1,962 research outputs found
Infectivity decline of an RNA plant virus by increased mutagenesis supports the lethal defection model in vivo
Lethal mutagenesis is a new antiviral therapy based on increasing the mutation rate by using mutagenic base and nucleoside analogues whose molecular mechanisms are not fully understood. Most of the research has been conducted on animal RNA viruses in cell culture and, to a lesser extent, in vivo. There is experimental evidence supporting the model of lethal defection for lethal mutagenesis of RNA viruses. In this model, viral genomes with a low degree of mutation and low specific infectivity, termed "defectors", exert an interfering activity leading to virus loss. Lethal mutagenesis of plant viruses has not been addressed yet despite being excellent in vivo model systems that develop systemic infections, undergo rapid bottlenecks and pose no ethical issues.
Here, we address lethal mutagenesis in vivo of Tobacco mosaic virus (TMV), a single-stranded positive RNA virus of 6.4 Kb. Nicotiana tabacum plants cultured in vitro were treated with 25, 50 and 100 µg/ml of the base analogue 5-fluorouracil (FU) and 24 h later were inoculated with 50 lesion forming units (lfu) of TMV. We analyzed the infectivity, viral load and mutant spectra of viral populations after 5 and 10 days of treatment, as well as of populations that went 10 days of treatment followed by 21 days of ex vitro growth in the absence of FU.
The results show that TMV infectivity decreases when treated with 50 and 100 µg/ml FU for 10 days. TMV mutagenized populations grown without FU reach infectivity values higher than untreated populations. Predominant mutations in FU-treated populations with decreased infectivity at 10 dpi are U→C, A→G and G→A transitions, which are expected due to the action of FU. TMV replication is not affected by FU at any dose and there are no imbalances of ribonucleotide triphosphate pools measured by HPLC. No differences in mutation frequencies and Shannon Entropies between control and FU-treated populations with declined infectivity were found. However, we did found a dose-dependent decrease of specific infectivity in FU-treated populations, but not in untreated samples, as well as dominance of molecules with a low degree of mutation. Specific infectivity recovered to control levels after 21 days of growth without the analogue. Altogether, our results suggest that TMV defector molecules mediate the decrease in TMV infectivity. This is the first report that addresses the molecular basis of lethal defection in vivo using an RNA plant virus.Junta de Andalucía (P09-CVI-5428 y P10-CVI-6561), Plan Nacional I+D+i (BFU2007-65080 BMC) y Universidad de Málaga (Plan propio
Herramientas predictivas para disminuir futuras complicaciones en pacientes hipertensos ingresados a través de un servicio de urgencias hospitalario
Las enfermedades cardiovasculares suponen una de las principales causas de ingresos hospitalarios. Los pacientes con factores de riesgo cardiovascular acuden e ingresan en mayor proporción a los servicios de urgencias hospitalarios, y dentro de estos factores de riesgo cardiovascular destaca la hipertensión arterial como el más prevalente. Los pacientes hipertensos que ingresan a través de servicios de urgencias hospitalarios suelen tener una alta comorbilidad de otros factores de riesgo cardiovascular y una alta mortalidad en el ingreso. Por tanto es importante tomar medidas preventivas para poder diminuir los ingresos hospitalarios y la mortalidad en estos pacientes.
En la actualidad no existen modelos predictivos de enfermedad cardiovascular o de mortalidad por todas las causas en pacientes hipertensos ingresados a través de servicios de urgencias hospitalarias. Por este motivo decidimos realizar un estudio de cohorte con seguimiento de 1 año, con el objetivo de poder obtener herramientas que nos permitan estimar la probabilidad de desarrollar una enfermedad cardiovascular, así como el fallecimiento de los pacientes hipertensos ingresados, facilitando de esa forma al clínico mejorar en el cuidado de dichos pacientes.
Se consideraron como variables principales el tiempo hasta la aparición de una nueva enfermedad cardiovascular (coronaria, cerebrovascular o vascular periférica) y el tiempo hasta la muerte (mortalidad por cualquier causa). Como variables secundarias (potenciales factores de los modelos predictivos), se analizaron: edad, género, vivir sólo, nivel de estudios, antecedentes familiares de enfermedad cardiovascular, infarto de miocardio, insuficiencia cardiaca, enfermedad vascular periférica, enfermedad cerebrovascular, diabetes, diabetes con afectación de órganos, enfermedad renal moderada y severa, calidad de vida, fumador, paquetes-años, tensión arterial, índice de Charlson, actividad física y adherencia a la dieta mediterránea. Todas las variables secundarias se recogieron a través de entrevistas clínicas con los pacientes. Posteriormente se contruyeron 2 modelos para predecir la enfermedad cardiovascular y mortalidad al año de ingreso de los paciente hipertensos, adaptando los resultados a sistemas de puntos, que se validaron internamente, calculando la discriminación y calibración.
