Nuoret seksuaalirikoksen kokijana : Alle 20-vuotiaiden seksuaaliväkivaltaa kokeneiden nuorten psykososiaalinen tuki ja sen kehittäminen

Nuoren riski altistua seksuaaliväkivallalle on muita ikäkausia suurempi, sillä suurin osa lapsiin kohdistuvasta seksuaaliväkivallasta kohdistuu yli 13-vuotiaisiin. Nuoruusikäisten huomioiminen seksuaalirikoksen uhreille tarkoitetuissa palveluissa on tähän saakka ollut pirstaleista ja puutteellista. Nuorisosensitiivistä työtä on kehitetty Barnahus-hankkeessa vuodesta 2019 lähtien yhteistyössä yliopistosairaaloiden ja pääasiassa Seri-tukikeskusten kanssa. Nuorisosensitiiviset työntekijät, psykososiaalisen tuen koordinaattorit, ovat antaneet nuorille akuuttitukea seksuaaliväkivallan aiheuttamasta traumaattisesta kriisistä toipumiseen ja pyrkineet varmistamaan tarpeiden mukaiselle palvelupolulle. Kehittämistyön aikana on parannettu myös nuorten seksuaaliväkivallan uhrien hoidon saatavuutta ja hoitopolkuja sekä palveluita. Lisäksi on koulutettu nuorten kanssa työskenteleviä ammattilaisia. Työmuoto on osoittautunut tarpeelliseksi. Sitä ei kuitenkaan voida jättää pelkästään hanketyön varaan. Työn juurruttamista ja kansallista yhtenäisyyttä tulee vahvistaa. Barnahus-hankkeen osalta työn tukeminen jatkuu osin vuoteen 2025 saakka

TET proteins regulate the lineage specification and TCR-mediated expansion of iNKT cells

TET proteins oxidize 5-methylcytosine in DNA to 5-hydroxymethylcytosine and other oxidation products. We found that simultaneous deletion of Tet2 and Tet3 in mouse CD4+CD8+ double-positive thymocytes resulted in dysregulated development and proliferation of invariant natural killer T cells (iNKT cells). Tet2-Tet3 double-knockout (DKO) iNKT cells displayed pronounced skewing toward the NKT17 lineage, with increased DNA methylation and impaired expression of genes encoding the key lineage-specifying factors T-bet and ThPOK. Transfer of purified Tet2-Tet3 DKO iNKT cells into immunocompetent recipient mice resulted in an uncontrolled expansion that was dependent on the nonclassical major histocompatibility complex (MHC) protein CD1d, which presents lipid antigens to iNKT cells. Our data indicate that TET proteins regulate iNKT cell fate by ensuring their proper development and maturation and by suppressing aberrant proliferation mediated by the T cell antigen receptor (TCR)

Comparative analysis of human and mouse transcriptomes of Th17 cell priming

Uncontrolled Th17 cell activity is associated with cancer and autoimmune and inflammatory diseases. To validate the potential relevance of mouse models of targeting the Th17 pathway in human diseases we used RNA sequencing to compare the expression of coding and non-coding transcripts during the priming of Th17 cell differentiation in both human and mouse. In addition to already known targets, several transcripts not previously linked to Th17 cell polarization were found in both species. Moreover, a considerable number of human-specific long non-coding RNAs were identified that responded to cytokines stimulating Th17 cell differentiation. We integrated our transcriptomics data with known disease-associated polymorphisms and show that conserved regulation pinpoints genes that are relevant to Th17 cell-mediated human diseases and that can be modelled in mouse. Substantial differences observed in non-coding transcriptomes between the two species as well as increased overlap between Th17 cell-specific gene expression and disease-associated polymorphisms underline the need of parallel analysis of human and mouse models. Comprehensive analysis of genes regulated during Th17 cell priming and their classification to conserved and non-conserved between human and mouse facilitates translational research, pointing out which candidate targets identified in human are worth studying by using in vivo mouse models

