387 research outputs found

    The Stabilizing Function of Superficial Shoulder Muscles Changes Between Single-Plane Elevation and Reaching Tasks

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    Objective: The goal of the current study was to determine whether and how much the stabilizing role of the shoulder muscles changes as a function of humeral elevation and the plane of elevation. Methods: A musculoskeletal model, comprising a personalized scapulohumeral rhythm, was used to calculate the ratio of shear over compressive force (stability ratio) of three rotator cuff muscles (supraspinatus, infraspinatus, subscapularis) and three superficial shoulder muscles (middle deltoid, clavicular part of pectoralis major, latissimus dorsi) during abduction, flexion and reaching movements in ten healthy adults. Results: The range of the stability ratios was [±0.5] for the rotator cuff muscles compared to [+5, −2] for the superficial shoulder muscles. In the superior-inferior direction, the stability ratios of all muscles changed with humeral elevation and for infraspinatus, subscapularis, latissimus dorsi and deltoid also with the plane of elevation. In the anterior-posterior direction, the stability ratios of all muscles changed with humeral elevation, except for the deltoid, and with the plane of elevation, except for the supraspinatus, with interaction effects in all muscles. Conclusion: The rotator cuff muscles provide greater compression than shear forces during all tasks. The stabilizing function of the superficial shoulder muscles examined in this study varies during tasks. Significance: The findings can be used to predict in which movements the shoulder joint becomes more unstable and can be applied to understand how shear and compressive forces change in populations with abnormal shoulder motion

    Konkursboets rett til å tre inn i aksjonæravtaler etter dekningsloven § 7-3

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    MasteroppgaveJUS39

    Eine hypofunktionelle Mutation in der Polynukleotid-Phosphorylase führt zu einer autosomal-rezessiven nicht-syndromalen Hörstörung

