A new species of Bryophryne (Anura: Strabomantidae) from the Cordillera de Vilcabamba, southeastern Peruvian Andes

Descrevemos uma nova espécie de Bryophryne proveniente da Cordilheira de Vilcabamba, Departamento de Cusco, nos Andes do sudeste do Peru. A nova espécie se diferencia das demais espécies do gênero, excepto de B. flammiventris e de B. gymnotis, por apresentar membrana e anel timpânicos pouco definidos, machos com sacos e fendas vocais e por emitir cantos nupciais; além disso, diferencia-se de B. flammiventris e de B. gymnotis pela textura da pele, presença de processos vomerianos pequenos e oblíquos, coloração ventral cinza azulado a cinza claro com manchas marrons irregulares ou reticuladas e canto nupcial composto por duas ou três notas. Os espécimes da nova espécie caracterizam-se ainda pela pele dorsal finamente granulada com tubérculos, pregas dorso-laterais descontínuas, pele lisa nas partes ventrais e presença de quilhas laterais nos dedos das mãos e dos pés. Esta espécie habita os bosques altoandinos, entre a puna e o bosque montano, e foi encontrada em ambientes úmidos entre musgos e debaixo de pedras em altitudes de 3519 a 3707 m acima do nível do mar.Describimos una nueva especie de Bryophryne proveniente de la Cordillera de Vilcabamba, en el Departamento de Cusco, en los Andes del sureste de Perú. La nueva especie se diferencia de las demás especies de Bryophryne, excepto por B. flammiventris y B. gymnotis, por tener membrana y anillo timpánico poco definidos, machos con sacos y hendiduras vocales, y por emitir llamados nupciales; además, se diferencia de B. flammiventris y B. gymnotis por la textura de su piel, la presencia de procesos vomerianos pequeños y oblicuos, coloración ventral gris azulada a gris clara con manchas marrones irregulares o reticuladas, y llamado nupcial compuesto por dos o tres notas. Los especímenes de la nueva especie se caracterizan además por tener piel dorsal finamente granulada con tubérculos, pliegues dorsolaterales discontinuos, piel lisa en partes ventrales, y presencia de quillas laterales en los dedos de manos y pies. Esta especie habita los bosques altoandinos, entre la puna y el bosque montano, y fue encontrada en ambientes húmedos entre musgo y bajo piedras a elevaciones de 3519 a 3707 m s.n.m.We describe a new species of Bryophryne from the Cordillera de Vilcabamba in Department Cusco, in the southeastern Peruvian Andes. The new species differs from all other congeneric taxa, except B. flammiventris and B. gymnotis, by possessing a weakly defined tympanic membrane and tympanic annulus, by the presence of vocal sac and vocal slits in males, and by producing advertisement calls. The new species is distinguished from B. flammiventris and B. gymnotis by skin texture, presence of small, oblique dentigerous processes on the vomer, ventral coloration ranging from bluish-gray to whitish-gray with irregular or reticulate dark brown spots, and call composed of two or three notes. The new species is further characterized by having dorsal skin shagreen with tubercles, discontinuous dorsolateral folds, skin smooth on ventral surfaces of the body, and lateral fringes on fingers and toes. This species was found at the transition from montane forest to high Andean puna, where it occurs in moist microhabitats under moss and rocks at elevations from 3519 to 3707 m a.s.l

New insights into Clostridium Difficile (CD) infection in Latin America : Novel description of toxigenic profiles of diarrhea-associated to CD in Bogotá, Colombia

