Characterization of polymorphic microsatellite markers for the Neotropical leaf-frog Phyllomedusa burmeisteri and cross-species amplification

Twelve polymorphic tetranucleotide microsatellite loci were isolated and characterized for the leaf-frog Phyllomedusa burmeisteri, an endemic species of the Brazilian Atlantic forest. These loci were screened in 25 individuals from two populations of the Minas Gerais State (Carangola and Juiz de Fora). The number of alleles per locus ranged from 3 to 16 (mean = 8). Observed and expected heterozygosities ranged from 0.25 to 0.92 and 0.56 to 0.92, respectively. Evidence for both the presence of null alleles and Hardy-Weinberg equilibrium deviations were found in loci Phybu4, Phybu17, and Phybu21. Genotypic disequilibrium for each pair of loci across populations was not significant. Cross-species amplification was successful for 11 of the 12 developed loci for the sister-species, P. bahiana. These microsatellites will be important for future fine-scale population structure analyses

Utilização de marcadores microssatélites no melhoramento populacional do arroz.

Introdução; Estudo de caso - análise molecular da cultivar Tio Taka por marcadores microssatélites; Análise dos genitores da população CNA-IRAT; Variabilidade genética do germoplasma de arroz; Escolha de genitores para a composição de novas populações de seleção recorrente; Considerações finais.bitstream/CNPAF/23246/1/doc_169.pd

Tendência genética para características de crescimento e reprodução em bovinos avaliados em teste de desempenho.

Objetivou-se avaliar as tendências genéticas para as características de crescimento e reprodução de bovinos Nelore avaliados em Teste de Desempenho de Touros Jovens

Fluxo gênico entre arroz vermelho e arroz cultivado estimado por meio de marcadores microssatélites.

Este trabalho objetivou avaliar a capacidade de marcadores SSR em detectar a ocorrência de fluxo gênico entre o arroz vermelho (AV) e o arroz cultivado (AC). Marcadores SSR são utilizados em análise genômica de plantas devido ao alto conteúdo informativo, serem co-dominantes e baseados na reação de PCR. O ensaio de campo foi realizado em dez círculos concêntricos de 5 m a 50 m de distância, a partir de uma planta AV central, que foi a fonte doadora de pólen. Foram semeadas 120 plantas de arroz da cultivar BR-Irga 409, distribuídas nas interseções entre os círculos e doze raios. A partir de 51 marcadores SSR, foram selecionados quatro marcadores que detectaram polimorfismo entre o AV e AC, para identificar os alelos de AV em sementes produzidas pelas plantas da cultivar BR-Irga 409. A distância máxima encontrada entre a planta AV doadora de pólen e uma planta AC que produziu sementes híbridas (AV x AC) foi de 10 m. Teoricamente, sob 0,1% de taxa de cruzamento, esta distância de polinização pode dar origem a 4.710 sementes híbridas entre AC e AV, o que, na geração seguinte, resultará em 3.532 plantas produzindo grãos vermelhos. Marcadores SSR foram capazes de identificar fluxo gênico entre AR e AC; e, portanto, podem ser empregados em associação com outras metodologias (ex. plantas tolerantes a herbicidas) para melhorar a precisão das estimativas de polinização cruzada em arroz

Parâmetros genéticos de caracteres de crescimento e reprodutivas em rebanhos selecionados da raça nelore.

RESUMO - Objetivou-se com este estudo estimar as herdabilidades e correlações genéticas entre os caracteres de crescimento e reprodutivas em bovinos Nelore criados extensivamente a pasto. O banco de dados foi fornecido pela Associação Nacional dos Criadores e Pesquisadores (ANCP), de cinco rebanhos, totalizando 34.137 animais. Os parâmetros genéticos foram estimados em análises uni e bicaracterísticas sob modelo animal, usando o algoritmo EM-REML disponível no programa REMLF90. As estimativas de herdabilidade dos efeitos aditivos diretos variaram de 0,10 a 0,46. As herdabilidades dos efeitos maternos variaram, 0,04 a 0,09. As estimativas de correlação entre os caracteres variaram de ?0,70 a 0,97, sendo todas favoráveis. As estimativas de herdabilidades obtidas permitem concluir que existe variabilidade genética nos rebanhos, indicando o progresso genético. E as correlações genéticas obtidas foram favoráveis, indicando a seleção para aumento de uma acarretará a melhoria do outro caráter. ABSTRACT - The objective of this study was to estimate the heritabilities and genetic correlations between growth and reproductive traits in Nelore cattle raised extensively to pasture. The database was provided by the National Association of Breeders and Researchers (ANCP), of five herds, totaling 34,137 animals. The genetic parameters were estimated in uni and bicaracterísticas analyzes under animal model, using the EM-REML algorithm available in the program REMLF90. Heritability estimates of direct additive effects ranged from 0.10 to 0.46. Heritabilities of maternal effects ranged from 0.04 to 0.09. Estimates of correlation between the characters ranged from -0.72 to 0.97, all of which were favorable. The estimates of heritabilities obtained allow to conclude that there is genetic variability in the herds, indicating the genetic progress. And the genetic correlations obtained were favorable, indicating the selection for increase of one will entail the improvement of the other character

Determinação da variabilidade alélica de marcadores SSR entre ciclos de recombinação das populações de seleção recorrente de arroz CNA-IRAT 4 e CNA 12.

Este trabalho teve como objetivo a caracterização por meio de marcadores moleculares SSR, dos genitores e indivíduos amostrados na etapa de recombinação das populações de seleção recorrente CNA-IRAT4 e CNA12

Microsatellite analysis of Tio Taka, the first rice commercial cultivar released from the recurrent selection breeding method.

This paper aims: to estimate the genetic variability of the genitors of the CNA-IRAT 4 population and the cultivar Tio Taka derived from this population; and to discuss this variability in relation to rice germplasm under cultivation in Brazil

Sub-local differences in Late Holocene land use at Orstad, Jæren in SW-Norway, revealed by soil pollen stratigraphy

Made available with permission from Maney Publishing / Environmental Archaeology. www.maneypublishing.com/journals/env and www.ingentaconnect.com/content/maney/env.Four soil profiles along an 84 m transect through a clearance cairn field on podsol soils at Orstad, Jæren, SW Norway, were investigated. By relating pollen-analytical results to soil stratigraphical and morphological features, it was possible to reconstruct the landuse history of the site, and to reveal differences along the transect, although pollen preservation was poor. Human activity at Orstad began about 4500 uncalibrated 14C years BP. The reason for an intermediate abandonment of the site between about 4000 and 3600 uncalibrated 14C years BP was presumably a higher ground-water level, caused by local deforestation and/or by a climatic change. After that period, people seem to have grown cereals (Triticum and Hordeum) on at least two different field patches on the site. This land use was presumably occasional, and related to extraordinary needs. Fire-clearance seems to have been practised to prepare the fields for cultivation after long fallow periods. Between 2900 and 3200 uncalibrated 14C years BP, Orstad was possibly permanently inhabited. The agricultural fields were moved to higher levels, as the initial fields had become nutrient-depleted and too moist. Thin black layers in the profile may be remains of manure