Influence on its Genotypes of the treatment for type B hepatitis

A hepatite B pode ser classificada em oito diferentes genótipos (A-H). Esses genótipos diferem na sua distribuição geográfica mundial. No Brasil, os genótipos mais freqüentemente encontrados são o A, D e F. Algumas alterações na estrutura genética desses genótipos podem resultar em diferentes níveis de patogenicidade, sendo relacionadas com maior ou menor risco de desenvolvimento de hepatocarcinoma ou cirrose no fígado. Além das diferenças citadas, a heterogeneidade dos genótipos da hepatite B parece estar relacionada com diferenças na evolução clínica da infecção e na resposta ao tratamento antiviral. Alguns genótipos demonstraram responder melhor ao tratamento com interferon ou nucleotídeos análogos do que outros. O objetivo desta revisão foi demonstrar a importância do tratamento da hepatite B baseado nos seus diferentes genótipos. Foram revisados artigos da literatura, selecionando aqueles que abordavam questões relacionadas aos genótipos da hepatite B e sua relação com o tratamento desta infecção. Nos artigos revisados, o tratamento da hepatite B baseada em genótipos apresentou diferenças significativas. Os genótipos A e B parecem ter uma melhor resposta ao tratamento antiviral com interferon alfa e/ou lamivudina; porém, mais estudos são necessários para a consistência dessa afirmação. No entanto, através dos presentes dados, já é possível demonstrar forte associação entre genótipos e resposta antiviral. Deste modo, adaptar o tratamento aos genótipos pode promover uma melhor resposta do interferon e dos nucleotídeos na terapêutica da infecção pelo vírus da hepatite B.Type B hepatitis can be classified according to eight different genotypes (A-H). These genotypes are different in terms of worldwide geographical distribution. In Brazil the most frequent genotypes are A, D and F. Some changes in the genetic structure of these genotypes can cause different levels of pathogenesis, being related to lower or higher risk of developing hepatocellular carcinoma or liver cirrhosis. In addition to the above mentioned differences, heterogeneity of hepatitis B genotypes seems to be related to the differences in clinical evolution of the infection and response to antiviral treatment. Some genotypes proved to have a better response to the treatment using interferon or similar nucleotides than others. This review aimed at showing the importance of treatment of type B hepatitis based on its different genotypes. Different articles from the specific medical literature were reviewed and those including genotypes for type B hepatitis and their association with the treatment of this infection were selected. In the reviewed articles genotype-based treatment of hepatitis B showed significant differences. Genotypes A and B seem to have a better response to the antiviral treatment with alpha interferon and/or lamivudine; however, more studies are necessary to confirm this assertion. Nevertheless, using the present data it is already possible to prove a strong connection between genotypes and antiviral response. Therefore, adjusting treatment to genotypes can cause a better therapeutic response from interferon and nucleotides in type B hepatitis therapy

Investigação de Leishmania infantum em javalis de vida livre (Sus scrofa) no Rio Grande do Sul

A leishmaniose visceral (LV) é uma doença causada pelo protozoário Leishmania infantum, transmitida pelo mosquito Lutzomyia longipalpis. No Brasil, a LV é endêmica e de importância para a saúde pública, pois é uma zoonose e o cão consiste no principal reservatório desse parasita. No entanto, animais silvestres podem ter um papel no ciclo de L. infantum. O presente estudo teve como objetivo investigar a ocorrência de L. infantum em javalis (Sus scrofa), espécie exótica que ocorre no Sul do Brasil. Oitenta javalis de vida livre foram amostrados nos municípios de Barra do Ribeiro (n = 77), Herval (n = 2) e São Francisco de Paula (n = 1) no Rio Grande do Sul, Brasil. Os animais foram necropsiados e amostras de fígado, baço e linfonodos foram avaliadas para a ocorrência de L. Infantum por PCR em tempo real. Todos os animais apresentaram resultados negativo, demonstrando que este parasita provavelmente não ocorre em javalis na região estudada. A vigilância ativa LV é essencial para que haja um controle efetivo dessa doença de grande importância epidemiológica