Transcriptional Repressor HIC1 Contributes to Suppressive Function of Human Induced Regulatory T Cells

Regulatory T (Treg) cells are critical in regulating the immune response. In vitro induced Treg (iTreg) cells have significant potential in clinical medicine. However, applying iTreg cells as therapeutics is complicated by the poor stability of human iTreg cells and their variable suppressive activity. Therefore, it is important to understand the molecular mechanisms of human iTreg cell specification. We identified hypermethylated in cancer 1 (HIC1) as a transcription factor upregulated early during the differentiation of human iTreg cells. Although FOXP3 expression was unaffected, HIC1 deficiency led to a considerable loss of suppression by iTreg cells with a concomitant increase in the expression of effector T cell associated genes. SNPs linked to several immune-mediated disorders were enriched around HIC1 binding sites, and in vitro binding assays indicated that these SNPs may alter the binding of HIC1. Our results suggest that HIC1 is an important contributor to iTreg cell development and function

Time-resolved transcriptome and proteome landscape of human regulatory T cell (Treg) differentiation reveals novel regulators of FOXP3

Background: Regulatory T cells (Tregs) expressing the transcription factor FOXP3 are crucial mediators of self-tolerance, preventing autoimmune diseases but possibly hampering tumor rejection. Clinical manipulation of Tregs is of great interest, and first-in-man trials of Treg transfer have achieved promising outcomes. Yet, the mechanisms governing induced Treg (iTreg) differentiation and the regulation of FOXP3 are incompletely understood.Results: To gain a comprehensive and unbiased molecular understanding of FOXP3 induction, we performed time-series RNA sequencing (RNA-Seq) and proteomics profiling on the same samples during human iTreg differentiation. To enable the broad analysis of universal FOXP3-inducing pathways, we used five differentiation protocols in parallel. Integrative analysis of the transcriptome and proteome confirmed involvement of specific molecular processes, as well as overlap of a novel iTreg subnetwork with known Treg regulators and autoimmunity-associated genes. Importantly, we propose 37 novel molecules putatively involved in iTreg differentiation. Their relevance was validated by a targeted shRNA screen confirming a functional role in FOXP3 induction, discriminant analyses classifying iTregs accordingly, and comparable expression in an independent novel iTreg RNA-Seq dataset.Conclusion: The data generated by this novel approach facilitates understanding of the molecular mechanisms underlying iTreg generation as well as of the concomitant changes in the transcriptome and proteome. Our results provide a reference map exploitable for future discovery of markers and drug candidates governing control of Tregs, which has important implications for the treatment of cancer, autoimmune, and inflammatory diseases

TET proteins regulate the lineage specification and TCR-mediated expansion of iNKT cells

TET proteins oxidize 5-methylcytosine in DNA to 5-hydroxymethylcytosine and other oxidation products. We found that simultaneous deletion of Tet2 and Tet3 in mouse CD4+CD8+ double-positive thymocytes resulted in dysregulated development and proliferation of invariant natural killer T cells (iNKT cells). Tet2-Tet3 double-knockout (DKO) iNKT cells displayed pronounced skewing toward the NKT17 lineage, with increased DNA methylation and impaired expression of genes encoding the key lineage-specifying factors T-bet and ThPOK. Transfer of purified Tet2-Tet3 DKO iNKT cells into immunocompetent recipient mice resulted in an uncontrolled expansion that was dependent on the nonclassical major histocompatibility complex (MHC) protein CD1d, which presents lipid antigens to iNKT cells. Our data indicate that TET proteins regulate iNKT cell fate by ensuring their proper development and maturation and by suppressing aberrant proliferation mediated by the T cell antigen receptor (TCR)

RNA-sekvensoidun aikasarjadatan analyysi tyypin 17 auttaja T-solun erilaistumissa hiiressä ja ihmisessä