Dentro del modelo predictivo para estimar el riego de desarrollar enfermedad cardiovascular al año de seguimiento desde el ingreso del paciente hipertenso, nos encontramos como resultado las siguientes variables: edad, género, actividad cotidiana, la presencia o no de infarto de miocardio, enfermedad vascular periférica e insuficiencia cardiaca. En el modelo predictivo de estimación del riesgo de muerte al año de seguimiento obtuvimos como variables: género, cuidado personal, actividad cotidiana y el índice de cormobilidad de Charlson.
A modo de conclusión podemos decir que los modelos construidos obtuvieron buenos indicadores en las muestras que se han desarrollado, quedando pendiente su validación externa que será motivo de estudio en futuras investigaciones
La creación del Servicio Europeo de Acción Exterior y su repercusión en la política de cooperación para el desarrollo de la Unión Europea
La creación del Servicio Europeo de Acción Exterior ha supuesto un cambio institucional para la Unión Europea y un fortalecimiento de su Acción Exterior, que previamente se veía diluida entre las distintas instituciones que forman la UE y carecía de coherencia debido a la difícil gestión. A parte del cambio institucional, también ha supuesto un cambio material de las políticas de Acción Exterior de la UE, entre ellas la de Cooperación para el Desarrollo. A pesar de que la política de Cooperación para el Desarrollo está gestionada principalmente por la Comisión con DG DEVCO, el SEAE tiene competencias en la fase de programación de las estrategias, prioridades y la distribución regional del presupuesto. Además, también influye en la cooperación mediante la gestión de las delegaciones, donde se gestiona la Programación Conjunta, y a través de su Sistema de Respuesta a las Crisis, cuyo enfoque condiciona el uso de la ayuda a los fines de seguridad. Por lo tanto, el SEAE supone una influencia tanto positiva como negativa en la Cooperación para el Desarrollo de la Unión Europea.Máster en Cooperación Internacional para el Desarroll
As capitulacións matrimoniais
Titulación: Licenciatura en Dereito -- Materia: Dereito Civil V. Familia e SucesiónsA unidade didáctica desenvolve unha materia propia do Dereito de familia e corresponde ao módulo sobre organización económica do matrimonio, pois as capitulacións son a manifestación máis clara do principio de autonomía da vontade en materia matrimonial. Os cónxuxes ou noivos que pensan casar en breve poden pactar, con algúns límites, sobre os aspectos patrimoniais da súa relación. O tema conecta tamén con contidos doutras materias da titulación, como Dereito Civil I, no que se estuda o negocio xurídico, do que as capitulacións matrimoniais constitúen unha especie, pois é un negocio xurídico-familiarUniversidade de Santiago de Compostela. Servizo de Normalización Lingüístic
Reading Habit in Primary School Students: Influence of Family and School Reading Plan
In Primary School reading competence is a fundamental part of linguistic communication competence. And it has
also been determined that its development in the early stages of education favors the academic success of students.
Considering these ideas, a pilot study limited to one educational centre was carried out, a transversal cut, using a
survey of closed-ended questions, on the value of the family in the development of the reading habit, investigating
and showing the implications of this in the development policy of the Reading Plan and analysing whether this
implication influenced the academic results of the students. This survey was administered to a sample of 51
students in the third year of Primary school. The management of the centre and the coordinators of the section
were also interviewed. Once the results were obtained, the data obtained corroborated that the reading habit of the
students is associated above all with school tasks and not so much with the taste or pleasure of reading in leisure
time. It has also been determined that the attitude of the family has a clear influence on the development of the
reading habit. And, finally, it could be verified that the academic performance of the students was related to this
habit. It concludes with an emphasis on the necessary training of teachers to encourage the students' reading habits
and family involvement in the Reading Plan.En Educación Primaria la competencia lectora es una parte fundamental de la competencia en comunicación
lingüística. Se ha determinado que su desarrollo en las primeras etapas educativas favorece el éxito académico de los
estudiantes. Considerando estas ideas, se realizó un estudio piloto limitado a un centro educativo, de corte transversal,
empleando una encuesta de preguntas cerradas sobre el valor de la familia en el desarrollo del hábito lector,
investigando y mostrando las implicaciones de ésta en la política de desarrollo del Plan Lector y analizando si esta
implicación influía en los resultados académicos del alumnado. Dicha encuesta se administró a una muestra de 51
estudiantes de tercer curso de Primaria. También se entrevistó a la dirección del centro y a los coordinadores de
tramo. Una vez obtenidos los resultados, los datos alcanzados corroboraron que el hábito lector de los estudiantes
está asociado sobre todo a las tareas escolares y no tanto al gusto o al placer de leer en tiempo de ocio. También se
ha determinado que la actitud de la familia posee una clara influencia en el desarrollo del hábito lector. Y, finalmente,
se pudo comprobar que el rendimiento académico de los alumnos estaba relacionado con dicho hábito. Se concluye
poniendo de relieve la necesaria formación y capacitación del profesorado para incentivar el hábito lector del
alumnado y la implicación familiar en el Plan Lector del centro
Analysis of hypervariable DNA sequences by NGS technologies: QuasiFlow
The development of Next Generation Sequencing (NGS) technologies has allowed deep characterization of highly variable sequences such as viral or mitochondrial genomes. With respect to RNA and ssDNA viruses, their low replication fidelity generates viral populations consisting of complex mutant spectra termed viral quasispecies. Their study is of special interest as they can be considered a phenotypic reservoir1. Similarly, heteroplasmy of human mitochondrial genomes, in which different sequences are found within a single individual, might have important clinical consequences.
For the analysis of the mutant spectrum of such hypervariable sequences from NGS data, we have developed QuasiFlow, a workflow designed in AutoFlow2 that uses Illumina reads. QuasiFlow provides information about DNA variability, such as SNPs, indels and recombination events (Figure 1). Furthermore, it allows haplotype reconstruction of viral quasispecies and characterization of its diversity through normalized Shannon index, nucleotide diversity and mutation networks. Quasiflow performs also a comparative study among samples, based on correlation, ANOVA and PCA analysis, in order to determine which parameters are affected by the experiment and how the samples behave according to their biological origin.
In this work, we have applied QuasiFlow to analyze the population structure of the begomovirus Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) infectious clone inoculated in Arabidopsis thaliana plants, using HiSeq or MiSeq reads. Their analysis allowed detection of minor quasispecies variants with a frequency of 10-4 to 10-5 and reconstructed the haplotypes present in the sample. In addition, QuasiFlow was used to discover variants and recombinants in mixed infections of tomato plants. These results show the fast generation of recombinant genomes in geminivirus mixed infections and demonstrate the potential of QuasiFlow for the analysis of mutant spectra using Illumina MiSeq sequencing data. We have extended the use of QuasiFlow to the analysis of highly variable sequences such as the mitochondrial DNA. For that, we have analyzed DNA Illumina Miseq reads from 47 human mitochondrial samples from different cell lines obtained from the NCBI SRA database. Quasiflow generated automatically SNPs, SNP frequencies, indels and analyzed up to 23 variables using PCA analysis and performed an hierarchical clustering of the samples. Our analysis was able to detect pathological variants presented in a frequency lower than 1%.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech.
This research was funded by Junta de Andalucía and EU through the ERDF 2014-2020, Projects P10-CVI-6075 to M. G.C. and P10-CVI-6561 to A.G-P
Infectivity decline of an RNA plant virus by increased mutagenesis in vivo
According to the lethal defection model, during lethal mutagenesis viral genomes with a low degree of mutation and low specific infectivity exert an interfering activity that leads to virus loss. Lethal mutagenesis of plant viruses has not been reported to date. We address lethal defection in vivo of Tobacco mosaic virus (TMV), a single-stranded positive RNA virus. Nicotiana tabacum plants cultured in vitro were treated with 25, 50 and 100 µg/ml of the base analogue 5-fluorouracil (FU) and 24h later were inoculated with 50 lesion forming units of TMV.
