Changes in the proteome of pea (Pisum sativum L.) seeds germinating under optimal and osmotic stress conditions and subjected to post-stress recovery

Plants growing under natural conditions are exposed to a variety of stresses, which can lead to undesirable changes in the physiological processes and yielding. These changes can be regulated at different levels, resulting in the synthesis of specific proteins which participate in the plant's response to stress. The purpose of this study was to determine changes in the accumulation of proteins in germinating pea (Pisum sativum L.) seeds under optimal and osmotic (short- and long-term) stress conditions as well as recovery following a short-term stress. For identification of the proteins, two-dimensional electrophoresis and mass spectrometry (MALDI-TOF) were employed. Germination in optimal conditions increased the accumulation of several proteins involved in glycolysis, Krebs cycle, synthesis of fatty acids, cell growth, cellular transport and detoxification. Osmotic stress, in turn, depressed the accumulation of proteins involved in glycolysis, synthesis of fatty acids, detoxication, methionine conversions, cellular transport, translation, growth control and of cytoskeletal proteins, but raised the accumulation of enzymes of the tricarboxylic acid cycle as well as proteins participating in signal transduction and protection (chaperones). One protein, 6a-hydroxymaackian-3-O-methyltransferase, which is involved in the synthesis of pisatin, was present only under osmotic stress conditions and recovery. Pisatin is synthesized mainly in response to microbiological infections and under stress conditions, indicating its key role in the acquisition of stress tolerance by plants

Analysis of the variability of human normal urine by 2D-GE reveals a "public" and a "private" proteome

International audienceThe characterization of the normal urinary proteome is steadily progressing and represents a major interest in the assessment of clinical urinary biomarkers. To estimate quantitatively the variability of the normal urinary proteome, urines of 20 healthy people were collected. We first evaluated the impact of the sample conservation temperature on urine proteome integrity. Keeping the urine sample at RT or at +4 degrees C until storage at -80 degrees C seems the best way for long-term storage of samples for 2D-GE analysis. The quantitative variability of the normal urinary proteome was estimated on the 20 urines mapped by 2D-GE. The occurrence of the 910 identified spots was analysed throughout the gels and represented in a virtual 2D gel. Sixteen percent of the spots were found to occur in all samples and 23% occurred in at least 90% of urines. About 13% of the protein spots were present only in 10% or less of the samples, thus representing the most variable part of the normal urinary proteome. Twenty proteins corresponding to a fraction of the fully conserved spots were identified by mass spectrometry. In conclusion, a "public" urinary proteome, common to healthy individuals, seems to coexist with a "private" urinary proteome, which is more specific to each individual

The hidden face of wine polyphenol polymerization highlighted by high resolution mass spectrometry

Polyphenols, including tannins and red anthocyanin pigments, are responsible for the color, taste, and beneficial health properties of plant-derived foods and beverages, especially in red wines. Known compounds represent only the emerged part of the "wine polyphenol iceberg". It is believed that the immersed part results from complex cascades of reactions involving grape polyphenols and yeast metabolites. We used a nontargeted strategy based on high-resolution mass spectrometry and Kendrick mass defect plots to explore this hypothesis. Reactions of acetaldehyde, epicatechin, and malvidin-3-O-glucoside, representing yeast metabolites, tannins, and anthocyanins, respectively, were selected for a proof-of-concept experiment. A series of compounds including expected and so-farunknown structures were detected. Random polymerization involving both the original substrates and intermediate products resulting from cascade reactions was demonstrated

Linking cocoa polyphenol composition to chocolate quality with Average-Mass-Spectra fingerprints

Linking cocoa polyphenol composition to chocolate quality with Average-Mass-Spectra fingerprints. CoCoTea 2019 (5. International Congress on Cocoa Coffee and Tea

Excreted/Secreted Proteins from Trypanosome Procyclic Strains

Trypanosoma secretome was shown to be involved in parasite virulence and is suspected of interfering in parasite life-cycle steps such as establishment in the Glossina midgut, metacyclogenesis. Therefore, we attempted to identify the proteins secreted by procyclic strains of T. brucei gambiense and T. brucei brucei, responsible for human and animal trypanosomiasis, respectively. Using mass spectrometry, 427 and 483 nonredundant proteins were characterized in T. brucei brucei and T. brucei gambiense secretomes, respectively; 35% and 42% of the corresponding secretome proteins were specifically secreted by T. brucei brucei and T. brucei gambiense, respectively, while 279 proteins were common to both subspecies. The proteins were assigned to 12 functional classes. Special attention was paid to the most abundant proteases (14 families) because of their potential implication in the infection process and nutrient supply. The presence of proteins usually secreted via an exosome pathway suggests that this type of process is involved in trypanosome ESP secretion. The overall results provide leads for further research to develop novel tools for blocking trypanosome transmission

Isolement et identification de peptides présents dans l'extrait hydrosoluble sapide de fromage de chèvre et de jambon cuit par chromatographie en phase liquide et spectrométrie de masse

