Comparative evaluation of genetic risk models of reproductive disorders caused by MTHFR, MTRR, MTR1 gene polymorphism.

The scientific literature presents contradictory data about influence of folate metabolism genes polymorphism on development of risk of reproductive disorders. The aim of the study was to determine the role of MTHFR, MTRR, MTR1 gene polymorphism in the development of reproductive disorders by evaluation of genetic risk models of inheritance. 658 patients with reproductive disorders from all Ukrainian regions were examined. The data from population studies presented in the online resource (1000 genomes) served as comparison group. There were no reliable risk models for polymorphic variants of MTHFR gene. We identified 3 and 4 significant inheritance models for MTRR and MTR1 genes respectively. The best inheritance models were the dominant model for MTRR gene and the additive model for MTR1 gene. The polymorphic variants frequencies of the studied genes did not differ among men and women. Further analyse is necessary for evaluation of genetic polymorphism and intergenic interactions influence on reproductive disorders risk, taking into account folate metabolism indices and exogenous factors

Comparative evaluation of genetic risk models of reproductive disorders caused by MTHFR, MTRR, MTR1 gene polymorphism.

The scientific literature presents contradictory data about influence of folate metabolism genes polymorphism on development of risk of reproductive disorders. The aim of the study was to determine the role of MTHFR, MTRR, MTR1 gene polymorphism in the development of reproductive disorders by evaluation of genetic risk models of inheritance. 658 patients with reproductive disorders from all Ukrainian regions were examined. The data from population studies presented in the online resource (1000 genomes) served as comparison group. There were no reliable risk models for polymorphic variants of MTHFR gene. We identified 3 and 4 significant inheritance models for MTRR and MTR1 genes respectively. The best inheritance models were the dominant model for MTRR gene and the additive model for MTR1 gene. The polymorphic variants frequencies of the studied genes did not differ among men and women. Further analyse is necessary for evaluation of genetic polymorphism and intergenic interactions influence on reproductive disorders risk, taking into account folate metabolism indices and exogenous factors

Genetic predictors of development risk of combined caries and chronic catarrhal gingivitis course in children

The purpose of this work was to determine the role of the genetic component in the development of the combined course of caries and gingivitis in children. Materials and methods: The study involved 49 schoolchildren aged 7–15 years. Dental examination was carried out according to the generally accepted method. The children were divided according to the carious process activity into two groups: 0–4 (compensated caries-comparison group) and 5–8 (subcompensated caries – main group). Chronic generalized catarrhal gingivitis (СGCG) was detected in these groups with frequency: 8 (29.62 %) of 27 patients and 15 (68.18 %) of 22 patients, respectively. Biochemical analysis of the oral fluid parameters, which included an assessment of calcium, phosphorus content, the activity of acid and alkaline phosphatases, malondialdehyde (MDA), catalase, was carried out for children. Molecular genetic research was based on the genomic DNA isolation from the buccal epithelium. To determine the polymorphic variants of GSTT1, GSTM1 genes the method of multiplex polymerase chain reaction (PCR) was used and for the IL-1β (C3953T, rs1143634) and MMP13 (A77G, rs2252070) gene s– PCR followed by restriction fragment length polymorphism analysis. Results. The development chance of caries in children was associated with the GSTM1 gene deletion polymorphism in combination with the 3953CT polymorphic variant in the IL-1β gene. It was shown, that the development of caries was associated with СGCG, and this combined dental pathology was more reliably detected in patients with 3953СT and 3953TT genotypes in the IL-1β gene. Significantly increased index of malonic dialdehyde and decreased catalase activity in the presence of 3953СT and 3953TT polymorphic variants in the IL-1β gene are determined. Conclusions. Genetic predictors of increased development chance of combined dental pathology – subcompensated caries and СGCG, pathogenetically combined with increased activity and intensity of periodontal tissue damage among children, were revealed

Determination of frequencies of alleles, associated with the pseudodeficiency of lysosomal hydrolases, in population of Ukraine

