Projekte praxisbezogener Lehre und Forschung am Department of Community Health Bochum

Als Reaktion auf eine sich diversifizierende Gesellschaft in Deutschland widmet sich Community Health gesundheitsrelevanten Bedarfen von gesellschaftlichen Gruppen, um Teilhabe und Chancengleichheit zu fördern und die Versorgung zu verbessern. So nimmt die Lehre am Department of Community Health der HS Gesundheit in Bochum individuelle Bedarfe und Lebensrealitäten von Communities in den Blick. Drei Angebote einer praxisbezogenen, partizipativen und transdisziplinären Lehr-Forschungsstruktur werden vorgestellt und deren Zusammenwirken beschrieben. Abschließend werden die Erfahrungen partizipativer und transdisziplinärer Ansätze im Sinne von Campus-Community-Partnerships diskutiert

Methyl-binding domain protein-based DNA isolation from human blood serum combines DNA analyses and serum-autoantibody testing

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Circulating cell free DNA in serum as well as serum-autoantibodies and the serum proteome have great potential to contribute to early cancer diagnostics via non invasive blood tests. However, most DNA preparation protocols destroy the protein fraction and therefore do not allow subsequent protein analyses. In this study a novel approach based on methyl binding domain protein (MBD) is described to overcome the technical difficulties of combining DNA and protein analysis out of one single serum sample.</p> <p>Methods</p> <p>Serum or plasma samples from 98 control individuals and 54 breast cancer patients were evaluated upon silica membrane- or MBD affinity-based DNA isolation via qPCR targeting potential DNA methylation markers as well as by protein-microarrays for tumor-autoantibody testing.</p> <p>Results</p> <p>In control individuals, an average DNA level of 22.8 ± 25.7 ng/ml was detected applying the silica membrane based protocol and 8.5 ± 7.5 ng/ml using the MBD-approach, both values strongly dependent on the serum sample preparation methods used. In contrast to malignant and benign tumor serum samples, cell free DNA concentrations were significantly elevated in sera of metastasizing breast cancer patients. Technical evaluation revealed that serum upon MBD-based DNA isolation is suitable for protein-array analyses when data are consistent to untreated serum samples.</p> <p>Conclusion</p> <p>MBD affinity purification allows DNA isolations under native conditions retaining the protein function, thus for example enabling combined analyses of DNA methylation and autoantigene-profiles from the same serum sample and thereby improving minimal invasive diagnostics.</p

DNA Methylation Analysis of Chromosome 21 Gene Promoters at Single Base Pair and Single Allele Resolution

Differential DNA methylation is an essential epigenetic signal for gene regulation, development, and disease processes. We mapped DNA methylation patterns of 190 gene promoter regions on chromosome 21 using bisulfite conversion and subclone sequencing in five human cell types. A total of 28,626 subclones were sequenced at high accuracy using (long-read) Sanger sequencing resulting in the measurement of the DNA methylation state of 580427 CpG sites. Our results show that average DNA methylation levels are distributed bimodally with enrichment of highly methylated and unmethylated sequences, both for amplicons and individual subclones, which represent single alleles from individual cells. Within CpG-rich sequences, DNA methylation was found to be anti-correlated with CpG dinucleotide density and GC content, and methylated CpGs are more likely to be flanked by AT-rich sequences. We observed over-representation of CpG sites in distances of 9, 18, and 27 bps in highly methylated amplicons. However, DNA sequence alone is not sufficient to predict an amplicon's DNA methylation status, since 43% of all amplicons are differentially methylated between the cell types studied here. DNA methylation in promoter regions is strongly correlated with the absence of gene expression and low levels of activating epigenetic marks like H3K4 methylation and H3K9 and K14 acetylation. Utilizing the single base pair and single allele resolution of our data, we found that i) amplicons from different parts of a CpG island frequently differ in their DNA methylation level, ii) methylation levels of individual cells in one tissue are very similar, and iii) methylation patterns follow a relaxed site-specific distribution. Furthermore, iv) we identified three cases of allele-specific DNA methylation on chromosome 21. Our data shed new light on the nature of methylation patterns in human cells, the sequence dependence of DNA methylation, and its function as epigenetic signal in gene regulation. Further, we illustrate genotype–epigenotype interactions by showing novel examples of allele-specific methylation