Clostridium difficile (CD) produces antibiotic associated diarrhea and leads to a broad range of diseases. The source of CD infection (CDI) acquisition and toxigenic profile are factors determining the impact of CD. This study aimed at detecting healthcare facility onset- (HCFO) and community-onset (CO) CDI and describing their toxigenic profiles in Bogotá, Colombia. A total of 217 fecal samples from patients suffering diarrhea were simultaneously submitted to two CDI detection strategies: (i) in vitro culture using selective chromogenic medium (SCM; chromID, bioMérieux), followed verification by colony screening (VCS), and (ii) molecular detection targeting constitutive genes, using two conventional PCR tests (conv. PCR) (conv.16S y conv.gdh) and a quantitative test (qPCR.16s). The CD toxigenic profile identified by any molecular test was described using 6 tests independently for describing PaLoc and CdtLoc organization. High overall CDI frequencies were found by both SCM (52.1%) and conv. PCR (45.6% for conv.16S and 42.4% for conv.gdh), compared to reductions of up to half the frequency by VCS (27.2%) or qPCR.16S (22.6%). Infection frequencies were higher for SCM and conv.16S regarding HCFO but greater for CO concerning conv.gdh, such differences being statistically significant. Heterogeneous toxigenic profiles were found, including amplification with lok1/3 primers simultaneously with other PaLoc markers (tcdA, tcdB or tcdC). These findings correspond the first report regarding the differential detection of CDI using in vitro culture and molecular detection tests in Colombia, the circulation of CD having heterogeneous toxigenic profiles and molecular arrays which could affect the impact of CDI epidemiology. © 2018 Muñoz, Ríos-Chaparro, Herrera, Soto-De Leon, Birchenall, Pinilla, Pardo-Oviedo, Josa, Patarroyo and Ramírez

An endemic and endangered new species of the lizard liolaemus montanus group from southwestern peru (Iguania: Liolaemidae), with a key for the species of the l. reichei clade

The southwestern Andes of Peru harbor a hidden taxonomic diversity of reptiles. We describe a new species of Liolaemus Wiegmann (Iguania: Liolaemidae) from xerophytic environments of the southwestern slopes of the Andes of Peru, 2,400– 2,900 m asl. The new species, previously considered to be a population of L. insolitus Cei, exhibits unique diagnostic characters of morphology, scalation and color pattern, and molecular evidence that suggest that it belongs in the Liolaemus montanus species group and the L. reichei clade. Moreover, the species is endemic to the eastern slopes of La Caldera batholith in the Department of Arequipa, southern Peru. We also provide information on the conservation status of the species and suggest it be included in the IUCN red list of the threatened species as endangered (EN). A key for the species of the L. reichei clade is provided.Fil: Quiroz, Aarón J.. Universidad Nacional de San Agustin de Arequipa; PerúFil: Huamaní Valderrama, Ling. Universidad Nacional de San Agustin de Arequipa; PerúFil: Gutiérrez, Roberto C.. Universidad Nacional de San Agustin de Arequipa, Museo de Historia Natural; PerúFil: Aguilar Kirigin, Alvaro Juan. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: López Tejeda, Evaristo Luciano. Universidad Nacional de San Agustin de Arequipa; PerúFil: Lazo Rivera, Ana. Universidad Nacional de San Agustin de Arequipa; PerúFil: Huanca Mamani, Wilson. Universidad de Tarapacá; ChileFil: Valladares Faúndez, Pablo. Universidad de Tarapacá; ChileFil: Morrone, Juan José. Universidad Nacional Autónoma de México; MéxicoFil: Cerdeña, José. No especifíca;Fil: Chaparro, Juan C.. No especifíca;Fil: Abdala, Cristian Simón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; Argentin

Some color in the desert: description of a new species of Liolaemus (Iguania: Liolaemidae) from southern Peru, and its conservation status.

The desert of southern Peru and northern Chile is an area with a high degree of endemismin squamate reptiles. In this work, an endemic new species is described in the genus Liolaemus with a restricted geographical distribution on the western slopes of the La Caldera batholith in the Department of Arequipa, southern Peru, that inhabits the Desert province of southern Peru, between 1,800 and 2,756 m asl. The new species is characterized by a unique combination of morphological and molecular characters that distinguish it from all other Liolaemus species, and it is included in the L. reichei clade within the L. montanus group. Evidence presented shows that the category of threat corresponds to Endangered under the IUCN Red List criteriaFil: Huamani Valderrama, Ling. Universidad Nacional de San Agustín. Facultad de Ciencias Biológicas. Departamento Académico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Quiroz, Aarón J.. Universidad Nacional de San Agustín. Facultad de Ciencias Biológicas. Departamento Académico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Gutierrez, Roberto C.. Universidad Nacional de San Agustín. Facultad de Ciencias Biológicas. Departamento Académico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Aguilar Kiriguin, Alvaro. Universidad Nacional de San Agustín. Facultad de Ciencias Biológicas. Departamento Académico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Huanca Mamani, Wilson. Universidad de Tarapacá; ChileFil: Valladares Faúndez, Pablo. Universidad de Tarapaca.; ChileFil: Cerdeña, José. Universidad Nacional de San Agustín. Facultad de Ciencias Biológicas. Departamento Académico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Chaparro, Juan C,. Museo de Biodiversidad del Perú; PerúFil: Abdala, Cristian Simón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; Argentin