The pseudodeficiency of lysosomal hydrolases described as a significant reduction in enzyme activi­ty in vitro in clinically healthy individuals, can lead to diagnostic errors in the process of biochemical analysis of lysosomal storage disease in case of its combination with pathology of another origin. Pseudodeficiency is mostly caused by some non-pathogenic changes in the corresponding gene. These changes lead to the in vitro lability of the enzyme molecule, whereas in vivo the enzyme retains its functional activity. To assess the prevalence of the most common lysosomal hydrolases pseudodeficiency alleles in Ukraine, we have determined the frequency of alleles c.1055A>G and c.* 96A>G in the ARSA gene, substitutions c.739C>T (R247W) and c.745C>T (R249W) in the HEXA gene, c.1726G>A (G576S) and c.2065G>A (E689K) in the GAA gene, c.937G>T (D313Y) in the GLA1 gene and c.898G>A (A300T) in the IDUA gene in a group of 117 healthy individuals from different regions of the country and 14 heterozygous carriers of pathogenic mutations in the HEXA gene (parents of children with confirmed diagnosis of Tay-Sachs disease). The total frequency of haplotypes, associated with arylsulfatase A pseudodeficiency, in healthy people in Ukraine (c.1055G/c.*96G and c.1055G/c.*96A haplotypes) was 10.3%. The frequency of c.739C>T (R247W) allele, associated with hexo­saminidase A pseudodeficiency, among Tay-Sachs carriers from Ukraine was 7.1%. The total frequency of α-glucosidase pseudodeficiency haplotypes in healthy individuals in Ukraine (c.1726A/c.2065A and c.1726G/c.2065A haplotypes) was 2.6%. No person among examined individuals with the substitution c.937G>T (D313Y) in the GLA1 gene and c.898G>A (A300T) in the IDUA gene was found. The differential diagnostics of lysosomal storage diseases requires obligatory determination of the presence of the pseudodeficiency alleles, particularly the ones with high incidence in the total population. Ignoring phenomenon of pseudodeficiency may lead to serious diagnostic errors

Study on association of the polymorphic variants of ACE (I/D), AT2R1 (A1166C), TNF-α (G308A), MTHFR (C677T) genes and their combinations with the risk of development of perinatal pathology and gestation reduction

Aim. To study the association of the polymorphic variants of ACE (I/D), AT2R1 (A1166C), TNF-alpha (G308A), MTHFR (C677T) genes and their combinations with the risk of perinatal pathology and gestation reduction. Methods. The polymorphic variants of genes were analyzed by PCR and RFLP in 235 newborns with severe perinatal pathology and 110 clinically healthy term newborns. Results. An increased risk of severe perinatal pathology was associated with such genotypes: DD and ID (ACE), 1166AC, 1166CC (AT2R1), 677CT (MTHFR), 308AA and 308AG (TNF-alpha), this risk for homozygotes is almost 2-fold higher than for heterozygotes. Reduction of terms of gestation is associated with the genotype 677TT (MTHFR), and resistance to diseases in the perinatal period – with the genotype II (ACE) and 1166AA (AT2R1), 677CC (MTHFR) and the 308GG (TNF-alpha), particularly when combined. Conclusions. The identified associations evidence the role of polymorphic variants of ACE, AT2R1, TNF-alpha, MTHFR genes in the development of severe perinatal pathology and can be used for its early prediction with subsequent correction of treatment

ОПТИМІЗАЦІЯ ВИБОРУ МЕТОДУ ЕНДОСКОПІЧНОЇ ОПЕРАЦІЇ У ПАЦІЄНТІВ З НЕПЛІДДЯМ , ОБУМОВЛЕНИМ СИНДРОМОМ ПОЛІКІСТОЗНИХ ЯЄЧНИКІВ.

