Écologie du système hôte - parasite, juvéniles GO de sole (Solea solea) - métacercaires de Digènes (dynamique et effets de l'infestation)

Little attention has been paid to parasitism as a potential factor of variation in flatfish juveniles biological performances. In this PhD thesis, the dynamics and the effects of the infection by digenean metacercariae have been studied on 0-group juveniles of the common sole Solea solea (Pleuronectiformes, Soleidae), species of primary importance for fisheries for the North East Atlantic region. In coastal nursery grounds, 0-group sole locally accumulate different taxa of digenean metacercariae. The dynamics of the infection is controlled by the major local factors, proximity of the first intermediate hosts (molluscs) and cercariae dispersal capacities. Digenean metacercariae have been used as biological tags of habitat use by their host: 0-group sole juveniles are very sedentary and their density / growth show a high variability at small spatial scale, which reflects the high variability of habitat quality at this scale. Prosorhynchus crucibulum (Digenea, Bucephalidae) infection is enhanced by mussel farming (mussel = first intermediate host). This parasite can have effects on immunity, condition and behaviour of 0-group sole juveniles. These impacts are modulated by the development of the parasite, the physiological status of the host and the environmental factors. From now, parasitism appears essential in the study of the functioning of flatfish coastal nurseries.Peu d attention avait été portée jusqu alors sur le parasitisme comme facteur pouvant potentiellement affecter les performances biologiques des juvéniles de Pleuronectiformes. Dans cette thèse, la dynamique et les effets de l infestation par des métacercaires de Digènes ont été étudiés chez les juvéniles G0 de sole commune, Solea solea (Pleuronectiformes, Soleidés), espèce d intérêt halieutique majeur dans la région de l Atlantique Nord-Est. Dans les nourriceries côtières, les G0 de sole accumulent localement différents taxons de métacercaires de Digènes, dont la dynamique spatiale est essentiellement contrôlée par les facteurs locaux que sont la présence des premiers hôtes intermédiaires (mollusques) et la capacité de dispersion des cercaires. Les métacercaires de Digènes ont, en outre, pu être utilisées comme marqueurs biologiques de l utilisation de l habitat par leur hôte : les G0 de sole sont très sédentaires et leur densité / croissance varient fortement à petite échelle spatiale, reflétant ainsi la variabilité élevée de la qualité de l habitat à cette échelle. L infestation par Prosorhynchus crucibulum (Digènes, Bucéphalidés), dont la transmission est favorisée par la mytiliculture sur bouchots (moule = premier hôte intermédiaire), est susceptible d affecter l immunité, la condition et le comportement des juvéniles G0 de sole. Ces impacts peuvent être modulés par le développement du parasite, le statut physiologique de l hôte et les facteurs environnementaux. La prise en compte des parasites semble donc être incontournable dans l étude du fonctionnement des nourriceries côtières pour les juvéniles de Pleuronectiformes.LA ROCHELLE-BU (173002101) / SudocBORDEAUX1-Lab.Océanogr.Arcacho (330092101) / SudocSudocFranceF

Fast-GC Quantification of Harmonine, the Major Defense Alkaloid of the Multicolored Asian Ladybird Harmonia axyridis (Pallas)

info:eu-repo/semantics/publishe

Galleria mellonella as a screening tool to study virulence factors of Aspergillus fumigatus

International audienceThe invertebrate Galleria mellonella has increasingly and widely been used in the last few years to study complex host-microbe interactions. Aspergillus fumigatus is one of the most pathogenic fungi causing life-threatening diseases in humans and animals. Galleria mellonella larvae has been proven as a reliable model for the analysis of pathogenesis and virulence factors, enable to screen a large number of A. fumigatus strains. This review describes the different uses of G. mellonella to study A. fumigatus and provides a comparison of the different protocols to trace fungal pathogenicity. The review also includes a summary of the diverse mutants tested in G. mellonella, and their respective contribution to A. fumigatus virulence. Previous investigations indicated that G. mellonella should be considered as an interesting tool even though a mammalian model may be required to complete and verify initial data

Changes in lipid and fatty acid contents of gonad during the reproductive cycle of the Mediterranean swordfish Xiphias gladius

International audienceSwordfish Xiphias gladius is a large pelagic fish distributed worldwide and exploited for human consumption, however there is limited knowledge about its reproductive biology, especially regarding lipid dynamic in gonads. In teleost fish, reproductive success and offspring survival are associated to lipid availability for gamete synthesis. This study investigated the lipid composition, including lipid classes and fatty acids (FA) of cell membrane and reserve lipids (i.e., polar and neutral lipids, respectively; PL and NL), along female and male gonad development of a swordfish population from waters surrounding Corsica Island in the Mediterranean Sea. Overall, swordfish gonads contained 20% of total FA), while 20:5n-3 and 20:4n-6 were minor (3-6% of total FA) and varied little with maturation. 22:6n-3 and 18:1n-9 were selectively allocated to the ovarian maturation (increased in concentration and in proportion with maturation) until spawning. Finally, swordfish gonads might represent a good food source for humans given that 150 g of swordfish ovaries can cover the daily requirements in omega-3 for humans, but research on pollutants should also be conducted to evaluate their implications on the reproduction output of this species, and on the safety of swordfish gonads for human consumption

