Génotype caséine αs1 et sélection des boucs sur descendance dans les races Alpine et Saanen

International audienc

An international parentage and identification panel for the domestic cat (Felis catus)

Seventeen commercial and research laboratories participated in two comparison tests under the auspices of the International Society for Animal Genetics to develop an internationally tested, microsatellite-based parentage and identification panel for the domestic cat (Felis catus). Genetic marker selection was based on the polymorphism information content and allele ranges from seven random-bred populations (n = 261) from the USA, Europe and Brazil and eight breeds (n = 200) from the USA. Nineteen microsatellite markers were included in the comparison test and genotyped across the samples. Based on robustness and efficiency, nine autosomal microsatellite markers were ultimately selected as a single multiplex ‘core’ panel for cat identification and parentage testing. Most markers contained dinucleotide repeats. In addition to the autosomal markers, the panel included two gender-specific markers, amelogenin and zinc-finger XY, which produced genotypes for both the X and Y chromosomes. This international cat parentage and identification panel has a power of exclusion comparable to panels used in other species, ranging from 90.08% to 99.79% across breeds and 99.47% to 99.87% in random-bred cat populations

An ec-funded project on characterisation of genetic variation in the european pig. objectives, organisation, breed sampling, DNA preparation and circulation

The overall objective of the project (PigBioDiv) was to demonstrate the applicability of molecular biology tools for evaluating pig genetic diversity. Use was made of two marker technologies, namely microsatellites and arbitrary amplification of fragment length polymorphism (AFLP). Altogether, including this project (PigBioDiv) and a previous pilot project (PiGMaP), s eventeen European teams and an international organisation (FAO) contributed to the work. This paper outlines the various tasks which were shared among the participants and particularly the sampling scheme and the subsequent circulation of the DNA samples among the partners. DNA was extracted from about 50 pigs from each population. The populations considered included 69 European domestic breeds (or lines) and, in addition, the Chinese Meishan breed and a sample of European wild pigs. The European populations sampled belonged to 3 categories, namely local breeds, national varieties of international breeds and commercial lines mostly derived from the previous category. Difficulties were met during the project, particularly in sampling rare breeds under extensive conditions. The number of individuals and the diversity of origin recommended could not be reached in a few local breeds. Although the problems encountered significantly compromised the work plan initially intended, it was possible to complete all tasks that were proposed. The project has demonstrated how effectively commercial and public sector entities can work together. Guidelines have been developed in the project in view of more efficient international implementations of the approach

An ec-funded project on characterisation of genetic variation in the european pig. objectives, organisation, breed sampling, DNA preparation and circulation

The overall objective of the project (PigBioDiv) was to demonstrate the applicability of molecular biology tools for evaluating pig genetic diversity. Use was made of two marker technologies, namely microsatellites and arbitrary amplification of fragment length polymorphism (AFLP). Altogether, including this project (PigBioDiv) and a previous pilot project (PiGMaP), s eventeen European teams and an international organisation (FAO) contributed to the work. This paper outlines the various tasks which were shared among the participants and particularly the sampling scheme and the subsequent circulation of the DNA samples among the partners. DNA was extracted from about 50 pigs from each population. The populations considered included 69 European domestic breeds (or lines) and, in addition, the Chinese Meishan breed and a sample of European wild pigs. The European populations sampled belonged to 3 categories, namely local breeds, national varieties of international breeds and commercial lines mostly derived from the previous category. Difficulties were met during the project, particularly in sampling rare breeds under extensive conditions. The number of individuals and the diversity of origin recommended could not be reached in a few local breeds. Although the problems encountered significantly compromised the work plan initially intended, it was possible to complete all tasks that were proposed. The project has demonstrated how effectively commercial and public sector entities can work together. Guidelines have been developed in the project in view of more efficient international implementations of the approach

Fréquences alléliques de la caseine alphas1 chez les boucs d'insémination de race Alpine et Saanen de 1975 à 1994

