Survey of the genetic variability of populations of <i>Ruditapes philippinarum</i> from tre Gulf of Olbia (N-E Sardinia) by microsatellites = Indagine sulla variabilità genetica di popolazioni di <i>Ruditapes philippinarum</i> provenienti dal golfo di Olbia (N-E Sardegna)

Genetic variability was investigated at six microsatellite loci of the Manila clam Ruditapes philippinarum (Adams &amp; Reeve, 1850) (Bivalvia) from the Gulf of Olbia (N-E Sardinia) and Sacca di Goro (N Adriatic Sea). We found no significant differentiation among Sardinian samples and between those and the Adriatic one, which suggests the absence of a founder effect in Sardinian population

Gli ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) come strumento molecolare per l'identificazione tassonomica di ciprinodontiformi mediterranei

Il genere Valencia (Valenciidae) ha una distribuzione disgiunta, con V. hispanica presente in habitat dulciacquicoli o leggermente salmastri dalla Catalogna meridionale all'estremità meridionale del Golfo di Valencia e V. letourneuxi segnalata nell'Albania meridionale e nella Grecia occidentale. Nel presente lavoro sono stati analizzati e confrontati i profili ISSR dei seguenti esemplari: 2 pesci di dubbia collocazione tassonomica, provenienti da una popolazione mantenuta in cattività da un allevatore amatoriale danese di pesci da acquario, 2 individui di V. hispanica, 5 di V. letourneuxi e 5 dell'altro ciprinodontiforme Aphanius fasciatus. Lo scopo del lavoro è stato quello di 1) saggiare l'efficacia degli ISSR nel risolvere problemi di tipo tassonomico e 2) verificare l'ipotesi di appartenenza dei due esemplari di dubbia collocazione tassonomica ad una delle due specie di Valencia. L'estrazione del DNA è stata effettuata mediante kit di estrazione, utilizzando porzioni di pinna caudale (circa 5 mg ciascuna) fissate in etanolo. Sono stati utilizzati 9 primer che hanno fornito complessivamente 101 loci. Il confronto dei profili ISSR, e l'analisi dei cluster basata sulla matrice delle dissimilarità di Rogers e Tanimoto hanno consentito di assegnare gli individui di dubbia identità a V. hispanica. Gli ISSR si sono rivelati uno strumento efficace per la risoluzione di problemi di tipo tassonomico

Population structure of the <i>Monocelis lineata</i> (Proseriata, Monocelididae) species complex assessed by phylogenetic analysis of the mitochondrial Cytochrome c Oxidase subunit I (<i>COI</i>) gene

Monocelis lineate consists of a complex of sibling species, widespread in the Mediterranean and Atlantic Ocean. Previous genetic analysis placed in evidence at least four sibling species. Nevertheless, this research was not conclusive enough to fully resolve the complex or to infer the phylogeny/phylogeography of the group. We designed specific primers aiming at obtaining partial sequences of the mtDNA gene Cytochrome c Oxidase subunit I (COI) of M. lineate, and have identified 25 different haplotypes in 32 analyzed individuals. The dendrogram generated by Neighbor- Joining analysis confirmed the differentiation between Atlantic and Mediterranean siblings, as well as the occurrence of at least two Mediterranean sibling species. Thus validated, the method here presented appears as a valuable tool in population genetics and biodiversity surveys on the Monocelis lineate complex

Analisi della struttura genetica di <i>Hediste diversicolor</i> (Polychaeta, Nereididae) nel Mediterraneo occidentale mediante marcatori ISSR