T helper (Th) cells are white blood cells that play a critical role in immune-mediated diseases. Th cells are divided into subclasses based on their cytokine production. Depending on the antigen, cytokine environment and co-stimulatory signals naïve CD4+ Th cells can differentiate into recently identified T helper 17 cells. The discovery of Th17 cells has provided new insights into host defense and autoimmune diseases. To identify novel factors involved in Th17 cell differentiation we have analyzed time-series RNA-Seq data of activated Th cells and Th17 cells in mouse and human. This master's thesis describes the steps of computational analysis of RNA-Seq data, including preprocessing, clustering of samples and genes, differential expression calling and gene set enrichment analysis. The comprehensive gene expression data set allows us to study how the Th17 differentiation is modified with additional cytokines and how reducing the expression of aryl hydrocarbon receptor changes the differentiation process in mouse. In this thesis we compare results from two widely used tools for calling differential expression. We also compare our RNA-Seq results to the microarray data of human Th17 cells. Despite the very active research on T helper cell differentiation, most of the studies have been generated using mouse models. A central aim of this study was to find genes, which are regulated in both species. We develop a Gaussian process regression method to compare gene expression dynamics in mouse and human in more detail. We have found thousands of genes which are regulated during the differentiation of Th17 cell and identified those genes, which are common between human and mouse. This analysis gives a good basis for further experimental studies and provides directly testable novel biological hypotheses. The results are mainly reported as enriched gene sets and detailed results are saved for later publication.Auttaja T-solut (Th) ovat valkosoluja, joilla on kriittinen rooli immuunisairauksissa. Th-solut on jaettu alaluokkiin sytokiinituotannon perusteella. Riippuen antigeenistä, sytokiiniympäristöstä ja ärsykesignaaleista naiivit T-solut voivat erilaistua vastikään löydetyiksi tyypin 17 auttaja T-soluiksi. Tämä löytö on tarjonnut uutta ymmärrystä elimistön puolustusjärjestelmästä ja autoimmuunisairauksista. Olemme analysoineet aktivoitujen Th-solujen ja Th17-solujen geeniekspressiota hiiressä ja ihmisessä löytääksemme uusia tekijöitä, jotka ovat mukana Th17-solujen erilaistumisessa. Tämä diplomityö raportoi RNA-sekvensointimittausten laskennallisen analyysin vaiheet, kuten esimerkiksi esikäsittely, näytteiden ja geenien klusterointi, yli- ja aliekspressoituneiden geenien identifiointi sekä geenijoukon rikastuma-analyysi. Kattavan geeniekspressiodatan avulla voimme tutkia, miten eri sytokiinien lisääminen ja aryylihiilivetyreseptorin ekspression muokkaaminen muuttavat erilaistumista. Tässä diplomityössä vertailemme kahden, laajasti käytetyn, yIi- ja aliekspressoituneiden geenien etsimiseen tarkoitetun työkalun antamia tuloksia. Vertaamme myös RNA-sekvensoinnin tuloksia mikrosirukokeeseen, jossa on mitattu ihmisen Th17-soluja. Vaikka Th-solujen erilaistumista on tutkittu paljon, suurin osa tutkimuksista on tehty käyttäen hiirisoluja. Keskeinen tavoite tässä tutkimuksessa oli löytää geenejä, jotka ovat säädeltynä Th17-erilaistumisessa sekä ihmisessä että hiiressä. Olemme kehittäneet gaussisten prosessien regressioon perustuvan menetelmän vertaillaksemme geeniekspression dynamiikkaa tarkemmin hiiressä ja ihmisessä. Löysimme tuhansia geenejä, joita säädellään Th17-erilaistumisessa. Lisäksi identifioimme ne geenit, jotka ovat yhteisiä ihmisen ja hiiren välillä. Tämä analyysi antaa hyvän pohjan kokeellisille jatkotutkimuksille ja tarjoaa uusia, suoraan testattavia biologisia hypoteeseja. Tulokset on esitetty pääasiassa rikastuneina geeniryhminä ja tarkemmat tulokset on säästetty myöhempää julkaisua varten

