A genome-wide genetic map of NB-LRR disease resistance loci in potato

Like all plants, potato has evolved a surveillance system consisting of a large array of genes encoding for immune receptors that confer resistance to pathogens and pests. The majority of these so-called resistance or R proteins belong to the super-family that harbour a nucleotide binding and a leucine-rich-repeat domain (NB-LRR). Here, sequence information of the conserved NB domain was used to investigate the genome-wide genetic distribution of the NB-LRR resistance gene loci in potato. We analysed the sequences of 288 unique BAC clones selected using filter hybridisation screening of a BAC library of the diploid potato clone RH89-039-16 (S. tuberosum ssp. tuberosum) and a physical map of this BAC library. This resulted in the identification of 738 partial and full-length NB-LRR sequences. Based on homology of these sequences with known resistance genes, 280 and 448 sequences were classified as TIR-NB-LRR (TNL) and CC-NB-LRR (CNL) sequences, respectively. Genetic mapping revealed the presence of 15 TNL and 32 CNL loci. Thirty-six are novel, while three TNL loci and eight CNL loci are syntenic with previously identified functional resistance genes. The genetic map was complemented with 68 universal CAPS markers and 82 disease resistance trait loci described in literature, providing an excellent template for genetic studies and applied research in potato

Docenten en hun voorkeuren: zijn studenten met één type leerstijl favoriet?

In dit onderzoek is gekeken of HBO-docenten een voorkeur hebben voor studenten met een bepaalde leerstijl, zoals getypeerd door Kolb. In één van de docententeams van de opleiding Media, Informatie en Communicatie aan de Hogeschool van Amsterdam is een kleinschalig kwantitatief onderzoek uitgevoerd. Alle 23 docenten van dit team kozen uit twintig stellingen drie leerstrategieën zij het meest typerend vinden voor een goede student. Elk van deze strategieën is gekoppeld aan een van de vier leerstijlen van Kolb, vijf strategieën per leerstijl. Voor elke leerstijl is gekwantificeerd hoe vaak daarbij bijbehorende stellingen zijn genoemd, en vervolgens zijn de uitkomsten aan analyse onderworpen. Hieruit bleek een significante afwijking van de verwachte verdeling: het aantal keren dat docenten kozen voor een strategie behorende tot de leerstijl ‘doener’ is niet gebaseerd op een evenredige verdeling van de strategieën over de leerstijlen. Geconcludeerd kan worden dat de resultaten ondersteuning bieden voor de hypothese: docenten kiezen, gevraagd naar leerstrategieën die de leerstijl van een student typeren, voor één leerstijl als beste. Er worden ook andere leerstijlen gekozen, maar het is significant dat de docenten samen, als team, een voorkeur voor studenten met één leerstijl hebben, in dit geval die van ‘doener’

Risk factors for resistance to ciprofloxacin in community-acquired urinary tract infections due to Escherichia coli in an elderly population

Background: Antimicrobial resistance to ciprofloxacin is rising worldwide, especially in bacteria causing urinary tract infections (UTIs). Prudent use of current antibiotic drugs is therefore necessary. Objectives: We analysed (modifiable) risk factors for ciprofloxacin-resistant Escherichia coli. Methods: Urinary cultures of UTIs caused by E. coli were collected from participants in the Rotterdam Study, a prospective cohort study in an elderly population, and analysed for susceptibility to ciprofloxacin. Multivariate logistic regression was performed to investigate several possible risk factors for resistance. Results: Ciprofloxacin resistance in 1080 E. coli isolates was 10.2%. Multivariate analysis showed that higher age (OR 1.03; 95% CI 1.00-1.05) and use of two (OR 5.89; 95% CI 3.45-10.03) and three or more (OR 3.38; 95% CI 1.92-5.97) prescriptions of fluoroquinolones were associated with ciprofloxacin resistance, while no association between fluoroquinolone use more than 1 year before culture and ciprofloxacin resistance could be demonstrated. Furthermore, a high intake of pork (OR 3.68; 95% CI 1.36-9.99) and chicken (OR 2.72; 95% CI 1.08-6.85) and concomitant prescription of calcium supplements (OR 2.51; 95% CI 1.20-5.22) and proton pump inhibitors (OR 2.04; 95% CI 1.18-3.51) were associated with ciprofloxacin resistance. Conclusions: Ciprofloxacin resistance in community-acquired UTI was associated with a high intake of pork and chicken and with concomitant prescription of calcium supplements and proton pump inhibitors. Modification of antibiotic use in animals as well as temporarily stopping the prescription of concomitant calcium and proton pump inhibitors need further evaluation as strategies to prevent ciprofloxacin resistance

A Mass Spectrometry-Based Panel of Nine Thyroid Hormone Metabolites in Human Serum

BACKGROUND: While thyroxine (T4), 3,3’,5-triiodothyronine (T3), and 3,3’,5’-triiodothyronine (rT3) have routine methods available for evaluating patients with suspected thyroid