диклофенака, ацетилсалициловой кислоты (АСК) и трех пребиотиков как молекул сравнения (лактозы, лактулозы, фруктозы). Для каждого из веществ получены оценки значений площади под кривой роста (AUC) для репрезентативной выборки микробиоты человека (38 бактерий-комменсалов). Также выполнено определение их минимальных ингибирующих концентраций (MIC) для более чем 120 болезнетворных бактерий.Результаты. В среднем по репрезентативной выборке микробиоты профиль действия ГС на микробиом был практически идентичен профилю действия лактозы (AUC=0,23±0,18). Наиболее эффективно рост микробиома поддерживался фруктозой и лактулозой (AUC=0,58±0,21). Эффекты диклофенака и АСК на микробиом были сопоставимы с эффектами ГС (AUC=0,27±0,22). Однако анализ полученных значений MIC для болезнетворных микроорганизмов показал, что диклофенак в большей степени поддерживал рост патогенной флоры (MIC=35±1,4 мкг/мл), чем ГС (MIC=16±1,5 мкг/мл) и АСК (MIC=23±2,2 мкг/мл).Заключение. Эффекты ГС на микробиом сравнимы с эффектами пребиотика лактозы, а ингибирующее воздействие ГС и АСК на болезнетворные бактерии более выражено, чем у диклофенака. Ингибирование болезнетворных бактерий микробиома молекулой ГС способствует снижению воспаления

Аскорбат анион - эффективный противострессовый лиганд нового поколения для лития

The state of chronic stress caused by various exogenous factors, is always accompanied by a state of excitation in the Central nervous system, neurodegenerative disorder of body functions, impairment of metabolic and physiological processes, immune abnormalities. To increase stress tolerance it is necessary to maintain the body's balance functions of the nervous, immune, endocrine and antioxidant systems of the monooxygenase. The analysis of Literature data and results of own researches of the authors give grounds to conclude that higher stress can be achieved by reducing the Level of free radical oxidation, optimization of Lipid-choLesteroL and hormonal status when using anti-stress drugs of new generation, which incLude organic Lithium saLts. UnLike many synthetic tranquiLizers and sedatives, acting on the neuroreceptors, organic Lithium saLts affect mentaL activity, without affecting neuroreceptors unit of the brain, and are invoLved in the reguLation of neurosynaptic activity through inhibition of enzymes responsibLe for the main metaboLic degradation pathway of gamma-aminobutyric acid - inhibition of GABA-decarboxyLase and GABA-aminotransferase. There is reason to beLieve this method of increasing stress resistance are not onLy more effective but aLso more physioLogicaL Compound organic Lithium saL with ascorbic acid, combined effect on neurohumoraL status and normaLize it, with the effect of their use is the resuLt of decrease LeveL of free radicaL oxidation, incLuding Lipid peroxidation. Lithium ions, contribute to the maintenance of normaL excitabiLity of CentraL nervous system and bLood vesseL tone by reducing the excessive concentration of norepinephrine in the CentraL nervous system and normaLization of the LeveL of sodium ions in nerve and muscLe ceLLs. The compLex nature of neyroLepticheskih of action of Lithium is due to the existence of muLtipLe pathways of exposure to Lithium ions on physioLogicaL processes. With sufficient suppLy of Lithium sensitivity of the brain to dopamine increases. Lithium ions have an effect on the homeostasis of neurotransmitters, and increase the synthesis of neurotrophic factors and the sensitivity of ceLLs of the nervous system to their effects. Further study of the physioLogicaL action of organic saLts of Lithium wiLL aLLow to expand representations about the mechanism of antistress action of drugs of this type and to outLine ways of enhancing the stress resistance of humans and animaLs in the treatment and prevention of depressive and subdepressive States.Состояние хронического стресса, вызвано различными экзогенными факторами, всегда сопровождается состоянием возбуждения в центральной нервной системе, нейродегенеративной неупорядоченностью функций организма, нарушениями метаболических и физиологических процессов, иммунными отклонениями. Для повышения стрессоустойчивости необходимо поддержание в организме сбалансированности функций нервной, иммунной, эндокринной, антиоксидантной и монооксигеназной систем. Проведённый анализ данных литературы и результаты собственных исследований авторов дают основание заключить, что повышение стрессоустойчивости может быть достигнуто за счёт снижения уровня свободнорадикального окисления, оптимизации липидно-холестеролового и гормонального статуса при использовании антистрессовых препаратов нового поколения, к которым можно отнести органические соли лития. В отличие от многочисленных синтетических транквилизаторов и седативных веществ, воздействующих на нейрорецепторы, органические соли лития влияют на психическую активность, не затрагивая нейрорецепторный аппарат мозга, и включаются в регуляцию нейросинаптической активности за счёт ингибирования ферментов, ответственных за главный метаболический путь деградации гамма-аминомасляной кислоты - ингибирование ГАМК-декарбоксилазы и ГАМК-аминотрансферазы. Есть основания считать такой способ повышения стрессоустойчивости не только более эффективным, но и более физиологичным. Соединения органической соли лития с аскорбиновой кислотой комплексно воздействуют на нейрогуморальный статус и нормализуют его, при этом эффект от их применения является следствием снижения уровня свободнорадикального окисления, включая липопероксидацию. Ионы лития способствуют поддержанию нормальной возбудимости ЦНС и тонуса кровеносных сосудов за счёт снижения избыточной концентрации норадреналина в ЦНС и нормализации уровня ионов натрия в нервных и мышечных клетках. Комплексный характер нейролептического действия препаратов лития объясняется существованием нескольких путей воздействия ионов лития на физиологические процессы. При достаточной обеспеченности литием чувствительность мозга к дофамину повышается. Ионы лития оказывают влияние на гомеостаз нейротрансмиттеров, повышают синтез нейротрофических факторов и чувствительность клеток нервной системы к их воздействию. Дальнейшее изучение физиологического действия органических солей лития позволит расширить представления о механизме антистрессового действия препаратов этого типа и наметить реальные пути повышения стрессоустойчивости человека и животных, в лечении и профилактике депрессивных и субдепрессивных состояний