Results show that TMV infectivity decreases when treated with 50 and 100 µg/ml FU for 10 days. TMV mutagenized populations grown without FU reach infectivity values higher than untreated populations. Predominant mutations in FU-treated populations with decreased infectivity at 10 dpi are transitions which are expected due to the action of FU. Viral load is not affected by FU at any dose and there are no imbalances of ribonucleotide triphosphate pools measured by HPLC. No differences in mutation frequencies and Shannon Entropies between control and FU-treated populations were found. However, we found a dose-dependent decrease of specific infectivity in FU-treated populations, but not in untreated samples, as well as dominance of molecules with a low degree of mutation. Specific infectivity recovered to control levels after 21 days of growth without the analogue. Altogether, our results suggest that TMV defector molecules mediate the decrease in TMV infectivity. This is the first report that addresses the molecular basis of lethal defection in vivo using an RNA plant virus.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech
Factores explicativos de la inversión extranjera directa en España (1970- 1992)
El fenómeno conocido como "globalización", con sus manifestaciones en el crecimiento
del comercio internacional, la integración de mercados y la creciente importancia de las empresas
multinacionales en la estructura productiva, constituye actualmente un referente básico en la
práctica totalidad de los estudios económicos. Las exigencias de competitividad y el riesgo de
deslocalización que la "globalización" implica se han convertido en elementos omnipresentes en
este marco de credente complejidad.
Dentro del ámbito concreto de los flujos de inversión transnadonal, el concepto de
inversión productiva, reflejado de forma aproximada a través de la inversión extranjera directa,
constituye el objeto de numerosos estudios, tanto desde la perspectiva de análisis de sus efectos
sobre los países receptores3en términos de empleo, tecnología, saldo exterior etc., como desde
una aproximación explicativa de los factores determinantes de la misma.
El presente trabajo se enmarca dentro de esta segunda corriente, centrándonos en el
análisis econométrico de los factores explicativos, desde una perspectiva macroeconómica, de los
flujos de inversión extranjera directa recidos por España en el período 1970-1992.
A tal efecto, comenzaremos recogiendo brevemente las principales teorías explicativas de
la IED y los contrastes empíricos realizados para el caso español. A continuación, expondremos
las características básicas de nuestro modelo y los resultados obtenidos. Por último, comentaremos
las líneas principales de extensión del estudio
Structural properties of various sodium thiogermanate glasses through DFT-based molecular dynamics simulations
We present a study of the structural properties of (x)NaS-(1-x)GeS
glasses through DFT-based molecular dynamics simulations, at different sodium
concentrations (). We computed the radial pair correlation functions
as well as the total and partial structure factors. We also analyzed the
evolution of the corner- and edge-sharing intertetrahedral links with the
sodium concentration and show that the sodium ions exclusively destroy the
former. With the increase of the sodium concentration the ``standard'' FSDP
disappears and a new pre-peak appears in the structure factor which can be
traced back in the Na-Na partial structure factor. This self organization of
the sodium ions is coherent with Na-rich zones that we find at high modifier
concentration.Comment: 9 pages, 7 figures; to be published in Phys. Rev.
University net works. The case of DIPRO 2.0 net
La irrupción de la red Internet en el ámbito educativo es hoy una realidad latente y patente. En
el nivel universitario, esta relación se ha ido haciendo visible en los nuevos recursos que los profesores
han ido incorporando a sus dinámicas de aula y a su quehacer docente. Una de esas herramientas
son las redes sociales, las cuales fuera del espectro educativo tienen una gran relevancia.
En este artículo, presentamos una red social educativa destinada a profesores universitarios,
como propuesta para desarrollar su formación en la temática de los entornos personales de
aprendizaje. Dicha temática va cobrando una mayor significación, dado que implica el desarrollo
de una serie de habilidades que desemboquen en el logro de la competencia digital, así como
en la consecución de una alfabetización en medios tecnológicos, tanto para su uso como para su
consumo desde una perspectiva crítica, tan relevante en los estudiantes y tan necesaria en los
docentes, de cara a la correcta incorporación de las tecnologías de la información y la comunicación
en la realidad educativa diaria. La incorporación de los entornos personales de aprendizaje
a la dinámica laboral del docente universitario supone, en primera instancia, adentrarse en el
conocimiento de este entorno, si a ellos sumamos las redes sociales conjugaremos dos herramientas
con un alto grado de actualidad. La proposición que aquí traemos se enmarca dentro de
un proyecto I+D+i concedido por el Ministerio de Ciencia e Innovación (clave: EDU2009-08893)
en la convocatoria de 2010, en la cual participan investigadores y docentes de más de una veintena
de instituciones de enseñanza superior nacionales y extranjeras
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