A Review of the Mitogenomic Phylogeny of the Chondrichthyes

The phylogenetic analysis of the Chondrichthyes has been the subject of intense debate over the past two decades. The principal relationships within the group based on the analysis of morphological traits are inconsistent with the available molecular topologies, and the phylogeny of these animals is highly controversial, at all levels, ranging from superorders to families and even the genera within families. With the recent development of new generation sequencing (NGS), many phylogenies are now being inferred based on the complete genome of the species. In 2015 and 2016 alone, around 21 new elasmobranch genomes were made available in GenBank. In this context, the principal objective of the present study was to infer the phylogeny of the sharks and rays based on the complete mitochondrial genomes available in the literature. A total of 73 mitogenomes of chondrichthyan species were analyzed. The phylogenetic trees generated rejected the “Hypnosqualea” hypothesis and confirmed the monophyly of the Neoselachii and Batoidea as sister groups of the sharks. These mitogenomic analyses provided ampler and more complete insights into the relationships between the sharks and rays, in particular, the topologies obtained by the analyses revealed a number of incongruities in certain groups of sharks and rays, and the interrelationships between them

Commercialization of a critically endangered species (largetooth sawfish, Pristis perotteti) in fish markets of northern Brazil: Authenticity by DNA analysis

AbstractPristis perotteti, the largetooth sawfish, is one of most endangered elasmobranchs because of fisheries and habitat degradation. Its commercialization in Brazil is prohibited, but fresh or salted fillets of this fish can be found in markets, labeled as “sharks”. In this study we performed genetic analyses on “shark” samples from two important fishery-trading ports in northern Brazil (Vigia and Bragança). Based on partial DNA sequences of the mitochondrial 16S and Cyt b genes, 24 (55%) out of 44 samples were unequivocally identified as P. perotteti while the others comprised eight species of the families Carcharhinidae and Ginglymostomatidae. These results show that fishing surveillance and monitoring have not been effective to prohibit the commercialization of this highly endangered species

Identification and phylogenetic inferences on stocks of sharks affected by the fishing industry off the Northern coast of Brazil

The ongoing decline in abundance and diversity of shark stocks, primarily due to uncontrolled fishery exploitation, is a worldwide problem. An additional problem for the development of conservation and management programmes is the identification of species diversity within a given area, given the morphological similarities among shark species, and the typical disembarkation of processed carcasses which are almost impossible to differentiate. The main aim of the present study was to identify those shark species being exploited off northern Brazil, by using the 12S-16S molecular marker. For this, DNA sequences were obtained from 122 specimens collected on the docks and the fish market in Bragança, in the Brazilian state of Pará. We identified at least 11 species. Three-quarters of the specimens collected were either Carcharhinus porosus or Rhizoprionodon sp, while a notable absence was the daggernose shark, Isogomphodon oxyrhyncus, previously one of the most common species in local catches. The study emphasises the value of molecular techniques for the identification of cryptic shark species, and the potential of the 12S-16S marker as a tool for phylogenetic inferences in a study of elasmobranchs

Análise econômica na cultura do milho segunda safra em resposta a doses e fontes de nitrogênio

Fertilization is one of the most relevant conditions to increase maize productivity, with the patient being the crop that absorbs the most nutrients from food. Most of the nitrogen fertilizers used in Brazil are water soluble and release quickly, which can be absorbed by plants and easily lost. Conventional urea is the most used source of water due to its higher concentration of high N2 and lower cost, but it has losses due to volatilization. The use of controlled-release fertilizers has been proposed to reduce losses, synchronize nutrient release with crop demand and increase the recovery efficiency of nutrients applied to the soil. In this sense, the objective of this work was to evaluate the economic viability of using different doses and travel sources in the off-season corn crop. The test was treated in the experimental area by the company Pulveriza Soluções Agrícolas, in the city of Rio Verde – GO, Brazil. Corn was sown on 01/29/2022, using a 5-row seeder with a horizontal disc seed distribution system. The experimental design used was randomized blocks, analyzed in a 5 x 2 + 1 factorial scheme, with 4 replications, totaling 40 experimental plots. Grain productivity per hectare increased as the fuel doses applied increased, regardless of the source.La fertilización es una de las condiciones más relevantes para incrementar la productividad del maíz, siendo el nitrógeno el cultivo que mayor cantidad de nutrientes absorbe. La mayoría de los fertilizantes nitrogenados utilizados en Brasil son solubles en agua y liberan nitrógeno rápidamente, que las plantas pueden absorber y perder fácilmente. La urea convencional es la fuente de nitrógeno más utilizada por su mayor concentración de N2 y menor costo, pero presenta altas pérdidas por volatilización. Se ha propuesto el uso de fertilizantes de liberación controlada para reducir pérdidas, sincronizar la liberación de nutrientes con la demanda del cultivo y aumentar la eficiencia de recuperación de los nutrientes aplicados al suelo. En este sentido, el objetivo de este trabajo fue evaluar la factibilidad económica del uso de diferentes dosis y fuentes de nitrógeno en el cultivo de maíz de contraestación. La prueba fue realizada en el área experimental por la empresa Pulveriza Soluções Agrícolas, en la ciudad de Rio Verde - GO, Brasil. El maíz se sembró el 29/01/2022, utilizando una sembradora de 5 hileras con sistema de distribución de semillas de discos horizontales. El diseño experimental utilizado fue bloques al azar, analizados en un esquema factorial 5 x 2 + 1, con 4 repeticiones, totalizando 40 parcelas experimentales. La productividad de grano por hectárea aumentó a medida que aumentaron las tasas de nitrógeno aplicadas, independientemente de la fuente.A adubação é uma das condições mais relevantes para aumentar a produtividade do milho, sendo o nitrogênio a cultura que absorve maiores quantidades de nutrientes. A maioria dos fertilizantes nitrogenados usados ​​no Brasil são solúveis em água e liberam nitrogênio rapidamente, que pode ser absorvido pelas plantas e facilmente perdido. A ureia convencional é a fonte de nitrogênio mais utilizada devido à sua maior concentração de N2 e menor custo, porém apresenta altas perdas por volatilização. O uso de fertilizantes de liberação controlada tem sido proposto para reduzir as perdas, sincronizar a liberação de nutrientes com a demanda da cultura e aumentar a eficiência de recuperação dos nutrientes aplicados ao solo. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi avaliar a viabilidade econômica do uso de diferentes doses e fontes de nitrogênio na cultura do milho safrinha. O ensaio foi conduzido na área experimental pela empresa Pulveriza Soluções Agrícolas, na cidade de Rio Verde – GO, Brasil. O milho foi semeado em 29/01/2022, utilizando uma semeadora de 5 linhas com sistema de distribuição de sementes por disco horizontal. O delineamento experimental utilizado foi em blocos ao acaso, analisado em esquema fatorial 5 x 2 + 1, com 4 repetições, totalizando 40 parcelas experimentais. A produtividade de grão por hectare cresceu conforme o aumento das doses de nitrogênio aplicadas, independente da fonte

