Functional characterization of complexes regulating chloride and mucus transport and their significance in disease

Mucus hyperproduction is a feature of several pulmonary diseases, such as cystic fibrosis (CF). CF is caused by mutations in the Cl-/HCO3- channel CFTR, which result in airway mucus obstruction, bacterial infections, chronic inflammation, and epithelial remodelling. A possible therapy is the activation of alternative Cl- channels, such as TMEM16A, that can compensate for the absence of functional CFTR. However, some studies describe a role of Cl- channels in mucus hyperproduction, inflammation and differentiation, although the mechanisms behind these processes are still unclear. Thus, the aim of this work was to understand the importance of Cl- channels for mucus production, epithelial differentiation and airway inflammation. In the first chapter, we showed that, although essential for airway hydration, TMEM16A is not required for mucus production. Particularly, our results show that TMEM16A is upregulated by interleukin-4 (IL-4) due to an increase in cell proliferation that is independent of mucus hyperproduction. Hence, we conclude that TMEM16A is a promising drug target for CF. In the second chapter, we generated a novel CF airway basal cell line and observed that dysfunctional CFTR is sufficient to impair epithelial differentiation, even in the absence of bacterial infection or inflammation. This cell line is the first in vitro model allowing the study of the CFTR-dependent differentiation, thus contributing to the understanding of CF pathogenesis. In the third chapter, we studied the interaction between inflammatory mediators and the airway epithelium. Our results describe differential responses according to the inflammatory stimuli in terms of mucus production, expression of Cl- channels and epithelial differentiation. These findings may help to design novel cytokine-specific therapies to solubilise mucus secretions for the treatment of pulmonary diseases. Altogether, these results contribute to the understanding of how mucus hyperproduction, ion transport and epithelial differentiation are regulated, particularly upon airway inflammatio

Desenvolvimento de metodologias de biologia molecular para a deteção de Cynara scolymus e Silybum marianum em suplementos alimentares à base de plantas

