Evaluation de l'apport de l'IRM corps entier avec séquences de diffusion pour le suivi du myélome multiple

Introduction. L'IRM de diffusion est en cours d'évaluation dans le myélome multiple. L'objectif de notre étude était d'évaluer l'apport de l'IRM de diffusion corps entier pour le suivi de myélome. Méthodes. Chez 54 patients ayant eu 2 IRM corps entier avec séquences de diffusion pour le suivi d'un myélome, nous avons comparé évolution en IRM et évolution biologique. Nous avons aussi évalué l'apport des séquences de diffusion par rapport aux séquences classiques, et la concordance inter-observateurs pour l'interprétation des IRM. Résultats. L'évolution en IRM avec séquences de diffusion concordait avec l'évolution biologique dans 66,7% des cas. Cela équivalait à une concordance modérée (kappa pondéré 0,53), meilleure qu'en n'interprétant que les séquences T1 et STIR (kappa pondéré 0,50). La concordance inter-observateurs était modérée à bonne. Conclusion. L'IRM de diffusion corps entier évolue avec l'activité du myélome et semble un examen prometteur pour le suivi de cette pathologie.Introduction. Diffusion-weighted MRI (DWI) is currently evaluated in multiple myeloma. The aim of our study was to assess the interest of whole-body DWI (WB-DWI) for the follow-up of MM. Methods. 54 patients with myeloma underwent 2 WB-DWI at Rennes university hospital. We compared MRI changes to clinical evolution based on the international uniform response criteria. We also evaluated the impact of diffusion-weighted images compared to conventional MRI images, and the inter-observeur agreement. Results. We found an agreement between MRI changes and clinical evolution in 66,7% of cases. The weighted kappa coefficient was 0,53 (95% CI, 0,34 to 0,72), indicating moderate agreement, slightly higher than when taking into account only T1 and STIR weighted images (weighted kappa 0,50, 95% CI 0,31 to 0,69). Inter-observer agreement was moderate to good. Conclusion. WB-DWI correlates with clinical evolution and seems a promising technique for the follow-up of patients with MM.RENNES1-BU Santé (352382103) / SudocSudocFranceF

Association of tuberculosis and deep venous thromboembolism in patients with autoimmune diseases

International audienceLetter to the Edito

Lineages with broad dairy biotope ranges and phenotypic variability in Propionibacterium freudenreichii revealed by multilocus sequence typing

Propionibacterium freudenreichii is used as a ripening culture in Swiss cheese and studied for its probiotic potentialities. Despite the reported variety of biotopes and phenotypes in the species, little is known about the P. freudenreichii population structure. The molecular diversity and the relationships between P. freudenreichii strains MLST scheme and sequence diversity were investigated using multilocus sequence typing (MLST

Lineages with broad dairy biotope ranges and phenotypic variability in Propionibacterium freudenreichii revealed by multilocus sequence typing

Propionibacterium freudenreichii is used as a ripening culture in Swiss cheese and studied for its probiotic potentialities. Despite the reported variety of biotopes and phenotypes in the species, little is known about the P. freudenreichii population structure. The molecular diversity and the relationships between P. freudenreichii strains MLST scheme and sequence diversity were investigated using multilocus sequence typing (MLST

Lineages with broad dairy biotope ranges and phenotypic variability in Propionibacterium freudenreichii revealed by multilocus sequence typing

Propionibacterium freudenreichii is used as a ripening culture in Swiss cheese and studied for its probiotic potentialities. Despite the reported variety of biotopes and phenotypes in the species, little is known about the P. freudenreichii population structure. The molecular diversity and the relationships between P. freudenreichii strains MLST scheme and sequence diversity were investigated using multilocus sequence typing (MLST

