The Hidden Though Flourishing Justification of Intellectual Property Laws: Distributive Justice, National Versus International Approaches

Bu çalışmada, Gökkuşağı alabalıklarında enfeksiyonoluşturan Ichthyophthirius multifiliis’infarklı bölgelerden izole edilmiş saha suşlarının genotipik yapıları temelindeimmundominant özellik gösteren rekombinant immobilizan antijenlerini(i-antijen) kodlayan genlerin bakteriyel ekspresyon sistemine klonlanarakeksprese ve karakterize edilmeleri, antijenik profillerinin ortaya çıkarılmasıve aşı adayı olabilecek rekombinant antijenlerin elde edilmesi amaçlanmıştır.&nbsp;Çalışmada 2018 ve 2019 yıllarının Temmuz ve Ağustos ayları arasında Gökkuşağıalabalığı yetiştiriciliğinin yoğun yapıldığı Samsun, Rize, Kayseri, Elazığ,Burdur, Antalya ve Muğla illerinde bulunan işletmeler ziyaret edilerek balıkpopülasyonları üzerinde saha araştırmaları yürütülmüş ve I. multifiliis ile enfekte bulunan balıklardan ilgili protokolleregöre izolasyon gerçekleştirilmiştir. Laboratuvara uygun solüsyonlar ve soğukzincir altında intikal ettirilen örneklerden cDNA ve gDNA izolasyonlarıgerçekleştirilmiştir. I. multifiliis i-antijengen lokusunun amplifikasyonu amacıyla optimum primer dizaynı için ön çalışmalaryürütülmüş ve hedef gen bölgeleri uygun amplifikasyon koşullarında PCR’daçoğaltılmıştır. Elde edilen amplikonlar agaroz jel üzerinden saflaştırılmıştır.Multiple gen lokusu sekanslarının belirlenebilmesi amacıyla ilgili pürifiyeamplikonlar pJET 1.2 plazmit vektörüne CloneJET PCR cloning kit (Thermo FisherScientific) kullanılarak klonlanmış ve katı besi yerinde belirlenenkolonilerden rekombinant plazmid DNA izolasyonları gerçekleştirilmiştir. Rekombinantplazmidler spesifik primerlerle çift yönlü olarak sekanslanmış vekromotogramlar De Novo Assemble üzerinden işlenerek hedef insert sekanslarvektör plazmid DNA’sı içerisinden çıkarılmış ve konsensüs sekanslar eldeedilmiştir. İlgili primerlerin i-antijen gen lokusu içerisinde çoğalttığı fragmentlerinbelirlenebilmesi amacıyla PCR ürünleri ayrıca yeni nesil dizileme teknolojisi (NGS)kullanılarak işlenmiş ve elde edilen dizilimlerin gen veri tabanlarındakimevcut tüm i-antijen gen lokusları ile filogenetik ilişkileri araştırılmıştır.Tüm bu araştırmalar sonucu karakterize edilen i-antijen genlerinin ekspreseettiği proteinlerin rekombinant olarak eldesi için çalışmalargerçekleştirilmiştir. Aşı adayı potansiyeli olabilecek bazı lokusların bakteriyelekspresyon sistemine aktarımı için kodon optimizasyonları yapılarak pET-32a(+)ekspresyon plazmid DNA’sına (Novagen) klonlanması gerçekleştirilmiştir. Eldeedilen rekombinant plazmitler E. colikompotent BL21(DE3) hücrelerine transforme edilerek optimum koşullardaekspresyon çalışmaları yürütülmüş ve ekspresyon etkinliği SDS-PAGE ve WesternBlot analizleri ile belirlenmiştir. Eksprese edilen rekombinant i-antijenproteinleri afinite kromotografi kulanılarak saflaştırılmış ve immunreaktiflikleri Western Blot analizleri ile tespit edilmiştir.&nbsp;Çalışmada,Elazığ, Rize ve Muğla illerinde ziyaret edilen işletmelerdeki Gökkuşağıalabalıklarında deri ve solungaçlarından hazırlanan preparatların mikroskobikincelemeleri ile I. multifiliisenfeksiyonunun yaygın olduğu görülmüştür. İlgili bölgelerden elde edilen I. multifiliis suşlarına ait cDNA vegDNA izolatlarının i-antijen gen lokusunun dizayn edilen pirmerlerle PCR’daamplifiye edilmesi sonucu 1200-1300 bp büyüklüğünde amplikonlar saptanmıştır.Pürifiye amplikonların klonlanması sonucu ilgili izolatlara ait açık okumaçerçevesi (ORF) sekanslarının analizinde birbirleriyle %38,3-58,8 arasındafarklılık gösteren 4 farklı i-antijen izoformu tespit edilmiştir. Bu izoformlararasında bir antijenik lokusun (ImulTR1-iant) her üç ildeki alabalıkpopülasyonlarından izole edilen I.multifiliis suşlarında da var olduğu NGS analizlerinde görülmüştür.ImulTR1-iant ORF sekansı ayrıca Amerika Birleşik Devletleri’nde alabalıklardanizole edilmiş bir i-antijen izoformuyla %83,3 identiklik gösterirken, diğertespit edilen izoformlara ait sekansların GenBank veri tabanında mevcuti-antijen sekanslarından oldukça farklı olduğu belirlenmiştir. Araştırmadarekaombinant i-antijen eldesi için yaygın belirlenen ImulTR1-iant izolatıüzerinden analizler yürütülmüştür. Bu izoformu kodlayan gen bölgesinin 1263bpbüyüklüğünde olduğu ve ORF’nin 420 amino asitten teşekkül ettiğibelirlenmiştir. ORF amino asit sekanslarının in-slico analizlerde 42,552 kDabüyüklüğünde bir proteini eksprese ettiği, bu proteinin sitoplazmik olduğu vetransmembran bölge içermediği tespit edilmiştir. Ayrıca ilgili ORF sekansıiçerisinde uzunluğu 7-22aa arasında değişen 21 antijenik bölge olduğubelirlenmiştir. Kodon optimizasyonu yapılmış olan ImulTR1-iant izoformuna ait pET-32a(+)rekombinant plazmitinin E. colikompotent BL21(DE3) hücrelerine transformasyonu ve ekspresyonu sonrasındayapılan SDS-PAGE analizlerinde in-silico analiz sonuçlarına paralel olarakyaklaşık 43kDa’luk protein jel üzerinde görüntülenmiştir. İlgili rekombinantprotein afinite kromotografide HisTrap FF crude (GE Healthcare) kolonlarıkullanılarak saflaştırılmış ve pürifiye rekombinant antijenin immun-reaktifliğiWestern-Blot analizleriyle gösterilmiştir.&nbsp;ErciyesÜniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından TOA-2017-7742 kodnumarasıyla desteklenen bu çalışma ile Türkiye’de gökkuşağı alabalıklarındasorun oluşturan ve ekonomik kayıplara yol açan I. multifiliis suşlarına karşı biyoteknolojik aşı geliştirilmesinoktasında aşı adayı olabilecek immobilizan antijenler üzerine özgün veriler sağlanmıştır.Elde edilen aşı adayı rekombinant antijenlerin etkinliğini ortaya koymanoktasında laboratuvar ve saha şartlarında immunizasyon ve çelınç enfeksiyondenemeleri için yeni proje çalışmaları planlanmaktadır.</style