Dissertação de mestrado em Segurança Alimentar, apresentada à Faculdade de Farmácia da Universidade de CoimbraAs plantas Cynara scolymus L. (Alcachofra) e a Silybum marianum (L.) Gaertn (Cardo mariano) têm sido frequentemente incluídas em suplementos alimentares devido às suas propriedades benéficas para a saúde. De acordo com a Diretiva 2002/46/CE, os suplementos alimentares são considerados alimentos, não sendo por isso sujeitos a qualquer avaliação de segurança, qualidade ou eficácia antes da sua comercialização. Esta limitação no seu controlo pode facilitar potenciais adulterações, como a troca intencional ou acidental de material vegetal. Deste modo, metodologias analíticas específicas, tais como as baseadas na análise de ADN constituem ferramentas fundamentais para a avaliação da autenticidade destes produtos. Assim, o objetivo deste trabalho consistiu na deteção de alcachofra e cardo mariano em suplementos alimentares para a perda de peso, usando as técnicas de PCR qualitativa e PCR em tempo real com análise por high resolution melting (HRM). Para tal, foram utilizadas sementes destas plantas, catalogadas por bancos de germoplasma (nacional e internacionais), e de espécies filogeneticamente próximas a estas, totalizando 43 espécies de plantas medicinais, e 17 suplementos alimentares contendo alcachofra e/ou cardo mariano. Os extratos de ADN de todas as amostras de plantas e suplementos alimentares foram amplificados por PCR qualitativa, tendo como alvo regiões nucleares (18S rRNA) e dois genes cloroplastidiais (rbcL e matK). Os primers EG-F/EG-R desenhados na região nuclear foram os que apresentaram maior universalidade e capacidade de amplificação do ADN das amostras de suplementos. A especificidade dos primers com alvo numa região genómica da C. scolymus foi testada por PCR qualitativa, verificando-se que estes permitiam a amplificação de diferentes espécies do género Cynara. A aplicação do método possibilitou a deteção de Cynara spp. em algumas das amostras de suplementos alimentares. O desenvolvimento de um sistema de PCR em tempo real com análise HRM permitiu discriminar a C. scolymus das restantes espécies, com um nível de confiança acima de 99,4% e, ainda, confirmar a presença inequívoca de C. scolymus nos suplementos testados (nível de confiança >98,8%). Para a deteção de S. marianum, conseguiu-se desenvolver um método de PCR qualitativa específico para a espécie, mas a sua aplicação não permitiu detetar a presença de cardo mariano nos suplementos alimentares analisadosCynara scolymus L. (artichoke) and Silybum marianum (L.) Gaertn (Marian thistle) are frequently included in plant food supplements (PFS), owing to their beneficial health properties. According to Directive 2002/46 / EC, food supplements are defined as foods, so they are not subject to any quality, efficacy or safety assessments prior to their commercialisation. Thus, these products are often subjected to fraudulent practices, such as the intentional or accidental exchange of plant material. To assess their authenticity, the development of reliable and specific analytical methods is of utmost importance. With this work, it was intended the development of DNA-based methods, namely qualitative polymerase chain reaction (PCR) and real-time PCR coupled with high resolution melting analysis (HRM) for the detection of C. scolymus and S. marianum in food supplements for weight loss. For this purpose, seeds from these plants and other genetically related species provided by banks cataloged germplasm (national and international), totalising 43 medicinal plants, and 17 plant food supplements, containing artichoke and/or thistle, were used in this study. DNA extracts from all samples of plants and food supplements were amplified by PCR qualitative, targeting the nuclear regions (18S rRNA) and two plastidial genes (rbcL and matK). The EG-F/EG-R primers that were designed a conserved nuclear region showed the greatest universality, enabling positive amplification of PFS. The specificity of the primers targeting the genomic region of C. scolymus was assayed by qualitative PCR, allowing the amplification of different species from Cynara genus. The application of the proposed qualitative PCR enabled the detection of Cynara spp. in some samples of PFS. The development of a real time PCR system coupled with HRM analysis allowed to discriminate C. scolymus from other species with a high level of confidence (99.4%). Using the proposed system, it was also possible to identify the presence of C. scolymus in the tested PFS (level of confidence >98.8%). For the detection of S. marianum, it was developed a species-specific qualitative PCR method, but its application did not allow detecting the presence of thistle in the PFS under study

Bank of Cyprus´ bad debt: too big to manage?

“Back from the dead” is how international media today describes the Bank of Cyprus after its resolution. Although market perception and financial results are improving considerably, there is still a “nightmare haunting” BoC’s credibility and performance: the big scale of Non- Performing Loans. The case narrative describes all the important facts during and after the turbulent crisis period as well as the actions of BoC’s CEO to overcome the bad debt problem and the hypothesis of the creation of a “bad bank”. The teaching notes analyze the impact of NPLs’ problem and the options presented at the end of the case

Avaliação da aliança terapêutica na terapia familiar:a perspetiva observacional e de autorrelato

