Caracterización de la función de Mhf1/2 (CENP-S/X) en la segregación y en la reparación del DNA de Schizosaccharomyces pombe

[ES] En este estudio se ha analizado la función de dos proteínas de plegamiento tipo histona que interaccionan físicamente entre sí formando complejos implicados en dos procesos de gran relevancia fisiológica como son la segregación y la reparación del DNA. Estas proteínas fueron identificadas inicialmente en células de mamíferos como componentes constitutivos de la región interna del cinetocoro y se las denominó CENP-S y CENP-X (centromeric protein). En trabajos posteriores, realizados también en células de mamíferos, se identificaron formando un complejo con la DNA helicasa FANCM que participa en la ruta de reparación de la Anemia de Fanconi, denominándose MHF1 y MHF2 (FANCM- associated histone-fold protein). Así pues en eucariotas superiores hablamos de estas proteínas como CENP-S y -X si tratamos sobre la segregación del material genético o como MHF1 y 2, respectivamente, si nos referimos a su actividad en la reparación del DNA. La estructura de estas proteínas, su interacción física y su implicación en los procesos mencionados están altamente conservados desde humanos hasta levaduras indicando su importancia fisiológica. Sin embargo, muchos datos acerca de su regulación y actividad son aún desconocidos. Debido a su alto grado de conservación, su estudio en eucariotas unicelulares como las levaduras facilitará la disección y el entendimiento de su función

El derecho del trabajo y de la seguridad social en españa en 2018

En su quinta edición, el Informe “El Derecho del Trabajo y de la Seguridad Social en España 2018” le ofrece una síntesis, que por concreta no es menos rigurosa, de los principales hitos por los que ha transitado el iuslaboralismo a lo largo del último año. En concreto, en las páginas que siguen, los expertos integrantes de la Sección Juvenil de la Asociación Española de Derecho del Trabajo y de la Seguridad Social (AEDTSS) analizan para usted, en primer lugar, las principales resoluciones europeas y nacionales en materia de igualad y no discriminación, acoso en sus más diversas manifestaciones, liberad religiosa y libertad de expresión. Asimismo, se abordan también las cuestiones relativas al empleo y la contratación, casi monopolizadas por el impacto de las plataformas y las consecuencias del caso de Diego. En materia de vicisitudes, sin perder importancia el despido colectivo, observará un cierto auge de los casos relativos a sucesión empresarial, movilidad funcional y empleo público. En el ámbito del derecho colectivo, además de analizarse el IV AENC, encontrará un estudio pormenorizado de las principales resoluciones en materia de libertad sindical, representación unitaria y ultraactividad. La sección relativa a conciliación y corresponsabilidad incluye este año como novedad un apartado relativo a violencia de género, al hilo de los avances normativos derivados del Real Decreto-ley 9/2018. Los epígrafes concernientes a la protección social y la prevención de riesgos laborales crecen de forma significativa en esta edición, lo que ha permitido abordar la evolución jurisprudencial para buena parte de las prestaciones y riesgos previstos en la Ley. Por último, las expertas del apartado de derecho procesal se han encargado de revisar a fondo los casos más significativos en el marco de las modalidades procesales especiales, con especial hincapié en el ámbito concursal. También han abordado la jurisprudencia constitucional más reciente sobre el de recurso de reposición. En suma, tienen ante usted un trabajo científico consolidado en el tiempo y sólido en cuanto al contenido, fiel reflejo de, a pesar del difícil contexto, el buen hacer de la joven doctrina iuslaboralista española

El Derecho del Trabajo y de la Seguridad Social en España en 2016. Sección Juvenil de la Asociación Española de Derecho del Trabajo y de la Seguridad Social