An endemic new species of Andean lizard of the genus Liolaemus from southern Peru (Iguania: Liolaemidae) and its phylogenetic position

Integrative evidence of several external morphological characters and molecular phylogeneticanalyses of mitochondrial DNA (12S, cyt-b) are used to place a new species of Andean lizard of the genus Liolaemus (Iguania: Liolaemidae) in the Liolaemus montanus group and as sister group of the clade formed by L. signifer. The new species is characterized by a unique combination of morphometric characteristics, scalation, and color pattern. The L. montanus group now contains seventeen species in southern Peru, distributed along the eastern and western slopes of the Andes.Utilizamos evidencia integradora de varios caracteres morfológicos externos y análisis filogenéticos moleculares de ADN mitocondrial (12S, cyt-b) que ubican una nueva especie del género Liolaemus (Iguania: Liolaemidae) en el grupo de Liolaemus montanus y como grupo hermano del clado formado por L. signifer. La nueva especie se caracteriza por una combinación única de patrón morfométrico, escamación y color. El grupo montanus del género Liolaemus en Perú contiene diecisiete especies, distribuidas a lo largo de la vertiente oriental y occidental de los Andes en el sur del paísFil: Chaparro, Juan C.. Museo de Biodiversidad del Perú; PerúFil: Quiroz, Aaron. Universidad Nacional de San Agustín. Facultad de Ciencias Biológicas. Departamento Académico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Mamani, Luis. Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco; PerúFil: Gutiérrez, Roberto C.. Universidad Nacional de San Agustín. Facultad de Ciencias Biológicas. Departamento Académico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Condorí, Peter. Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco; PerúFil: de la Riva, Ignacio. Consejo Superior de Investigaciones Científicas; EspañaFil: Herrera Juárez, Gabriela. niversidad Nacional de San Agustín de Arequipa; PerúFil: Cerdeña José. Universidad Nacional de San Agustín. Facultad de Ciencias Biológicas. Departamento Académico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Arapa, Laura Andrea. Universidad Nacional de San Agustín. Facultad de Ciencias Biológicas. Departamento Académico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Abdala, Cristian Simón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; Argentin

A new species of pitviper of the genus Bothrops (Serpentes: Viperidae: Crotalinae) from the Central Andes of South America

We describe a new species of montane pitviper of the genus Bothrops from the Cordillera Oriental of the Central Andes, distributed from southern Peru to central Bolivia. The new species can be distinguished from its congeners by the characteristic combination of a dorsal body color pattern consisting of triangular or subtriangular dark brown dorsal blotches, paired dark brown parallel occipital stripes, a conspicuous dark brown postocular stripe, the presence of canthorostrals in some specimens, prelacunal fused or partially fused with second supralabial, one scale usually separating internasals, rostral trapezoidal, two canthals oval to rounded, similar size or slightly larger than internasals, three or four medial intercanthals, eight to twelve intersupraoculars, intercanthals and intersupraoculars keeled and frequently slightly keeled, supraoculars oval, one to three suboculars, two to three postoculars, loreal subtriangular, two to six prefoveals, subfoveals absent, two or none postfoveals, one or two scales between suboculars and fourth supralabial, seven or eight supralabials, nine or eleven infralabials, 23-25 middorsal scales, 189-195 ventrals in females and 182-190 in males, 48-58 subcaudals in females and 54-63 in males, exceptionally undivided. The new species is apparently restricted to areas within Andean montane forests that are less humid and devoid of large trees.Fil: Timms, J.. Museo Nacional de Ciencias Naturales; EspañaFil: Chaparro Auza, Juan C.. Museo de Biodiversidad del Perú; PerúFil: Venegas, Pablo J.. Centro de Ornitología y Biodiversidad; PerúFil: Salazar Valenzuela, David. Universidad Tecnológica Indoamérica; EcuadorFil: Scrocchi Manfrini, Gustavo Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; ArgentinaFil: Cuevas, Jairo. Universidad Complutense de Madrid; EspañaFil: Leynaud, Gerardo Cristhian. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Zoología Aplicada; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Diversidad y Ecología Animal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto de Diversidad y Ecología Animal; ArgentinaFil: Carrasco, Paola Andrea. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Zoología Aplicada; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Diversidad y Ecología Animal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto de Diversidad y Ecología Animal; Argentin