Dissertação de mestrado em Psicologia Clínica e Saúde (Psicoterapia Sistémica e Familiar), apresentada à Faculdade de Psicologia e de Ciências da Educação da Universidade de CoimbraA aliança terapêutica é considerada uma importante variável do processo terapêutico, dado que é um bom preditor dos resultados da terapia, independentemente das modalidades psicoterapêuticas utilizadas (Horvath & Bedi, 2002). A perceção dos clientes é aquela que mais se relaciona com os resultados obtidos (Horvath & Bedi, 2002). A presente investigação tem assim como principal objetivo compreender de que forma a perspetiva dos clientes acerca da aliança se correlaciona com os comportamentos observados. Para realização da investigação recorreu-se ao System for Observing Family Therapy Alliances (SOFTA, Friedlander, Escudero, & Heatherington, 2006), versão autorresposta e versão observacional, tendo por base a análise da 1ª sessão de terapia. A amostra é constituída por 35 sujeitos pertencentes a 14 casos arquivados de terapia familiar e de casal. Os resultados obtidos indicam que das quatro dimensões da aliança terapêutica, apenas a Conexão Emocional e o Sentimento de Partilha de Objetivos na família apresentam correlações significativas nas duas versões do SOFTA. Estes resultados são um contributo para a área da aliança nas terapias conjuntas, uma vez que permitiram conhecer a associação entre a perspetiva interna dos clientes e os comportamentos observados.The therapeutic alliance is an important variable of the therapeutic process, as it is a good predictor of therapy's results, independently of psychotherapeutic modalities used (Horvath & Bedi, 2002). The client’s perception is the one that most closely relates to the results obtained, so this research aims to understand how their perspective of their alliance with the observed behavior. The research was carried out using the System for Observing Family Therapy Alliances (SOFTA- Friedlander, Escudero & Heatherington, 2006), self-report version and observational version, based on the analysis of the first therapy session. The sample consisted of 35 subjects, belonging to 14 cold cases of family and couples therapy. The results indicate that, considering the four dimensions of the therapeutic alliance, only Emotional Connection and Shared Sense of Purpose within the client's family showed significant correlations. These results are a contribution to the area of conjoint therapies once enabled to know the association between the internal perspective of the clients and their behavior observed

Clinical drug development in Parkinson’s disease : descriptive and exploratory analysis of success and failure pathways