En su quinta edición, el Informe “El Derecho del Trabajo y de la Seguridad Social en España 2018” le ofrece una síntesis, que por concreta no es menos rigurosa, de los principales hitos por los que ha transitado el iuslaboralismo a lo largo del último año. En concreto, en las páginas que siguen, los expertos integrantes de la Sección Juvenil de la Asociación Española de Derecho del Trabajo y de la Seguridad Social (AEDTSS) analizan para usted, en primer lugar, las principales resoluciones europeas y nacionales en materia de igualad y no discriminación, acoso en sus más diversas manifestaciones, liberad religiosa y libertad de expresión. Asimismo, se abordan también las cuestiones relativas al empleo y la contratación, casi monopolizadas por el impacto de las plataformas y las consecuencias del caso de Diego. En materia de vicisitudes, sin perder importancia el despido colectivo, observará un cierto auge de los casos relativos a sucesión empresarial, movilidad funcional y empleo público. En el ámbito del derecho colectivo, además de analizarse el IV AENC, encontrará un estudio pormenorizado de las principales resoluciones en materia de libertad sindical, representación unitaria y ultraactividad. La sección relativa a conciliación y corresponsabilidad incluye este año como novedad un apartado relativo a violencia de género, al hilo de los avances normativos derivados del Real Decreto-ley 9/2018. Los epígrafes concernientes a la protección social y la prevención de riesgos laborales crecen de forma significativa en esta edición, lo que ha permitido abordar la evolución jurisprudencial para buena parte de las prestaciones y riesgos previstos en la Ley. Por último, las expertas del apartado de derecho procesal se han encargado de revisar a fondo los casos más significativos en el marco de las modalidades procesales especiales, con especial hincapié en el ámbito concursal. También han abordado la jurisprudencia constitucional más reciente sobre el de recurso de reposición. En suma, tienen ante usted un trabajo científico consolidado en el tiempo y sólido en cuanto al contenido, fiel reflejo de, a pesar del difícil contexto, el buen hacer de la joven doctrina iuslaboralista española. The fifth edition of the report, "Labour and Social Security Law in Spain in 2018" analyses the key issues in the changing scenario of Labour Law and Social Security during last year. Elaborated by the Young Scholars’ Section of the Spanish Association of Labour and Social Security Law focuses on the following thematic blocks: non-specific fundamental rights; employment contracts and employment; issues related to employment relationship; collective rights; equality and co-responsibility; occupational risks prevention; and procedural law. In conclusion, you may find here a concrete but detailed analysis of the the main legal and case law novelties of Spanish Social Law

The evolution of the ventilatory ratio is a prognostic factor in mechanically ventilated COVID-19 ARDS patients

Background: Mortality due to COVID-19 is high, especially in patients requiring mechanical ventilation. The purpose of the study is to investigate associations between mortality and variables measured during the first three days of mechanical ventilation in patients with COVID-19 intubated at ICU admission. Methods: Multicenter, observational, cohort study includes consecutive patients with COVID-19 admitted to 44 Spanish ICUs between February 25 and July 31, 2020, who required intubation at ICU admission and mechanical ventilation for more than three days. We collected demographic and clinical data prior to admission; information about clinical evolution at days 1 and 3 of mechanical ventilation; and outcomes. Results: Of the 2,095 patients with COVID-19 admitted to the ICU, 1,118 (53.3%) were intubated at day 1 and remained under mechanical ventilation at day three. From days 1 to 3, PaO2/FiO2 increased from 115.6 [80.0-171.2] to 180.0 [135.4-227.9] mmHg and the ventilatory ratio from 1.73 [1.33-2.25] to 1.96 [1.61-2.40]. In-hospital mortality was 38.7%. A higher increase between ICU admission and day 3 in the ventilatory ratio (OR 1.04 [CI 1.01-1.07], p = 0.030) and creatinine levels (OR 1.05 [CI 1.01-1.09], p = 0.005) and a lower increase in platelet counts (OR 0.96 [CI 0.93-1.00], p = 0.037) were independently associated with a higher risk of death. No association between mortality and the PaO2/FiO2 variation was observed (OR 0.99 [CI 0.95 to 1.02], p = 0.47). Conclusions: Higher ventilatory ratio and its increase at day 3 is associated with mortality in patients with COVID-19 receiving mechanical ventilation at ICU admission. No association was found in the PaO2/FiO2 variation

Clustering COVID-19 ARDS patients through the first days of ICU admission. An analysis of the CIBERESUCICOVID Cohort