Study of the factors involved in the aggregation of Harmonia axyridis Pallas (Coleoptera: Coccinellidae)

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Bonifacio strait natural reserve (BSNR): investigating ecosystem functioning through comparative modelling of marine protected areas

International audienceThe Bonifacio Straits Natural Reserve (BSNR) is a Mediterranean Marine Protected Area (MPA) located in Corsica, characterized by rocky coasts, steep bathymetry, and regulated exploitation of marine resources. In this study, we updated the BSNR Ecopath model from 2010, providing a re-evaluation of the MPA's impact 13 years after the reserve's establishment and incorporating improved catch estimates, particularly for recreational fisheries. The model encompassed four primary producer groups, fourteen invertebrate groups, two Chondrichthyes groups, sixteen teleost groups, one seabird group, and one cetacean group. The BSNR model depicted a Mediterranean ecosystem where piscivorous fishes and cephalopods link primary producers to top predators (Tursiops truncatus, Dentex dentex and Epinephelus marginatus), emphasizing complex trophic relationships. Although the ecosystem faced moderate fishing pressure, the model revealed uneven pressure among groups, with rays, for example, being particularly vulnerable to fishing nets. Additionally, a mixed trophic impact analysis revealed an absence of competition among fishing fleets for resources, suggesting that, overall, recreational and artisanal fisheries do not impact each other. By comparing MPA models across the Mediterranean Sea, our research suggests that MPA establishment might enhance the overall biomass of ecosystems within their boundaries. This abundance can spill over into adjacent areas, thereby increasing biomass and diversity in those regions. In more exploited MPAs, higher values for the Finn cycling index and the consumption to total system throughput ratio indicated that fishing activities increased pressure on prey resources by diminishing the system's energy, pushing the ecosystem to optimize recycling

Atlas des Chondrichtyens de France métropolitaine - Cartographier la présence et la sensibilité des espèces réglementées dans le cadre du programme de mesures D01-PC-OE01-AN1 (sous-action 1) de la DCSMM (Directive Cadre Stratégie Milieu Marin) cycle 2

Currently, 106 species of chondrichthyans (40 rays, 59 sharks, and 7 chimaeras) can be found in the marine waters of metropolitan France. 14 chondrichthyans are listed on French IUCN red list and/or national and international legislations and most of them (63 species) are Data Deficient as a result of lack of data. The protection of these populations has been problematic because the conservation status and spatial distribution of most species are not well known or poorly understood. This chondrichthyan distribution atlas, aims to address measures under the Marine Strategy Framework Directive (MSFD), which requires mapping of the presence of these species within French marine waters. Capture data from onboard observers on commercial fishing vessels, scientific surveys, and citizen science data from 2003 to 2021 were compiled. Given the mobile nature of these species, the study area includes waters up within the North-east Atlantic, specifically Greater North Sea (including Kattegat and English Channel), Celtic Seas, Bay of Biscay and the Iberian Coast, and French western Mediterranean waters. Each species has a fact sheet that includes 1) maps of raw occurrences broken down by 3 regions (MSFD marine waters of North East Atlantic; the Gulf of Lion, and Corsica); 2) information on the ecology (seasonality and depth of captures) and 3) capture by fishing gears and according to their length. To address potential miss-identification issues and identify areas where the presence of a species is unlikely, a certainty of data occurrence index has been implemented. These results are commented on by French chondrichthyans experts in the species sheets, and information on historical distributions or taxonomy, where appropriate, is also provided. The relevance of this Atlas to implementing chondrichthyan conservation measures to meet MSFD requirements are discussed.Actuellement, 106 espèces de chondrichtyens (40 raies, 59 requins et 7 chimères) sont présentes de manière régulière ou occasionnelle dans les eaux maritimes de France métropolitaine. Parmi elles, 14 espèces figurent sur la liste rouge de l’UICN France tandis qu’une majorité (63 espèces) est classée « données insuffisantes ». La protection de ces populations est identifiée comme un enjeu fort bien que le statut de conservation et/ou la distribution spatiale d’une majorité d’espèces ne soient pas ou peu connus faute de données. Le présent document, qui prend la forme d’un « atlas de distribution des chondrichtyens », vise à répondre à une action du programme de mesures de la Directive Cadre Stratégie Milieu Marin qui nécessite une cartographie actualisée de la présence de ces espèces. Pour cela, les données de captures et d’observations disponibles dans différentes sources de données (suivis de la pêche professionnelle, campagnes scientifiques et sciences participatives) et sur une période récente (2003-2021) ont été compilées. Compte tenu du caractère mobile de ces espèces, la zone d’étude comprend les eaux de l’Atlantique Nord-Est, précisément la Mer du Nord (y compris le Cattégat et la Manche), les Mers Celtiques, le Golfe de Gascogne et la côte ibérique, ainsi que la Mer Méditerranée occidentale (uniquement les eaux françaises). Chaque espèce possède une fiche dédiée qui inclut 1) des cartes d’occurrences brutes déclinées pour 3 zones (Atlantique/Manche et mer du Nord, Golfe du Lion et Corse) et qui sont complétées par 2) des informations visant notamment à décrire l’écologie (saisonnalité et profondeur des captures) et 3) la vulnérabilité des espèces vis-à-vis des engins de pêche (types d’engins, tailles de capture). Pour prendre en compte les problèmes d’identification dont ces espèces font l’objet et identifier des zones potentielles où la présence d’une espèce est peu probable, un niveau de conformité des données d’occurrences recueillies a été évalué. Ces résultats sont commentés, au sein des fiches espèces, par des experts nationaux et des éléments concernant les distributions historiques ou de taxonomie sont apportés, le cas échéant. Finalement, l’apport de ce travail pour la mise en œuvre des mesures de gestion des chondrichtyens dans le cadre de la DCSMM est discuté

