10 research outputs found
USE OF PHYLOGENETIC ANALYSIS TO IDENTIFY EVOLUTIONARILY SIGNIFICANT UNITS FOR THE ORANGE-FRONTED PARAKEET (EUPSITTULA CANICULARIS) IN MEXICO
In avian conservation biology, the subspecies concept based on reciprocal monophyly has been successfully applied to define priority populations through Evolutionarily Significant Units (ESUs). In México, the Orange-fronted Parakeet (Eupsittula canicularis) ranks first in illegal parrot trade. Its distribution ranges from southern Sonora to Chiapas on the Pacific slope, with populations representing three subspecies: E. c. canicularis, E. c. eburnirostrum, and E. c. clarae. To identify and propose ESUs to assist in conservation proposals for different populations, we assessed subspecific reciprocal monophyly via phylogenetic analyses and haplotype networks based on the mitochondrial DNA genes cytochrome oxidase I y NADH dehydrogenase 2. Feather and blood samples from specimens collected from nests in 2005 and 2007 were used. A total of five specimens of E. c. eburnirostrum from two localities in the state of Michoacán and four specimens of E. c. clarae from the state of Sinaloa were analyzed and no specimens of E. c. canicularis were included. The analyses included sequences obtained by us and those previously reported for E. aurea, E. cactorum, E. canicularis, E. nana, and E. pertinax. Both the phylogenetic analyses and haplotype networks suggest two groups that correspond to two subspecies of E. canicularis based on morphological and geographical evidence. Therefore these two subspecies are proposed as independent ESUs for conservation purposes
GENETIC DIVERSITY AND STRUCTURE OF THE WHITE-FRONTED PARROT (AMAZONA ALBIFRONS) IN MEXICO
In this study we assessed the genetic diversity and differentiation, and genealogical relationships in a group of individuals of A. albifrons distributed on the Pacific slope and in the Yucatan Peninsula, Mexico using mitochondrial DNA markers.Both range regions the species showed a high genetic diversity, suggesting population expansion from a small effective population size. Genealogical relationships revealed the presence of two genetic groups that have gone through different demographic events, one in the Yucatan Peninsula and the other in the Pacific slope. Considering that the individuals of the Yucatan Peninsula formed a genetic group exclusive to the region due to isolation events and a unique evolutionary history, we suggest its recognition as an evolutionarily significant unit (ESU). In addition, considering the presence of unique haplotypes in the localities of Sinaloa and Michoacan, we recommended that conservation plans focus on these regions
DEMOGRAPHIC HISTORY OF THE ORANGE-FRONTED PARAKEET (EUPSITTULA CANICULARIS) IN MEXICO
Abstract ∙ Molecular analyses can contribute to an understanding of the present and past demography of a species. In this study, we analyzed genetic diversity, intraspecific divergence patterns and historical demography of the Orange-fronted Parakeet (Eupsittula canicularis) using molecular data obtained from biological samples collected on the Pacific slope of México from Sinaloa to Guerrero. In addition, we analyzed the possible effect of Quaternary climatic changes on the population of this species. Based on genetic differentiation, and genealogical relationships analysis, we identified three genetic groups with overlapping geographical distributions on the north coast of Michoacán. Apparently, an ancestral group in the Balsas Basin underwent diversification and range expansion, initially towards the north coast of Michoacán and later northward along the Pacific slope to Sinaloa, and southward to the coast of Guerrero. Our results of skyline plot analysis suggest that a population expansion occurred during the Upper Pleistocene. The present analysis contributes to the knowledge of the phylogeographic pattern of E. canicularis in the tropical dry forest of western México, and identifies the Balsas Basin as an important center of diversification for the species.Resumen ∙ Historia demográfica del Periquito Frente-naranja (Eupsittula canicularis) en México Los análisis moleculares pueden contribuir a la comprensión de la demografía actual e histórica de una especie. En este estudio analizamos la diversidad genética, el