Background Acute respiratory distress syndrome (ARDS) can be classified into sub-phenotypes according to different inflammatory/clinical status. Prognostic enrichment was achieved by grouping patients into hypoinflammatory or hyperinflammatory sub-phenotypes, even though the time of analysis may change the classification according to treatment response or disease evolution. We aimed to evaluate when patients can be clustered in more than 1 group, and how they may change the clustering of patients using data of baseline or day 3, and the prognosis of patients according to their evolution by changing or not the cluster.Methods Multicenter, observational prospective, and retrospective study of patients admitted due to ARDS related to COVID-19 infection in Spain. Patients were grouped according to a clustering mixed-type data algorithm (k-prototypes) using continuous and categorical readily available variables at baseline and day 3.Results Of 6205 patients, 3743 (60%) were included in the study. According to silhouette analysis, patients were grouped in two clusters. At baseline, 1402 (37%) patients were included in cluster 1 and 2341(63%) in cluster 2. On day 3, 1557(42%) patients were included in cluster 1 and 2086 (57%) in cluster 2. The patients included in cluster 2 were older and more frequently hypertensive and had a higher prevalence of shock, organ dysfunction, inflammatory biomarkers, and worst respiratory indexes at both time points. The 90-day mortality was higher in cluster 2 at both clustering processes (43.8% [n = 1025] versus 27.3% [n = 383] at baseline, and 49% [n = 1023] versus 20.6% [n = 321] on day 3). Four hundred and fifty-eight (33%) patients clustered in the first group were clustered in the second group on day 3. In contrast, 638 (27%) patients clustered in the second group were clustered in the first group on day 3.Conclusions During the first days, patients can be clustered into two groups and the process of clustering patients may change as they continue to evolve. This means that despite a vast majority of patients remaining in the same cluster, a minority reaching 33% of patients analyzed may be re-categorized into different clusters based on their progress. Such changes can significantly impact their prognosis

Estudios de estructura y de interacciones de LRRK2, una proteína implicada en la Enfermedad de Parkinson

87 p., bibliografía y anexos[EN] Parkinson's disease (PD) is a neurodegenerative disease for which there is not known cure, and for which have been proposed as causes genetic and environmental factors. The LRRK2 gene(Leucine‐Rich Repeat Kinase 2, PARK8) is mutated in a significant number of cases of autosomal dominant PD and in some sporadic cases of the late‐onset type, so that knowledge of function of the protein provides an opportunity for deciphering molecular pathways important in neurodegeneration, particularly in which causes PD. LRRK2 is a large and complex multidomain protein that comprises several domains: armadillo‐type repeats, ankyrin‐type repeats, leucine‐rich repeats (LRR) and a C‐terminal WD40 domain, two catalytic domains: ROC‐GTPase and a kinase of the threonine/serine kinases subfamily, and a domain of unknown function: COR (C‐terminal of ROC). With the ultimate goal of determining the structural characteristics of several of those domains, in this work we have tested various conditions of expression and extraction of different domains of LRRK2, independently cloned, to obtain soluble protein. I have also been performing in vitro refolding of the COR domain, due to the interest on the structure and function of this particular domain. Furthermore, we have made a detailed in silico analysis of the three‐dimensional structure of each domain of LRRK2 and the effect that pathogenic mutations and described polymorphisms may have on it. This latter analysis has allowed us to redefine the limits of the different domains and prompted the re‐cloning ROC‐COR and COR re‐defined domains.[ES] La enfermedad de Parkinson (EP) es una enfermedad neurodegenerativa para la que no se conoce cura y para la que se han propuesto como causas tanto factores genéticos como ambientales. El gen LRRK2 (Leucine‐Rich Repeat Kinase 2, PARK8) aparece mutado en una importante número de casos de la EP autosómica dominante y en algunos de los casos esporádicos de aparición tardía, por lo que el conocimiento de la función de la proteína LRRK2 proporciona una oportunidad para descifrar las rutas moleculares importantes en la neurodegeneración, particularmente en la que causa de la EP. LRRK2 es una proteína multidominio grande y compleja, que comprende varios dominios de interacción: repeticiones tipo armadillo, repeticiones tipo anquirina, repeticiones ricas en leucina (LRR) y un dominio WD40 Cterminal; dos dominios catalíticos: ROC‐GTPasa y quinasa de la subfamilia de las treonina/serina quinasas; y un dominio de función desconocida: COR (C‐terminal de ROC). Con el objetivo último de determinar las características estructurales de varios de estos dominios, en este trabajo se han ensayado diversas condiciones de expresión y extracción de los distintos dominios de LRRK2, clonados de manera independiente para obtener proteína soluble. También se ha realizado el replegado in vitro del dominio COR, dado el interés que presenta la estructura y función de este dominio concreto. Además, se ha realizado un detallado análisis in silico de la estructura tridimensional de cada dominio de LRRK2 y del efecto que las mutaciones patogénicas y los polimorfismos descritos pueden tener en ésta. Este análisis nos ha permitido redefinir los límites de los diferentes dominios y se ha procedido a re‐clonar los dominios COR y ROC‐COR así definidos.Peer reviewe

