10 research outputs found
PROSTAT KANSERİ HÜCRE DİZİNİNDE FOTODİNAMİK VE SONODİNAMİK TEDAVİLERİN ETKİSİ
Bu çalışmanın amacı, prostat kanseri tedavisinde metilen mavisi veya fiyorbid a-aracılı sonodinamik, fotodinamik ve sonofotodinamik tedavilerin olası antitümör etkilerinin ve etki mekanizmalarının in vitro incelenmesidir. Sonodinamik ve sonofotodinamik tedaviler yeni tür noninvaziv yöntemler olup kanser tedavisinde önemli bir yere sahip olacağı düşünülmektedir. Bu bağlamda, tedavilerin hücre canlılığı üzerine etkileri MTT testi ile apoptotik morfolojik değişimler hoechst/propidiyum iyodid boyamayla, apoptotik yolakta ve wnt sinyal yolağında bulunan proteinlerin miktarları western blot yöntemiyle ve bu yolaklardaki proteinlerin gen düzeyindeki ekspresyonlarına etkileri RT-PCR analizi ile incelenmiştir. Ayrıca, tedavi sonrası hücrelerdeki reaktif oksijen türlerinin miktarı ile antioksidan sistemlerdeki değişimler biyokimyasal yöntemlerle incelenmiştir. Sonuçlara göre tek başına ışık veya ultrases uygulamasının kontrole nazaran hücre canlılığına etkisi yokken, uygulanan tedavilerin hücre canlılığını azalttığı belirlenmiştir. Ayrıca, kontrol hücrelerine nazaran tedavi gruplarında apoptotik hücrelerin sayısının önemli oranlarda arttığı gözlenmiştir. Uygulanan tedavilerin hücrelerde kaspaz-8, kaspaz-3, Parp ve Bax proteinlerinin seviyelerinde artışa, kaspaz-9 ve bcl2 protein seviyelerinde azalmalara yol açtığı gözlenmiştir. RT-PCR sonuçlarına göre wnt sinyal yolağındaki proteinlerin gen düzeyinde ekspresyonlarının uygulanan tedavilerle değiştiği gözlenmiştir. Ayrıca, uygulanan tedavilerin prostat kanser hücrelerinde ROS ve MDA seviyelerinde artış, GSH, CAT ve SOD seviyelerinde azalmaya neden olduğu tespit edilmiştir. Sonuç olarak prostat kanseri tedavisinde sonodinamik, fotodinamik ve sonofotodinamik tedavilerin umut verici etkilere sahip olduğu ve bu etkilerin hücre içi ROS miktarı ile indüklenen apoptoz ve wnt yolağı ile ilişkili olabileceği gösterilmiştir.TUBİTAK-SBAG 114S491 proje numarası ile ve Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi proje numarası TPF-15068.KABUL VE ONAY SAYFASI ................................................................................................... i
TEŞEKKÜR ............................................................................................................................... ii
İÇİNDEKİLER .......................................................................................................................... iii
SİMGELER ve KISALTMALAR DİZİNİ ................................................................................ v
ŞEKİLLER DİZİNİ .................................................................................................................. vii
TABLOLAR DİZİNİ ................................................................................................................ ix
ÖZET .......................................................................................................................................... x
ABSTRACT .............................................................................................................................. xi
1. GİRİŞ ..................................................................................................................................... 1
2. GENEL BİLGİLER ................................................................................................................ 3
2.1. Prostat Kanseri .................................................................................................................... 3
2.1.1. Prostat Anatomisi ............................................................................................................. 3
2.1.2. Prostat Kanseri Epidemiyolojisi ve Etiyolojisi ................................................................ 4
2.1.3. Prostat Kanserinde Tanı ................................................................................................... 6
2.1.4. Prostat Kanserinin Gelişimi ve Prostat Kanserinde Sinyal Yolakları .............................. 8
2.1.5. Wnt Sinyal İletisinde Rol Oynayan Başlıca Proteinler .................................................. 12
2.1.5.1. Wnt proteinleri ............................................................................................................ 12
2.1.5.2. Frizzled proteinleri ...................................................................................................... 13
2.1.5.3. Lipoprotein ilişkili reseptör proteinler ....................................................................... 13
2.1.5.4. Axin ............................................................................................................................. 13