patrón de divergencia intraespecífica y la demografía histórica del Periquito Frente-naranja (Eupsittula canicularis) utilizando datos moleculares obtenidos de muestras biológicas colectadas en la vertiente del Pacífico desde Sinaloa hasta Guerrero, México. Además, analizamos el posible efecto de los cambios climáticos del Cuaternario sobre la población de esta especie. Con base en el análisis de diferenciación genética y relaciones genealógicas, identificamos tres grupos genéticos que sobrelapan su distribución geográfica en la costa del norte de Michoacán. Aparentemente, un grupo ancestral con distribución en la Cuenca del Balsas sufrió diversificación y expansión de rango hacia la costa norte de Michoacán y por la vertiente del Pacífico hacia el norte hasta Sinaloa, y hacia el sur hasta la costa de Guerrero. Los resultados de los análisis de “skyline plot” sugieren una expansión de la población que ocurrió durante el Pleistoceno superior. El presente análisis contribuye al conocimiento del patrón filogeográfico de E. canicularis en el bosque tropical seco del oeste de México, e identifica a la cuenca del Balsas como un importante centro de diversificación para la especie
Caracterización de sistemas de producción del guajolote (Meleagris gallopavo gallopavo) de traspatio en las regiones fisiográficas del estado de Michoacán, México
En este trabajo se caracterizaron unidades de producción (UP) de traspatio de guajolote doméstico en las cinco regiones fisiográficas del estado de Michoacán. La meleagricultura de traspatio se lleva a cabo en todas las regiones fisiográficas del estado, con UP promedio de 7.20 a 14.80 aves. La relación hembra/macho es de 1.69 a 3.69 hembras por macho. De acuerdo a la coloración del plumaje, se encontraron las variedades Bronceado, Narrangansett, Palma Real, Negro español, Slate o plateado y Buffy (café o rojo) y otros colores que no se pudieron asignar a las variedades descritas. El peso en adultos mayores de 12 meses fue de 6.70 a 8.90 kg machos y 2.90 a 4.35 kg hembras. Las aves más pesadas se localizaron en las regiones de clima templado. Las hembras anidan 2 a 3 veces por año, produciendo de 12 a 15 huevos por evento con nacimientos de 10 a 12 pavipollos por evento. El 94.3 % de las unidades son no tecnificadas, con incorporación de algunas prácticas de manejo mejorado, como utilización de alimento balanceado en pavipollos hasta los dos meses de edad, poco o nulo esquema de vacunación y sin utilización de variedades "mejoradas", lo que indica que el tipo genético de guajolote es autóctono y es un fondo genético propio
Avances sobre la fisiopatogenia de la artritis reumatoide, ¿tiempo para una nueva teoría?
La Artritis Reumatoide (RA) es una de las tres enfermedades más comúnmente vistas en la consulta de Reumatología, siendo causa de una gran demanda en los servicios de salud globalmente. Su etiología permanece desconocida, y aunque se han hecho intentos por reconocer el blanco autoantigénico, éste aún no se conoce. La respuesta inmune de éstos pacientes se caracteriza por la participación de múltiples células y mecanismos efectores moleculares inflamatorios. Sin embargo, de esta complicada vista emerge un punto en común, éste es, el escape a los mecanismos de control inmunológico. El entendimiento de la razón y el sentido de la pérdida de tolerancia, la activación de linfocitos T auto-reactivos y la generación de autoanticuerpos serán puntos fundamentales para entender la fisiopatología de la artritis reumatoide y desarrollar estrategias terapéuticas inmuno-específicas
Diversidad genética y estructura de poblaciones de pavos domésticos mexicanos
En este estudio se analizaron niveles de diversidad y estructura genética de 144 guajolotes domesticados de poblaciones de traspatio de las cinco regiones fisiográficas de Michoacán y 16 guajolotes de dos poblaciones silvestres del centro de México utilizados como grupo externo de referencia, mediante siete loci de microsatélites. En guajolotes domesticados el promedio de heterocigosidad fue moderado (0.535 ± 0.285) comparado con silvestres (0.701 ± 0.068). Los guajolotes domesticados mostraron diferenciación entre poblaciones (FST= 0.122) a través de los loci. Los porcentajes de diferenciación estimados por Análisis de Varianza Molecular fueron bajos entre poblaciones (14 % domesticados y 6 % silvestres) y altos dentro de las poblaciones (86 % domesticados y 94 % silvestres). Los análisis de similitud mostraron la formación de un grupo con guajolotes silvestres y dos grupos basales con domesticados; un grupo basal incluyó tres subgrupos con poblaciones de las regiones Bajío, Faja Volcánica Transversal y Balsas, y un segundo grupo basal incluyó dos subgrupos con poblaciones de las regiones Sierra y Costa. El análisis de estructura genética mostró tres grupos para guajolotes domesticados y uno para silvestres. Una prueba de Mantel mostró aislamiento por patrón de distancia (r=0.84, P<0.05) entre poblaciones domesticadas. Los grupos genéticos de guajolotes domesticados fueron congruentes con los datos morfométricos previamente obtenidos de la misma población; un grupo correspondió a poblaciones de Bajío y Balsas (morfometría intermedia), el segundo grupo incluyó a la población de Faja Volcánica Transmexicana (grandes y pesados), y el tercer grupo correspondió a poblaciones de Sierra y Costa (ligeros y pequeños)
Diversidad y similitud genética entre poblaciones de guajolotes mexicanos utilizando un método de amplificación aleatorio de ADN polimórfico (RAPD)
Con el objetivo de abordar la caracterización de poblaciones de guajolotes de traspatio en México, en el presente trabajo se realizó un análisis molecular en seis poblaciones de guajolotes de traspatio, colectadas en los estados de Puebla y Michoacán, y una población de guajolotes de la línea comercial "Big-6 Large White". A partir de 65 muestras de sangre colectadas, se aisló el ADN y se realizaron ensayos tipo RAPD con un oligonucleótido con el que se obtuvieron 18 bandas polimórficas, con un taman,,o molecular de entre 220 a 1,700 pb. Las poblaciones de Michoacán presentaron altos valores de diversidad genética comparados con los de las poblaciones colectadas en el estado de Puebla. Se establecieron las relaciones de similitud, al observar que las poblaciones de Puebla se agrupan en una rama con valor de ¿bootstrap¿ de 88 %. La población perteneciente a la colección de guajolotes de la Posta Veterinaria de la UMSNH mostró una alta diferenciación genética con respecto al resto de las poblaciones (100 % valor bootstrap). La población comercial "Big-6 Large White" se agrupa estrechamente con la población colectada en el municipio de Turicato, Michoacán. Se demuestra que es posible diferenciar e inferir eventos históricos de las poblaciones analizadas en virtud de sus características genéticas
Análisis molecular de dos poblaciones de guajolotes nativos mexicanos y una línea comercial de pavos por rapd¸s
Even though native turkey (Maleagris gallopavo) is an economically and culturally important poultry species in Mexico, very little genomic information is available. In this study an approach to determine genetic fingerprints of native turkey and of "Big-6 Large White" commercial line was carried out. DNA from 20 individuals from two native populations (Posta Veterinaria and Puruarán) and from 10 of commercial line "Big-6 Large White" was isolated from blood samples and amplified through the RAPD method. A high degree of polymorphic fragments were observed between populations. Three highly conserved bands 920, 702 and 686 base pairs (bp) in size are suggested to be used as multilocus dominant markers. Analysis of 1198, 1282 and 462 bp bands suggest that the population from Puruarán, supposed to be native, probably developed from native x commercial crosses. Some other bands are present exclusively in commercial lines, and could be related to productivity traits.A pesar de que los guajolotes (Meleagris gallopavo) son aves de importancia económica y cultural en nuestro país, hay poca información sobre su genoma. En este trabajo se realizó un avance sobre el establecimiento de la huella de ADN de guajolotes nativos (M. gallopavo) y de la línea comercial "Big-6 Large White". A partir de muestras de sangre, se aisló el ADN de 20 individuos de dos poblaciones de guajolotes nativos (Puruarán y Posta Veterinaria) y de 10 individuos de una población de pavos de la línea comercial "Big-6 Large White", y se realizaron ensayos tipo RAPD. Los resultados mostraron un alto nivel de fragmentos polimórficos entre las poblaciones. Se encontraron tres bandas con un tamaño de 920, 702 y 686 pares de bases (pb), altamente conservadas, que podrían ser utilizadas como marcadores dominantes multilocus. El análisis de bandas con un tamaño de 1198, 1282 y 462 pb, sugiere que la supuesta población nativa de Puruarán puede ser el resultado de una cruza entre guajolotes nativos y pavos comerciales. Adicionalmente, algunas de las bandas presentes en los pavos comerciales, pueden estar relacionadas con características específicas de interés comercial
