114 research outputs found

    Les céramiques de raffinage du sucre en France : émergences et diffusions de part et d’autre de l’Atlantique du xvie au xixe s.

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    2018 constitue la seconde année de travail du projet collectif de recherche sur la culture matérielle associée à l’industrie sucrière métropolitaine et ultramarine durant la période moderne. Ce programme, faisant suite à une première triennale portant sur les céramiques de raffinage (cônes et pots à mélasse), se fixe pour objectif de caractériser puis replacer le matériel archéologique sucrier dans ses contextes de fabrications, de diffusions, d’emplois et de rejets, en résonance avec le déve..

    Saint-Hilaire-de-Villefranche – La Chapelle-des-Pots

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    Identifiant de l'opération archéologique : 204814 Date de l'opération : 2009 (PC) Ce programme d’analyses géochimiques vise à mettre en relation la production céramique régionale des périodes médiévales et modernes avec les sources supposées d’extraction de la matière première argileuse. Le corpus considéré s’oriente donc exclusivement sur de l’échantillonnage régional. Ceci afin de garantir d’une part la validité du traitement envisagé et, d’autre part, de pouvoir assurer son emploi vis-à-vi..

    Nanoimplantation and Purcell enhancement of single nitrogen-vacancy centers in photonic crystal cavities in diamond

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    We present the controlled creation of single nitrogen-vacancy (NV) centers via ion implantation at the center of a photonic crystal cavity which is fabricated in an ultrapure, single crystal diamond membrane. High-resolution placement of NV centers is achieved using collimation of a 5 keV-nitrogen ion beam through a pierced tip of an atomic force microscope. We demonstrate coupling of the implanted NV centers’ broad band fluorescence to a cavity mode and observe Purcell enhancement of the spontaneous emission. The results are in good agreement with a master equation model for the cavity coupling

    Novel polyomaviruses in mammals from multiple orders and reassessment of polyomavirus evolution and taxonomy

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    As the phylogenetic organization of mammalian polyomaviruses is complex and currently incompletely resolved, we aimed at a deeper insight into their evolution by identifying polyomaviruses in host orders and families that have either rarely or not been studied. Sixteen unknown and two known polyomaviruses were identified in animals that belong to 5 orders, 16 genera, and 16 species. From 11 novel polyomaviruses, full genomes could be determined. Splice sites were predicted for large and small T antigen (LTAg, STAg) coding sequences (CDS) and examined experimentally in transfected cell culture. In addition, splice sites of seven published polyomaviruses were analyzed. Based on these data, LTAg and STAg annotations were corrected for 10/86 and 74/86 published polyomaviruses, respectively. For 25 polyomaviruses, a spliced middle T CDS was observed or predicted. Splice sites that likely indicate expression of additional, alternative T antigens, were experimentally detected for six polyomaviruses. In contrast to all other mammalian polyomaviruses, three closely related cetartiodactyl polyomaviruses display two introns within their LTAg CDS. In addition, the VP2 of Glis glis (edible dormouse) polyomavirus 1 was observed to be encoded by a spliced transcript, a unique experimental finding within the Polyomaviridae family. Co-phylogenetic analyses based on LTAg CDS revealed a measurable signal of codivergence when considering all mammalian polyomaviruses, most likely driven by relatively recent codivergence events. Lineage duplication was the only other process whose influence on polyomavirus evolution was unambiguous. Finally, our analyses suggest that an update of the taxonomy of the family is required, including the creation of novel genera of mammalian and non-mammalian polyomaviruses.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

    A Solve-RD ClinVar-based reanalysis of 1522 index cases from ERN-ITHACA reveals common pitfalls and misinterpretations in exome sequencing

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    Purpose Within the Solve-RD project (https://solve-rd.eu/), the European Reference Network for Intellectual disability, TeleHealth, Autism and Congenital Anomalies aimed to investigate whether a reanalysis of exomes from unsolved cases based on ClinVar annotations could establish additional diagnoses. We present the results of the “ClinVar low-hanging fruit” reanalysis, reasons for the failure of previous analyses, and lessons learned. Methods Data from the first 3576 exomes (1522 probands and 2054 relatives) collected from European Reference Network for Intellectual disability, TeleHealth, Autism and Congenital Anomalies was reanalyzed by the Solve-RD consortium by evaluating for the presence of single-nucleotide variant, and small insertions and deletions already reported as (likely) pathogenic in ClinVar. Variants were filtered according to frequency, genotype, and mode of inheritance and reinterpreted. Results We identified causal variants in 59 cases (3.9%), 50 of them also raised by other approaches and 9 leading to new diagnoses, highlighting interpretation challenges: variants in genes not known to be involved in human disease at the time of the first analysis, misleading genotypes, or variants undetected by local pipelines (variants in off-target regions, low quality filters, low allelic balance, or high frequency). Conclusion The “ClinVar low-hanging fruit” analysis represents an effective, fast, and easy approach to recover causal variants from exome sequencing data, herewith contributing to the reduction of the diagnostic deadlock

    Rochelle (La) (Charente-Maritime). Les céramiques de raffinage du sucre à La Rochelle : caractérisation et variété des approvisionnements de la fin du xvie s. au xviiie s.

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    Cette étude collective, associant l’approche céramologique à l’analyse archéométrique, porte sur les céramiques de raffinage mises au jour à La Rochelle, où l’activité sucrière se développe dès la seconde moitié du xvie s. Il n’existe pour cette période que de très ponctuelles mentions de commandes à des potiers de Saintonge et de Vendée. Dès le dernier quart du xviie s. et durant le siècle suivant, les raffineurs rochelais font appel à des centres de production extra-régionaux, tels Sadirac ..

    Chappelle-des-Pots (La) (Charente-Maritime). Analyses archéométriques pour la mise en relation des céramiques médiévales charentaises avec les sources supposées d’exploitation d’argiles

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    Cette étude archéométrique s’attache à caractériser les productions céramiques charentaises des xiiie-xviie s. Le mobilier étudié concerne plus spécifiquement les poteries saintongeaises, fruit d’un artisanat local largement diffusé le long de la façade atlantique européenne dès la seconde moitié du xiiie s., puis vers le Nouveau Monde durant les xviie et xviiie s. Une première observation pétrographique de ce mobilier a permis de dresser les grandes caractéristiques minéralogiques des différ..

    Poitou-Charentes, Aquitaine, Centre, Île-de-France, Guadeloupe, Martinique. Les céramiques de raffinage dans les ports atlantiques : interactions économiques en métropole et avec les Antilles entre le xvie et le xixe s.

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    Faisant suite à des travaux récents de part et d'autre de l'Atlantique, dont une étude pluriannuelle sur la commune de La Rochelle, ce PCR ambitionne de mettre en commun, à l'échelle transatlantique, les données archivistiques ainsi que les corpus mobiliers relatifs aux céramiques de raffinage du sucre de canne. L'objectif de cette étude est donc de préciser l'origine et la variété des approvisionnements céramiques des pôles raffineurs antillais et de la façade atlantique, tributaires du savo..
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