2.1.5.5. β- katenin ..................................................................................................................... 14
2.1.5.6. Adenomatosis polyposis coli ....................................................................................... 14
2.1.5.7. T hücre faktörü/lenfoid arttırıcı faktör ........................................................................ 15
2.1.5.8. Glikojen sentaz kinaz 3 ............................................................................................... 15
2.1.5.9. Dishevelled .................................................................................................................. 16
2.1.5.10. Wnt sinyali ile apoptozun ilişkisi .............................................................................. 16
2.1.6. Prostat Kanserinde Tedavi Yöntemleri .......................................................................... 17
2.2. Fotodinamik ve Sonodinamik Tedaviler ........................................................................... 18
2.2.1. Fotodinamik Tedavi ....................................................................................................... 18
2.2.2. Fotodinamik Tedavinin Tarihçesi .................................................................................. 20
2.2.3. Fotodinamik Tedavide Kullanılan Işık Kaynakları ........................................................ 22
2.2.4. Sonodinamik Tedavi ...................................................................................................... 23
2.2.5. Sonodinamik Tedavinin Tarihçesi ................................................................................. 26
2.2.6. Fotodinamik ve Sonodinamik Tedavide Kullanılan Ajanlar .......................................... 27
2.2.6.1. Porfirin ve türevleri ..................................................................................................... 29
2.2.6.2. Porfirin olmayan ajanlar .............................................................................................. 32
2.2.7. Fotodinamik Terapinin Kanser Tedavisinde Kullanımı ................................................. 33
2.2.8. Sonodinamik Terapinin Kanser Tedavisinde Kullanımı ................................................ 35
2.2.9. Fotodinamik ve Sonodinamik Terapide Hücre Ölümü Mekanizmaları ......................... 36
3. GEREÇ ve YÖNTEM .......................................................................................................... 39
3.1. Hücre Kültürü Yöntemi ..................................................................................................... 39
iv
3.1.1. Hücre Kültüründe Kullanılan Hücre Hatları .................................................................. 41
3.1.2. Besiyerinin Hazırlanması ve Hücrelerin Çoğaltılması ................................................... 41
3.1.3. Hücrelerin Dondurulması ve Çözdürülmesi ................................................................... 42
3.1.4. Hücre Sayımı ve Deney Düzeneğinin Kurulması .......................................................... 42
3.1.5. Fotosensitif/Sonosensitif Ajanların Uygulanması .......................................................... 43
3.1.6. Işık ve Ultrases Uygulamaları ........................................................................................ 44
3.2. Ölçüm ve Değerlendirmeler .............................................................................................. 46
3.2.1. Hücre Canlılığı Testleri .................................................................................................. 46
3.2.2. Apoptoz ve Nekroz Tayini ............................................................................................. 46
3.2.3. Western Blot yöntemi ..................................................................................................... 47
3.2.3.1. Hücre lizatının hazırlanması ve uygulanması ............................................................. 47
3.2.3.2. SDS-PAGE elektroforez ............................................................................................. 48
3.2.3.3. Jelin membrana transfer edilmesi ................................................................................ 50
3.2.3.4. Görüntüleme ................................................................................................................ 52
3.2.4. RNA izolasyonu ve RT-PCR ......................................................................................... 53
3.2.4.1. Hücre hatlarından total RNA izolasyonu .................................................................... 53