The relationship between compliance level and value creation: evidence from integrated reports in Turkey

Purpose This study aims to investigate the level of reporting compliance in terms of content elements, measure to what extent each content element of the integrated reporting (IR) framework is linked to value creation and demonstrate the relationship between the level of compliance and value creation linkages. Design/methodology/approach The sample for this study consists of 12 companies, 11 of which are public and 1 is non-public. The data is obtained from the Integrated Reporting Turkey Network founded in 2015 in Turkey. This study applies a holistic approach integrating two different content analysis methods. First, a multi-weighted scoring system is constructed by using the IR content elements and the previously developed indexes in the literature. Second, in-depth, sentence-by-sentence content analysis is used to determine the relation between the content elements and value creation. Findings The results of the multi-weighted scoring system indicate a high level of compliance in the banking sector. On the other hand, the scores of the content analysis demonstrate higher scores in the disclosures of "basis of preparation and presentation", "organizational overview and external environment", "strategy and resource allocation", "performance" and "business model" elements, while lower scores in the elements of "risk and opportunities" and "outlook." The lowest compliance level associated with lower content analysis scores may indicate a low level of value creation potential. Consequently, this two-stage scoring is critical, as it clarifies the relation between compliance level and the explanatory power of each content element from a value creation perspective. Originality/value This study aims to support the policymakers and regulators in highlighting the importance of measuring and reporting value. Furthermore, it intends to encourage companies to produce reports that increase the value relevance of accounting information to contribute to the development of capital markets. The current literature includes research that mainly concentrates only on the quality or extent of IR disclosure practices. This study offers a combined analysis that helps to determine at what level a company has accomplished the expectations of the International Integrated Reporting Council in terms of both the content and the value creation potential

The main determinants of differences in compliance levels of disclosure items for IAS 16 in BIST

Purpose - This paper aims to empirically examine the main determinants of the compliance level of disclosure requirements for IAS 16, as well as factors that may explain the differences in the levels of compliance within companies

