SSR markers linked to stem canker resistance in soybean Glycine max

In this work, we studied 40 samples of Diaporthe phaseolorum var. meridionalis (Dpm), causal agent of stem canker in soybeans (SCS). In the susceptible genotype Golondrina65 the isolate RSF12 showed the highest percentage of the dead plant index (DP = 85.7 %) and was used to characterize all known sources of resistance to Dpm. The soybean MJ19RR experimental line showed the best behaviour against this isolate with a DP = 2.4 % and was used to develop a segregating population with the suscep¬tible cultivar FT-2001. In the F2 generation, the chi-square test determined a 3:1 ratio of resistant plants against susceptible plants, as expected for a dominant gene. In order to advance in our study we propose, as objective, to locate in the soybean genetic map the resistance to Diaporthe phaseolorum var. meridionalis. The Bulked Segregant Analyses and the genetic linkage study identified a region of chromosome 6 of the genetic map of soybean, located at 13.3 cM from the Satt433 locus associated with resistance to SCS. The soybean experimental line MJ19RR was selected as the best source of resistance, and it is available in the active bank of soybean germplasm of INTA, for the genetic control of this disease. The results obtained in this work represent a first approximation for the understanding of the genetic basis of resistance to SCS.En este trabajo estudiamos 40 muestras de Diaporthe phaseolorum var. meridionalis(Dpm), agente causal del cancro del tallo en soja (CTS). En el control susceptible Golon-drina65, el aislado RSF12 presentó el mayor porcentaje del índice de plantas muertas (DP = 85,7 %) y fue utilizado para caracterizar las fuentes de resistencia conocidas al Dpm. La línea experimental de soja MJ19RR mostró el mejor comportamiento frente a este aislado, con un valor de DP= 2,4 %, y fue utilizada para desarrollar una población segre-gante con el cultivar susceptible FT-2001. En la generación F2 la prueba de chi-cuadrado determinó una proporción 3:1 de plantas resistentes versus plantas susceptibles, como se espera para un gen dominante. Para avanzar en nuestro estudio, proponemos como objetivo localizar en el mapa genético de soja la resistencia a Diaporthe phaseolorum var. meridionalis. El Bulked Segregant Analysesy el estudio de ligamiento genético identifi-caron una región del cromosoma 6 del mapa genético de soja, a 13,3 cM del locus Satt433, asociada a la resistencia al CTS. Además la línea experimental de soja MJ19RR fue selec-cionada como la mejor fuente de resistencia disponible en el banco activo de germo-plasma de soja de INTA para el control genético de esta enfermedad. Los resultados obtenidos en este trabajo representan una primera aproximación para la comprensión de las bases genéticas de la resistencia al CTS.EEA Marcos JuárezFil: Gilli, Javier Ramon. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Vellicce, Gabriel Ricardo. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina; ArgentinaFil: Bernardi, Clarisa Noelia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentin

Genetic inheritance analysis of the resistance to a virulent isolate of Colletotrichum acutatum in strawberry based on an octoploid model = Análisis de la herencia genética de la resistencia a un aislado virulento de Colletotrichum acutatum en frutilla basado en un modelo octoploide