Atlas des Chondrichtyens de France métropolitaine - Cartographier la présence et la sensibilité des espèces réglementées dans le cadre du programme de mesures D01-PC-OE01-AN1 (sous-action 1) de la DCSMM (Directive Cadre Stratégie Milieu Marin) cycle 2

Currently, 106 species of chondrichthyans (40 rays, 59 sharks, and 7 chimaeras) can be found in the marine waters of metropolitan France. 14 chondrichthyans are listed on French IUCN red list and/or national and international legislations and most of them (63 species) are Data Deficient as a result of lack of data. The protection of these populations has been problematic because the conservation status and spatial distribution of most species are not well known or poorly understood. This chondrichthyan distribution atlas, aims to address measures under the Marine Strategy Framework Directive (MSFD), which requires mapping of the presence of these species within French marine waters. Capture data from onboard observers on commercial fishing vessels, scientific surveys, and citizen science data from 2003 to 2021 were compiled. Given the mobile nature of these species, the study area includes waters up within the North-east Atlantic, specifically Greater North Sea (including Kattegat and English Channel), Celtic Seas, Bay of Biscay and the Iberian Coast, and French western Mediterranean waters. Each species has a fact sheet that includes 1) maps of raw occurrences broken down by 3 regions (MSFD marine waters of North East Atlantic; the Gulf of Lion, and Corsica); 2) information on the ecology (seasonality and depth of captures) and 3) capture by fishing gears and according to their length. To address potential miss-identification issues and identify areas where the presence of a species is unlikely, a certainty of data occurrence index has been implemented. These results are commented on by French chondrichthyans experts in the species sheets, and information on historical distributions or taxonomy, where appropriate, is also provided. The relevance of this Atlas to implementing chondrichthyan conservation measures to meet MSFD requirements are discussed.Actuellement, 106 espèces de chondrichtyens (40 raies, 59 requins et 7 chimères) sont présentes de manière régulière ou occasionnelle dans les eaux maritimes de France métropolitaine. Parmi elles, 14 espèces figurent sur la liste rouge de l’UICN France tandis qu’une majorité (63 espèces) est classée « données insuffisantes ». La protection de ces populations est identifiée comme un enjeu fort bien que le statut de conservation et/ou la distribution spatiale d’une majorité d’espèces ne soient pas ou peu connus faute de données. Le présent document, qui prend la forme d’un « atlas de distribution des chondrichtyens », vise à répondre à une action du programme de mesures de la Directive Cadre Stratégie Milieu Marin qui nécessite une cartographie actualisée de la présence de ces espèces. Pour cela, les données de captures et d’observations disponibles dans différentes sources de données (suivis de la pêche professionnelle, campagnes scientifiques et sciences participatives) et sur une période récente (2003-2021) ont été compilées. Compte tenu du caractère mobile de ces espèces, la zone d’étude comprend les eaux de l’Atlantique Nord-Est, précisément la Mer du Nord (y compris le Cattégat et la Manche), les Mers Celtiques, le Golfe de Gascogne et la côte ibérique, ainsi que la Mer Méditerranée occidentale (uniquement les eaux françaises). Chaque espèce possède une fiche dédiée qui inclut 1) des cartes d’occurrences brutes déclinées pour 3 zones (Atlantique/Manche et mer du Nord, Golfe du Lion et Corse) et qui sont complétées par 2) des informations visant notamment à décrire l’écologie (saisonnalité et profondeur des captures) et 3) la vulnérabilité des espèces vis-à-vis des engins de pêche (types d’engins, tailles de capture). Pour prendre en compte les problèmes d’identification dont ces espèces font l’objet et identifier des zones potentielles où la présence d’une espèce est peu probable, un niveau de conformité des données d’occurrences recueillies a été évalué. Ces résultats sont commentés, au sein des fiches espèces, par des experts nationaux et des éléments concernant les distributions historiques ou de taxonomie sont apportés, le cas échéant. Finalement, l’apport de ce travail pour la mise en œuvre des mesures de gestion des chondrichtyens dans le cadre de la DCSMM est discuté