Caractérisation de l’interaction entre Pseudomonas aeruginosa et Staphylococcus aureus lors d’infections pulmonaires en fibrose kystique

Les complications les plus importantes retrouvées en fibrose kystique sont les infections pulmonaires chroniques. Staphylococcus aureus et Pseudomonas aeruginosa sont les deux microorganismes les plus prévalents. Malgré leur co-isolement fréquent des poumons de patients, P. aeruginosa est antagoniste envers S. aureus in vitro et inhibe sa croissance; ces pathogènes ne devraient donc vraisemblablement pas arriver à causer des infections mixtes comme ils le font. Il semble donc y avoir une incohérence entre les observations cliniques et celles effectuées dans le cadre de modèles expérimentaux au laboratoire. En effet, des co-isolats cliniques ayant persisté dans le temps lors d’infections mixtes ne démontrent pas l’antagonisme typiquement décrit. Les interactions des co-isolats cliniques ont donc été étudiée dans le cadre de mes travaux de maîtrise. Deux modèles de co-culture in vitro ont été établis afin de caractériser les isolats étudiés. Dans ces modèles, les co-isolats ont démontré une absence ou une diminution de leur antagonisme, comparativement aux souches prototypiques. Par la suite, un modèle d’infection pulmonaire animal a été établi afin de vérifier leur interaction dans un contexte plus proche de la condition des patients atteints de la fibrose kystique. Étonnamment, les co-isolats comme les souches antagonistes ont accentué la colonisation de S. aureus. Par l'étude de plusieurs infections expérimentales mixtes causées par P. aeruginosa et S. aureus, nous avons observé que plus l'infection des poumons par P. aeruginosa est importante, plus la colonisation par S. aureus semble être facilitée. Bien qu’aucun facteur de virulence spécifique de P. aeruginosa ni les facteurs transcriptionnels les plus importants à la virulence de S. aureus n’aient été identifiés comme explication à ce phénomène, la surexpression des protéines eucaryotes ICAM-1 et ITGA-5 par P. aeruginosa pourraient être impliquée dans l’adhésion et l’internalisation cellulaire de S. aureus. Ainsi, P. aeruginosa pourrait modifier l’environnement in vivo d’une façon bénéficiant à S. aureus. Cette étude donne une première explication à la co-colonisation fréquente de ces deux bactéries pathogènes dans le contexte des infections pulmonaires chez les sujets fibrose kystique

Caractérisation de l’interaction entre Pseudomonas aeruginosa et Staphylococcus aureus lors d’infections pulmonaires en fibrose kystique

Les complications les plus importantes retrouvées en fibrose kystique sont les infections pulmonaires chroniques. Staphylococcus aureus et Pseudomonas aeruginosa sont les deux microorganismes les plus prévalents. Malgré leur co-isolement fréquent des poumons de patients, P. aeruginosa est antagoniste envers S. aureus in vitro et inhibe sa croissance; ces pathogènes ne devraient donc vraisemblablement pas arriver à causer des infections mixtes comme ils le font. Il semble donc y avoir une incohérence entre les observations cliniques et celles effectuées dans le cadre de modèles expérimentaux au laboratoire. En effet, des co-isolats cliniques ayant persisté dans le temps lors d’infections mixtes ne démontrent pas l’antagonisme typiquement décrit. Les interactions des co-isolats cliniques ont donc été étudiée dans le cadre de mes travaux de maîtrise. Deux modèles de co-culture in vitro ont été établis afin de caractériser les isolats étudiés. Dans ces modèles, les co-isolats ont démontré une absence ou une diminution de leur antagonisme, comparativement aux souches prototypiques. Par la suite, un modèle d’infection pulmonaire animal a été établi afin de vérifier leur interaction dans un contexte plus proche de la condition des patients atteints de la fibrose kystique. Étonnamment, les co-isolats comme les souches antagonistes ont accentué la colonisation de S. aureus. Par l'étude de plusieurs infections expérimentales mixtes causées par P. aeruginosa et S. aureus, nous avons observé que plus l'infection des poumons par P. aeruginosa est importante, plus la colonisation par S. aureus semble être facilitée. Bien qu’aucun facteur de virulence spécifique de P. aeruginosa ni les facteurs transcriptionnels les plus importants à la virulence de S. aureus n’aient été identifiés comme explication à ce phénomène, la surexpression des protéines eucaryotes ICAM-1 et ITGA-5 par P. aeruginosa pourraient être impliquée dans l’adhésion et l’internalisation cellulaire de S. aureus. Ainsi, P. aeruginosa pourrait modifier l’environnement in vivo d’une façon bénéficiant à S. aureus. Cette étude donne une première explication à la co-colonisation fréquente de ces deux bactéries pathogènes dans le contexte des infections pulmonaires chez les sujets fibrose kystique