High frequency of toxigenic Clostridium difficile and Clostridium perfringens coinfection among diarrheic patients at health care facility-onset (HCFO) and community-onset (CO) centers in Bogotá, Colombia

Background: The aim of this study was to evaluate the frequency of toxigenic C. difficile and C. perfringens infections at health care facility-onset (HCFO) and community-onset (CO), in two health care centers (HCC) in Bogotá, Colombia. A total of 220 stool samples from patients presenting diarrhea acquired at HCFO or CO were analyzed by several PCR tests. Results: We found that 65.5% (n = 144) of the population had C. difficile infection, followed by toxigenic C. difficile with 57.3% (n = 126), and finally toxigenic C. perfringens with a frequency of 32.7% (n = 72). Conclusions: This study is the first molecular detection and characterization of C. difficile and C. perfringens in HCFO and CO in Latin America and demonstrates a relevant frequency of these two species, including coinfection and strikingly diverse toxigenic profiles, especially in the CO. © 2019 The Author(s)

A new species of Bothrops (Serpentes: Viperidae: Crotalinae) from Pampas del Heath, southeastern Peru, with comments on the systematics of the Bothrops neuwiedi species group

We describe a new species of pitviper of the genus Bothrops from the Peruvian Pampas del Heath, in the Bahuaja-Sonene National Park. Pampas del Heath is an area of seasonally flooded savannas and a northwestern extension of the Gran Chaco Boliviano-Paraguayo. The new species is easily distinguished from its congeners by the exclusive combination of dorsal color pattern of body consisting of small C-shaped blotches, postocular stripe originating posteriorly to the eye, covering posterior supralabials, dorsum of the head with paired markings arranged symmetrically, venter cream heavily speckled with brown, prelacunal scale discrete in contact with second supralabial, three to five prefoveals, subfoveal single usually present, postfoveals absent to two, canthals two, seven intersupraoculars, one or two suboculars, two or three postoculars, seven or eight supralabials, nine to eleven infralabials, 26-27 interrictals, 23-25 middorsal scales, 172 ventrals in the female and 169-173 in males, 45 subcaudals in the female and 50 in males. We performed separate and combined phylogenetic analyses based on morphology and five mitochondrial genes and recovered the new species as a member of the Bothrops neuwiedi species group. All lineages of this clade inhabit the South American dry diagonal. This novel species of pitviper increases the known diversity of the genus Bothrops and adds to the number of described taxa from the unique and scarcely known ecosystem of Pampas del Heath.Fil: Carrasco, Paola Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Diversidad y Ecología Animal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto de Diversidad y Ecología Animal; ArgentinaFil: Grazziotin, Felipe G.. Governo do Estado de Sao Paulo. Secretaria da Saude. Instituto Butantan; BrasilFil: Farfan, Roy Santa Cruz. Museo de Historia Natural de la Universidad Nacional de; PerúFil: Koch, Claudia. Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig; AlemaniaFil: Ochoa, José A.. Museo de Biodiversidad del Perú; PerúFil: Scrocchi Manfrini, Gustavo Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; ArgentinaFil: Leynaud, Gerardo Cristhian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Diversidad y Ecología Animal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto de Diversidad y Ecología Animal; ArgentinaFil: Chaparro, Juan C.. Museo de Biodiversidad del Perú; Per