La struttura genetica del polichete Hediste diversicolor del Mediterraneo occidentale è stata studiata utilizzando gli ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) come marcatori genetici. Sono stati raccolti 30 individui in ciascuna delle seguenti località: Stagno di Calich (Sardegna N-O), Baia di Figari (Corsica S-O), Migliacciaru (Corsica E), Fiume Morto (Toscana N-O) e Coltano (Toscana N-O). L'MDS applicato alle distanze genetiche individuali ha mostrato elevata diversità tra gli individui, ma non ha messo in evidenza alcuna sottostrutturazione genetica nelle popolazioni. Un forte segnale della divergenza genetica tra le popolazioni è dato dal fatto che il 37% del numero totale di bande rilevato è costituito da bande private, cioè esclusive di una popolazione. La varianza genetica, analizzata mediante AMOVA, è risultata equamente ripartita nelle componenti intra- e inter-popolazione (rispettivamente 46.9% e 53.1%). La Φ-statistica ha evidenziato la divergenza genetica tra le popolazioni (Φst = 0.469, P&lt;0.001). La notevole divergenza genetica tra le popolazioni di H. diversicolor è determinata in primo luogo dalla frammentazione naturale dell'habitat che produce isolamento con virtuale assenza di flusso genico tra le popolazioni. L'assenza di sottostrutturazione delle popolazioni, invece, conferma le osservazioni fatte in passato sulla dispersione degli adulti e delle postlarve all'interno dei singoli biotopi

Mitochondrial DNA reveals genetic structuring of <i>Pinna nobilis</i> across the Mediterranean Sea

Pinna nobilis is the largest endemic Mediterranean marine bivalve. During past centuries, various human activities have promoted the regression of its populations. As a consequence of stringent standards of protection, demographic expansions are currently reported in many sites. The aim of this study was to provide the first large broad-scale insight into the genetic variability of P. nobilis in the area that encompasses the western Mediterranean, Ionian Sea, and Adriatic Sea marine ecoregions. To accomplish this objective twenty-five populations from this area were surveyed using two mitochondrial DNA markers (COI and 16S). Our dataset was then merged with those obtained in other studies for the Aegean and Tunisian populations (eastern Mediterranean), and statistical analyses (Bayesian model-based clustering, median-joining network, AMOVA, mismatch distribution, Tajima’s and Fu’s neutrality tests and Bayesian skyline plots) were performed. The results revealed genetic divergence among three distinguishable areas: (1) western Mediterranean and Ionian Sea; (2) Adriatic Sea; and (3) Aegean Sea and Tunisian coastal areas. From a conservational point of view, populations from the three genetically divergent groups found may be considered as different management units

Determinazione specifica di individui giovanili del genere <i>Patella</i> fissati su adulti di <i>Patella ferruginea</i> (Gmelin, 1791), tramite utilizzo del DNA barcoding = Specific attribution of juveniles belonging to tehe genus <i>Patella</i> set on adults of <i>Patella ferruginea</i> (Gmelin, 1791) by means of DNA barcoding

A genetic analysis was performed on two individuals belonging to the genus Patella recovered as epibionti on P. ferruginea (Gmelin, 1791). The survey was carried out by means of the Cytochrome c Oxidase (COI) Folmer’s region. Results obtained evidenced the occurrence of a juveniles of P. ferruginea and one of P. rustica, and confirmed that COI is an invaluable tool for the DNA barcoding

Studio preliminare sulla struttura genetica di <i>Patella ferruginea</i> Gmelin, 1791 (Mollusca, Gastropoda), nell'Area Marina Protetta (AMP) dell'Isola dell'Asinara mediante ISSR