*INRA Laboratoire de recherches sur les arômes BP 86510 21065 Dijon cedex (FRA) Diffusion du document : INRA Laboratoire de recherches sur les arômes BP 86510 21065 Dijon cedex (FRA) Diplôme : Dr. d'UniversitéLes fractions hydrosolubles de fromage de chèvre et de jambon cuit, contenant les peptides de moins de 1 000 g/mol, les acides aminés libres et les sels, ont une flaveur importante, proche de celle des aliments initiaux. L'objectif de cette étude était de développer une stratégie de purification et d'identification structurale de petits peptides supposes importants, au vu des données bibliographiques, pour la flaveur globale des aliments. La séparation effectuée sur le fromage de chèvre a nécessité plusieurs étapes. La fraction aqueuse est extraite par broyage et centrifugation puis ultrafiltrée afin d'éliminer les composes de masse supérieure à 1 000 g/mol. Cette fraction est alors soumise à une étape de purification par chromatographie d'exclusion stérique puis d'échange d'anions avant d'être finalement séparée par chromatographie sur phase inversée (c#1#8). Ces étapes ont été mises au point à l'échelle analytique puis adaptées à l'échelle préparatoire. Plusieurs méthodes combinées de spectrométrie de masse (electrospray, lsims, spectrométrie de masse en tandem après collisions à hautes énergies, avant et après méthylation des fonctions acides libres) ont permis de déterminer la séquence de 28 peptides naturellement présents dans le fromage de chèvre. Ces peptides, à une exception près, n'ont pas été décrits dans la littérature et ne proviennent pas de l'hydrolyse des caséines par une seule enzyme, mais sont d'une origine plus complexe. Du fait de leur petite taille (3 à 8 acides aminés) et de leur faible hydrophobicité, 17 peptides sont prédits non-amers. La méthode a ensuite été étendue, pour validation, au jambon cuit. Les résultats ont montré une moins grande diversité de peptides qui sont aussi plus polaires et de plus petite taille. La dernière partie de ce travail a concerné la nanofiltration, une technique de filtration sur membrane qui présente l'avantage de fractionner les petites molécules dans l'eau, avantage indéniable pour une analyse sensorielle ultérieure. Cette méthode a permis de séparer les peptides des acides aminés et des sels. Une analyse sensorielle, après incorporation de ces 3 différents composés dans une base fromagère, n'a pas permis de mettre en évidence un rôle particulier de la fraction peptidique dans la flaveur du produit

Isolement et identification de peptides présents dans l'extrait hydrosoluble sapide de fromage de chèvre et de jambon cuit par chromatographie en phase liquide et spectrométrie de masse

*INRA Laboratoire de recherches sur les arômes BP 86510 21065 Dijon cedex (FRA) Diffusion du document : INRA Laboratoire de recherches sur les arômes BP 86510 21065 Dijon cedex (FRA) Diplôme : Dr. d'UniversitéLes fractions hydrosolubles de fromage de chèvre et de jambon cuit, contenant les peptides de moins de 1 000 g/mol, les acides aminés libres et les sels, ont une flaveur importante, proche de celle des aliments initiaux. L'objectif de cette étude était de développer une stratégie de purification et d'identification structurale de petits peptides supposes importants, au vu des données bibliographiques, pour la flaveur globale des aliments. La séparation effectuée sur le fromage de chèvre a nécessité plusieurs étapes. La fraction aqueuse est extraite par broyage et centrifugation puis ultrafiltrée afin d'éliminer les composes de masse supérieure à 1 000 g/mol. Cette fraction est alors soumise à une étape de purification par chromatographie d'exclusion stérique puis d'échange d'anions avant d'être finalement séparée par chromatographie sur phase inversée (c#1#8). Ces étapes ont été mises au point à l'échelle analytique puis adaptées à l'échelle préparatoire. Plusieurs méthodes combinées de spectrométrie de masse (electrospray, lsims, spectrométrie de masse en tandem après collisions à hautes énergies, avant et après méthylation des fonctions acides libres) ont permis de déterminer la séquence de 28 peptides naturellement présents dans le fromage de chèvre. Ces peptides, à une exception près, n'ont pas été décrits dans la littérature et ne proviennent pas de l'hydrolyse des caséines par une seule enzyme, mais sont d'une origine plus complexe. Du fait de leur petite taille (3 à 8 acides aminés) et de leur faible hydrophobicité, 17 peptides sont prédits non-amers. La méthode a ensuite été étendue, pour validation, au jambon cuit. Les résultats ont montré une moins grande diversité de peptides qui sont aussi plus polaires et de plus petite taille. La dernière partie de ce travail a concerné la nanofiltration, une technique de filtration sur membrane qui présente l'avantage de fractionner les petites molécules dans l'eau, avantage indéniable pour une analyse sensorielle ultérieure. Cette méthode a permis de séparer les peptides des acides aminés et des sels. Une analyse sensorielle, après incorporation de ces 3 différents composés dans une base fromagère, n'a pas permis de mettre en évidence un rôle particulier de la fraction peptidique dans la flaveur du produit

Rapport du comité de suivi de thèse 1ère année de Marvin Soto (ED GAIA)

il s'agit d'un type de produit dont les métadonnées ne correspondent pas aux métadonnées attendues dans les autres types de produit : REPORTRapport du comité de suivi de thèse 1ère année de Marvin Soto (ED GAIA