The subject of this study – the restoration of reproductive health in women with endocrine form of infertility caused by polycystic ovary syndrome, by optimizing the method of endoscopic surgery. The level of reproductive hormones in the group of women for surgical treatment was characterized by a significant increase 2.4 times of total testosterone (p<0.001). So, the hormonal profile of women with PCOS is marked by an imbalance of reproductive hormones with higher androgen production, leading to the formation of cystic follicles with atresia and teka hyperplasia, stroma and consolidation of protein membrane of the ovaries. Comparison of two methods of surgery indicates that more pronounced normalizing effect on the production of reproductive hormones has decapsulation method of ovarian 1/3.В работе представлены результаты восстановления репродуктивной функции у женщин с эндокринной формой бесплодия, обусловленного синдромом поликистозных яичников, путем оптимизации метода эндоскопического хирургического лечения. Уровень репродуктивных гормонов в группе женщин до оперативного лечения характеризовался достоверным повышением в 2,4 раза содержания общего тестостерона (р<0,001). Гормональный профиль женщин с СПКЯ отмечается дисбалансом репродуктивных гормонов с повышенной продукцией андрогенов, которые приводят к формированию кистозной атрезии фолликулов с гиперплазией тека клеток, стромы и уплотнения белковой оболочки яичников. Сравнение двух методов оперативного вмешательства показало преимущество декапсуляции 1/3 яичников, как наиболее обоснованной патогенетически, что способствует восстановлению двухфазного цикла, овуляции и реализации репродуктивной функции пациенток.У роботі представлені результати відновлення репродуктивної функції у жінок з ендокринною формою безпліддя, обумовленого синдромом полікістозних яєчників, шляхом оптимізації методу ендоскопічного хірургічного лікування. Рівень репродуктивних гормонів у групі жінок до оперативного лікування характеризувався достовірним підвищенням у 2,4 раза вмісту загального тестостерону (р<0,001). Гормональний профіль жінок із СПКЯ відзначається дисбалансом репродуктивних гормонів з підвищеною продукцією андрогенів, які призводять до формування кістозної атрезії фолікулів з гіперплазією тека клітин, строми і ущільнення білкової оболонки яєчників. Порівняння двох методів оперативного втручання показало перевагу декапсуляції 1/3 яєчників, як найбільш обґрунтованої патогенетично, що сприяє відновленню двофазного циклу, овуляції і реалізації репродуктивної функції пацієнток