Transtorno por uso de álcool e HIV/AIDS

A ingestão de bebidas alcoólicas é um evento socioculturalmente aceito em muitos países. Porém, o consumo frequente e descontrolado deste tipo de bebida configura o transtorno por uso de álcool (TUA). Esta condição causa agravos que podem afetar a sociedade de uma forma geral. O TUA também pode levar os pacientes a contraírem doenças. Entre estas, existe uma relação importante entre TUA e doenças infectocontagiosas, com destaque para a infecção pelo HIV e o posterior desenvolvimento da AIDS. Portanto, a presente pesquisa objetivou realizar uma revisão da literatura sobre as relações entre TUA e HIV/AIDS. A seleção do material científico foi efetuada tendo por base plataformas eletrônicas, tais como: Google Scholar, MEDLINE, LILACS, SciELO, NCBI / PUBMED, Scopus e Science Direct. O entendimento dos fatores relacionados ao TUA, principalmente em pacientes com HIV/AIDS, é de fundamental importância para a formulação e criação de estratégias de políticas públicas que visem reduzir esta possível relação. Palavras-chave: TUA; HIV; AIDS; políticas pública

Phylogenetic Classification of Feline Immunodeficiency Virus

Background: The feline immunodeficiency virus (FIV) is responsible for a retroviral disease that affects domestic and wild cats worldwide, causing Feline Acquired Immunodeficiency Syndrome (FAIDS). FIV is a lentivirus from the family Retroviridae and its genome has 3 main structural genes: gag, pol and env. Phylogenetic studies have classified FIV into 7 subtypes according to the diversity among strains from the World, mainly in the env gene. Epidemiological analyses have demonstrated the high predominance of FIV-A and FIV-B. This in silico study aimed to perform a phylogenetic analysis to study FIV diversity worldwide. Materials, Methods & Results: A total of 60 whole genome sequences (WGS) and 122 FIV env gene sequences were included in 2 datasets, which were aligned using MAFFT version 7. Recombination among genomes and/or env genes was analyzed with RDP5 software. Phylogenetic analyses with both datasets were performed, after removing the recombinant sequences, by the W-IQ-TREE and constructed and edited by the FigTree. A total of 12 recombination events involving 19 WGS were detected. In addition, 27 recombination events involving 49 sequences were observed in the env gene. A high rate of recombinants was observed inter-subtypes (A/B and B/D) and intra-subtypes (A/A). All recombinants were removed from the subsequent phylogenetic analyses. Phylogenies demonstrated 6 distinct main clades, 5 from domestic cats (A, B, C, E, U) and 1 from wild cat sequences (W) in the WGS, as well as in the specific env gene analyses. Most clustered with subtype B sequences. In the WGS analysis, clade B had a prevalence of 65.9% Brazilian sequences (27/41) and 2.4% Japanese sequences (1/41). In the env gene analyses, clade B showed a prevalence of 43.8% of Brazilian sequences (32/73) and 20.5% of USA sequences (15/73). The results of both analyses also confirm the FIV-wide geographical distribution around the world. In the phylogenetic analyses carried out with WGS, sequences from China (1/41; 2.4%), Colombia (1/41; 2.4%) and the USA (1/41; 2.4%) were identified in clade A; sequence from Canada in clade C (1/41; 2.4%); sequence from Botswana belonged to clade E (1/41; 2.4%); sequences from Brazil clustered into clade U (2/41; 5% - data not yet published); and sequences belonging to the clade W were from Canada (1/41; 2.4%) and the USA (5/41; 12.3%). Specific env gene phylogenetic analyses showed sequences from Colombia (1/73; 1.4%), France (2/73; 2.7%), the Netherlands (3/73; 4.1%), Switzerland (2/73; 2.7%), EUA (6/73; 8.3%), belonging to clade A; sequence from Canada belonging to clade C (1/73; 1.4%); sequences from Brazil belonging to clade U (2/73; 5% - data not yet published); and sequences belonging to clade W from the USA (6/73; 8.3%). Discussion: The results presented here demonstrate that FIV has a rapid viral evolution due to recombination and mutation events, more specifically in the env gene, which is highly variable. Currently, this retrovirus is classified into 7 subtypes (A, B, C, D, E, F and U-NZenv) according to their high genomic diversity. It also highlighted the importance of in silico sequence and phylogeny studies to demonstrate evolutionary processes. This was the first study to address the WGS FIV diversity with a phylogenetic approach. Keywords: FIV, in silico, phylogeny, subtypes, recombination.