Les fréquences alléliques en caséine ay ont été calculées à partir des 761 boucs d’IA nés de 1975 à 1994, dont 483 Alpins et 278 Saanen. Dans ces 2 races, le même schéma de sélection a entraîné une évolution différente des fréquences alléliques. Chez les boucs Alpins de testage et améliorateurs, la fréquence de l’allèle « fort » A n’a cessé d’augmenter (0,70 en 1994) aux dépens des allèles E et F. Chez les boucs Saanen, l’allèle E reste majoritaire et a même tendance à augmenter (0,69 en 1994) aux dépens de l’allèle F, alors que la fréquence de l’allèle A augmente peu. L’allèle « fort » B est rare dans les 2 races, mais tend à se fixer en race Alpine, alors que l’allèle « fort » C absent en race Saanen, tend à disparaître en race Alpine. Cette évolution moins favorable à la Saanen, s’explique par une plus faible fréquence initiale des allèles « forts », un effet défavorable du prétestage - reproduction, un niveau de sélection plus faible pour le taux de protéines, et des effectifs plus réduits. Cette évolution doit être corrigée si l’on souhaite améliorer la richesse en protéines vraies et protéines coagulables du lait des chèvres Saanen.Les fréquences alléliques en caséine αS1 ont été calculées à partir des 761 boucs d’IA nés de 1975 à 1994, dont 483 Alpins et 278 Saanen. Dans ces 2 races, le même schéma de sélection a entraîné une évolution différente des fréquences alléliques. Chez les boucs Alpins de testage et améliorateurs, la fréquence de l’allèle « fort » A n’a cessé d’augmenter (0,70 en 1994) aux dépens des allèles E et F. Chez les boucs Saanen, l’allèle E reste majoritaire et a même tendance à augmenter (0,69 en 1994) aux dépens de l’allèle F, alors que la fréquence de l’allèle A augmente peu. L’allèle « fort » B est rare dans les 2 races, mais tend à se fixer en race Alpine, alors que l’allèle « fort » C absent en race Saanen, tend à disparaître en race Alpine. Cette évolution moins favorable à la Saanen, s’explique par une plus faible fréquence initiale des allèles « forts », un effet défavorable du prétestage - reproduction, un niveau de sélection plus faible pour le taux de protéines, et des effectifs plus réduits. Cette évolution doit être corrigée si l’on souhaite améliorer la richesse en protéines vraies et protéines coagulables du lait des chèvres Saane

Utilisation de marqueurs génétiques en sélection : les activités de Labogena

National audienceLe diagnostic génétique appliqué à la sélection animale n’est pas récent, mais des progrès fantastiques ont été réalisés ces dernières années grâce à l’émergence des techniques de biologie moléculaire. L’évolution du nombre d’analyses réalisées par LABOGENA, 45 000 en 1988 pour plus de 100 000 en 1998, est bien la preuve de cet essor. Si deux tiers des activités demeurent traditionnelles, 30 % sont réalisées grâce aux marqueurs de l’ADN et la tendance va encore s’accentuer. La biologie moléculaire permet de réaliser des progrès et d’augmenter les possibilités de diagnostic : les supports biologiques utilisables sont nombreux (sang, poil, peau, viande, embryon, sperme …) ; l’émergence de nouveaux marqueurs polymorphes comme les marqueurs microsatellites de l’ADN permet l’identification et le contrôle de filiations pour de nouvelles espèces (Porc, Chien, Turbot …) ; les diagnostics peuvent être réalisés très précocement par l’analyse directe des variations des gènes impliqués (exemple de la qualité fromagère du lait déterminée sur les futurs reproducteurs mâles) ; les pathologies d’origine génétique peuvent être recherchées par les mutations causales (hyperthermie maligne, tremblante …). Ces informations sur les génotypes aident les sélectionneurs à définir leurs stratégies et permettent d’assurer une bonne gestion des reproducteurs et des populations animales