ГЕНЕТИЧНО ОБУМОВЛЕНІ ПОРУШЕННЯ ФОЛАТНОГО ОБМІНУ У НОВОНАРОДЖЕНИХ З ПЕРИНАТАЛЬНОЮ АСФІКСІЄЮ ТЯЖКОГО СТУПЕНЯ

The paper deals with the influence of genetic polymorphisms on the features of folate metabolism and antioxidant protection in newborns with critical conditions in neonatal period. The objective of the study was to examine changes in folate metabolism, antioxidant defense indicators and their relationship with genetic polymorphism to determine the contribution of genetically determined folate metabolism disorders in the development of critical conditions in newborns. To perform the work 45 infants were examined (gestational age 38-40 weeks) with critical conditions of the early neonatal period (the main group) and 30 infants (gestational age 38-40 weeks) with physiological early neonatal period (the comparison group). Examined children were in obstetric and neonatal intensive care units of the Regional Maternity Hospital in Poltava. There were significant differences in the indices of homocysteine, folate and serum glutathione transferase activity in newborns of the examined groups during the first three days of life, with varying strength correlation found. Dynamics of the indices of folate metabolism on the third day of life as compared to the first day was significantly different in the newborns from the main groups and correlated with the indices of antioxidant protection. The peculiarities of the dynamics of folate metabolism indices, characterizing antioxidant and folate dependent metabolic processes in the perinatal period, were determined. The analysis of the intergenic interaction impact on the development of  folate metabolism disorders and critical conditions revealed association with polymorphisms of GSTT1, GSTM1, MTHFR, ACE, TNF-a, AT2R1 genes. Synergistic interaction between polymorphic variants of genes GSTT1 and GSTM1, MTHFR and ACE was found. Polymorphic variants of these genes associated with changes in the dynamics of folate metabolism indicators. In the course of the study the best predictive model of intergenic interaction in the development of critical conditions and genetically determined folate metabolism disorders in newborns was found (predictive value - 91.47%). Analysis of unfavorable polymorphic variants in GSTT1, GSTM1, MTHFR, ACE, TNF-a, AT2R1 genes is a perspective one to predict unfavourable early neonatal period in newborns in clinical practice.Статья посвящена изучению влияния генетического полиморфизма на особенности фолатного обмена и антиоксидантной защиты у новорожденных с перинатальной асфиксией тяжелой степени. Целью исследования было изучение изменений показателей фолатного обмена, антиоксидантной защиты и их взаимосвязи с генетическим полиморфизмом для определения вклада генетически обусловленных нарушений фолатного обмена в развитие перинатальной асфиксии тяжелой степени. Для выполнения работы обследовано 45 новорожденных (гестационный возраст 38-40 недель) с перинатальной асфиксией тяжелой степени (основная группа) и 30 новорожденных (гестационный возраст 38-40 недель) с физиологическим течением раннего неонатального периода (группа сравнения). Обследованные дети находились в послеродовых отделениях и отделениях интенсивной терапии новорожденных областного и городского родильного дома города Полтавы. Выявлены значимые различия показателей гомоцистеина, фолатов в сыворотке крови и активности глутатионтрансферазы у новорожденных обследованных групп в течение первых трех суток жизни, для которых установлено различной силы корреляцию. Динамика изменений показателей фолатного обмена на третьи сутки жизни, по сравнению с первыми сутками, достоверно отличалась в группах обследованных новорожденных и коррелировала с показателями антиоксидантной защиты. Были определены особенности динамики показателей фолатного обмена, характеризующие фолатзависимые и антиоксидантные метаболические процессы перинатального периода. Анализ влияния межгенного взаимодействия на развитие нарушений фолатного обмена и перинатальной асфиксии тяжелой степени установил ассоциацию с полиморфизмом генов GSTT1, GSTM1, MTHFR, ACE, TNF-a, АT2R1. Было установлено синергическое взаимодействие между полиморфными вариантами генов GSTT1 и GSTM1, MTHFR и ACE. Полиморфные варианты перечисленных генов ассоциировались с динамикой изменений показателей фолатного обмена. При выполнении работы было установлено лучшую прогностическую модель межгенного взаимодействия в развитии перинатальной асфиксии тяжелой степени и генетически обусловленных нарушений фолатного обмена у новорожденных (прогностическая ценность - 91,47%). Анализ неблагоприятных полиморфных вариантов генов GSTT1, GSTM1, MTHFR, ACE, TNF-a, АT2R1 является перспективным для прогнозирования неблагоприятного течения раннего неонатального периода у новорожденных в клинической практике.Cтаття присвячена вивченню впливу генетичного поліморфізму на особливості фолатного обміну та антиоксидантного захисту у новонароджених з перинатальною асфіксією тяжкого ступеня. Метою дослідження було вивчення змін показників фолатного обміну, антиоксидантного захисту та їх взаємозв’язку з генетичним поліморфізмом для з’яcування внеску генетично обумовлених порушень фолатного обміну в розвитку перинатальної асфіксії тяжкого ступеня. Матеріали і методи. Для виконання роботи обстежено 45 новонароджених (гестаційний вік 38-40 тижнів) з перинатальною асфіксією тяжкого ступеня (основна група) та 30 новонароджених (гестаційний вік 38-40 тижнів) з фізіологічним перебігом раннього неонатального періоду (група порівняння). Обстежені діти перебували у післяпологових та відділеннях інтенсивної терапії новонароджених обласного та міського пологових будинків міста Полтави. Виявлено значимі відмінності показників гомоцистеїну, фолатів у сироватці крові та активності глутатіонтрансферази у новонароджених обстежених груп впродовж перших трьох діб життя, для яких встановлено різної сили кореляцію. Динаміка зміни показників фолатного обміну на третю добу життя, порівняно з першою добою, достовірно відрізнялася у групах обстежених новонароджених та корелювала з показниками антиоксидантного захисту. Визначені особливості динаміки показників фолатного обміну характеризують фолатзалежні й антиоксидантні метаболічні процеси перинатального періоду. Аналіз впливу міжгенної взаємодії на розвиток порушень фолатного обміну та перинатальної асфіксії тяжкого ступеня встановив асоціацію з поліморфізмом генів GSTT1, GSTM1, MTHFR, ACE, TNF-a, АT2R1. Була з’ясована синергічна взаємодія між поліморфними варіантів генів GSTT1 та GSTM1, MTHFR та ACE. Поліморфні варіанти перерахованих генів асоціювалися з динамікою змін показників фолатного обміну. При виконанні роботи було встановлено найкращу прогностичну модель міжгенної взаємодії у розвитку перинатальної асфіксії та генетично обумовлених порушень фолатного обміну у новонароджених (прогностична цінність – 91,47%). Комплексний аналіз несприятливих поліморфних варіантів генів GSTT1, GSTM1, MTHFR, ACE, TNF-a, АT2R1 є перспективним для прогнозування несприятливого перебігу раннього неонатального періоду у новонароджених у клінічній практиці