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    Hörstörungen sind beim Menschen mit einer Prävalenz von 1 bis 2 auf 1000 Neugeborene die häufigste Erkrankung der Sinnesorgane. Kongenitale Hörstörungen können sowohl genetische als auch umweltbedingte Ursachen haben, wobei in Industrieländern mindestens 50-60% der Fälle frühkindlicher Taubheit auf eine genetische Ursache zurückzuführen sind. Im Rahmen dieser Arbeit sollte der ursächliche Gendefekt identifiziert werden, der in einer konsanguinen marokkanischen Familie für eine nicht-syndromale Form autosomal-rezessiver Hörstörung verantwortlich ist. In der untersuchten Familie sind drei Kinder von Geburt an taub, die Eltern und drei weitere Kinder sind nicht betroffen. Nachdem Mutationen in GJB2, dem häufigsten Taubheitsgen, ausgeschlossen werden konnten, wurde anhand der acht Familienmitglieder eine genomweite Kopplungsanalyse durchgeführt. Diese ergab einen putativ gekoppelten Locus mit einem LOD-Score von 2,7 auf Chromosom 2 und einen weiteren mit einem LOD-Score von 1,5 auf Chromosom 12. Durch die Analyse von zusätzlichen Mikrosatelliten-Markern konnte, da betroffene Individuen nicht den gleichen Haplotypen aufwiesen, der Locus auf Chromosom 12 ausgeschlossen werden. Die Kopplung des Locus auf Chromosom 2 hingegen konnte bestätigt werden. Diese Kandidatengenregion, die durch die Mikrosatellitenmarker D2S119 und D2S378 begrenzt wird, wurde entsprechend der Nomenklatur für autosomal-rezessive Taubheitsloci DFNB70 benannt und ist auf der Hereditary Hearing Loss Homepage registriert. Der DFNB70-Locus umfasst 13,2 Megabasen mit 49 annotierten Genen. Durch direktes Sequenzieren der kodierenden Exons und angrenzenden Spleiß-Stellen aller Gene innerhalb der gekoppelten Region wurde bei betroffenen Individuen eine einzelne homozygote nicht-annotierte Missense-Veränderung in dem Gen PNPT1 identifiziert. Der Austausch von Adenin nach Guanin an der Nukleotidposition 1424 (c.1424A>G) in PNPT1 hat auf Proteinebene eine Substitution von Glutaminsäure zu Glycin (p.E475G) zur Folge. Weder in mehr als 400 gesunden Kontrollindividuen unterschiedlicher ethnischer Herkunft noch in Datenbanken wie dbSNP oder dem Exome Variant Server konnte diese Mutation gefunden werden, wodurch ausgeschlossen werden konnte, dass es sich um einen häufigen Polymorphismus handelt. Die Polynukleotid-Phosphorylase (PNPase), die von PNPT1 kodiert wird, ist ein evolutionär hochkonserviertes Protein, das in Bakterien am RNA-Metabolismus beteiligt ist. Bei Säugetieren ist die PNPase im Intermembranraum von Mitochondrien lokalisiert und stellt das bisher einzig bekannte Protein dar, das den Import von RNAs in Mitochondrien vermittelt. Dieser Prozess ist sowohl für die Replikation als auch für die Transkription des mitochondrialen Genoms notwendig. Die kodierende Sequenz des PNPT1-Orthologs im Zebrafisch, welches bis dato nicht annotiert gewesen ist, konnte vollständig identifiziert und kloniert werden. Mittels in situ Hybridisierung konnte die Expression von PNPT1 in frühen Entwicklungsstadien des Zebrafisches aufgeklärt werden. Vergleichbar mit der embryonalen Letalität der bereits beschriebenen PNPT1-Knockout-Maus führte ein Morpholino-Knockdown des PNPT1-Gens zu schweren Störungen der frühen Zebrafischentwicklung. Sowohl für die Maus als auch für den Zebrafisch scheint die Funktion der PNPase von essentieller Bedeutung zu sein. Der immunhistochemische Nachweis der PNPase in der murinen Cochlea konnte deren Expression in dem betroffenen Organ, darunter insbesondere in den Haarzellen und in den Neuronen der Spiral- bzw. Vestibularganglien, belegen. In vitro Analysen in Bakterien, in der Hefe und in Säugetierzellen ergaben, dass die E475G Mutation ein hypofunktionelles Allel darstellt. In Komplementationsversuchen konnte z.B. gezeigt werden, dass exogen exprimierte bakterielle Wildtyp-PNPase das Wachstumsdefizit eines PNPase defizienten E. coli-Stämms signifikant besser ausgleichen konnte, als die entsprechende PNPase-Mutante. Sowohl in der Hefe als auch in Säugetierzellen sind die Trimerisierung der PNPase und der mitochondriale RNA-Import der RNase P RNA durch die E475G-Mutation beeinträchtigt. Der verringerte Import der RNase P RNA hat vermutlich zur Folge, dass die Prozessierung mitochondrialer Transkripte durch die RNase P gestört ist, wodurch es zu einer Akkumulation von unprozessierten Transkripten in der mitochondrialen Matrix kommen würde. Ähnlich wie durch Mutationen in mitochondrialen Genen, die bekanntermaßen zu Hörstörungen führen können, könnte die Akkumulation dieser Transkripte eine Erklärung für die Taubheit in der untersuchten Familie sein. Zusammenfassend konnte erstmalig gezeigt werden, dass eine beeinträchtigte Funktion der PNPase mit wahrscheinlich reduziertem mitochondrialen RNA-Import zu einer erblichen Hörstörung beim Menschen führen kann

    Desenvolvimento de um método rápido para detecção de Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) em cromatografia liquida acoplada a espectrometria de massas (LC-MS/MS)

