Improving diagnostic approaches in extensively and multidrug resistant tuberculosis: new diagnostic tools and repurposing drugs against X/MDRTB

Tuberculosis remains a major killer worldwide. Accurate, fast, and accessible diagnostics for both the disease and drug resistance remain challenges for tuberculosis (TB) control. In four different translational projects linked by the fact they dealt with laboratory diagnosis of drug resistance, I evaluated repurposed compounds and diagnosis of tuberculosis using resources already available in most microbiology laboratories in high-income countries and rapidly expanding to low and middle-income countries. Our aim was to utilise resources already available in most microbiology laboratories in high-income countries wherever possible with the belief that these systems would subsequently expand to low and middle-income countries. In Chapter 1, I found that the MGIT instrument missed true rifampicin resistance associated with specific rpoB mutations. This has now been overcome by the introduction of whole genome sequencing. In Chapter 2, carbapenems were tested against M. tuberculosis using different methodologies, showing that their role in the treatment of tuberculosis remains unclear. Testing in a more physiological model of the granuloma showed similar unclear results but confirmed the excellent activity of clofazimine, a drug that until recently could not be reliably tested in vitro. In Chapter 3, a MALDI-ToF MS lipidomic approach was used to identify M. tuberculosis and NTMs at species and some sub-species level. This approach could be easily introduced in UK microbiology laboratories today. In Chapter 4, urine was explored as a sample for the diagnosis of pulmonary tuberculosis using a lipidomic-MALDI-ToF MS approach and a PCR-based approach aiming to detect M. tuberculosis trans-renal DNA. Over the period of my PhD, I was part of the seminal projects that produced the evidence to introduce WGS for susceptibility testing and which recommended stopping routine phenotypic testing for these drugs. I was involved in the provision of phenotypic data, validation of comparative UK data, writing the standard operating procedure for DST and training technical staff to set up and read commercially available microtiter plates for slow growing mycobacteria. This included MGIT-based phenotypic test methodology which was used to pair with genotypic results. For first line drugs results were very good. Implementation of whole genome sequencing in the UK for the diagnosis, susceptibility testing and surveillance promised to overcome some of the issues mentioned above. However, 7 years later, a reliable phenotypic drug susceptibility testing methodology is desperately needed for both new compounds and to inform on those drugs for which genomic information is unclear or sparse. New understanding of pharmacokinetics-pharmacodynamics should also be incorporated in these models.Open Acces

Costo de arrepentimiento de la planificación de la expansión de la generación decenal 2024-2033 de Uruguay

Se analizan los costos de arrepentimiento de posibles planes de expansión de la generación eléctrica en Uruguay en el horizonte 2024-2033. Se identifican las principales fuentes de incertidumbre y se evalúan los costos asociados a la toma de decisiones, asumiendo que se verificará el escenario erróneo, considerando una estrategia de adaptación para mitigar el sobrecosto

Planificación de la Expansión Decenal de la Generación de Uruguay 2024-2033

El presente reporte técnico refiere a la Planificación Decenal de la Expansión de la Generación en Uruguay en el período 2024-2033. Se concluye que no se necesitarían térmicas adicionales en el período decenal y que para el primer año (2024) en que se considera la expansión del Sistema de Generación, se necesitaría incorporar 200 MW de Solar y 150 MW de Eólica. Luego, en los años siguientes, se deberían seguir instalando generación renovable hasta totalizar en el Decenio 800 MW de Solar y 350 MW de Eólica, valores que se deberán revisar año a año en función de la evolución de los costos de cada tecnología

Sobrecostos acumulados incurridos por retraso de Inversiones en Generación entre los años 2024 y 2026.

