Utvärdering av effekten av att lägga till trindsädesslag i finska växtföljder

Grain legumes are grown on less than 2% of the arable area of Europe, while large quantities of soybean and soymeal are imported for feed for pigs and poultry. Crop rotations need diversifying by adding grain legumes for soil health and for the break-crop effect, lowering pest, disease and weed pressures in the subsequent crop. The economic effects are of interest from adding legumes to crop rotations and can be evaluated by modelling crop rotations and comparing the means of the gross margins (GM) from the rotations. In Finland, cereal-based crop rotations dominate the important crop growing areas of Southwestern Finland. The most common rotation during a five-year-period can consist of a cereal monoculture with two or more cereal species. The largest potential for diversification in crop rotations can be found on pig, poultry, and cereal farms. Modelling of grain legumes in crop rotations has previously been done for Västra Götaland in Sweden, Brandenburg in Germany, Calabria Italy, eastern Scotland in the United Kingdom, and Sud-Muntenia i Romania. The aim of this work was to create modelled crop rotations for Southwestern Finland to evaluate the gross margin, NO3-N-leaching, and N2O-emissions of the crop rotations. Yields were modelled for a ten-year period following actual yield fluctuations. They were analysed and there were no significant differences in gross margin detected in the crop rotations, whether they were a legume or an all-cereal rotation. Significant differences were found in N2O-emissions between the crop rotationsTrindsäd odlas på mindre än 2% av den odlingsbara jorden i Europa, medan stora mängder av sojaböna och sojamjöl importeras till foder för svin- och fjäderfähushållning. Växtföljderna behöver diversifieras genom att lägga till baljväxter för jordhälsan och för effekten från avbrottsgrödor: att minska skadedjuren och sjukdomarna samt ogräsen i följande gröda. De ekonomiska effekterna av att lägga till baljväxter i växtföljderna är av ekonomiskt intresse, och kan utvärderas genom att göra modeller för växtföljder och genom att jämföra bruttomarginalerna för växtföljderna. I Finland dominerar de spannmålsbaserade växtföljderna i de viktigaste odlingsområdena i sydvästra Finland. Den vanligaste växtföljden under en femårsperiod är en spannmålsmonokultur med två eller fler spannmålsslag. Den största potentialen för diversifiering av växtföljder påträffas på svin- fjäderfä- och spannmålsgårdar. Modeller för baljväxter i växtföljder har gjorts för Västra Götaland i Sverige, Brandenburg i Tyskland, Kalabrien i Italien, östra Skottland i Storbritannien och Sud-Muntenia i Rumänien. Målet med detta arbete är fastställa växtföljder för sydvästra Finland samt utvärdera bruttomarginalen, NO3-N-läckage samt N2O-utsläpp för växtföljderna. Skördenivåer som följde verkliga skördefluktuationer, simulerades för en tioårs period. Dessa analyserades och det upptäcktes inte några signifikanta skillnader i bruttomarginalerna från de olika växtföljderna, vare sig de var med baljväxt i växtföljden eller endast med spannmål. Signifikanta skillnader fanns dock i N2O-utsläppen mellan växtföljderna

Effekten av situationsbundna faktorer i sexuellt utnyttjande av barn på depression : en metaanalys

Sexuellt utnyttjande av barn (SUB) har påvisats resultera i en mängd negativa utfall, så som depression. Eftersom inte alla som upplevt SUB utvecklar depression har man föreslagit att situationsbundna faktorer, så som offrets ålder när SUB startade, graden av fysisk kontakt, användningen av fysiskt våld i samband med SUB, mängden SUB och relationen mellan offret och förövaren påverkar förhållandet mellan SUB och depression. En metaanalys över den existerande litteraturen om effekten av situationsbundna faktorer på utvecklingen av depression utfördes. Samplets kön användes som modererande variabel i analyserna. Utöver detta utfördes också analyser av publikationsbias. För att inkluderas i metaanalysen skulle studierna vara referentgranskade, skrivna på engelska och undersöka effekten av minst en situationsbunden faktor på insjuknande i depression. Litteratursökningen resulterade i 73 relevanta artiklar. Dessa artiklar undersökte sammanlagt 14 058 individer som utsatts för sexuellt utnyttjande före 18 års ålder. Högre grad av fysisk kontakt, incestuöst SUB (jämfört med icke-incestuöst SUB), användningen av fysiskt våld (jämfört med SUB utan fysisk våld) samt högre frekvens, fler incidenter och längre varaktighet av SUB ökade risken för att insjukna i depression. Resultaten från den föreliggande metaanalysen överensstämmer med tidigare metaanalyser gjorda på situationsbundna faktorers inverkan på hälsoriskbeteende, social kompetens och psykosexuell ångest