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    Enterobacterales resistentes aos carbapenêmicos (ERC) foram reconhecidas como uma ameaça urgente à saúde global que causam a maioria das infecções de difícil tratamento em estabelecimentos de saúde e estão associadas a elevada mortalidade. ERCs produtoras de Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC), principalmente Klebsiella pneumoniae, são mundialmente disseminadas e responsáveis por um grande número de surtos. Métodos rápidos de diagnóstico proporcionam grandes benefícios clínicos e epidemiológicos. Recentemente, um método de detecção direta de KPC baseado em cromatografia líquida acoplada a espectrometria de massas (LC-MS/MS) foi desenvolvido. O objetivo deste trabalho foi padronizar e validar este método, com adaptações adequadas às nossas especificações e disponibilidade de equipamentos. Testamos o nosso método contra uma ampla variedade de isolados, incluindo produtores de outras carbapenemases. Para fase de validação foram selecionados 111 isolados (49 KPC-positivos e 62 KPC-negativos) provenientes de um estudo de vigilância para o monitoramento de Enterobacterales com susceptibilidade reduzida aos carbapenêmicos. Os resultados foram avaliados por um operador experiente que desconhecia a caracterização prévia dos isolados. O operador classificou corretamente 47 dos 49 isolados KPC-positivos. Todos os isolados KPC-negativos (n=62) foram corretamente classificados. O método apresentou uma sensibilidade de 96,07% e uma especificidade de 100%. A presença de outras carbapenemases não interferiu nos resultados. O peptídeo APIVLAVYTR se apresentou negativo em 19 dos 49 isolados KPC-positivos, enquanto GFLAAAVLAR apresentou apenas um resultado negativo. LTLGSALAAPQR e LALEGLGVNGQ foram detectados em todos extratos proteicos. Em conclusão, nossos resultados demonstram que os peptídeos marcadores de KPC foram robustamente detectados pelo método em LC-MS/MS, que apresentou elevada sensibilidade e especificidade e pode ser utilizado como um método confirmatório para detecção deste mecanismo de resistência em Enterobacterales.Carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) have been recognized as an urgent threat to global health that cause of the majority of the difficult-to-treat infections in health-care settings and are associated with high mortality. Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) producing CREs, specially Klebsiella pneumoniae, are globally disseminated and responsible for a large number of outbreaks. Rapid methods for KPC detection provide great clinical and epidemiological benefits. Recently, a method based in liquid chromatography-tandem MS (LC-MS/MS) was developed. The aim of this study was to standardize and validate this method, with adaptations to suit our equipment availability and specifications. We tested our method against a broad variety of isolates, including other carbapenemases producers. For validation phase 111 isolates (49 KPC-positives and 62 KPC-negatives) from a surveillance study monitoring Enterobacterales with reduced susceptibility to carbapenems were selected. The results were evaluated by an expert operator blinded to the isolates previous characterization. The operator correctly classified 47 of 49 KPC-positive isolates. All KPC-negative isolates (n=62) were correctly classified. The method yields 96.07% sensitivity and 100% specificity. The presence of other carbapenemases did not interfere in the results. The APIVLAVYTR peptide was called negative in 19 from 49 KPC-positive isolates while GFLAAAVLAR presented just one negative result. LTLGSALAAPQR and LALEGLGVNGQ were detected in all protein extracts. In conclusion, our results demonstrate that the KPC peptide markers were robustly detected by the method which presented high sensitivity and specificity and therefore can be used as a confirmatory method to identify this resistance mechanism among Enterobacterales

    Estudo retrospectivo sobre a prevalência de Streptococcus agalactiae em gestantes em um município do interior do Rio Grande do Sul, Brasil

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    Introdução: O Streptococcus agalactiae, também conhecido como estreptococo do grupo B (EGB), é uma bactéria pertencente à microbiota de seres humanos e encontra-se aderido às membranas das mucosas, colonizando principalmente os tratos gastrointestinal e geniturinário. Métodos: Trata-se de um estudo retrospectivo que envolveu a coleta de dados do Laboratório de Análises Clínicas de Veranópolis (RS), no período de abril de 2014 a fevereiro de 2017. Resultados: No período estudado, realizaram o exame no referido laboratório 109 gestantes que se encontravam a partir da 27ª semana de gestação, das quais 92 (84,4%) apresentaram resultado negativo e 17 (15,6%) apresentaram resultado positivo para S. agalactiae. Conclusão: Os resultados demonstram a importância de realizar a pesquisa de S. agalactiae antes do parto, para manter o recém-nascido e a mãe em segurança e sem complicações. Palavras-chave: Streptococcus agalactiae; gestante