CIRM : préserver la biodiversité microbienne pour soutenir l’innovation

L’utilisation des micro-organismes est régie par un cadre légal et consensuel, actuellement en pleine évolution. Le protocole de Nagoya et sa transposition récente en droit français imposent désormais une traçabilité complète de toutes les souches de micro-organismes sur lesquelles les chercheurs travaillent. La Loi règlemente notamment l’accès aux ressources microbiennes prélevées sur le territoire national ainsi que leur utilisation pour la recherche et le développement. Le non-respect de cette loi est passible de conséquences pénales et financières qui ne sont pas anodines.Les microorganismes jouent un rôle essentiel dans de nombreux processus naturels et anthropiques. Il est indispensable de les préserver et d’explorer leur diversité, en termes de recherche fondamentale mais aussi de recherche appliquée. Convaincu de leur importance, l’INRA a créé en 2004, le Centre International de Ressources Microbiennes (CIRM) afin de valoriser ses collections patrimoniales de micro-organismes. Le CIRM est un réseau constitué à ce jour de cinq Centres de Ressources Biologiques (CRB) dont le CIRM-bactéries pathogènes des animaux ou des humains basé à Tours. Le CIRM met à la disposition de la communauté scientifique et des industriels plus de 22000 souches. Il se distingue aujourd’hui des autres collections européennes par le fait qu’il dispose d’un grand nombre de souches par espèce. Associée à l’expertise scientifique et technique de ses équipes et à des outils analytiques haut-débit, cette grande diversité intra-spécifique représente un potentiel d’innovation majeur permettant la compréhension des bases moléculaires de la biodiversité phénotypique ainsi que la recherche de fonctionnalités d’intérêt (aptitudes technologiques, activités enzymatiques, caractères phénotypiques…) pouvant aboutir sur des applications industrielles. En tant que CRB certifié ISO 9001, le CIRM-BP offre la garantie du respect du cadre réglementaire et légal.Le CIRM est devenu un acteur incontournable dans le paysage Français et Européen des Ressources Génétiques: Il constitue le pilier Microbien de l’Infrastructure nationale de Recherche (IR) dédiée aux ressources pour l’agronomie, RARe (http://www6.inra.fr/agrobrc-rare/) et joue désormais un rôle clé dans la construction de l’IR européenne MIRRI (Microbial Resource Research Infrastructure/ http://mirri.org),. MIRRI vise à faciliter l’accès aux ressources microbiennes et leur utilisation par la recherche académique et industrielle et devrait impliquer à terme plus de 300.000 isolats microbiens

Multilocus sequence typing of Propionibacterium freudenreichii

 Propionibacterium freudenreichii is used as a ripening culture in Swiss cheese manufacture. This study investigates the molecular diversity and the population structure of this bacterium via multilocus sequence typing (MLST). Internal fragments of seven genes sequenced for 113 strains of different subspecies and origins allowed the resolution of 46 sequence types (STs) with occurrence frequencies ranging from 1 to 11. The core genome of the species harbours a low level of nucleotide polymorphism. In our data, single nucleotide polymorphisms account for only 2.28% of the concatenated sequences, and the average polymorphism rate in pairwise comparisons is 0.46%. The analyses reveal quantitatively comparable contributions of recombination and mutation in nucleotide changes at core genome loci along cell lineages. Remarkably, the STs exhibit little if any dairy biotope specialization. Phenotypic characterisation of the strains, based on their aptitude to use lactose and nitrate, shows that the two previously identified subspecies (freudenreichii and shermani) do notreflect the ancestral relationships in the P. freudenreichii population. The considerable phenotypic heterogeneity, found even at the ST level, suggests instead a history of recurrent switches between phenotypes

Evaluation of the diversity of two species of the genus Propionibacterium : Mass Spectrometry versus Triple-Locus Sequence Analysis

