Host–Parasite interactions in Entamoeba histolytica and Entamoeba dispar: what have we learned from their genomes?

Invasive amoebiasis caused by Entamoeba histolytica is a major global health problem. Virulence is a rare outcome of infection, occurring in fewer than 1 in 10 infections. Not all strains of the parasite are equally virulent, and understanding the mechanisms and causes of virulence is an important goal of Entamoeba research. The sequencing of the genome of E. histolytica and the related avirulent species Entamoeba dispar has allowed whole-genome-scale analyses of genetic divergence and differential gene expression to be undertaken. These studies have helped elucidate mechanisms of virulence and identified genes differentially expressed in virulent and avirulent parasites. Here, we review the current status of the E. histolytica and E. dispar genomes and the findings of a number of genome-scale studies comparing parasites of different virulence

Spanish cohort of VEXAS syndrome : clinical manifestations, outcome of treatments and novel evidences about UBA1 mosaicism

The vacuoles, E1-enzyme, X linked, autoinflammatory and somatic (VEXAS) syndrome is an adult-onset autoinflammatory disease (AID) due to postzygotic UBA1 variants. To investigate the presence of VEXAS syndrome among patients with adult-onset undiagnosed AID. Additional studies evaluated the mosaicism distribution and the circulating cytokines. Gene analyses were performed by both Sanger and amplicon-based deep sequencing. Patients' data were collected from their medical charts. Cytokines were quantified by Luminex. Genetic analyses of enrolled patients (n=42) identified 30 patients carrying UBA1 pathogenic variants, with frequencies compatible for postzygotic variants. All patients were male individuals who presented with a late-onset disease (mean 67.5 years; median 67.0 years) characterised by cutaneous lesions (90%), fever (66.7%), pulmonary manifestations (66.7%) and arthritis (53.3%). Macrocytic anaemia and increased erythrocyte sedimentation rate and ferritin were the most relevant analytical abnormalities. Glucocorticoids ameliorated the inflammatory manifestations, but most patients became glucocorticoid-dependent. Positive responses were obtained when targeting the haematopoietic component of the disease with either decitabine or allogeneic haematopoietic stem cell transplantation. Additional analyses detected the UBA1 variants in both haematopoietic and non-haematopoietic tissues. Finally, analysis of circulating cytokines did not identify inflammatory mediators of the disease. Thirty patients with adult-onset AID were definitively diagnosed with VEXAS syndrome through genetic analyses. Despite minor interindividual differences, their main characteristics were in concordance with previous reports. We detected for the first time the UBA1 mosaicism in non-haematopoietic tissue, which questions the previous concept of myeloid-restricted mosaicism and may have conceptual consequences for the disease mechanisms

New insights into the genetic etiology of Alzheimer's disease and related dementias

Characterization of the genetic landscape of Alzheimer's disease (AD) and related dementias (ADD) provides a unique opportunity for a better understanding of the associated pathophysiological processes. We performed a two-stage genome-wide association study totaling 111,326 clinically diagnosed/'proxy' AD cases and 677,663 controls. We found 75 risk loci, of which 42 were new at the time of analysis. Pathway enrichment analyses confirmed the involvement of amyloid/tau pathways and highlighted microglia implication. Gene prioritization in the new loci identified 31 genes that were suggestive of new genetically associated processes, including the tumor necrosis factor alpha pathway through the linear ubiquitin chain assembly complex. We also built a new genetic risk score associated with the risk of future AD/dementia or progression from mild cognitive impairment to AD/dementia. The improvement in prediction led to a 1.6- to 1.9-fold increase in AD risk from the lowest to the highest decile, in addition to effects of age and the APOE ε4 allele

Multiancestry analysis of the HLA locus in Alzheimer’s and Parkinson’s diseases uncovers a shared adaptive immune response mediated by HLA-DRB1*04 subtypes