Генетичні предиктори ризику розвитку поєднаного перебігу карієсу та хронічного катарального гінгівіту в дітей

The purpose of this work was to determine the role of the genetic component in the development of the combined course of caries and gingivitis in children.Materials and methods: The study involved 49 schoolchildren aged 7–15 years. Dental examination was carried out according to the generally accepted method. The children were divided according to the carious process activity into two groups: 0–4 (compensated caries-comparison group) and 5–8 (subcompensated caries – main group). Chronic generalized catarrhal gingivitis (СGCG) was detected in these groups with frequency: 8 (29.62 %) of 27 patients and 15 (68.18 %) of 22 patients, respectively. Biochemical analysis of the oral fluid parameters, which included an assessment of calcium, phosphorus content, the activity of acid and alkaline phosphatases, malondialdehyde (MDA), catalase, was carried out for children. Molecular genetic research was based on the genomic DNA isolation from the buccal epithelium. To determine the polymorphic variants of GSTT1, GSTM1 genes the method of multiplex polymerase chain reaction (PCR) was used and for the IL-1β (C3953T, rs1143634) and MMP13 (A77G, rs2252070) gene s– PCR followed by restriction fragment length polymorphism analysis.Results. The development chance of caries in children was associated with the GSTM1 gene deletion polymorphism in combination with the 3953CT polymorphic variant in the IL-1β gene. It was shown, that the development of caries was associated with СGCG, and this combined dental pathology was more reliably detected in patients with 3953СT and 3953TT genotypes in the IL-1β gene. Significantly increased index of malonic dialdehyde and decreased catalase activity in the presence of 3953СT and 3953TT polymorphic variants in the IL-1β gene are determined.Conclusions. Genetic predictors of increased development chance of combined dental pathology – subcompensated caries and СGCG, pathogenetically combined with increased activity and intensity of periodontal tissue damage among children, were revealed.Цель работы – определение роли генетического компонента в развитии сочетанного течения кариеса и гингивита у детей.Материалы и методы. В исследовании принимали участие 49 детей школьного возраста – 7–15 лет. Стоматологическое обследование провели по общепринятой методике. Дети были разделены в зависимости от активности кариозного процесса на две группы: КПУ 0–4 (компенсированный кариес – группа сравнения, n = 27) и КПУ 5–8 (субкомпенсированный кариес – основная группа, n = 22). В этих группах хронический генерализованный катаральный гингивит (ХГКГ) установлен у 8 (29,62 %) из 27 пациентов и 15 (68,18 %) из 22 пациентов соответственно. У детей провели биохимический анализ ротовой жидкости, который включал оценку содержания кальция, фосфора, активности кислой и щелочной фосфатаз, малонового диальдегида (МДА), каталазы. Молекулярно-генетическое исследование базировалось на выделении геномной ДНК из буккального эпителия. Для определения полиморфных вариантов генов GSTT1, GSTM1 использовали метод мультиплексной полимеразной цепной реакции (ПЦР), а для генов IL-1β (C3953T, rs1143634) и MMP13 (А77G, rs2252070) – ПЦР с последующим анализом полиморфизма длины рестрикционных фрагментов.Результаты. Установлено, что вероятность развития кариеса у детей ассоциирована с наличием делеционного полиморфизма гена GSTM1 в сочетании с полиморфным вариантом 3953СT по гену IL-1β. Показано, что развитие кариеса ассоциировано с ХГКГ, а указанную сочетанную стоматологическую патологию достоверно чаще диагностировали у пациентов с генотипами 3953СТ и 3953ТТ по гену IL-1β. Наличие генотипа 3953СС по гену IL-1β у детей снижало вероятность развития данной сочетанной стоматологической патологии. Определено достоверное повышение показателя малонового диальдегида и снижение активности каталазы при наличии полиморфных вариантов 3953СТ и 3953ТТ по гену IL-1β.