A preliminary study was performed on two species of Propionibacterium coming from very different biotope. The first specie, Propionibacterium acnes, is a commensal of the human skin. As an opportunistic pathogen, Propionibacterium acnes is involved in the pathogenesis of acne and may cause severe infections. The second specie, Propionibacterium freudenreichii belongs to the dairy group of propionic acid bacteria and is the main species involved in the holes and flavor formations in Swiss-type cheeses. The partial sequencing of genes coding for proteins (RpoB and RecA) and for 16S rRNA in addition to a mass spectrometric analysis of proteins (MALDI-TOF, MS) were applied to 20 strains of Propionibacterium acnes (15 from the collection of the National Reference Center for anaerobic bacteria and botulism from the Institut Pasteur and 5 strains from the Collection de l’Institut Pasteur) and to 20 strains of Propionibacterium freudenreichii from International Center of Microbial Ressources of Bacteria of Food Interest (CIRM-BIA, INRA). Main objective of this study is dual. Firstly, to determine the degree of molecular diversity of the strains at two levels, species level and clonal diversity level, taking into account that strains were selected in order to offer the largest diversity as possible in terms of biotopes and geographic origin for both species. Secondly, to compare the ranking of the strains according to the methodology applied: triple-locus sequence analysis or mass spectrometry. For mass spectrometry two equipments, an Applied Biosystems instrument and a Bruker Daltonics autoflex, were used to obtain mass spectra in order to evaluate and guarantee the reproducibility of the method. Results should also help to compare triple-locus sequence analysis to the MLST analysis which incorporates a greater number of genes

Le CIRM : préserver la biodiversité microbienne pour innover

Les microorganismes sont des ressources génétiques d’une valeur inestimable qu’il est indispensable de préserver et d’explorer, en termes de recherche fondamentale mais aussi de recherche appliquée. Convaincu de cette richesse et de la valeur intrinsèque de la diversité intra-spécifique des microorganismes, l’INRA a créé en 2006, le Centre International de Ressources Microbiennes (CIRM) afin de préserver et de valoriser ses collections patrimoniales de micro-organismes. Le CIRM est un réseau constitué à ce jour de cinq Centres de Ressources Biologiques (CRB) thématiques - levures d’intérêt technologique (Jouy-en-Josas), champignons filamenteux d’intérêt agro-industriel (Marseille), bactéries alimentaires (Rennes), bactéries pathogènes des animaux ou des humains (Tours) et bactéries associées aux plantes (Angers). L’exploitation et la valorisation de ces ressources présentent des intérêts et un impact socio-économique dans des domaines aussi variés que les fermentations alimentaires, les biotechnologies blanche et verte ainsi que la lutte contre les phyto-pathogènes et les infections bactériennes des animaux et de l’homme. Le CIRM met à la disposition de la communauté scientifique et des industriels plus de 22000 souches. Il se distingue aujourd’hui des autres collections européennes par le fait qu’il dispose d’un grand nombre de souches par espèce. Associée à l’expertise scientifique et technique de ses équipes et à des outils analytiques haut-débit, cette très grande diversité intra-spécifique représente un potentiel d’innovation majeur permettant d’une part, la compréhension des bases moléculaires de la biodiversité phénotypique et d’autre part, la recherche de fonctionnalités d’intérêt (aptitudes technologiques, activités enzymatiques, caractères phénotypiques…) pouvant aboutir sur des applications industrielles. Le CIRM, en tant que CRB certifié ISO 9001, offre la garantie du respect du cadre réglementaire et légal actuellement en pleine évolution, garantie essentielle à toute démarche d’innovation que ce soit pour des collaborations de recherche ou des prestations de service

Biogenic amine and antibiotic resistance profiles determined for lactic acid bacteria and a propionibacterium prior to use as antifungal bioprotective cultures

International audienceLactic acid bacteria (LAB) and propionibacteria are two microbial groups studied as alternatives tochemical preservatives in foods. As potential bioprotective cultures in the food industry, not only doesantimicrobial efficiency need to be ensured, but safety criteria should be evaluated. Here, 21 LAB and 1propionibacterium with previously determined antifungal properties were screened for two relevantcriteria: biogenic amine production and antibiotic resistance patterns. Low risk profiles were observedfor 15 strains, highlighting their potential industrial use as bioprotective cultures. Some exceptions wereidentified: both Lactobacillus buchneri strains tested were histamine-producers, while 1 Lactobacillusbrevis, 2 Lactobacillus rhamnosus and 1 Leuconostoc mesenteroides strains were tyramine-producers.These same strains were resistant to up to 5 antibiotics, thus excluding them as candidates for industrialuse. These results confirm the importance of ensuring safety criteria are met before considering acandidate strain for use as a bioprotective agent in food products