L'istituzione delle AMP consente adeguate misure di conservazione dell'ambiente marino. L'efficacia di tale protezione dovrebbe essere verificata attraverso programmi di monitoraggio, utilizzando specie che siano facili da identificare e analizzare in modo non distruttivo. In tale contesto è stata individuata Patella ferruginea, che risulta essere l'invertebrato marino più minacciato del Mediterraneo occidentale. L'obiettivo dello studio è quello di stimare i livelli di diversità genetica e flusso genico di alcune popolazioni di P. ferruginea dell'AMP dell'Isola dell'Asinara. È stato prelevato il materiale biologico di 10 esemplari da 3 diversi siti, tramite escissione di piccole quantità di tessuto muscolare, seguendo un protocollo da noi sperimentato sulla specie P. ulyssiponensis. Il protocollo assicura la sopravvivenza degli esemplari campionati. L'analisi genetica è stata condotta attraverso la genotipizzazione di un subcampione di individui per ciascun sito utilizzando la tecnica ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat). I risultati indicano una notevole uniformità genetica tra gli individui appartenenti a ciascun sito, contrapposta ad una moderata eterogeneità genetica tra gli individui appartenenti ai tre siti. Questi fatti suggeriscono inoltre che P. ferruginea possa aver subito erosione genetica negli anni passati in relazione alla sua raccolta, e che i livelli di flusso genico non siano elevati anche su piccola scala geografica

La Biodiversità degli invertebrati marini è sottostimata? Il caso di <i>Ophelia bicornis</i> e <i>Ophelia barquii</i> (Annelida, Polychaeta)

Negli ultimi anni gli studi molecolari condotti su invertebrati marini hanno contribuito fortemente alla valutazione della biodiversità locale mediante la risoluzione di complessi casi di tassonomia. Ophelia bicornis s.l. è un polichete che vive in habitat intertidali sabbiosi delle coste mediterranee ed europee atlantiche, la cui sistematica è ancora in fase di definizione. Un nostro precedente studio effettuato tramite alloenzimi ha suggerito che O. bicornis s.l. è costituita da due specie: O. bicornis s.s. e O. barquii, rispettivamente riconducibili a morfotipi con 6 e 5 paia di nefridiopori. Nel presente lavoro è stata abbinata l'analisi morfologica (conteggio dei nefridiopori) con quella genetica (genotipizzazione tramite ISSR). Sono stati analizzati 6 campioni (n=50) di O. bicornis s.l. provenienti da 3 località sarde e 3 siciliane. I dati morfologici indicano una diversa distribuzione dei due morfotipi, che sono stati rilevati in simpatria, sia in località sarde che siciliane. L'analisi genetica effettuata tramite gli ISSR ripropone la distinzione tra individui con 6 e 5 paia di nefridiopori, confermando la precedente separazione di O. bicornis s.l. in due specie distinte. Il presente lavoro i) rappresenta un'ulteriore conferma del fatto che i livelli di biodiversità negli invertebrati marini sono attualmente sottostimati e ii) pone le basi per uno studio più accurato delle caratteristiche dell'habitat di queste specie

Analysis of the genetic variability of <i>Patella ferruginea</i> Gmelin, 1791 (Gastropoda: Patellidae) populations from the North-East Sardinia = Analisi della variabilità genetica in popolazioni di <i>Patella ferruginea</i> Gmelin, 1791 (Gastropoda: Patellidae) provenienti dalla Sardegna nord-orientale

The mollusc Patella ferruginea (Gastropoda, Patellidae), endemic to the Medilerranean, is the most endangered marine species on the list of the European Couneil Directive 92/43/EEC and it is presently under serious risk of extinction. This research was aimed to unravel the genetic variability of some Sardinian populations sampled on the North-Eastern coast, in order to shed light on their status of conservation

The Role of a marine protected area in safeguarding the genetic diversity of rare species: the case of <i>Patella ferruginea</i> Gmelin, 1791 (Gastrpoda: Patellidae) = Il Ruolo delle aree marine protette per la salvaguardia della diversità genetica di specie rare: il caso di <i>Patella ferruginea</i> Gmelin, 1791 (Gastropoda: Patellidae)

Patella ferruginea (Gastropoda: Patellidae) is an endangered marine gastropod, distributed on the western Mediterranean coasts, whose range has progressively contracted, due to intense human exploitation. Our attention focused on its genetic structure, in order to gather information about levels of genetic variability of P. ferruginea from the Asinara Marine Protected Area and a neighbouring non-protected area