Myymälän ilmeen visuaalinen uudistus : Case: Alko Oy, Kotka Sutela

Tämän opinnäytetyön tarkoituksena oli tarkastella Alkon myymälän ilmeen uudistamista. Työssä suunniteltiin tuoteryhmien sekä tuotteiden paikat tilanhallintaa hyväksikäyttämällä sekä toteutettiin uudistus ja mitattiin siinä onnistumista asiakaspalautteen sekä henkilökunnalta saadun palautteen avulla. Henkilökunta antoi palautetta varsinkin myymälän viihtyvyyden parantumisesta. Työn toimeksiantajana toimi Alkon Kotkan Sutelan myymälä, jossa toteutettiin ilmeen uudistus marraskuussa 2009. Työ toteutettiin suunnittelemalla tilanhallinta Space Maker 2003 -ohjelmalla uuteen myymälään, toteuttamalla uudistus sekä raportoimalla siitä. Työ on toiminnallinen tutkimus, jonka onnistumisen mittaamisessa käytettiin apuna haastatteluita, joissa käytettiin tukilomaketta. Opinnäytetyöstä kerätään hyödyllistä tietoa seuraavien ilmeen uudistusten avuksi ja niiden helpottamiseksi. Toimeksiantaja halusi saada suoraa palautetta uudistuksesta sekä sen vaikutuksista henkilökunnalta sekä asiakkailta, jotta tiedetään, onko investoinnista ollut hyötyä. Ilmeen uudistuksen suunnittelu ja toteutus olivat onnistuneita sekä asiakkaiden että henkilökunnan mielestä. Myymälästä saatiin toimiva sekä visualisesti näyttävä.The objective of this thesis was to plan, execute and report the reconstruction of a store’s visual appearance in Alko, Kotka Sutela. A plan was made for places of each product family in the new store with architectural layout, and a place for every individual product was set before executing the plan. This visual reconstruction was executed in Alko Kotka Sutela in November 2009. The focus of this reconstruction was to better the work satisfaction in the store, because the sales number won’t change much due to monopoly status that Alko has in Finland. Personnel were interviewed about work satisfaction and planning and executing of the reconstruction. Also feedback was collected from customers to see if the reconstruction made their shopping experience more pleasurable than before. From the feedback, a few points were collected for consideration in the next reconstructions. The feedback was positive, and personnel found it useful and necessary

Käsikirja Uudenkoiviston vastaanottokodille: Mitä, Missä, Milloin ja ennen kaikkee Millai?

Käsikirja koottiin käyttämällä työyhteisön valmista perehdyttämiskansiota pohjana. Vanha perehdyttämiskansio tarjosi raamit käsikirjan kirjoittamiselle. Uuden lastensuojelulain muutokset astuivat voimaan vuodenvaihteessa 2020, mikä aiheutti muutoksia työntekoon ja -toteutukseen lastensuojelulaitoksissa. Käsikirjaan koottiin kattavasti työssä tarvittava tieto, sekä useita työssä käytettäviä työmenetelmiä. Käsikirja toimii niin uuden työntekijän perehdyttämisoppaana, kuin kokeneen työntekijän tarkistuslistana. Käsikirjan tavoite on selkiyttää Uudenkoiviston vastaanottokodin ohjaajan työnkuvaa ja tuoda paremmin esiin vastaanottokodissa käytettäviä käytänteitä, sekä muuttunutta lastensuojelulakia. Käsikirja pitää sisällään ennen kirjoittamatonta materiaalia toimintatavoista, sekä selkeät ohjeet muun muassa rajoitustoimenpiteiden käyttöön ja tekoon kirjausohjelma sosiaaliEfficassa. Työntekijä löytää käsikirjasta helposti ja nopeasti tarvittavan tiedon. Käsikirjan lähtökohtana oli käytettävyys, tiedonhaku, sekä päivitettävyys. Käsikirja toteutettiin niin kansiona, kuin sähköisessä muodossakin