Il genere Valencia (Valenciidae) ha una distribuzione disgiunta, con V. hispanica presente in habitat dulciacquicoli o leggermente salmastri dalla Catalogna meridionale all'estremità meridionale del Golfo di Valencia e V. letourneuxi segnalata nell'Albania meridionale e nella Grecia occidentale. Nel presente lavoro sono stati analizzati e confrontati i profili ISSR dei seguenti esemplari: 2 pesci di dubbia collocazione tassonomica, provenienti da una popolazione mantenuta in cattività da un allevatore amatoriale danese di pesci da acquario, 2 individui di V. hispanica, 5 di V. letourneuxi e 5 dell'altro ciprinodontiforme Aphanius fasciatus. Lo scopo del lavoro è stato quello di 1) saggiare l'efficacia degli ISSR nel risolvere problemi di tipo tassonomico e 2) verificare l'ipotesi di appartenenza dei due esemplari di dubbia collocazione tassonomica ad una delle due specie di Valencia. L'estrazione del DNA è stata effettuata mediante kit di estrazione, utilizzando porzioni di pinna caudale (circa 5 mg ciascuna) fissate in etanolo. Sono stati utilizzati 9 primer che hanno fornito complessivamente 101 loci. Il confronto dei profili ISSR, e l'analisi dei cluster basata sulla matrice delle dissimilarità di Rogers e Tanimoto hanno consentito di assegnare gli individui di dubbia identità a V. hispanica. Gli ISSR si sono rivelati uno strumento efficace per la risoluzione di problemi di tipo tassonomico