Aves silvestres recebidas para atendimento emergencial em Porto Alegre

Os ambientes urbanos possuem comunidades específicas de aves pouco estudadas em comparação com ecossistemas naturais. Informações ainda mais restritas estão disponíveis sobre os atendimentos clínicos veterinários de aves nas grandes cidades. O objetivo deste trabalho foi estudar a frequência de espécies de aves de vida livre atendidas de forma emergencial em uma clínica veterinária de referência na cidade de Porto Alegre, Rio Grande do Sul, entre 2019 e 2021. O atendimento foi realizado na Clínica Toca dos Bichos. Os animais eram trazidos por diferentes pessoas quase que diariamente após recolhimento em espaços públicos (ruas, praças) e privados (casas, apartamentos). Os resultados mostraram o atendimento de 2.332 aves em 2019, 2.733 em 2020 e 3.469 em 2021. A ordem dos Passeriformes foi a mais frequente, seguida por Columbiformes e Psittaciformes. Novas pesquisas na área são necessárias para que haja um monitoramento da avifauna urbana e identificação de doenças e zoonoses

DETECÇÃO DE POLIMORFISMOS ASSOCIADOS À MACIEZ DA CARNE EM GENES DA CALPAÍNA E DA CALPASTATINA EM BOVINOS DA RAÇA SIMENTAL NO RIO GRANDE DO SUL

A maciez da carne bovina depende da ação de enzimas proteolíticas próprias do animal. Polimorfismos de nucleotídeos únicos nos genes das enzimas calpaína (CAPN) e calpastatina (CAST) demonstraram forte associação com a maciez em diversas raças bovinas em estudos prévios. Este trabalho objetivou detectar a ocorrência de três polimorfismos (CAPN1-316, CAPN1-4751 e CASTc:2832) em 50 reprodutores da raça Simental no estado do Rio Grande do Sul. Os resultados demonstraram a ocorrência de um alelo no CAPN1-316 (G) e dois no CAPN1-4751 (42% C, 58% T) e CASTc:2832 (94% A, 6% G). As frequências genotípicas foram 26% CC, 32% CT, 42% TT (CAPN1-4751) e 88% AA, 12% AG (CASTc:2832). Estas informações estão sendo utilizadas nos cruzamentos em programas de melhoramento genético bovino visando o aumento da maciez da carne

A Multiplex real-time PCR for detection of Mycoplasma gallisepticum and Mycoplasma synoviae in clinical samples from Brazilian commercial poultry flocks

Mycoplasma gallisepticum (MS) and Mycoplasma synoviae (MS) are important avian pathogens and cause economic losses to the poultry industry. Molecular biology techniques are currently used for a rapid detection of these pathogens and the adoption of control measures of the diseases. The aim of this study was to develop and validate a technique for simultaneous detection of MG and MS by multiplex real time polymerase chain reaction (PCR). The complete assay (Multiplex MGMS) was designed with primers and probes specific for each pathogen and developed to be carried out in a single tube reaction. Vaccines, MG and MS isolates and DNA from other Mycoplasma species were used for the development and validation of the method. Further, 78 pooled clinical samples from different poultry flocks in Brazil were obtained and used to determine the sensitivity and specificity of the technique in comparison to 2 real time PCR assays specific for MG (MG PCR) and MS (MS PCR). The results demonstrated an agreement of 100% (23 positive and 44 negative samples) between Multiplex MGMS and MG PCR in the analysis of 67 samples from MG positive and negative poultry flocks, and an agreement of 96.9% between Multiplex MGMS and MS PCR in the analysis of 64 samples from MS positive and negative poultry flocks. Considering the single amplification tests as the gold standard, the Multiplex MGMS showed 100% of specificity and sensitivity in the MG analysis and 94.7% sensitivity and 100% specificity in the MS analysis. This new assay could be used for rapid analysis of MG and MS in the poultry industry laboratories

ANÁLISE DA SEQUÊNCIA DE AMINOÁCIDOS DA NEURAMINIDASE DOS VÍRUS INFLUENZA A H1N1PDM09 CIRCULANTES NO RIO GRANDE DO SUL ENTRE 2009 E 2012