Se analizan los costos incurridos asociados al retraso de inversiones de los años 2024 a 2026 en la Generación de Energía Eléctrica en Uruguay. Los escenarios a comparar son: a) PEG33, que es la Planificación Decenal 2024-2033 realizada el año 2022 por parte de Grupo de Energía Eléctrica de la Facultad de Ingeniería de la UDELAR, b) PEG34, que es Planificación 2025-2034 realizada en el 2023, c) ADME, que es la expansión incluida por la Administración del Mercado Eléctrico de Uruguay en su Planificación Estacional de Mayo de 2023, d) UTE, que son las inversiones anunciadas por la empresa eléctrica de Uruguay para los años 2025 y 2026, y e) Base, que es un escenario sin expansión. En general se analizan y comparan escenarios de expansión suponiendo una Baja Demanda esperada. Solo se analiza un escenario de Alta Demanda esperada para evaluar la situación extrema asociada a la efectiva instalación de un Data Center que requeriría una demanda adicional relativamente importante en el corto y mediano plazo. En todos los escenarios se incluyen los 29 MW que UTE informa estarán operativos en 2024. En todos los escenarios se asume como criterio conservador que se exportan los excedentes energéticos ocasionales a un precio de 12 USD/Mwh. Todos los números asociados con costos se refieren a dólares del año 2023 y son el acumulado de los años 2024 a 2026. El resultado es por una parte, que comparando con el escenario PEG33, los sobrecostos de cada escenario en Valor Esperado son : 16 (PEG34), -3 (ADME), 83 (UTE) y 87 (Base) millones de dólares. Por otra parte, para el conjunto de 10% de casos mas adversos, el costo promedio se ve incrementado respecto al PEG33 en: 48 (PEG34), -17 (ADME), 279 (UTE) y 289 (Base) millones de dólares. Finalmente, en el conjunto de 10% de casos mas favorables, el costo promedio se ve reducido en : 4 (PEG34), -1 (ADME), 19 (UTE) y 21 (Base) millones de dólares. Como estudio de sensibilidad de los resultados y atendiendo al hecho de que se está pudiendo comprar excedentes térmicos en la región a precios convenientes, se modeló que los costos de las térmicas se reducen un 35 %. En este caso, los sobrecostos incurridos en Valor Esperado se reducen aproximadamente a la tercera parte, los sobrecostos de casos mas adversos se reducen a la mitad, y la reducción de costos de casos mas favorables aumentan al doble. Finalmente se evalúa el Valor Esperado del sobrecosto en un marco de la ocurrencia de una Alta Demanda y que no se concreten las inversiones consideradas por ADME para los años 2025 y 2026, dando como resultado un aumento de costos de 147 millones de dólares para un valor normal del combustible de las térmicas y de 71 millones de dólares si las térmicas costaran un 35% menos. Se concluye que con las hipótesis consideradas en el estudio, incluso con Baja Demanda esperada, ya se habría incurrido en sobrecostos en Valor Esperado, que difícilmente sean remediables, ya que el tiempo que media en Uruguay entre que se decide una inversión de ERNC y la misma está disponible, es al menos de un par de años. En lo que refiere a comparar las curvas de Riesgo y evaluar los Costos de Arrepentimiento entre escenarios para los casos adversos o favorables considerados, los sobrecostos de los casos mas adversos son sensiblemente mayores a los beneficios de los casos mas favorables. En el caso de costos de combustible normales, la razón es 15 a 1, y en el caso de costos de combustibles un 35% más bajos, la razón es 4 a 1. Asimismo, en el caso de que finalmente se instale el Data Center que en estos días ha sido anunciado, se configuraría un escenario de Alta Demanda esperada, que requerirá acelerar la toma de decisiones para mitigar los sobrecostos y riesgos informados

PEG34 : Planificación de la Expansión de la Generación Decenal 2025-2034 de Uruguay.

Se realizan posibles Planes de Expansión de la Generación de Uruguay en el horizonte 2025-2034 (PEG34). Se plantean las hipótesis pertinentes y se identifican los escenarios principales sobre los que se hacen las expansiones óptimas respectivas. Por una parte, en un escenario de mínima demanda, asumiendo que no se instala el Centro de Datos de porte que hace unos años se está negociando, el sistema óptimo necesitaría incorporar en el año 2025 50 MW de Eólica y 250 MW de Solar, lo que supone en conjunto una energía adicional de 76 MW-m, valor similar a lo que diera la PEG33 para el año 2024. Por otra parte, en un escenario de máxima demanda, suponiendo que se instalara finalmente el Centro de Datos, habría que instalar en el año 2025 50 MW de Eólica y 500 MW de Solar, lo que representan 131 MW-m, que es algo menos que los 178 MW-m de la expansión óptima de la PES de Mayo 2023 de ADME para el año 2025. Finalmente se analizan los resultados y se ensayan conclusiones y/o las recomendaciones correspondientes

Impacto del COVID19 en la demanda de energía eléctrica de Uruguay.

Este trabajo realiza una puesta al día de la información referida a como ha evolucionado la demanda de energía eléctrica en Uruguay a partir de la llegada, hace tres meses y medio, de la crisis COVID19. Se analizan los datos, reales a los que se le intenta desacoplar en forma simplificada las variables macroeconómicas previas y así quedarse con la foto de la profundidad con que se redujo la demanda por el efecto COVID19 para luego hacer una proyección del cierre a fin de año de como se habrá reducido la demanda en el año 2020 respecto al 2019. Finalmente se hacen consideraciones respecto a un eventual modelos de cómo se recupera la Demanda de Energía Eléctrica luego de un eventos de CRISIS PROFUNDO como ha sido el COVID19

An updated checklist of Chondrichthyes from the southeast Pacific off Peru

7 páginas.-- This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International LicenseThe first updated and comprehensive checklist of Chondrichthyes from the southeast Pacific off Peru, based on the revision of scientific literature, is presented. The group of Chondrichthyes in the Peruvian coast is composed of 115 species that include 66 species of sharks, 43 species of batoids, and six species of chimaeras. We present nine new records and one recent discovery obtained from secondary sources. For some species, we also compiled the extensions in the geographic distributionsPeer reviewe

Identificación y clasificación de los potenciales riesgos ambientales asociados a accidentes industriales en la comuna de Teno.

55 p.Teno una comuna eminentemente agrícola que en la actualidad a dado forma a un parque industrial en el acceso norte a la región del Maule, con actividades industriales que presentan áreas de vulnerabilidad con su entorno, donde en caso de accidentes industriales graves como incendio y/o explosión, fugas o vertidos, o corte de caminos por accidentes durante el transporte de las materias primas necesarias para el funcionamiento de estas grandes empresas industriales, debieran ser consideradas para la elaboración de los planes de emergencias comunales . Este nuevo escenario, incorpora la aparición de nuevas situaciones de peligrosidad, asociados a las actividades realizadas por estas industrias en donde los riesgos se relacionan a las características de las sustancias o productos utilizados (tóxicos, inflamables, explosivos), así como con las condiciones de trabajo (presión, temperatura y otros) de los equipos utilizados en sus procesos. El estudio realizado a través de Método Delphi en las cinco empresas evaluadas de la Comuna de Teno, indica que de las Grandes Empresas Evaluadas y sometidas a encuesta de expertos las empresas Arauco y Agrozzi resultan ser las más peligrosas considerando su ubicación y proximidad a población en caso de incendio y cursos de agua. /ABSTRACT: Teno is an eminently agricultural commune that at present has formed an industrial park in the northern access to the Maule’s region, with industrial activities that present areas of vulnerability with its surroundings, where in the case of serious industrial accidents such as fire and / or explosion, leakage or spillage, or road cutting by accident during the transportation of the raw materials necessary for the operation of these large industrial enterprises, should be considered for the elaboration of community emergency plans. This new scenario incorporates the emergence of new hazardous situations, associated with the activities carried out by these industries where the risks relate to the characteristics of the substances or products used (toxic, flammable, explosive), as well as the conditions of work (pressure, temperature and others) of the equipment used in their processes. he study carried out through the Delphi Method in the five companies evaluated in the Teno Commune indicates that of the Large Companies Evaluated and submitted to an expert survey the companies Arauco and Agrozzi turn out to be the most dangerous considering their location and proximity to population in case of fire and water courses

Propuesta de producción y comercialización de barras nutricionales energéticas elaboradas con bactris gasipaes, aplicando un modelo de branding basado en innovación, enfocado a pequeñas y medianas empresas de la ciudad de Quito

En la estructura económica de todo país se encuentran sectores más dinámicos que otros, actividades con diferentes ventajas, y empresas pequeñas, medianas y grandes, Las ventajas competitivas dependen de diversos factores, entre los cuales está el tipo de producción que maneja y las herramientas de innovación que utiliza..