In the present work we propose a hypothesis to explain the mechanism of the genetic control of resistance to anthracnose and we show an experimental model that may support our hypothesis. The inheritance of the strawberry resistance to a virulent strain of Colletotrichum acutatum isolated in Northwestern Argentina was assessed with a progeny obtained from the cross between the susceptible cultivar ‘Pájaro’ as female and the resistant cultivar ‘Sweet Charlie’ as male. Infections were carried out under controlled conditions by spraying a conidial suspension on leaves of young plants and lesions were evaluated from days 10-50 after infection. The disease severity ratings (DSR) values exhibited a continuous distribution. We propose a model based on a gene-for-gene interaction in an octoploid genomic background to explain the results. The model assumes that the genetic control of the resistance is determined by different allelic variants of an R-gene. According to this model, results suggest that susceptibility to this isolate is partially dominant over resistance and that the defensive response would be modulated by the allele dosage, although other gene interactions may also be involved.En el presente trabajo proponemos una hipótesis para explicar el mecanismo del control genético de la resistencia a la antracnosis y mostramos un modelo experimental que puede apoyar nuestra hipótesis. La herencia de la resistencia en plantas de frutilla a una cepa virulenta de Colletotrichum acutatum aislada en el noroeste de Argentina se evaluó con una progenie obtenida del cruce entre el cultivar susceptible ‘Pájaro’ como hembra y el cultivar resistente ‘Sweet Charlie’ como macho. Las infecciones se llevaron a cabo en condiciones controladas pulverizando una suspensión conidial en hojas de plantas jóvenes y las lesiones se evaluaron entre los 10 y 50 días posteriores a la infección. Los valores obtenidos en las evaluaciones de severidad de la enfermedad (DSR) exhibieron una distribución continua. Proponemos un modelo basado en una interacción gen-por-gen en un fondo genómico octoploide para explicar los resultados. El modelo supone que el control genético de la resistencia está determinado por diferentes variantes alélicas de un gen R. De acuerdo con este modelo, los resultados sugieren que la susceptibilidad a este aislamiento es parcialmente dominante sobre la resistencia y que la respuesta defensiva sería modulada por la dosificación del alelo, aunque también pueden estar involucradas otras interacciones génicas.EEA FamailláFil: Salazar, Sergio Miguel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Agronomía y Zootecnia; ArgentinaFil: Ontivero, M. I.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; ArgentinaFil: Castagnaro, Atilio Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; ArgentinaFil: Mariotti Martinez, Jorge Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; ArgentinaFil: Vellicce, Gabriel Ricardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; ArgentinaFil: Diaz Ricci, Juan Carlos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; Argentin

Importancia de la podredumbre carbonosa de la soja en el noroeste argentino durante las campañas 2010/2011, 2011/2012 y 2012/2013.

Numerosas enfermedades afectan a la soja [Glycine max (L.) Merr.] en el noroeste argentino (NOA). Entre estas enfermedades se encuentra la podredumbre carbonosa, producida por Macrophomina phaseolina, un patógeno débil de soja y de otras especies vegetales, que solamente afecta los cultivos cuando el crecimiento de las plantas se ve retardado por tiempo cálido y seco durante períodos prolongados. En el presente trabajo se detallan las principales características de la enfermedad y de su agente causal, y se resumen los resultados de las prospecciones de esta patología en los cultivos de soja en la región, realizadas por el personal de la Sección Fitopatología de la Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEAOC) durante las campañas 2010/2011, 2011/2012/ y 2012/2013. Se determinó que los valores de incidencia de la enfermedad fueron aumentando con los años, alcanzando valores entre 1 y 5% en la campaña 2010/2011, entre 5 y 30% en 2011/2012 y llegando a valores entre 5 y 90% en 2012/2013. A su vez los valores de prevalencia en los lotes monitoreados en estadio fenológico R7 fueron del 100%. Para cuantificar el desarrollo de la enfermedad en 2012/2013, se graficaron las curvas epidémicas, resultados de la interacción del hospedante (soja), patógeno (M. phaseolina), el ambiente y el hombre a través del manejo del sistema productivo, en una relación en el transcurso del tiempo. Se calculó el área bajo la curva de progreso de la enfermedad (ABCPE) para los diferentes lotes monitoreados. Dentro de los lotes que presentaron mayores valores de ABCPE se encuentran los ubicados en Las Lajitas con 725, Pichanal con 650 seguido por el Lote 1 ubicado en Gral. Mosconi con 470 y el lote de Rapelli con 255. Las pérdidas ocasionadas por M. phaseolina fueron mayores en aquellos lotes en donde el incremento significativo de la incidencia de la enfermedad ocurrió en estadios fenológicos reproductivos tempranos, lo cual se tradujo en los mayores valores de ABCPE. Las pérdidas y los valores de ABCPE fueron mayores en los lotes de Las Lajitas y Pichanal en la provincia de Salta, en los cuales las plantas alcanzaron la madurez temprana y muerte debido a M. phaseolina en estadios fenológicos reproductivos R5.1 que impidieron a las plantas enfermas llegar a formar granos. El lote ubicado en General Mosconi, Salta fue el que presentó los mayores valores de incidencia en R7 (90%); pero el aumento significativo de la enfermedad recién ocurrió en el estadio fenológico R5.5 y consecuentemente las pérdidas ocasionadas fueron menores ya que posibilitó la formación de semillas, aunque de menor peso y tamaño al reducir la duración del llenado.Fil: Reznikov, Sebastian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ArgentinaFil: de Lisi, Vicente. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ArgentinaFil: Stegmayer, C. Adolfo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ArgentinaFil: Jalil, Ana C.. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Agronomía y Zootecnia; ArgentinaFil: Alarcón, Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ArgentinaFil: Martinez, María J. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ArgentinaFil: Gonzalez, Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ArgentinaFil: Vellicce, Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ArgentinaFil: Castagnaro, Atilio Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ArgentinaFil: Ploper, Leonardo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentin

Use of AFLP markers to estimate molecular diversity of Phakopsora pachyrhizi

Background: Asian soybean rust (SBR) caused by Phakopsora pachyrhizi Syd. & Syd., is one of the main diseases affecting soybean and has been reported as one of the most economically important fungal pathogens worldwide. Knowledge of the genetic diversity of this fungus should be considered when developing resistance breeding strategies. We aimed to analyze the genetic diversity of P. pachyrhizi combining simple sampling with a powerful and reproducible molecular technique. Results: We employed Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique for the amplification of P. pachyrhizi DNA extracted from naturally SBR-infected plants from 23 production fields. From a total of 1919 markers obtained, 77% were polymorphic. The high percentage of polymorphism and the Nei's genetic diversity coefficient (0.22) indicated high pathogen diversity. Analysis of molecular variance showed higher genetic variation within countries than among them. Temporal analysis showed a higher genetic variation within a year than between years. Cluster, phylogenetic and principal co-ordinate analysis showed that samples group by year of collection and then by country sampled. Conclusions: The study proposed combining a simple collection of urediniospore with a subsequent analysis by AFLP was useful to examine the molecular polymorphism of samples of P. pachyrhizi collected and might have a significant contribution to the knowledge of its genetic diversity. Also, AFLP analysis is an important and potent molecular tool for the study of genetic diversity and could be useful to carry out wider genetic diversity studies

Transformation of a Strawberry Cultivar Using a Modified Regeneration Medium

A protocol for shoot regeneration of strawberry (Fragaria ·ananassa Duch. 'Pajaro') leaf disks was developed. In Murashige and Skoog basal medium with 3% of sucrose (w/v), BA (1 mg·L -1 ), and 2,4-D (0.1 mg·L -1 ), 70% of the cultivated leaf explants regenerated plants. This regeneration system was used for genetic transformation of strawberry with Agrobacterium tumefaciens strain LBA 4404 carrying the binary vector plasmid pBI121 that contains the npt II (neomycin phosphotransferase) and uidA (s-D glucuronidase) genes. A transformation rate of 6.6%, calculated as the number of leaf disks able to regenerate kanamycin-resistant plants/total leaf disks infected, was obtained. The integration of both marker genes was evaluated in each transformed line by PCR (poly- merase chain reaction) amplifi cation of the npt II and uidA genes. High expression levels of the uidA gene were found in leaves, fl ower, and fruits of the transgenic lines. The protocol here reported may represent a way to conduct transformation research in strawberries. Chemical names used: benzyladenine (BA); 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D)Fil: Vellicce, Gabriel Ricardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; ArgentinaFil: Coll, Yamilet. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; ArgentinaFil: Castagnaro, Atilio Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; ArgentinaFil: Diaz Ricci, Juan Carlos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; Argentin

Evaluation of chemical and biological seed treatments to control charcoal rot of soybean