3.2.4.2. cDNA sentezi .............................................................................................................. 54
3.2.4.3. RT-PCR protokolü ...................................................................................................... 55
3.2.5. Biyokimyasal Ölçümler .................................................................................................. 56
3.2.5.1. Reaktif oksijen türleri miktarının ölçümü ................................................................... 56
3.2.5.2. Süperoksit dismutaz aktivitesinin belirlenmesi ........................................................... 57
3.2.5.3. İndirgenmiş glutatyon ölçümü .................................................................................... 58
3.2.5.4. Malondialdehit ölçümü ............................................................................................... 59
3.2.5.5. Katalaz aktivitesi ölçümü ............................................................................................ 60
3.2.6. İstatistiksel Analiz .......................................................................................................... 60
4. BULGULAR ........................................................................................................................ 61
4.1. PCa Hücre Dizinlerinde Sonosensitif/Fotosensitif Ajanların Tek Başına Etkinliği.......... 61
4.2. PC3 ve LNCaP Hücre Dizinlerinde Işık ve Ultrasesin Tek Başına Etkinliği ................... 62
4.3. PCa Hücre Dizinlerine Sonodinamik Tedavi Uygulanması .............................................. 64
4.4. PCa Hücre Dizinlerine Fotodinamik Tedavi Uygulanması ............................................... 66
4.5. PC3 ve LNCaP Hücrelerine Sonofotodinamik Tedavilerin Etkisi .................................... 67
4.6. PC3 ve LNCaP Hücre Dizinlerinde Apoptoz ve Nekroz Tayini Sonuçları ...................... 70
4.6.1. PHa-Aracılı Tedavilerin Prostat Kanseri Hücre Dizinlerine Apoptotik Etkileri ............ 70
4.6.2. MB-Aracılı Tedavilerin Prostat Kanseri Hücre Dizinlerine Apoptotik Etkileri ............ 73
4.7. PCa Hücre Dizilerinde Tedavi Sonrası Western Blot Sonuçları ....................................... 76
4.8. PCa Hücre Dizilerinde Tedavi Sonrası Wnt Sinyal Yolağı Gen İfade Seviyeleri ............ 80
4.9. Prostat Kanseri Hücre Dizilerinde Tedavi Sonrası Biyokimyasal Analizler .................... 84
5. TARTIŞMA ......................................................................................................................... 86
6. SONUÇLAR ve ÖNERİLER ............................................................................................... 95
KAYNAKLAR ......................................................................................................................... 97
EKLER ................................................................................................................................... 115
ÖZGEÇMİŞ ........................................................................................................................... 11
The effect of inclination angle on the strength of vertical mattress configuration for meniscus repair
Vertical mattress configuration is the strongest of all other configurations and the repairing devices of meniscus repair. The purpose was whether increasing the inclination angle between two strands of the vertical mattress configuration by increasing the amount of meniscus tissue captured would enhance the initial strength of the construction
Green synthesis of silver nanoparticles via Cynara scolymus leaf extracts: The characterization, anticancer potential with photodynamic therapy in MCF7 cells.
In this study, we report on the synthesis of silver nanoparticles (AgNPs) from the leaf extracts of Cynara scolymus (Artichoke) using microwave irradiation and the evaluation of its anti-cancer potential with photodynamic therapy (PDT). Silver nanoparticles formation was characterized by scanning electron microscopy with energy dispersive x-ray spectroscopy and Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy. Silver nanoparticles formation was also investigated the surface charge, particle size and distribution using zetasizer analysis. The cytotoxic effect of AgNPs and/or PDT was studied by MTT assay and migration by the scratch assay. The apoptotic inducing ability of the AgNPs and/or PDT was investigated by intracellular ROS analysis, antioxidant enzyme levels (SOD, CAT, GPx and GSH), Hoechst staining and Bax/Bcl-2 analysis using western blotting. The mean particle size of produced AgNPs was found 98.47±2.04 nm with low polydispersity (0.301±0.033). Zeta potential values of AgNPs show -32.3± 0.8 mV. These results clearly indicate the successful formation of AgNPs for cellular uptake. Mitochondrial damage and intracellular ROS production were observed upon treatment with AgNPs (10μg/mL) and PDT (0.5 mJ/cm2) showed significant reducing cell migration, expression of Bax and suppression of Bcl-2. Significantly, biosynthesized AgNPs showed a broad-spectrum anti-cancer activity with PDT therapy and therefore represent promoting ROS generation by modulating mitochondrial apoptosis induction in MCF7 breast cancer cells