Descripción y relaciones filogenéticas de una nueva especie de Liolaemus (Iguania: Liolaemidae) y notas sobre el grupo de L. montanus de Perú

Se describe una nueva especie de lagartija del grupo de Liolaemus montanus, endémico de lavertiente occidental de los Andes, en la provincia de Huaytará, departamento de Huancavelica,Perú. Esta nueva especie de Liolaemus, es de tamaño medio (máximo LHC 70,1 mm),se caracteriza por presentar un patrón de coloración único en los machos, donde numerosasescamas celestes se destacan sobre el dorso del cuerpo y el vientre es de color amarillo intenso.Además tiene las escamas del dorso y lados del cuerpo subimbricadas, con quilla leve y deforma redondeada a triangular. Tanto machos como hembras tienen poros precloacales. Lacombinación de varios estados de caracteres morfológicos, morfométricos, de escamación, yen el patrón de coloración, diferencian claramente este nuevo taxón de las demás especies deLiolaemus, especialmente de los integrantes del grupo de L. montanus descritos para el centroy sur del Perú. Asimismo, en este trabajo, presentamos una revisión del estado taxonómico ydistribución de las especies del grupo de L. montanus descritas o citadas para Perú.Fil: Gutierrez Roberto C.. Universidad Nacional de San Agustin. Facultad de Cs. Biológicas. Departamento Academico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Chaparro, Juan C.. Universidad Nacional de San Agustin. Facultad de Cs. Biológicas. Departamento Academico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Vásquez, Meylin Y.. Universidad Nacional de San Agustin. Facultad de Cs. Biológicas. Departamento Academico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Quiroz, Aaron J.. Universidad Nacional de San Agustin. Facultad de Cs. Biológicas. Departamento Academico de Biología. Museo de Historia Natural; PerúFil: Aguilar Kiriguin, A.. Colección Boliviana de Fauna; BoliviaFil: Abdala, Cristian Simón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; Argentin

Description and phylogenetic relationships of a new species of Liolaemus (Iguania: Liolaemidae) and notes on the L. montanus group of Peru

A new lizard species of the Liolaemus montanus group endemic of the Andes western slope, Huaytará Province, Huancavelica, Peru is described. This new species of Liolaemus is of medium size (maximum SVL 70.1 mm) and is characterized by presenting a unique color standard in males, where several light-blue scales on the back and side of the body are prominent, and the abdomen is of an intense yellow. Also, the scales of the back and sides of the body are sub-imbricated, with a slight keel and its shape is rounded to triangular. While females, as well as males exhibit pre-cloacal pores. The combination of several states of morphological, morphometric and flake characters and their color standard clearly differentiate these new taxa of the other Liolaemus species, especially of the members of the L. montanus group described for the center and south of Peru. Also, in this study, we present a revision of the taxonomic status and distribution of species of the L. montanus group described or cited for Peru.Se describe una nueva especie de lagartija del grupo de Liolaemus montanus, endémico de la vertiente occidental de los Andes, en la provincia de Huaytará, departamento de Huancavelica, Perú. Esta nueva especie de Liolaemus, es de tamaño medio (máximo LHC 70,1 mm), se caracteriza por presentar un patrón de coloración único en los machos, donde numerosas escamas celestes se destacan sobre el dorso del cuerpo y el vientre es de color amarillo intenso. Además tiene las escamas del dorso y lados del cuerpo subimbricadas, con quilla leve y de forma redondeada a triangular. Tanto machos como hembras tienen poros precloacales. La combinación de varios estados de caracteres morfológicos, morfométricos, de escamación, y en el patrón de coloración, diferencian claramente este nuevo taxón de las demás especies de Liolaemus, especialmente de los integrantes del grupo de L. montanus descritos para el centro y sur del Perú. Asimismo, en este trabajo, presentamos una revisión del estado taxonómico y distribución de las especies del grupo de L. montanus descritas o citadas para Perú.Asociación Herpetológica Argentin