Charcoal rot caused by Macrophomina phaseolina (Mp) affects economically important crops around the world. In northwestern Argentina, the disease is present in seasons with dry and hot weather. Here, the efficacy of seed treatments with two biological products (Trichodermaviride or Bacillus subtilis) or one chemical treatment (thiophanate methyl + pyraclostrobin) were evaluated in the field to control Mp on two soybean cultivars in Tucumán, Argentina. In field tests, Mp was added to the soil at planting in the 2010/2011 and 2011/2012 growing seasons. Plant emergence (PE) was reduced for both cultivars: 6.7 and 56.8 % for NA8000 RG and 12.5 and 61.3 % for Munasqa RR in 2010/2011 and 2011/2012, respectively. On a 1–5 disease severity scale, the inoculated control of NA8000 RG scored 2.5 and Munasqa RR 1.8 during the 2010/2011 season, and 3.6 for NA8000 RG, and 2.7 for Munasqa RR during 2011/2012. Likewise, Mp CFU/g values in the inoculated control increased during the 2011/2012 season: from 2100 to 2366 in NA8000 RG and from 300 to 566 in Munasqa RR. Crop yield and 1000-seed weight were also reduced by fungal infection. Although the treatments counteracted PE reduction in both genotypes, disease severity was higher in NA8000 RG than in Munasqa RR, coincident with the highest CFU/g values. The 1000-seed weight of the two cultivars did not differ significantly among treatments. The highest yields were obtained in chemically treated plots, followed by those treated with Trichoderma or Bacillus.Fil: Reznikov, Sebastian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; ArgentinaFil: Vellicce, Gabriel Ricardo. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; ArgentinaFil: González, Victoria. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; ArgentinaFil: de Lisi, Vicente. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; ArgentinaFil: Castagnaro, Atilio Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; ArgentinaFil: Ploper, Leonardo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentin

Diagnóstico molecular de enfermedades sistémicas de la caña de azúcar en la Argentina: ajuste metodológico y aplicaciones Molecular diagnosis of sistemic sugarcane diseases in Argentina: methodology adjustment and applications

Las enfermedades sistémicas representan uno de los principales factores que afectan la producción de caña de azúcar. El conocimiento del estado fitosanitario del cultivo y la identificación correcta de los fitopatógenos son claves para reducir las pérdidas por enfermedades. En este sentido, es fundamental contar con técnicas de diagnóstico sensibles, rápidas y fáciles de ejecutar, para realizar un diagnóstico preciso y precoz. A partir del año 2005, en la Estación Exper imental Agroindustrial Obispo Colombres se incorporó el diagnóstico molecular basado en la reacción en cadena de la polimerasa, para la detección específica de cuatro enfermedades sistémicas de la caña de azúcar: raquitismo de la caña soca (Leifsonia xyli sp. xyli), escaldadura de la hoja (Xanthomonas albilineans), mosaico de la caña de azúcar (Sugarcane mosaic virus, ScMV) y síndrome de la hoja amarilla (Sugarcane yellow leaf virus, ScYLV). En este trabajo, se presenta la optimización metodológica del diagnóstico molecular y se compara su eficiencia con la de la técnica inmunoquímica ELISA. El método molecular mostró mayor sensibilidad para las enfermedades evaluadas, tanto bacterianas como virales. El establecimiento del diagnóstico molecular constituye un avance tecnológico de gran importancia para la industria azucarera regional, ya que no solo ayudará a disminuir la incidencia de dichas enfermedades, sino que también evitará el ingreso de otras nuevas al introducir germoplasma de caña de azúcar desde otras regiones.Systemic diseases represent one of the main factors affecting sugarcane production. The knowledge of crop sanitary conditions and the correct identification of phytopathogens are key factors to reduce losses caused by them. To diagnose diseases as early as possible is crucial, so techniques that are sensitive, fast, accurate and easy to use are essential. Since 2005, molecular diagnosis based on polymerase chain reaction has been applied at Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres, for detecting four systemic sugarcane diseases: ratoon stunting (Leifsonia xyli sp xyli), leaf scald (Xanthomonas albilineans), Sugarcane mosaic virus (ScMV) and yellow leaf syndrome (Sugar cane yellow leaf virus, ScYLV). This paper presents the methodological optimization of molecular diagnosis and compares its efficiency with that of ELISA immunochemistry technique. The molecular approach showed greater sensitivity for the detection of both the bacterial and viral diseases evaluated. The implementation of molecular analysis constitutes a technological advance for regional sugar industry, which will not only help to reduce disease incidence, but also avoid the entrance of new pathogens whenever sugarcane germplasm is introduced from other regions

GFP transient expression and silencing in fragaria x ananassa

Background: Stable transformation, transient expression, and post-transcriptional gene silencing (PTGS) are powerful methodologies that allow exploration of gene function. Objective: We aimed to apply these methodologies to strawberry leaves. Methods: the binary vectors pBIN19-sgfp, pBICds- GFP and pBIN61-P19 were transferred into A. tumefaciens EHA105 supervirulent strain by electroporation. The sgfp gene silencing was carried out in stably transformed GFP (green fluorescent protein) F. x ananassa Duch. cultivar ‘P´ajaro’ strawberry plants by agroinfiltration. GFP-fluorescence was observed using a stereomicroscope (507 nm). Results: We attained a GFP transgenic F. x ananassa plant that expresses the functional protein in all the tissues during a complete and normal life cycle. In planta sgfp transient expression and silencing have also been achieved in F. x ananassa cv. ‘P´ajaro’ leaves of wild type and GFP transgenic plants, respectively. Agrobacterium-mediated transient expression was visualized as high intensity green fluorescent spots as early as 7 days post-agroinfiltration (dpa), peaking between 10 and 14 dpa and persisting as long as 24 dpa. A knockdown GFP phenotype was achieved by silencing using a dsGFP hairpin. Conclusion: This work contributes significantly to the reverse genetics field in strawberry, might help to gain knowledge in the analysis of functional promoters and thereby allow protein expression and silencing of genes. This will help to develop resistant plants expressing plant defense elicitors or silencing pathogen receptors and/or negative regulators of plant defense.Fil: Hael Conrad, Verónica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; ArgentinaFil: Iezzi, María Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; ArgentinaFil: Vellicce, Gabriel Ricardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ArgentinaFil: Tomas Grau, Rodrigo Hernán. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; ArgentinaFil: Castagnaro, Atilio Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; ArgentinaFil: Diaz Ricci, Juan Carlos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Biológica; Argentin

Disease incidence of charcoal rot (\u3ci\u3eMacrophomina phaseolina\u3c/i\u3e) on soybean in north-western Argentina and genetic characteristics of the pathogen

Charcoal rot of soybean (Glycine max (L.) Merr.), caused by Macrophomina phaseolina (Tassi) Goid., is an economically important disease worldwide. In recent years, charcoal rot has become a concern for farmers in north-western Argentina. The present work aimed to (1) evaluate disease incidence of charcoal rot; (2) assess morphological and genetic characteristics of M. phaseolina isolates from soybean and other hosts collected in north-western Argentina; and (3) compare genetic diversity between soybean isolates of M. phaseolina from Argentina and the USA. Incidence of charcoal rot evaluated in 11 locations during five growing seasons (2008–2012) was 1%, 1%, 1%, 5–10% and 90%, respectively, indicating a gradual increase over the cropping seasons. Cluster analysis by AFLP of Argentinean isolates exhibited one main group, with isolate Mp56 separated at a genetic distance of 0.70. Four main groups were identified using SSR markers at the same genetic distance, with Mp56 and Mp53 separated from them. There was no clear association between AFLP, SSR profiles, morphological characteristics or host of origin within isolates from Argentina. However, using principal coordinate analysis of SSRs, 22 isolates of M. phaseolina from soybean from north-western Argentina were clearly distinguished from 11 isolates previously collected from two states in the USA. Our results confirmed the increasing importance of charcoal rot in north-western Argentina and identified characteristics of isolates that may be useful for breeding for disease resistance and developing integrated management programmes for charcoal rot in Argentina in the future. La pourriture noire du soya (Glycine max (L.)Merr.), causée par Macrophomina phaseolina (Tassi) Goid., est une maladie économiquement importante dans le monde entier. Depuis les dernières années, elle préoccupe les producteurs du nord-ouest de l’Argentine. Ces travaux visaient à: (1) estimer l’incidence de la maladie; (2) évaluer les caractéristiques morphologiques et génétiques des isolats de M. phaseolina collectés sur le soya et d’autres hôtes du Nord-Ouest argentin; et (3) comparer la diversité génétique entre les isolats de M. phaseolina collectés sur le soya en Argentine et aux États-Unis. L’incidence de la pourriture noire évaluée à 11 endroits durant 5 saisons de croissance (de 2008 à 2012) était de 1%, 1%, 1%, 5–10% et 90%, respectivement, ce qui indique une progression graduelle d’une saison à l’autre. L’analyse typologique des données AFLP des isolats argentins a fait ressortir un groupe principal incluant l’isolat Mp56 séparé par une distance génétique de 0.70. Quatre groupes principaux ont été identifiés à l’aide de marqueurs SSR à la même distance génétique,Mp56 etMp53 en étant séparés. Il n’y avait pas de corrélation nette entre les données AFLP, les profiles SSR, les caractéristiquesmorphologiques ou l’hôte d’origine parmi les isolats argentins. Toutefois, en utilisant l’analyse des principales coordonnées des SSR, 22 isolats de M. phaseolina collectés sur le soya du nord-ouest de l’Argentine ont été nettement différenciés de 11 isolats préalablement collectés dans deux États américains. Nos résultats confirment l’importance croissante de la pourriture noire dans le nord-ouest de l’Argentine. Ils ont permis de définir les caractéristiques des isolats qui pourraient être utiles en vue d’une sélection visant la résistance et l’élaboration d’un programme de gestion intégrée pour, dans l’avenir, combattre la pourriture noire en Argentine