MACROECOLOGIA, BIOGEOGRAFIA E ÁREAS PRIORITÁRIAS PARA CONSERVAÇÃO NO CERRADO

revista vol 13 nº 3.indd Há consenso entre os cientistas de que a há atualmente uma “crise da biodiversidade”, resultado da constante e intensa perda de habitat natural causada pela expansão da ocupação. Como a biologia da conservação tem sido muitas vezes reconhecida como uma ciência da crise, ela deve fornecer informações capazes de mediar, de forma mais científica possível, as tomadas de decisão que são necessárias. Dentre estas, uma das mais importantes é indicar regiões prioritárias para a conservação, já que por motivos óbvios não é possível preservar todos os ecossistemas por inteiro. Nesse contexto, recentemente sugeriu-se que a aplicação de princípios, teorias e análises provenientes da biogeografia e da macroecologia seriam importantes na Biologia da Conservação, formalizando uma abordagem que tem sido denominada “Biogeografia da Conservação”. Assim, o objetivo deste artigo é discutir e revisar esses componentes da biogeografia da conservação, utilizando uma abordagem macroecológica para desenvolver e aplicar métodos de planejamento sistemático em conservação, utilizando o bioma Cerrado como um modelo de estudo. Foram discutidos inicialmente os padrões de riqueza e diversidade beta e, em um segundo momento, como esses padrões podem ser correlacionados à ocupação humana do Bioma. Essa relação é fundamental para subsidiar a aplicação de modelos de planejamento sistemático de conservação em escala regional (análises de insubstituibilidade, complementaridade e de lacunas). É preciso considerar também que há sérias falhas de conhecimento sobre os padrões de biodiversidade na região e que a escolha de grupos indicadores pode ser importante para minimizar problemas gerados pela falta de conhecimento. Assim, essa abordagem é interessante em um cenário de grandes incertezas (ausência de dados detalhados) e de rápida transformação da paisagem, possibilitando a otimização de estudos em grandes escalas e depois transferir os resultados para escalas espaciais mais locais e realmente relevantes para a conservação. Nessas regiões, podem ser realizados, em um segundo momento, estudos mais detalhados a fim de avaliar padrões de viabilidade populacional, fragmentação de habitat e regiões potenciais de manutenção da diversidade genética

Pervasive gaps in Amazonian ecological research

Biodiversity loss is one of the main challenges of our time,1,2 and attempts to address it require a clear un derstanding of how ecological communities respond to environmental change across time and space.3,4 While the increasing availability of global databases on ecological communities has advanced our knowledge of biodiversity sensitivity to environmental changes,5–7 vast areas of the tropics remain understudied.8–11 In the American tropics, Amazonia stands out as the world’s most diverse rainforest and the primary source of Neotropical biodiversity,12 but it remains among the least known forests in America and is often underrepre sented in biodiversity databases.13–15 To worsen this situation, human-induced modifications16,17 may elim inate pieces of the Amazon’s biodiversity puzzle before we can use them to understand how ecological com munities are responding. To increase generalization and applicability of biodiversity knowledge,18,19 it is thus crucial to reduce biases in ecological research, particularly in regions projected to face the most pronounced environmental changes. We integrate ecological community metadata of 7,694 sampling sites for multiple or ganism groups in a machine learning model framework to map the research probability across the Brazilian Amazonia, while identifying the region’s vulnerability to environmental change. 15%–18% of the most ne glected areas in ecological research are expected to experience severe climate or land use changes by 2050. This means that unless we take immediate action, we will not be able to establish their current status, much less monitor how it is changing and what is being lostinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio