8 research outputs found

    Detection of MET Alterations Using Cell Free DNA and Circulating Tumor Cells from Cancer Patients

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    MET alterations may provide a potential biomarker to evaluate patients who will benefit from treatment with MET inhibitors. Therefore, the purpose of the present study is to investigate the utility of a liquid biopsy-based strategy to assess MET alterations in cancer patients. We analyzed MET amplification in circulating free DNA (cfDNA) from 174 patients with cancer and 49 healthy controls and demonstrated the accuracy of the analysis to detect its alteration in patients. Importantly, a significant correlation between cfDNA concentration and MET copy number (CN) in cancer patients (r = 0.57, p <10−10) was determined. Furthermore, we evaluated two approaches to detect the presence of MET on circulating tumor cells (CTCs), using the CellSearch® and Parsortix systems and monitored patients under anti-EGFR treatment (n = 30) combining both cfDNA and CTCs analyses. This follow-up provides evidence for the potential of MET CN assessment when patients develop resistance to anti-EGFR therapy and a significant association between the presence of CTCs MET+ and the Overall Survival (OS) in head and neck cancer patients (P = 0.05; HR = 6.66). In conclusion, we develop specific and noninvasive assays to monitor MET status in cfDNA/CTCs and demonstrate the utility of plasma MET CN determination as a biomarker for monitoring the appearance of resistance to anti-EGFR therapyThis study was financed by all the donors who participated in the Liquid Biopsy Crowdfunding campaign in 2017. LMR is supported by Asociación Española Contra el Cancer (AECC). ADL is funded by a “Juan Rodés” contract (JR17/00016) from ISCIIIS

    Metodología de muestreo expeditivo ambiental/productivo para la determinación de líneas de base prediales en planes MBGI

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    En el Manejo de Bosque con Ganadería Integrada (MBGI); las propuestas técnicas se basan en el manejo adaptativo de los componentes forestales; ganaderos; forrajeros; y ambientales que se deben plasmar en la presentación de un Plan MBGI con propuestas factibles de implementar. Este tipo de manejo implica un proceso de monitoreo de la evolución de los distintos componentes en el que los aciertos y los errores de las prácticas de manejo son fuentes de conocimiento. Se trata de un proceso abierto que atiende la historia del sistema e incluye intereses y expectativas de usuarios presentes y futuros. Para llevar a cabo el ordenamiento predial bajo el concepto del manejo adaptativo; es imprescindible contar con un sistema de monitoreo que verifique que la planificación cumple con los objetivos en todas las dimensiones de la sustentabilidad: ambiental; social-económica y productiva. A través de la metodología actualmente propuesta para el monitoreo de planes prediales a campo para Patagonia (Peri et al.; 2021); se relevan datos para el cálculo o estimación de 12 indicadores ambientales; 2 socio económicos y 6 productivos. En este diseño se procura optimizar la obtención de datos de calidad; basados en la economía de los recursos del monitoreo y el tiempo. Atento a esta premisa; se propone establecer como base una transecta lineal; fajas de diferentes anchos asociadas a la misma y cuadros de censo cada 5 metros de transecta; para cada unidad de muestreo específica (tipos de vegetación).Estación Experimental Agropecuaria BarilocheFil: Varela, Santiago Agustin. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Area Forestal. Grupo de Ecologia Forestal; ArgentinaFil: Diez, Juan Pablo. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Area Forestal. Grupo de Ecologia Forestal; ArgentinaFil: Gazzotti, Juan Ignacio. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Agencia de Extensión Rural San Martin de los Andes; ArgentinaFil: Valiña, Pablo. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Agencia de Extensión Rural San Martin de los Andes; ArgentinaFil: Furlan, Natalia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Agencia de Extensión Rural San Martin de los Andes; ArgentinaFil: Cardozo, Andrea Gabriela. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Agencia de Extension Rural El Bolson; ArgentinaFil: Farina, Clara Maria. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Area Produccion Animal; ArgentinaFil: Castillo, Daniel Alejandro. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Area Desarrollo Rural; ArgentinaFil: Umaña, Fernando. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Area Desarrollo Rural. Laboratorio de Teledetección; ArgentinaFil: Raffo, Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Area de Recusos Naturales. Laboratorio de Teledetección; ArgentinaFil: Borrelli, Laura Beatriz. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Area de Recursos Naturales; ArgentinaFil: Claps, Leonardo Luis. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Area Desarrollo Rural; ArgentinaFil: Aramayo, Maria Valeria Del Luján. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agropecuaria Bariloche. Area Recursos Naturales; ArgentinaFil: Amoroso, Mariano Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Instituto de Investigaciones en Recursos Naturales, Agroecologia y Desarrollo Rural; ArgentinaFil: Von Müller, Axel. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria (INTA). Estacion Experimental Agroforestal Esquel. Area Forestal; Argentin

    Automated cell count in body fluids: a review

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    Body fluid cell counting provides valuable information for the diagnosis and treatment of a variety of conditions. Chamber cell count and cellularity analysis by optical microscopy are considered the gold-standard method for cell counting. However, this method has a long turnaround time and limited reproducibility, and requires highly-trained personnel. In the recent decades, specific modes have been developed for the analysis of body fluids. These modes, which perform automated cell counting, are incorporated into hemocytometers and urine analyzers. These innovations have been rapidly incorporated into routine laboratory practice. At present, a variety of analyzers are available that enable automated cell counting for body fluids. Nevertheless, these analyzers have some limitations and can only be operated by highly-qualified laboratory professionals. In this review, we provide an overview of the most relevant automated cell counters currently available for body fluids, the interpretation of the parameters measured by these analyzers, their main analytical features, and the role of optical microscopy as automated cell counters gain ground

    El recuento automatizado de células en líquidos biológicos: una revisión

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    El recuento de células en líquidos biológicos proporciona una información valiosa para el diagnóstico y tratamiento de diferentes patologías. El recuento en cámara y el estudio de la celularidad mediante microscopía óptica han sido consideradas tradicionalmente como método de referencia. Sin embargo, esta metodología implica un tiempo de respuesta del laboratorio elevado, carece de la reproducibilidad adecuada y requiere de personal experto. El avance tecnológico ha permitido el desarrollo de módulos de análisis específicos para los líquidos biológicos, incorporados en analizadores de hematología y de orinas, que permiten la automatización del recuento celular y han sido rápidamente incorporados a la práctica asistencial de los laboratorios En la actualidad diferentes analizadores están disponibles para ofrecer soluciones de automatización en el recuento de células en líquidos biológicos. Sin embargo, el empleo de dichos analizadores no está exento de limitaciones y su utilización requiere de un profundo conocimiento por los especialistas de la Medicina de Laboratorio. En esta revisión, se describen las principales tecnologías para la automatización del recuento celular en líquidos biológicos, el significado de los parámetros informados por los analizadores, sus principales características analíticas, así como el papel de la microscopía óptica en un contexto de utilización creciente de estas tecnologías

    Metodología de muestreo expeditivo ambiental/productivo para la determinación de líneas de base prediales en planes MBGI

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    En el Manejo de Bosque con Ganadería Integrada (MBGI); las propuestas técnicas se basan en el manejo adaptativo de los componentes forestales; ganaderos; forrajeros; y ambientales que se deben plasmar en la presentación de un Plan MBGI con propuestas factibles de implementar. Este tipo de manejo implica un proceso de monitoreo de la evolución de los distintos componentes en el que los aciertos y los errores de las prácticas de manejo son fuentes de conocimiento. Se trata de un proceso abierto que atiende la historia del sistema e incluye intereses y expectativas de usuarios presentes y futuros. Para llevar a cabo el ordenamiento predial bajo el concepto del manejo adaptativo; es imprescindible contar con un sistema de monitoreo que verifique que la planificación cumple con los objetivos en todas las dimensiones de la sustentabilidad: ambiental; social-económica y productiva. A través de la metodología actualmente propuesta para el monitoreo de planes prediales a campopara Patagonia (Peri et al.; 2021); se relevan datos para el cálculo o estimación de 12 indicadores ambientales; 2 socio económicos y 6 productivos. En este diseño se procura optimizar la obtención de datos de calidad; basados en la economía de los recursos del monitoreo y el tiempo. Atento a esta premisa; se propone establecer como base una transecta lineal; fajas de diferentes anchos asociadas a la misma y cuadros de censo cada 5 metros de transecta; para cada unidad de muestreo específica (tipos de vegetación). El primer paso consiste en delimitar dentro del predio áreas homogéneas en cuanto a la vegetación; las condiciones ambientales e historia de uso. Debe delimitarse claramente el área destinada al pastoreo; el área de conservación y el área de conectividad; así como las áreas dedicadas a otra actividad ya que cada una tiene un objetivo diferente y por ende los umbrales de aceptación para algunos indicadores no serán los mismos. Para esto se pueden utilizar imágenes satelitales de distintas fuentes. Estas unidades permiten diagramar los muestreos y monitoreo de manera que cada una de las áreas delimitadas tenga adicionalmente representatividad. Las unidades seleccionadas deben cubrir las diferentes fisonomías dentro del paisaje (ej. bosque; pastizal; matorral) cubriendo la heterogeneidad espacial y abarcando la composición específica característica del ecosistema bajo análisis.Fil: Varela, Santiago Agustín. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Diez, Juan Pablo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Gazotti, Juan Ignacio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Valiña, Pablo Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Furlan, Natalia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Cardozo, Andrea Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Agencia de Extensión Rural El Bolsón; ArgentinaFil: Cancino, Andrea Karina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Fariña, Clara María. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Área de Recursos Naturales; ArgentinaFil: Castillo, Daniel Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Área de Recursos Naturales; ArgentinaFil: Umaña, Fernando Javier. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Raffo, Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Borrelli, Laura Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Claps, Leonardo Luis. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Aramayo, Maria Valeria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Área de Recursos Naturales; ArgentinaFil: Amoroso, Mariano Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones En Recursos Naturales, Agroecología y Desarrollo Rural. - Universidad Nacional de Rio Negro. Instituto de Investigaciones En Recursos Naturales, Agroecología y Desarrollo Rural; ArgentinaFil: Von Müller, Axel Ricardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Sur. Estación Experimental Agropecuaria Esquel; ArgentinaVI Jornadas Forestales Patagónicas: el rol de los bosques en un mundo diferenteSan Carlos de BarilocheArgentinaInstituto Nacional de Tecnología AgropecuariaCentro de Investigación y Extensión Forestal Andino PatagónicoConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnica

    Detection of MET Alterations Using Cell Free DNA and Circulating Tumor Cells from Cancer Patients

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    [eng] MET alterations may provide a potential biomarker to evaluate patients who will benefit from treatment with MET inhibitors. Therefore, the purpose of the present study is to investigate the utility of a liquid biopsy-based strategy to assess MET alterations in cancer patients. We analyzed MET amplification in circulating free DNA (cfDNA) from 174 patients with cancer and 49 healthy controls and demonstrated the accuracy of the analysis to detect its alteration in patients. Importantly, a significant correlation between cfDNA concentration and MET copy number (CN) in cancer patients (r = 0.57, p <10−10) was determined. Furthermore, we evaluated two approaches to detect the presence of MET on circulating tumor cells (CTCs), using the CellSearch® and Parsortix systems and monitored patients under anti-EGFR treatment (n = 30) combining both cfDNA and CTCs analyses. This follow-up provides evidence for the potential of MET CN assessment when patients develop resistance to anti-EGFR therapy and a significant association between the presence of CTCs MET+ and the Overall Survival (OS) in head and neck cancer patients (P = 0.05; HR = 6.66). In conclusion, we develop specific and noninvasive assays to monitor MET status in cfDNA/CTCs and demonstrate the utility of plasma MET CN determination as a biomarker for monitoring the appearance of resistance to anti-EGFR therapy

    Forest Management with Integrated Livestock in Argentine Patagonia: methodological adjustment for determining the baseline in complex ecosystems and heterogeneous landscapes

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    El Manejo del Bosque con Ganadería Integrada (MBGI) es una propuesta técnica que se basa en el manejo de los componentes forestal, ganadero, forrajero y ambiental, articulada como un plan predial factible de implementar. Requiere un proceso de monitoreo de los distintos componentes en un marco de manejo adaptativo, verificando que la planificación cumpla con los objetivos en todas las dimensiones de la sustentabilidad. Es necesario para la caracterización de la línea de base del predio, la determinación de “Sitios Ecológicos” (unidades de paisaje con similares tipos de suelo, topografía, hidrología, clima y vegetación, que se espera que respondan de manera similar a disturbios y manejo) y sus correspondientes “Estados de Referencia” (condición de mayor integridad ecológica). El objetivo del presente trabajo es generar una propuesta de “muestreo expeditivo” de los aspectos ambientales/productivos para predios bajo MBGI. Apunta a una visualización holística de procesos clave de dinámicas de los bosques norpatagónicos y zonas aledañas, permitiendo en menor tiempo (en comparación con la metodología actualmente disponible) su descripción, categorización y planificación.Forest Management with Integrated Livestock (MBGI, for its acronym in Spanish) is a technical proposal based on the management of forestry, livestock, forage and environmental components of a property articulated as a feasible farm plan. It requires a monitoring process of these different components within an adaptive management framework, and verification that planning meets the objectives of all dimensions of sustainability. It is necessary for the baseline characterization of the property, the determination of “Ecological Sites” (landscape units with similar types of soil, topography, hydrology, climate and vegetation, which are expected to respond in a similar way to disturbances and management) and their corresponding “Reference States” (condition of greater ecological integrity). The objective of this work is to generate a proposal for “expeditious sampling” of environmental/productive aspects of properties under MBGI. It aims at a holistic visualization of the key dynamics of Northern Patagonian forests and surrounding areas, allowing for their description, categorization and planning in less time compared to the currently available methodology.Fil: Varela, Santiago Agustín. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Diez, Juan Pablo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Gazotti, Juan Ignacio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Valiña, Pablo Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Furlan, Natalia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Cardozo, Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Agencia de Extensión Rural El Bolsón; ArgentinaFil: Cancino, Andrea Karina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Fariña, Clara María. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Área de Recursos Naturales; ArgentinaFil: Castillo, Daniel Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Área de Recursos Naturales; ArgentinaFil: Umaña, Fernando Javier. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Raffo, Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Borrelli, Laura Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Claps, Leonardo Luis. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche; ArgentinaFil: Aramayo, María Valeria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Área de Recursos Naturales; ArgentinaFil: Amoroso, Mariano Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones en Recursos Naturales, Agroecología y Desarrollo Rural. - Universidad Nacional de Rio Negro. Instituto de Investigaciones en Recursos Naturales, Agroecología y Desarrollo Rural; ArgentinaFil: Quinteros, Claudia Pamela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Centro de Investigación Esquel de Montaña y Estepa Patagónica. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Centro de Investigación Esquel de Montaña y Estepa Patagónica; ArgentinaFil: Von Müller, Axel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Sur. Estación Experimental Agropecuaria Esquel; ArgentinaFil: Trinco, Fabio. Fundación Cruzada Patagónica; ArgentinaFil: Hernández, Hernán. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Salta-jujuy. Estacion Experimental Agropecuaria Yuto. Agencia de Extension Rural Tartagal.; ArgentinaFil: Peri, Pablo Luis. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; Argentina. Universidad Nacional de la Patagonia Austral; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin
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