Méthodes de recherche en contexte numérique : une orientation qualitative

Comprend des références bibliographiquesCet ouvrage a été publié grâce à une subvention de la Fédération des sciences humaines de concert avec le Prix d’auteurs pour l’édition savante, dont les fonds proviennent du Conseil de recherches en sciences humaines du Canada"Ce livre fait le point sur les avancées et les enjeux de la méthodologie qualitative en contexte numérique. Il offre un panorama des méthodes de recherche les plus récentes pour l’étude des phénomènes en ligne par les sciences sociales – communication, sociologie, anthropologie. Cet ouvrage foisonnant présente des textes allant des fondements épistémologiques aux méthodes visuelles pour l’étude d’objets numériques, en passant par les stratégies ethnographiques, la collecte et l’analyse de traces d’activités en ligne. Au-delà du manuel, l’ouvrage se distingue par son actualité, sa cohérence entre la théorie et la pratique ainsi que par sa résonance interdisciplinaire. Les chercheurs et les chercheuses en sciences humaines et sociales, les spécialistes d’Internet ainsi que les étudiants et les étudiantes intéressés à l’analyse d’un objet ou d’un fait social relié à l’univers numérique seront comblés notamment par la richesse des thèmes abordés, les types de corpus étudiés et les exemples d’enquêtes."--PU

<i>Staphylococcus aureus</i> Small-Colony Variants from Airways of Adult Cystic Fibrosis Patients as Precursors of Adaptive Antibiotic-Resistant Mutations

Prototypic Staphylococcus aureus and their small-colony variants (SCVs) are predominant in cystic fibrosis (CF), but the interdependence of these phenotypes is poorly understood. We characterized S. aureus isolates from adult CF patients over several years. Of 18 S. aureus-positive patients (58%), 13 (72%) were positive for SCVs. Characterization included genotyping, SCCmec types, auxotrophy, biofilm production, antibiotic susceptibilities and tolerance, and resistance acquisition rates. Whole-genome sequencing revealed that several patients were colonized with prototypical and SCV-related clones. Some clonal pairs showed acquisition of aminoglycoside resistance that was not explained by aminoglycoside-modifying enzymes, suggesting a mutation-based process. The characteristics of SCVs that could play a role in resistance acquisition were thus investigated further. For instance, SCV isolates produced more biofilm (p hemB) acquired resistance to ciprofloxacin and gentamicin faster than its parent counterpart after serial passages in the presence of sub-inhibitory concentrations of antibiotics. These results suggest a role for SCVs in the establishment of persistent antibiotic-resistant clones in adult CF patients

Rationally Designed Pyrimidine Compounds: Promising Novel Antibiotics for the Treatment of <i>Staphylococcus aureus</i>-Associated Bovine Mastitis

Staphylococcus aureus is one of the major pathogens causing bovine mastitis, and antibiotic treatment is most often inefficient due to its virulence and antibiotic-resistance attributes. The development of new antibiotics for veterinary use should account for the One Health concept, in which humans, animals, and environmental wellbeing are all interconnected. S. aureus can infect cattle and humans alike and antibiotic resistance can impact both if the same classes of antibiotics are used. New effective antibiotic classes against S. aureus are thus needed in dairy farms. We previously described PC1 as a novel antibiotic, which binds the S. aureus guanine riboswitch and interrupts transcription of essential GMP synthesis genes. However, chemical instability of PC1 hindered its development, evaluation, and commercialization. Novel PC1 analogs with improved stability have now been rationally designed and synthesized, and their in vitro and in vivo activities have been evaluated. One of these novel compounds, PC206, remains stable in solution and demonstrates specific narrow-spectrum activity against S. aureus. It is active against biofilm-embedded S. aureus, its cytotoxicity profile is adequate, and in vivo tests in mice and cows show that it is effective and well tolerated. PC206 and structural analogs represent a promising new antibiotic class to treat S. aureus-induced bovine mastitis