Caracterización de la función de Mhf1/2 (CENP-S/X) en la segregación y en la reparación del DNA de Schizosaccharomyces pombe

Memoria realizada por la licenciada Dª Marta Tormos Pérez en el Centro Mixto Instituto de Biología Funcional y Genómica, CSIC/Universidad de Salamanca para optar al grado de Doctora en Biotecnología.En este estudio se ha analizado la función de dos proteínas de plegamiento tipo histona que interaccionan físicamente entre sí formando complejos implicados en dos procesos de gran relevancia fisiológica como son la segregación y la reparación del DNA. Estas proteínas fueron identificadas inicialmente en células de mamíferos como componentes constitutivos de la región interna del cinetocoro y se las denominó CENP-S y CENP-X (centromeric protein). En trabajos posteriores, realizados también en células de mamíferos, se identificaron formando un complejo con la DNA helicasa FANCM que participa en la ruta de reparación de la Anemia de Fanconi, denominándose MHF1 y MHF2 (FANCM- associated histone-fold protein). Así pues en eucariotas superiores hablamos de estas proteínas como CENP-S y -X si tratamos sobre la segregación del material genético o como MHF1 y 2, respectivamente, si nos referimos a su actividad en la reparación del DNA. La estructura de estas proteínas, su interacción física y su implicación en los procesos mencionados están altamente conservados desde humanos hasta levaduras indicando su importancia fisiológica. Sin embargo, muchos datos acerca de su regulación y actividad son aún desconocidos. Debido a su alto grado de conservación, su estudio en eucariotas unicelulares como las levaduras facilitará la disección y el entendimiento de su función.Peer Reviewe

ESTUDIO METABONÓMICO POR RMN-1H DEL MUTANTE ybr194w(delta) DE S. cerevisiae

En este trabajo, hemos analizado por RMN-1H los perfiles metabólicos del mutante ybr194w(delta) de S. cerevisiae, en crecimiento en distintas fuentes de carbono y en condición de estrés. En base a los resultados, Ybr194w parece estar implicada en la regulación de la biosíntesis lipídica y/o en el control de la vía de integridad celular.Tormos Pérez, M. (2010). ESTUDIO METABONÓMICO POR RMN-1H DEL MUTANTE ybr194w(delta) DE S. cerevisiae. http://hdl.handle.net/10251/12877Archivo delegad

Structural and functional in silico analysis of LRRK2 missense substitutions

14 páginas, 5 figuras, 1 tabla.The LRRK2 gene (Leucine-Rich Repeat Kinase 2, PARK8) is mutated in a significant number of cases of autosomal dominant Parkinson's disease (PD) and in some sporadic cases of late-onset PD. LRRK2 is a large, complex protein that comprises several interaction domains: armadillo, ankyrin, leucine-rich repeats and WD40 domains; two catalytic domains: ROC-GTPase and serine/threonine kinase; and a COR domain (unknown function). Pathogenic mutations are scattered all over the domains of LRRK2, although the prevalence of mutations in some domains is higher (ROC-GTPase, COR and kinase). In this work, we model the structure of each domain to predict and explore the effects of described missense mutations and polymorphisms. The results allow us to postulate the possible effects of pathogenic mutations in the function of the protein, and hypothesize the importance of some polymorphisms that have not been linked directly to PD, but act as risk factors for the disease. In our analysis, we also study the effects of PD-related mutations in the kinase domain structure and in the phosphorylation of the activation loop to determine effects on kinase activity.Contract Grant sponsor: The Ministerio de Ciencia e Innovación, Spain; Contract Grant number: SAF2009-10434; Contract Grant sponsor: Generalitat Valenciana; Contract Grant number: ACOMP/2010/096.Peer reviewe

Fission yeast cell cycle synchronization methods

Fission yeast cells can be synchronized by cell cycle arrest and release or by size selection. Cell cycle arrest synchronization is based on the block and release of temperature-sensitive cell cycle mutants or treatment with drugs. The most widely used approaches are cdc10-129 for G1; hydroxyurea (HU) for early S-phase; cdc25-22 for G2, and nda3-KM311 for mitosis. Cells can also be synchronized by size selection using centrifugal elutriation or a lactose gradient. Here we describe the methods most commonly used to synchronize fission yeast cells.This work was funded by grants BFU2011-28274 from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness MINECO and CSI151U13 from la Junta de Castilla y León. M.T.-P. is a recipient of a CSIC JAE-predoctoral fellowship.Peer Reviewe