Tese de mestrado, Neurociências, Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina, 2021INTRODUÇÃO: A marca patológica da Doença de Parkinson (DP) é a perda de neurónios dopaminérgicos, predominantemente nos gânglios de base, e a agregação de proteínas dos corpos de Lewys (LBs) nas células nervosas restantes. O início do desenvolvimento clínico de fármacos na DP começou com uma formulação oral de levodopa em 1967. Desde então, os ensaios clínicos foram essenciais para entender quão seguros são os tratamentos e para trazer novos compostos ao mercado com efeito terapêutico comprovado. Biofarmacêuticas em todo o mundo desenvolvem tratamentos inovadores para cobrir necessidades médicas ainda não exploradas. Contudo, e embora os numerosos avanços no desenvolvimento de fármacos nos últimos 20 anos, ensaios clínicos ainda não produziram um número significativo de medicamentos novos e seguros na DP. Efetivamente, menos de 10% dos medicamentos testados foram aprovados pelas agências reguladoras. É então importante identificar fatores que contribuam para uma trajetória de licenciamento de sucesso. Nas últimas décadas tem sido feito um esforço rigoroso em várias áreas como a genética, bioquímica, epigenética, ómica, clínica e imagem para definir marcadores fiáveis para melhorar a qualidade dos ensaios clínicos. Será que marcadores farmacológicos podem melhorar as abordagens para restaurar a dopamina no núcleo estriado de forma direcionada ou para prevenir a neurodegeneração e progressão da DP? OBJETIVOS: O principal objetivo desta tese é a descrição dos programas de desenvolvimento terapêutico na DP e a avaliação crítica das causas de atrito dos compostos nas fases distintas do desenvolvimento do fármaco, i.e., desde a fase 1 até à fase 4 dos estudos da DP. Quais as razões para o insucesso no desenvolvimento de fármacos na DP ser elevado? Quais as razões do decréscimo do número de compostos licenciados nas últimas duas décadas? O insucesso no desenvolvimento de drogas é observado em todas as fases de desenvolvimento, incluindo nas fases tardias? Estará o insucesso relacionado com ensaios iniciais não informativos? Para responder a estas questões, o propósito desta tese centra-se em identificar as razões de sucesso no desenvolvimento de fármacos na DP. MÉTODOS: Esta tese investigou 1304 ensaios clínicos na DP. A metodologia compreendeu uma revisão de literatura, o desenho de parâmetros de seleção de ensaios, uma extração de dados, uma análise de dados, a criação do PDCard Database e a análise estatística. Para esse efeito, foram utilizadas informações de ensaios clínicos relativos à doença de Parkinson que estavam registadas em 3 plataformas: clinicaltrials.gov, World Health Organization (WHO) International Clinical Trials Search Portal (ICTRP) e Australian New Zealand Clinical Trials Registry (ANZCTR). Uma base de dados incorporada, chamada PDCard Database, foi obtida usando os critérios de extração e análise de dados, totalizando uma soma de 613 estudos de intervenção em G20 – Doença de Parkinson. Em seguida, foi realizada uma análise exploratória das vias de sucesso e insucesso, e foram calculadas as respetivas taxas para cada fase experimental. RESULTADOS: Os programas de desenvolvimento de medicamentos para a DP entre o ano 2000 e agosto de 2019 foram analisados e os dados publicados no banco de dados PDCard. Ao analisar o banco de dados, verifica-se que há uma alta frequência de insucesso no desenvolvimento de fármacos, bem como uma diminuição no número de compostos licenciados para DP nas últimas duas décadas. Para estudar essa tendência, as vias de sucesso e insucesso dos 613 ensaios clínicos e dos 187 compostos testados, totalizando 77496 participantes, são exploradas. As 50 variáveis foram (i) categorizadas, (ii) sistematizadas e (iii) organizadas, com base nas diretrizes do SPIRIT. Cada uma das variáveis foi adicionada manualmente e extraída da publicação original do ensaio clínico ou dos bancos de dados clinictrials.gov, WHO ICTRP e ANZCTR. Objetivamente, o banco de dados inclui 115 ensaios clínicos na fase 1, 23 ensaios clínicos na fase 1|2, 194 ensaios clínicos na fase 2, 19 ensaios clínicos na fase 2|3, 172 ensaios clínicos na fase 3 e 90 ensaios clínicos na fase 4. 42,90% eram estudos multicêntricos, enquanto apenas 13,38% são monocentrados. 74,55% dos estudos foram randomizados e 9,79% são estudos não randomizados. 