A gripe é uma doença infecciosa epidêmica aguda causada pelo vírus da influenza e que ocorre em aves e mamíferos, incluindo o homem. A mais recente pandemia de gripe humana foi causada pelo vírus influenza A H1N1pdm09 com mais de 30.000 casos confirmados no Brasil. No Rio Grande do Sul (RS), 3.585 casos foram positivos em 2009 (298 óbitos), 108 em 2011(13 óbitos) e 517 em 2012 (66 óbitos). A evolução dos vírus influenza ocorre devido a mutações no genoma com consequentes variações antigênicas das sequências das proteínas hemaglutinina (HA) e neuraminidase (NA). O objetivo deste estudo foi analisar a diversidade das sequências de aminoácidos da NA dos vírus influenza A H1N1pdm09 que circularam no RS entre os anos de 2009 a 2012, bem como verificar a ocorrência de casos de resistência aos inibidores de NA. Foram selecionadas 365 amostras clínicas de pacientes com Síndrome Respiratória Aguda Grave (SRAG) e com diagnóstico confirmado de infecção pelo vírus A H1N1pdm09, entre os anos de 2009 e 2012 (sendo 140 do ano de 2009, 105 de 2011 e 120 de 2012). Estas amostras foram submetidas à extração do RNA pelo método de adsorção em sílica e após amplificação pelas técnicas de RT-PCR e Nested PCR. Os produtos de amplificação foram submetidos ao sequenciamento de nucleotídeos e as sequências de aminoácidos da NA foram deduzidas e analisadas comparativamente. Os resultados mostraram elevado grau de identidade entre todas as amostras analisadas (97,1% e 100%), sendo observadas apenas alterações pontuais de aminoácidos em relação à cepa original (e vacinal) A/Califórnia/07/2009. Foram observados oito diferentes padrões de sequências em 2009, 21 em 2011 e 25 em 2012. Adicionalmente foram observadas alterações pontuais características na grande maioria das amostras circulantes no RS, como I241V em todas as amostras do ano 2009 (mas raramente em 2011 e 2012) e V106I em praticamente todas as amostras dos três anos. Outras alterações pontuais importantes foram V81A (n=16), S95N (n=39), T157A (n=30) e I193V (n=39) em 2011, I188T (n=22) e C285S (n=70) em 2012. A análise das modificações que conferem resistência aos inibidores da NA demonstrou a ocorrência de três amostras com a alteração H275Y (resistência comprovada ao oseltamivir) e uma com a substituição S247N (provável resistência ao oseltamivir)

DIVERSIDADE GENÉTICA DE MYCOPLASMA SYNOVIAE NO BRASIL

Mycoplasma synoviae (MS) é um agente infeccioso que acomete galinhas e perus, podendo causar doença respiratória crônicae sinovite infecciosa com graus variados de manifestações clínicas. Esta espécie possui diferentes cepas que podem ser caracterizadaspor técnicas de análise genética. O objetivo deste estudo foi analisar a diversidade de um gene específico (vlhA) em amostras de MSde granjas de produção de aves de diferentes locais do Brasil. Amostras de traquéias foram obtidas de aves de 35 lotes de granjaspositivas para MS de diferentes estados do país. DNA total destas amostras foi extraído pela metodologia de sílica e após foi realizadadupla amplificação de uma região variável (284 a 341 pares de bases - pb) da extremidade 5´ do gene vlhA pela técnica dareação em cadeia da polimerase (nested-PCR). As amostras positivas foram sequenciadas e analisadas comparativamente para aconstrução da árvore filogenética e avaliação do tamanho de uma região interna específica (PRR). Os resultados demonstraram aocorrência de 16 diferentes sequências de aminoácidos nas 35 amostras avaliadas e a análise filogenética mostrou a ocorrência de 8diferentes clados. A sequência de aminoácidos da respectiva cadeia polipeptídica também apresentou diversidade entre as amostras.A região variável PRR foi a que apresentou maior polimorfismo e as amostras foram classificadas em 5 tipos previamente caracterizados(A, C, D, E e F) e um novo tipo (G) encontrado em amostras de granjas do estado do Rio Grande do Sul. Estes resultadosdemonstraram que as amostras de MS de granjas de produção avícola do Brasil apresentam diversidade no gene vlhA

Utilização de marcadores de DNA para o diagnóstico genômico de animais domésticos: 1. Detecção da mutação pontual causadora da Deficiência de Adesão de Leucócitos Bovinos (BLAD) em gado Holandês no Brasil

Ten Holstein bovines, descendants from Ivanhoe line, have been analyzed. DNAs, purified from leukocytes of those animals, were submitted to Polymerase Chain Reaction technique (PCR) and digested by Hae III and Taq I restriction enzymes. Accordingly, the bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) genomic diagnosis was established. The tests revealed that 2 animals were carriers and 8 were normal. Since the development of PCR methodology, a fast, practical and efficient way to select bulls in Artificial Insemination Centers has been through detection of carrier and normal animals.Analisaram-se 10 bovinos da raça Holandesa, descendentes da linhagem Ivanhoe. Submeteram-se os DNAs, purificados a partir de leucócitos destes animais, à técnica de Polymerase Chain Reaction (PCR) e posterior digestão com as enzimas de restrição Hae III e Taq I. Estabeleceu-se, desta maneira, o diagnóstico genômico da Deficiência de Adesão de Leucócitos Bovinos (BLAD). Os exames revelaram que 2 animais eram portadores e 8, normais. A partir do desenvolvimento da metodologia de PCR, tornou-se disponível um método rápido, prático e eficiente para a seleção de touros em Centrais de Inseminação Artificial, por meio da detecção de animais portadores e normais