A comprehensive perspective on a Vagococcus salmoninarum outbreak in rainbow trout broodstock

Streptococcus species are of major concern for both warm-water and cold-water salmonid species, and have zoonotic importance. While Lactococcus garvieae, associated with warm-water streptococcosis, causes thousands of tons of mortalities, Vagococcus salmoninarum, the causative agent of cold-water streptococcosis, leads to chronic disease and devastating mortality in broodstock. In the present study, five bacterial samplings were performed from outbreaks that occurred between winter 2019 and summer 2020 in rainbow trout broodstock. The isolates were comprehensively characterized by phenotypic tests, using the API 20 Strept, Rapid ID 32 Strept and BIOLOG GENIII test kits. The antimicrobial susceptibilities of the strains were compared by the disk diffusion method, according to the guidelines of the Clinical & Laboratory Standards Institute (CLSI), additionally on commonly used media such as mueller-hinton agar and tryptic soy agar. Following a genomic approach, we analyzed the VS-1 strain by whole-genome sequencing. Virulence genes and correlation data were supported with the histopathological examination of the affected organs and tissues. The genome of the VS-1 strain included 69 virulence genes and 31 antimicrobial resistance genes. This study is one of the most comprehensive researches on V. salmoninarum, and elucidates the phenotypic, genotypic, antimicrobial resistance and virulence characteristics of this species

Does fibrin glue affect liver regeneration? An experimental study in rats

Background: Fibrin glue has been used to prevent bleeding from the raw liver surface after hepatectomy. Fibrin glue has been proposed to induce hepatic regeneration but has not been clarified yet. Aim: In this study, we investigated the effect of fibrin glue on liver regeneration. Settings and Design: An experimental study in rats. Materials and Methods: After the 2/3 hepatectomy, a standard, 1 cm edged triangle was resected from the remaining lobe and a raw surface was obtained in 56 males Wistar rats. The rats were randomized to two groups: liver was repaired with prolene mattress sutures in one group and was sealed with fibrin glue in the other. Four rats were sacrificed immediately after the surgery in both groups for liver weight calculations. It was observed that resected liver constituted 71.6% (± 1.6) of total liver weight. On first, second and seventh day post-operatively, eight rats were sacrificed in each group. Morphological liver regenerations were assessed with liver weight restoration ratio and proliferating cell nuclear antigen (PCNA) labeling index. Results: No rat died during the study. The mean liver weight restoration ratio in suture and fibrin glue groups were similar at each time point studied: The percentage of the restored liver weight in suture and fibrin groups were 45% (± 17.79) and 47.63% (± 11.38) at 24 hour ( P=0.730); 79.50% (± 16.21) and 74.75% (± 10.51) at 48 hour ( P =0.415); 82.5% (± 16.21) and 85.38% (± 9.68) at day seven ( P =0.673). The mean PCNA labeling index in both groups increased at 24 hour (54.62 ± 11.02% in suture group vs. 70.38 ± 15.70% in fibrin group) reached a peak at 48 hour (81.00 ± 10.74% in suture group vs. 84.00 ± 7.19% in fibrin group) and decreased at seventh day after the surgery (37.38 ± 24.49% in suture group vs. 41.63 ± 10.46% in fibrin group). The PCNA labeling index was higher in fibrin glue group 24 hour after the surgery ( P=0.036), but there was no difference between the groups at 48 hour ( P =0.522) and seven day ( P=0.662) after the surgery. Conclusion: The fibrin glue didn't enhance liver regeneration after 2/3 hepatectomy in rats

Genetic diversity of Ichthyophthirius multifiliis (Fouquet, 1876) infecting farmed rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) in Turkey

We assessed genetic diversities among Ichthyophthirius multifiliis (Ich) field isolates collected from farmed rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) in Turkey. The overall prevalence of Ich was 35.3% (634/1798). Five novel Ich genotypes (ImulTR1 and ImulTR3-ImulTR6) were described based on mitochondrial cox-1 and nad1_b genes. The remaining genotype ImulTR2 was identical to the previously reported NY3 (or Ark9 and TW7) genotype from the United States and South Asia. Phylogenetic analysis indicated Turkish Ich isolates separated genetically into at least four distinct groups. Our study presents the first data on the genotypes of Ich in Turkey. We also provide evidence for the wide distribution of the NY3 genotype (or Ark9 and TW7) from the United States and South Asia to Turkey. Genetic diversities within the mitochondrial genes provided adequate resolution for describing novel genotypes and identifying the known genotype within Turkish Ich isolates. Description of the Ich genotypes allows for tracking of pathogen genotypes worldwide. Thus, we can better understand the connections between Ich outbreaks in the fisheries aquaculture