Herausforderung Inklusion: Schule - Unterricht - Profession

Das Übereinkommen der Vereinten Nationen über die Rechte von Menschen mit Behinderungen sowie das dazu gehörende Fakultativprotokoll zum Übereinkommen der Vereinten Nationen über die Rechte von Menschen mit Behinderungen trat am 26.03.2009 ohne Einschränkung als innerstaatliches deutsches Recht in Kraft. Sich mit diesen vielschichtigen Themenkomplexen auseinanderzusetzen war das Ziel der Tagung „Herausforderung Inklusion: Schule – Unterricht – Profession“, die am 27. und 28. März 2014 an der Otto-Friedrich-Universität in Bamberg stattfand und sowohl betroffene Eltern, als auch Praktikerinnen und Praktiker und Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler zur Diskussion einlud. Der vorliegende Band geht auf diese Tagung zurück und möchte die vielfältigen Facetten der theoretischen, konzeptuellen und didaktisch-methodischen Zugänge im Kontext der derzeit geführten Debatten und Argumentationsmuster um ein inklusives Bildungswesen abbilden und neue Perspektiven für Forschung, Disziplin und Profession anregen. Demzufolge liegt der Fokus der Beiträge zum einen auf der Auseinandersetzung mit theoretischen Zugängen zur Inklusion sowie der Diskussion von nationalen und internationalen empirischen Erkenntnissen aus Studien der Inklusionsforschung, zum anderen auf der Präsentation von inklusiven Konzepten einer Schulentwicklung, (fach)didaktisch-methodischen Überlegungen und Modellprojekten aus der Praxis

An organelle-specific protein landscape identifies novel diseases and molecular mechanisms

Contains fulltext : 158967.pdf (publisher's version ) (Open Access)Cellular organelles provide opportunities to relate biological mechanisms to disease. Here we use affinity proteomics, genetics and cell biology to interrogate cilia: poorly understood organelles, where defects cause genetic diseases. Two hundred and seventeen tagged human ciliary proteins create a final landscape of 1,319 proteins, 4,905 interactions and 52 complexes. Reverse tagging, repetition of purifications and statistical analyses, produce a high-resolution network that reveals organelle-specific interactions and complexes not apparent in larger studies, and links vesicle transport, the cytoskeleton, signalling and ubiquitination to ciliary signalling and proteostasis. We observe sub-complexes in exocyst and intraflagellar transport complexes, which we validate biochemically, and by probing structurally predicted, disruptive, genetic variants from ciliary disease patients. The landscape suggests other genetic diseases could be ciliary including 3M syndrome. We show that 3M genes are involved in ciliogenesis, and that patient fibroblasts lack cilia. Overall, this organelle-specific targeting strategy shows considerable promise for Systems Medicine

Kinder und Jugendliche mit Körperbehinderung im gemeinsamen Unterricht. Befunde aus nationaler und internationaler Bildungsforschung und ihre Bedeutung für Inklusion und Schulentwicklung

In diesem Buch wird der Frage nach Gestaltungsmöglichkeiten und Einflussfaktoren auf das Gelingen des gemeinsamen Unterrichts nachgegangen, indem der Blick speziell auf die Bedürfnisse von Kindern und Jugendlichen mit Körperbehinderung gerichtet wird. Die Anpassung des Schulsystems scheint hier besonders einfach durch eine rollstuhlgerechte Gestaltung möglich zu sein, jedoch deuten die vorhandenen empirischen Arbeiten auf einen umfassenden Anpassungsbedarf hin, der über architektonische Veränderungen hinausgeht und Aspekte der Kooperation mit Schulbegleitern, Eltern und Therapeuten, den Einsatz von Hilfsmittel sowie Veränderungen der Lehrerrolle betrifft. Mit der vorliegenden Arbeit werden erstmals die Befunde von mehr als 80 wissenschaftlichen Studien der letzten 40 Jahre aus dem In- und Ausland zusammengetragen und systematisch mit Blick auf schülerbezogene Entwicklungen und Erfahrungen im persönlichen, sozialen, leistungsbezogenen und rehabilitativen Bereich beschrieben sowie Anpassungen der Schul- und Unterrichtsorganisation dargestellt. Auch werden praxisnahe Empfehlungen abgeleitet, wie effektiver gemeinsamer Unterricht für Schülerinnen und Schüler mit Körperbehinderung gestaltet werden kann. (DIPF/Orig.

Una aproximación para resolución de ambigüedad estructural empleando tres mecanismos diferentes

La ambigüedad estructural es uno de los problemas más difíciles de resolver en sistemas de procesamiento de lenguaje natural. Consideramos dos tipos de resolución de ambigüedad estructural que pueden emplearse en el análisis de textos sin restricciones: conocimiento léxico y cierta clase de contexto. En este trabajo, proponemos un modelo basado en tres diferentes mecanismos para revelar la estructura sintáctica correcta y un módulo de clasificación para obtener las estructuras más probables para la oración analizada. Nuestro modelo está dirigido al análisis de textos sin restricciones y las herramientas desarrolladas no requieren ninguna desambiguación de marcas morfológicas ni ningún tipo de marcas sintácticas.Trabajo hecho con apoyo parcial del CONACyT, SNI y CGEPI-IPN, México