Динамика распределения лития в различных тканях после перорального приёма цитрата лития у крыс

Concentration time curves for whole blood and tissue homogenates of 11 different bio-substrates (brain, frontal lobe, heart, aorta, lungs, liver, kidneys, spleen, adrenal capsules, femur, urine) were obtained for lithium citrate at a dose of 1 000 mg/kg. In the course of a non-compartmental analysis of the concentrations dynamics in the whole blood the following values of the pharmacokinetic parameters of lithium citrate were obtained: Cmax = 54,1 mcg/l, Tmax = 1,50 h, Clast = 33,7 mcg/l, AUCt = 1776 mcg/l х h, MRTt = 22,7 h, Lz = 0,004 1/h, T1/2 = 146 h, CL = 0,014 l/h, Vd = 3,0. Lithium concentrations in the whole blood and in the brain frontal lobe were stable for at least 40...50 hours after overcoming the peak concentration. Multi-compartmental pharmacokinetic analysis showed that the stabilization of the lithium levels in the blood and in the brain is maintained due to the special lithium “depot” that includes brain, aorta, kidneys and femur.Для цитрата лития в дозе 1 000 мг/кг получены фармакокинетические кривые для цельной крови и гомогенатов тканей 11 различных биосубстратов (головной мозг, лобная доля головного мозга, сердце, аорта, лёгкие, печень, почки, селезёнка, надпочечники, бедренная кость, моча). В рамках бескамерного анализа динамики концентраций в цельной крови получены следующие значения фармакокинетических параметров цитрата лития: Cmax = 54,1 мкг/л, Tmax = 1,50 ч, Clast = 33,7 мкг/л, AUCt = 1776 мкг/лхч, MRTt = 22,7 ч, Lz = 0,004 1/ч, T1/2 = 146 ч, CL = 0,014 л/ч, Vd = 3,0 л. Концентрации лития в цельной крови и в лобной доли головного мозга оставались стабильными в течение, по крайней мере, 40-50 ч после прохождения пика концентрации. Многокамерный фармакокинетический анализ показал, что стабилизация уровней лития в крови и в головном мозге поддерживается за счёт специального «депо» лития, в состав которого входят головной мозг, аорта, почки и бедренная кости