Across multiancestry groups, we analyzed Human Leukocyte Antigen (HLA) associations in over 176,000 individuals with Parkinson’s disease (PD) and Alzheimer’s disease (AD) versus controls. We demonstrate that the two diseases share the same protective association at the HLA locus. HLA-specific fine-mapping showed that hierarchical protective effects of HLA-DRB1*04 subtypes best accounted for the association, strongest with HLA-DRB1*04:04 and HLA-DRB1*04:07, and intermediary with HLA-DRB1*04:01 and HLA-DRB1*04:03. The same signal was associated with decreased neurofibrillary tangles in postmortem brains and was associated with reduced tau levels in cerebrospinal fluid and to a lower extent with increased Aβ42. Protective HLA-DRB1*04 subtypes strongly bound the aggregation-prone tau PHF6 sequence, however only when acetylated at a lysine (K311), a common posttranslational modification central to tau aggregation. An HLA-DRB1*04-mediated adaptive immune response decreases PD and AD risks, potentially by acting against tau, offering the possibility of therapeutic avenues

PROPIEDADES DE DIGESTIÓN DE ALMIDONES NATIVOS Y MODIFICADOS DE PLÁTANO Y MANGO.

Las propiedades de digestión del almidón han sido clasificadas en base a la cantidad de glucosa liberada durante el transcurso de la digestión: almidón de digestión rápida (ADR), almidón de digestión lenta (ADL) y almidón resistente (AR). El ADL y AR presentan efectos fisiológicos benéficos sobre la salud de quienes los consumen. Debido a ello se han buscado diferentes estrategias para enriquecer dichas propiedades en los almidones comerciales. El presente trabajo analizó dos estrategias para aumentar el ADL y AR de los almidones de fuentes no convencionales: plátano y mango. Se utilizaron una modificación química (hidrólisis ácida) y una modificación enzimática (desramificación), y se caracterizaron fisicoquímica, morfológica y estructuralmente para poder explicar sus propiedades de digestión. Los almidones nativos de plátano y mango, sin gelatinizar, presentaron bajos contenidos de ADL (5.06 – 18.00 %) y altos contenidos de AR (86.40 – 63.42 %). El almidón nativo de plátano, tras ser gelatinizado, presentó un mayor contenido de ADL (15.50 %) en comparación con el almidón de mango (10.60 %), esto debido a la distribución de tamaño molecular de la molécula de amilopectina, ya que el almidón de plátano mostró mayor porcentaje de cadenas tipo B1, B2 y B3. La modificación mediante hidrólisis ácida no tuvo efecto sobre la propiedad de ADL para el caso del almidón de mango, mientras que en el almidón de plátano generó un incremento de 5.06% a 35.4 % alcanzado al 50 % de hidrólisis ácida. Por otra parte, el AR aumentó a partir del 50 % de hidrólisis ácida de 16.24 % (7 días de hidrólisis) a 21.9 % (15 días de hidrólisis). Los lintners (producto de la hidrólisis ácida) de plátano y mango a los 15 días de hidrólisis estuvieron formados de una cadena ramificada con grado de polimerización (GP =27-28) y por cadenas lineales (GP=16-17). Los almidones nativos de plátano y mango presentaron un patrón de difracción tipo C- , el cual tras la modificación con hidrólisis ácida se transformó en un patrón tipo A-. La temperatura promedio de gelatinización de ambos almidones incrementó a partir de los 7 días de hidrólisis acida. La modificación mediante desramificación incrementó el contenido de ADL en el almidón de mango de 10.60% a 26 %, esto alcanzado con 8 h de reacción (83% desramificación), mientras que el almidón de plátano incrementó su contenido de ADL de 15.50 % a 19.15%, esto alcanzado a 4 h de reacción (67 % desramificación). La desramificacion del almidón de mango incrementó el contenido AR de 2.94 % a 22.7 %, a 24 h de reacción (100 % desramificación), la desramificacion del almidón de plátano incrementó el contenidode AR de 3.40% a 44.03%, a 24 h de reacción (100% desramificación). Las temperatura promedio de gelatinizacion de los almidones desramificados incrementó y no hubo cambio en la entalpia de gelatinización debido a la desramificación. Por lo cual, los almidones desramificados tienen mayor estabilidad térmica