Disease incidence of charcoal rot (\u3ci\u3eMacrophomina phaseolina\u3c/i\u3e) on soybean in north-western Argentina and genetic characteristics of the pathogen

Charcoal rot of soybean (Glycine max (L.) Merr.), caused by Macrophomina phaseolina (Tassi) Goid., is an economically important disease worldwide. In recent years, charcoal rot has become a concern for farmers in north-western Argentina. The present work aimed to (1) evaluate disease incidence of charcoal rot; (2) assess morphological and genetic characteristics of M. phaseolina isolates from soybean and other hosts collected in north-western Argentina; and (3) compare genetic diversity between soybean isolates of M. phaseolina from Argentina and the USA. Incidence of charcoal rot evaluated in 11 locations during five growing seasons (2008–2012) was 1%, 1%, 1%, 5–10% and 90%, respectively, indicating a gradual increase over the cropping seasons. Cluster analysis by AFLP of Argentinean isolates exhibited one main group, with isolate Mp56 separated at a genetic distance of 0.70. Four main groups were identified using SSR markers at the same genetic distance, with Mp56 and Mp53 separated from them. There was no clear association between AFLP, SSR profiles, morphological characteristics or host of origin within isolates from Argentina. However, using principal coordinate analysis of SSRs, 22 isolates of M. phaseolina from soybean from north-western Argentina were clearly distinguished from 11 isolates previously collected from two states in the USA. Our results confirmed the increasing importance of charcoal rot in north-western Argentina and identified characteristics of isolates that may be useful for breeding for disease resistance and developing integrated management programmes for charcoal rot in Argentina in the future. La pourriture noire du soya (Glycine max (L.)Merr.), causée par Macrophomina phaseolina (Tassi) Goid., est une maladie économiquement importante dans le monde entier. Depuis les dernières années, elle préoccupe les producteurs du nord-ouest de l’Argentine. Ces travaux visaient à: (1) estimer l’incidence de la maladie; (2) évaluer les caractéristiques morphologiques et génétiques des isolats de M. phaseolina collectés sur le soya et d’autres hôtes du Nord-Ouest argentin; et (3) comparer la diversité génétique entre les isolats de M. phaseolina collectés sur le soya en Argentine et aux États-Unis. L’incidence de la pourriture noire évaluée à 11 endroits durant 5 saisons de croissance (de 2008 à 2012) était de 1%, 1%, 1%, 5–10% et 90%, respectivement, ce qui indique une progression graduelle d’une saison à l’autre. L’analyse typologique des données AFLP des isolats argentins a fait ressortir un groupe principal incluant l’isolat Mp56 séparé par une distance génétique de 0.70. Quatre groupes principaux ont été identifiés à l’aide de marqueurs SSR à la même distance génétique,Mp56 etMp53 en étant séparés. Il n’y avait pas de corrélation nette entre les données AFLP, les profiles SSR, les caractéristiquesmorphologiques ou l’hôte d’origine parmi les isolats argentins. Toutefois, en utilisant l’analyse des principales coordonnées des SSR, 22 isolats de M. phaseolina collectés sur le soya du nord-ouest de l’Argentine ont été nettement différenciés de 11 isolats préalablement collectés dans deux États américains. Nos résultats confirment l’importance croissante de la pourriture noire dans le nord-ouest de l’Argentine. Ils ont permis de définir les caractéristiques des isolats qui pourraient être utiles en vue d’une sélection visant la résistance et l’élaboration d’un programme de gestion intégrée pour, dans l’avenir, combattre la pourriture noire en Argentine