Выводы. Установлены генетические предикторы, повышающие вероятность развития сочетанной стоматологической патологии – субкомпенсированного кариеса и ХГКГ, которые патогенетически связаны с повышением активности и интенсивности поражения тканей пародонта у детей. Мета роботи – визначення ролі генетичного компонента в розвитку поєднаного перебігу карієсу та гінгівіту в дітей.Матеріали та методи. В дослідженні брали участь 49 дітей шкільного віку – 7–15 років. Стоматологічне обстеження виконали за загальноприйнятою методикою. Дітей поділили залежно від активності каріозного процесу на дві групи: КПУ 0–4 (компенсований карієс – група порівняння, n = 27) і КПУ 5–8 (субкомпенсований карієс – основна група, n = 22). У цих групах хронічний генералізований катаральний гінгівіт (ХГКГ) виявили у 8 (29,62 %) із 27 пацієнтів і 15 (68,18 %) із 22 пацієнтів відповідно. У дітей виконали біохімічний аналіз ротової рідини, який включав оцінювання вмісту кальцію, фосфору, активності кислої та лужної фосфатаз, малонового діальдегіду (МДА), каталази. Молекулярно-генетичне дослідження базувалося на виділенні геномної ДНК із букального епітелію. Для визначення поліморфних варіантів генів GSTT1, GSTM1 використовували метод мультиплексної полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР), а для генів IL-1β (C3953T, rs1143634) і MMP13 (А77G, rs2252070) – ПЛР із наступним аналізом поліморфізму довжини рестрикційних фрагментів.Результати. Встановили, що вірогідність розвитку карієсу в дітей асоційована з наявністю делеційного поліморфізму гена GSTM1 в поєднанні з поліморфним варіантом 3953СT за геном IL-1β. Показано, що розвиток карієсу асоційований із ХГКГ, а зазначену поєднану стоматологічну патологію вірогідно частіше виявляли в пацієнтів із генотипами 3953СТ і 3953ТТ за геном IL-1β. Наявність генотипу 3953СС за геном IL-1β у дітей знижувала вірогідність розвитку цієї поєднаної стоматологічної патології. Визначили вірогідне підвищення показника малонового діальдегіду та зниження активності каталази за наявності поліморфних варіантів 3953СТ і 3953ТТ за геном IL-1β.Висновки. Виявили генетичні предиктори, що підвищують імовірність розвитку поєднаної стоматологічної патології – субкомпенсованого карієсу та ХГКГ, які патогенетично пов’язані з підвищенням активності та інтенсивності ураження тканин пародонта в дітей.

Nanometer-sized mineral grains and their genetic types in meteorites

Three genetically different types of nanometer-sized mineral grains in meteorites can be distinguished based on literature and original data: (a) primitive condensates, (b) metamorphic grains, and (c) weathering products. The first of these groups were formed by condensation in a gas-dust nebula in either a presolar or solar environment. Metamorphic grains were formed as a result of thermal, shock or aqueous metamorphism on the meteorite parent bodies. The third type can clearly be characterized as terrestrial weathering products, which are generally found in meteorite finds and are rare or absent within meteorites recovered shortly after having fallen. Nanometric components are found predominantly within the fine-grained silicate material of primitive meteorites. It is suggested that enhanced accretional properties of nanometer-sized grains could be responsible for the primary accretion of condensed nanoglobules within a protoplanetary nebula. The nature of nanometer-sized inclusions of native W and native Ag originally discovered in the Krymka chondrite is preliminarily discussed