Propiedades de digestión de almidones nativos y modificados de plátano y mango

Las propiedades de digestión del almidón han sido clasificadas en base a la cantidad de glucosa liberada durante el transcurso de la digestión: almidón de digestión rápida (ADR), almidón de digestión lenta (ADL) y almidón resistente (AR). El ADL y AR presentan efectos fisiológicos benéficos sobre la salud de quienes los consumen. Debido a ello se han buscado diferentes estrategias para enriquecer dichas propiedades en los almidones comerciales. El presente trabajo analizó dos estrategias para aumentar el ADL y AR de los almidones de fuentes no convencionales: plátano y mango. Se utilizaron una modificación química (hidrólisis ácida) y una modificación enzimática (desramificación), y se caracterizaron fisicoquímica, morfológica y estructuralmente para poder explicar sus propiedades de digestión. Los almidones nativos de plátano y mango, sin gelatinizar, presentaron bajos contenidos de ADL (5.06 – 18.00 %) y altos contenidos de AR (86.40 – 63.42 %). El almidón nativo de plátano, tras ser gelatinizado, presentó un mayor contenido de ADL (15.50 %) en comparación con el almidón de mango (10.60 %), esto debido a la distribución de tamaño molecular de la molécula de amilopectina, ya que el almidón de plátano mostró mayor porcentaje de cadenas tipo B1, B2 y B3. La modificación mediante hidrólisis ácida no tuvo efecto sobre la propiedad de ADL para el caso del almidón de mango, mientras que en el almidón de plátano generó un incremento de 5.06% a 35.4 % alcanzado al 50 % de hidrólisis ácida. Por otra parte, el AR aumentó a partir del 50 % de hidrólisis ácida de 16.24 % (7 días de hidrólisis) a 21.9 % (15 días de hidrólisis). Los lintners (producto de la hidrólisis ácida) de plátano y mango a los 15 días de hidrólisis estuvieron formados de una cadena ramificada con grado de polimerización (GP =27-28) y por cadenas lineales (GP=16-17). Los almidones nativos de plátano y mango presentaron un patrón de difracción tipo C- , el cual tras la modificación con hidrólisis ácida se transformó en un patrón tipo A-. La temperatura promedio de gelatinización de ambos almidones incrementó a partir de los 7 días de hidrólisis acida. La modificación mediante desramificación incrementó el contenido de ADL en el almidón de mango de 10.60% a 26 %, esto alcanzado con 8 h de reacción (83% desramificación), mientras que el almidón de plátano incrementó su contenido de ADL de 15.50 % a 19.15%, esto alcanzado a 4 h de reacción (67 % desramificación). La desramificacion del almidón de mango incrementó el contenido AR de 2.94 % a 22.7 %, a 24 h de reacción (100 % desramificación), la desramificacion del almidón de plátano incrementó el contenido de AR de 3.40% a 44.03%, a 24 h de reacción (100% desramificación). Las temperatura promedio de gelatinizacion de los almidones desramificados incrementó y no hubo cambio en la entalpia de gelatinización debido a la desramificación. Por lo cual, los almidones desramificados tienen mayor estabilidad térmica

Physicochemical Characterization of Resistant Starch Type-III (RS3) Obtained by Autoclaving Malanga (Xanthosoma sagittifolium) Flour and Corn Starch