Caracterización de sistemas de producción del guajolote (meleagris gallopavo gallopavo) de traspatio en las regiones fisiográficas del estado de michoacán, méxico
In this study native turkey backyard production units (UP) in the five physiographic regions of Michoacan state were characterized. Backyard meleagriculture is present in all physiographic regions of the State, UP averages ranging from 7.20 to 14.80 birds. The female/male ratio found ranged from 1.69 to 3.69. According to plumage's color, the following varieties were observed: Bronze, Narrangansett, Royal Palm, Spanish Black, Slate or silver and Buffy (brown or red) and other colors that could not be allocated to the these varieties. Live weight of adult birds of more than 12 mo of age ranged between 6.70 and 8.90 kg in males and between 2.90 and 4.35 kg in females. The heavier birds were located in the temperate areas. Females nest 2 to 3 times per year 12 to 15 eggs in each nesting event, hatching rate was 10-12 poults/nesting. Practically all (94.3 %) UP are non technified, using only some improved management practices: balanced diets in chicks up to two months old, little or null vaccination plan, non use of improved varieties, which indicate that the genetic type of turkey is native and constitutes a real genetic fund.En este trabajo se caracterizaron unidades de producción (UP) de traspatio de guajolote doméstico en las cinco regiones fisiográficas del estado de Michoacán. La meleagricultura de traspatio se lleva a cabo en todas las regiones fisiográficas del estado, con UP promedio de 7.20 a 14.80 aves. La relación hembra/macho es de 1.69 a 3.69 hembras por macho. De acuerdo a la coloración del plumaje, se encontraron las variedades Bronceado, Narrangansett, Palma Real, Negro español, Slate o plateado y Buffy (café o rojo) y otros colores que no se pudieron asignar a las variedades descritas. El peso en adultos mayores de 12 meses fue de 6.70 a 8.90 kg machos y 2.90 a 4.35 kg hembras. Las aves más pesadas se localizaron en las regiones de clima templado. Las hembras anidan 2 a 3 veces por año, produciendo de 12 a 15 huevos por evento con nacimientos de 10 a 12 pavipollos por evento. El 94.3 % de las unidades son no tecnificadas, con incorporación de algunas prácticas de manejo mejorado, como utilización de alimento balanceado en pavipollos hasta los dos meses de edad, poco o nulo esquema de vacunación y sin utilización de variedades "mejoradas", lo que indica que el tipo genético de guajolote es autóctono y es un fondo genético propio
Phase Angle and Nutritional Status: The Impact on Survival and Health-Related Quality of Life in Locally Advanced Uterine Cervical Cancer
The phase angle, an indicator of muscle mass status and membrane cell integrity, has been associated with low survival, poorer clinical outcomes, and worse quality of life among cancer patients, but information on women with uterine cervical cancer (UCCa) is scarce. In this prospective study, we used a bioelectrical impedance analyzer to obtain the PA of 65 women with UCCa. We compared the health-related quality of life and inflammatory and nutritional indicators between low PA and normal PA. The mean age was 52 ± 13. The low PA and normal PA groups differed in terms of the C-reactive protein (15.8 ± 19.6 versus 6.82 ± 5.02, p = 0.022), glucose (125.39 ± 88.19 versus 88.78 ± 23.08, p = 0.021), albumin (3.9 ± 0.39 versus 4.37 ± 0.30, p = 0.000), EORTC QLQ-C30 loss of appetite symptom scale score (33.33 (0.0–100.00) versus 0.0 (0.0–0.0), p = 0.005), and EORTC QLQ-CX24 menopausal symptoms scale score (0.0 (0.0–33.33) versus 0.0 (0.0–100.0), p = 0.03). The main finding of the present study is the interaction between PA and obesity as critical cofactors in the UCCa adeno and adenosquamous histologic variants, to a greater extent than cervical squamous cell carcinoma