Ozone Partially Decreases Axonal and Myelin Damage in an Experimental Sciatic Nerve Injury Model
Aim: To investigate the effects of ozone in experimental acute sciatic nerve injury. Material and Methods: Twenty-eight male rats were divided into four groups (n = 7): control (C), ozone (O), injury (SNI), and treatment with ozone after injury (SNI + Ozone). Sciatic nerve injury was generated by compressing the right sciatic nerve for 90 s using a Yasargil aneurysm clip in groups SNI and SNI + Ozone. A 70 µg/ml concentration of ozone was given four times (once a day at 1st, 24th, 48th, and 72th h) at a dose of 0.5 mg/kg to groups O and SNI + Ozone after injury by an intraperitoneal injection. Nerve conduction velocities of all rats were measured by in vivo electrophysiological tests at the end of the day 4. Then, plasma malondialdehyde, total oxidant and antioxidant status were measured and also axonal and myelin changes in sciatic nerves of histopathological examination were performed. The data were analyzed by Kolmogorov Smirnov test, Mann–Whitney U-test, and Chi square test. p <.05 was considered statistically significant. Results: The proximal and distal latency difference were higher and nerve conduction velocity were lower in SNI group than C and O groups, and the myelin structure was found to be broken in group SNI compared to groups C and O. However, the amplitude of the compound action potential, the nerve conduction velocity were significantly higher in group SNI + Ozone than in group SNI. Moreover, myelin injury was significantly lower in group SNI + Ozone compared to group SNI. Total oxidant status in group SNI was significantly higher than in groups C, O, and SNI + Ozone. But, total antioxidant status in group SNI was significantly lower than in groups C, O, and SNI + Ozone. Conclusion: This study showed that the administration of ozone at a dose of 0.5 mg/kg after peripheral nerve injury in rats reduces myelin and axonal injury
CCDC 2012502: Experimental Crystal Structure Determination
Related Article: Ebube E. Oyeka, Ilknur Babahan, Bernard Eboma, Kenechukwu J. Ifeanyieze, Obinna C. Okpareke, Esin P. Coban, Ali Özmen, Burak Coban, Mehran Aksel, Namık Özdemir, Tatiana.V. Groutso, Jude I. Ayogu, Ufuk Yildiz, Mehmet Dinçer Bilgin, H. Halil Biyik, Briana R. Schrage, Christopher J. Ziegler, Jonnie N. Asegbeloyin|2021|Inorg.Chim.Acta|528|120590|doi:10.1016/j.ica.2021.12059
CCDC 2065533: Experimental Crystal Structure Determination
Related Article: Ebube E. Oyeka, Ilknur Babahan, Bernard Eboma, Kenechukwu J. Ifeanyieze, Obinna C. Okpareke, Esin P. Coban, Ali Özmen, Burak Coban, Mehran Aksel, Namık Özdemir, Tatiana.V. Groutso, Jude I. Ayogu, Ufuk Yildiz, Mehmet Dinçer Bilgin, H. Halil Biyik, Briana R. Schrage, Christopher J. Ziegler, Jonnie N. Asegbeloyin|2021|Inorg.Chim.Acta|528|120590|doi:10.1016/j.ica.2021.12059
CCDC 2012503: Experimental Crystal Structure Determination
Related Article: Ebube E. Oyeka, Ilknur Babahan, Bernard Eboma, Kenechukwu J. Ifeanyieze, Obinna C. Okpareke, Esin P. Coban, Ali Özmen, Burak Coban, Mehran Aksel, Namık Özdemir, Tatiana.V. Groutso, Jude I. Ayogu, Ufuk Yildiz, Mehmet Dinçer Bilgin, H. Halil Biyik, Briana R. Schrage, Christopher J. Ziegler, Jonnie N. Asegbeloyin|2021|Inorg.Chim.Acta|528|120590|doi:10.1016/j.ica.2021.12059
CCDC 2009344: Experimental Crystal Structure Determination
Related Article: Ebube E. Oyeka, Ilknur Babahan, Bernard Eboma, Kenechukwu J. Ifeanyieze, Obinna C. Okpareke, Esin P. Coban, Ali Özmen, Burak Coban, Mehran Aksel, Namık Özdemir, Tatiana.V. Groutso, Jude I. Ayogu, Ufuk Yildiz, Mehmet Dinçer Bilgin, H. Halil Biyik, Briana R. Schrage, Christopher J. Ziegler, Jonnie N. Asegbeloyin|2021|Inorg.Chim.Acta|528|120590|doi:10.1016/j.ica.2021.12059
CCDC 2009343: Experimental Crystal Structure Determination
Related Article: Ebube E. Oyeka, Ilknur Babahan, Bernard Eboma, Kenechukwu J. Ifeanyieze, Obinna C. Okpareke, Esin P. Coban, Ali Özmen, Burak Coban, Mehran Aksel, Namık Özdemir, Tatiana.V. Groutso, Jude I. Ayogu, Ufuk Yildiz, Mehmet Dinçer Bilgin, H. Halil Biyik, Briana R. Schrage, Christopher J. Ziegler, Jonnie N. Asegbeloyin|2021|Inorg.Chim.Acta|528|120590|doi:10.1016/j.ica.2021.12059