The feasibility of obtaining resistant starch type III (RS3) from malanga flour (Xanthosoma sagittifolium), as an unconventional source of starch, was evaluated using the hydrothermal treatment of autoclaving. The physicochemical characterization of RS3 made from malanga flour was carried out through the evaluation of the chemical composition, color attributes, and thermal properties. In addition, the contents of the total starch, available starch, resistant starch, and retrograded resistant starch were determined by in vitro enzymatic tests. A commercial corn starch sample was used to produce RS3 and utilized to compare all of the analyses. The results showed that native malanga flour behaved differently in most of the evaluations performed, compared to the commercial corn starch. These results could be explained by the presence of minor components that could interfere with the physicochemical and functional properties of the flour; however, the RS3 samples obtained from malanga flour and corn starch were similar in their thermal and morphological features, which may be related to their similarities in the content and molecular weight of amylose, in both of the samples. Furthermore, the yields for obtaining the autoclaved powders from corn starch and malanga flour were similar (≈89%), which showed that the malanga flour is an attractive raw material for obtaining RS3 with adequate yields, to be considered in the subsequent research

PROPIEDADES DE DIGESTIÓN DE ALMIDONES NATIVOS Y MODIFICADOS DE PLÁTANO Y MANGO

Las propiedades de digestión del almidón han sido clasificadas en base a la cantidad de glucosa liberada durante el transcurso de la digestión: almidón de digestión rápida (ADR), almidón de digestión lenta (ADL) y almidón resistente (AR). El ADL y AR presentan efectos fisiológicos benéficos sobre la salud de quienes los consumen. Debido a ello se han buscado diferentes estrategias para enriquecer dichas propiedades en los almidones comerciales. El presente trabajo analizó dos estrategias para aumentar el ADL y AR de los almidones de fuentes no convencionales: plátano y mango. Se utilizaron una modificación química (hidrólisis ácida) y una modificación enzimática (desramificación), y se caracterizaron fisicoquímica, morfológica y estructuralmente para poder explicar sus propiedades de digestión. Los almidones nativos de plátano y mango, sin gelatinizar, presentaron bajos contenidos de ADL (5.06 – 18.00 %) y altos contenidos de AR (86.40 – 63.42 %). El almidón nativo de plátano, tras ser gelatinizado, presentó un mayor contenido de ADL (15.50 %) en comparación con el almidón de mango (10.60 %), esto debido a la distribución de tamaño molecular de la molécula de amilopectina, ya que el almidón de plátano mostró mayor porcentaje de cadenas tipo B1, B2 y B3. La modificación mediante hidrólisis ácida no tuvo efecto sobre la propiedad de ADL para el caso del almidón de mango, mientras que en el almidón de plátano generó un incremento de 5.06% a 35.4 % alcanzado al 50 % de hidrólisis ácida. Por otra parte, el AR aumentó a partir del 50 % de hidrólisis ácida de 16.24 % (7 días de hidrólisis) a 21.9 % (15 días de hidrólisis). Los lintners (producto de la hidrólisis ácida) de plátano y mango a los 15 días de hidrólisis estuvieron formados de una cadena ramificada con grado de polimerización (GP =27-28) y por cadenas lineales (GP=16-17). Los almidones nativos de plátano y mango presentaron un patrón de difracción tipo C- , el cual tras la modificación con hidrólisis ácida se transformó en un patrón tipo A-. La temperatura promedio de gelatinización de ambos almidones incrementó a partir de los 7 días de hidrólisis acida. La modificación mediante desramificación incrementó el contenido de ADL en el almidón de mango de 10.60% a 26 %, esto alcanzado con 8 h de reacción (83% desramificación), mientras que el almidón de plátano incrementó su contenido de ADL de 15.50 % a 19.15%, esto alcanzado a 4 h de reacción (67 % desramificación). La desramificacion del almidón de mango incrementó el contenido AR de 2.94 % a 22.7 %, a 24 h de reacción (100 % desramificación), la desramificacion del almidón de plátano incrementó el contenido de AR de 3.40% a 44.03%, a 24 h de reacción (100% desramificación). Las temperatura promedio de gelatinizacion de los almidones desramificados incrementó y no hubo cambio en la entalpia de gelatinización debido a la desramificación. Por lo cual, los almidones desramificados tienen mayor estabilidad térmica