    Prevalência de infecções do trato urinário e perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos em pacientes atendidos em um laboratório de análises clínicas

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    Introdução: A infecção do trato urinário (ITU) é uma doença comum na clínica médica; assim é importante o conhecimento dos agentes etiológicos envolvidos e seu perfil de suscetibilidade. Objetivo: Verificar a prevalência e o perfil de suscetibilidade dos principais agentes etiológicos das ITUs em um laboratório de análises clínicas de Veranópolis. Métodos: Foram analisados 3070 laudos de uroculturas do período de um de junho de 2015 a 30 junho de 2018. Resultados: Houve crescimento bacteriano em 20,1% (616/3070) das uroculturas analisadas. Escherichia coli foi a bactéria mais frequentemente isolada, em 67% (413/616) das amostras, seguida de Proteus mirabilis e Klebsiella pneumoniae, em 7,1% (44/616) e 7% (43/616), respectivamente. Verificou-se uma maior prevalência de ITUs no sexo feminino; a faixa etária de 0 a 10 anos a mais acometida com 16,7% (84/498). No sexo masculino, as maiores incidências foram nas faixas de 0 a 10 e 71 a 80 anos, ambas com 19,5% (23/118). Quanto ao perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos das bactérias mais prevalentes, verificou-se uma elevada resistência da E. coli à ampicilina (46,49%), seguido de sulfazotrim (30,02%) e ampicilina-sulbactam (20,10%). P. mirabilis também apresentou elevada resistência à ampicilina (52,27%), seguida de sulfazotrim (29,55%) e amoxicilina-clavulanato (29,55%). Todos os isolados de K. pneumoniae apresentaram resistência à ampicilina, seguida de nitrofurantoína (69,77%) e cefalexina (44,19%). Conclusão: Verificou-se uma maior prevalência de ITUs em pacientes da faixa etária entre 0 e 10 anos e no sexo feminino. Altas taxas de resistência a alguns antimicrobianos e considerável sensibilidade a outros foram verificadas nas três bactérias mais frequentemente isoladas

    Genomic surveillance of SARS-CoV-2 lineages indicates early circulation of P.1 (gamma) variant of concern in Southern Brazil

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    The SARS-CoV-2 P.1 lineage emerged in Amazonas (AM), North Brazil and its evolution has been dynamically reported associated with increased transmissibility and/or immune evasion. Here, we evaluated the lineages circulating in 29 cities in Rio Grande do Sul (RS), Southern Brazil between March 2020 and May 2021 and investigated the genetic events associated with the emergence of the P.1. A total of 202 oro/nasopharyngeal SARS-CoV-2 specimens from patients during routine hospital care were submitted to whole-genome sequencing. Phylogenetic and Bayesian Evolutionary Analyses of the P.1 lineage were carried out to determine the relationship between sequences from RS and AM and dated their common ancestor and origin. One hundred six (53%) sequences were assigned as P.1 and most carried the 22 lineage-defining mutations. All the P.1 sequences included other important mutations, such as P314L and R203K/G204R, and revealed a high genetic diversity in the phylogenetic tree. The time-scaled inference suggests that the oldest P.1 sequences from different Brazilian states share a ancestor with those from AM, but the origin of some sequences from RS is unknown. Further, the common ancestor of sequences from RS is dated to mid-June/July 2020, earlier than those previously reported from AM. Our results demonstrate that there is a high degree of genetic diversity among P.1 sequences, which suggests a continuous evolution and community spread of the virus. Although the first P.1 outbreak was reported in AM, the lineage was associated with multiple introductory events and had already been circulating in Southern Brazil prior to November 2020
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