The Importance of Being Promiscuous : Understanding enzyme function, specificity, and evolution through structure

Enzymes are known to be amazingly specific and efficient catalysts. However, many enzymes also have so-called promiscuous functions, i.e., they are able to catalyze other reactions than their main one. The promiscuous activities are often low, serendipitous, and under neutral selection but if conditions arise that make them beneficial, they can play an important role in the evolution of new enzymes. In this thesis, I present three studies where we have characterized different enzyme families by structural and biochemical methods. The studies demonstrate the occurrence of enzyme promiscuity and its potential role in evolution and organismal adaptation. In the first study, I describe the characterization of wild type and mutant HisA enzymes from Salmonella enterica. In the first part of this study, we could clarify the mechanistic cycle of HisA by solving crystal structures that showed different conformations of wild type HisA in complex with its labile substrate ProFAR (N´-[(5´-phosphoribosyl)formimino]-5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide). In the second part of this study, structures of mutant enzymes from a real-time evolution study provided us with an atomic-level description of how HisA had evolved a new function. The HisA mutants had acquired TrpF activity, either in addition to (bifunctional generalists) or instead of (TrpF specialists) their HisA activity. In the second study, I present the crystal structure and demonstrate promiscuous activity of the TrpC enzyme from Pseudomonas aeruginosa. The activity data demonstrates that the enzyme can turn over a substrate that lacks a substituent that was previously considered essential for catalysis. In the third study, I present the structural and functional characterization of SAM (S-Adenosyl methionine) hydrolases from bacteriophages. These enzymes were discovered because of their ability to rescue auxotrophic bacteria by inducing expression of a promiscuous bacterial enzyme.

The Importance of Being Promiscuous : Understanding enzyme function, specificity, and evolution through structure

Enzymes are known to be amazingly specific and efficient catalysts. However, many enzymes also have so-called promiscuous functions, i.e., they are able to catalyze other reactions than their main one. The promiscuous activities are often low, serendipitous, and under neutral selection but if conditions arise that make them beneficial, they can play an important role in the evolution of new enzymes. In this thesis, I present three studies where we have characterized different enzyme families by structural and biochemical methods. The studies demonstrate the occurrence of enzyme promiscuity and its potential role in evolution and organismal adaptation. In the first study, I describe the characterization of wild type and mutant HisA enzymes from Salmonella enterica. In the first part of this study, we could clarify the mechanistic cycle of HisA by solving crystal structures that showed different conformations of wild type HisA in complex with its labile substrate ProFAR (N´-[(5´-phosphoribosyl)formimino]-5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide). In the second part of this study, structures of mutant enzymes from a real-time evolution study provided us with an atomic-level description of how HisA had evolved a new function. The HisA mutants had acquired TrpF activity, either in addition to (bifunctional generalists) or instead of (TrpF specialists) their HisA activity. In the second study, I present the crystal structure and demonstrate promiscuous activity of the TrpC enzyme from Pseudomonas aeruginosa. The activity data demonstrates that the enzyme can turn over a substrate that lacks a substituent that was previously considered essential for catalysis. In the third study, I present the structural and functional characterization of SAM (S-Adenosyl methionine) hydrolases from bacteriophages. These enzymes were discovered because of their ability to rescue auxotrophic bacteria by inducing expression of a promiscuous bacterial enzyme.