67,86% são estudos concluídos, 11,91% são estudos em fase de recrutamento, 9,62% são estudos que não estão a recrutar, 8,16% são estudos terminados e 2,45% são estudos desqualificados. São apresentadas falhas no desenvolvimento de fármacos em todas as fases do programa de desenvolvimento, incluindo estágios tardios. Efetivamente, de todas as causas para terminar um ensaio clínico, na fase 1, o mais importante foi o primeiro milestone não ser atingido. Na fase 2, a falta de eficiência foi a principal causa. Na fase 2|3, o principal motivo foi que era improvável fornecer evidências de efeito significativo. Na Fase 3, a falta de eficácia foi o principal motivo para o término do estudo. Portanto, as falhas estão principalmente relacionadas aos estudos de fases precoces serem pouco informativos. A maioria dos estudos (79,93%) recrutou indivíduos adultos ou idosos. Apenas 10,77% dos estudos incluíram indivíduos saudáveis. A maioria das condições estudadas nos ensaios clínicos são doenças do sistema nervoso (IV), relacionadas com a condição DP, totalizando 265 estudos. Os outros 264 ensaios clínicos estudaram a eficácia e a segurança do próprio medicamento, sem especificar uma condição relacionada com a DP. A maioria dos ensaios é projetado para fins de tratamento. A eficácia é o primary gold predominante em todas as fases do desenvolvimento na população estudada. Como o principal objetivo desta tese foi identificar as razões para o sucesso ou insucesso no programa de desenvolvimento do fármaco, dois tipos de caminhos foram comparados: a taxa de sucesso vs. a taxa de insucesso. A taxa de sucesso é mais alta na vigilância e monitorização pós-mercado, i.e. em compostos licenciados em fase 4, e é mínima na transição do active pharmaceutical ingredient (API) da fase 2 e 1|2 para a fase 3, i.e. antes das provas regulatórias. Assim sendo, 613 ensaios clínicos em DP realizados de 1998 a 2019 e 187 compostos foram amplamente estudados. Destes 187 compostos, apenas 29 passaram os ensaios de confirmação e foram finalmente considerados caminhos de sucesso, que permitiram o licenciamento do fármaco. Boehringer Ingelheim, Sandoz e GlaxoSmithKline foram as grandes empresas farmacêuticas que conduziram mais estudos completando a totalidade do programa de desenvolvimento do fármaco, incluindo a vigilância e monitorização pós-mercado de moléculas em fase 4. De todos os 29 compostos testados, 12 foram considerados novas entidades moleculares. As novas entidades moleculares mais estudadas foram a rasagilina (30,77%), seguida pela rotigotina, ropinirol e pramipexol. De todos os 29 compostos aprovados, 75,44% foram testados numa amostra de indivíduos em todas as fases da DP. Os ensaios clínicos de quadrupla ocultação (47,22%) são os que produziram mais compostos licenciados por ensaios confirmatórios, seguidos pelos de ocultação dupla (38,89%). Os estudos paralelos (59,65%) foram o tipo de desenho que produziu mais compostos aprovados, seguidos pelos estudos de grupo único (26,32%) e pelos estudos cruzados (12,28%). Os estudos (76,79%) que utilizaram a via oral como via preferencial de administração e comprimidos como formulação preferida foram os que tiveram mais sucesso nas fases confirmatórias do programa de desenvolvimento do fármaco. Os moduladores dos recetores de dopamina, assim como as formulações puras de levodopa e as combinações de levodopa, representam 52,63% das vias de sucesso nos últimos 20 anos. Seguidamente, os moduladores da monoamina oxidase (19,30%), como a selegilina e a rasagilina, foram os compostos testados com mais sucesso. Em terceiro lugar, os moduladores de recetores adrenérgicos (5,26%), como a droxidopa e o mirabegron, e os moduladores da catecol o-metiltransferase (5,26%), como o entacapone e o opicapone, foram os compostos aprovados pelas autoridades reguladoras com mais sucesso. Dos 29 compostos licenciados e comercializados que passaram nos ensaios confirmatórios, 26,32% dos estudos que foram realizados foram para medicamentos não parkinsonianos, enquanto 73,68% dos estudos que foram realizados foram para agentes antiparkinsonianos. Nos últimos 20 anos, e resumindo as vias de sucesso no programa de desenvolvimento, 15 agentes antiparkinsonianos passaram primariamente na fase 3 e, portanto, completaram as provas regulatórias. Após o processo e aprovação do New Drug Application, apenas 14 APIs foram registados para a DP e, subsequentemente, concluíram com êxito os estudos de vigilância e monitorização pós mercado. Os agentes antiparkinsonianos bem-sucedidos são a amantadina, a apomorfina, a carbidopa/levodopa, a levodopa, a levodopa/carbidopa/entacapona, a entacapona, a opicapona, o pramipexol, a rasagilina, a rivastigmina, o ropinirol, a rotigotina, a safinamida e a selegilina. Esses 14 agentes antiparkinsonianos diferentes foram comercializados por 16 promotores diferentes e em 20 formulações distintas. A Novartis foi a farmacêutica que licenciou mais compostos. Contrastando com os caminhos de sucesso, os caminhos de insucesso que forçaram a suspensão do ensaio antes da fase final do programa de desenvolvimento também são descritos. Nos últimos 20 anos, os motivos foram principalmente devido à falta de eficácia, segurança e financiamento. Trinta e cinco compostos falharam na fase 3 e seis compostos falharam na fase 4. A maioria dos estudos que falharam a completa aprovação após os estudos de vigilância e monitorização pós-mercado (34%), não publicam os motivos da interrupção ou retirada do ensaio clínico. CONCLUSÃO: A tese revisou o estado de arte do desenvolvimento clínico de fármacos na doença de Parkinson entre 1998 e 2019. A problemática de explorar as causas do sucesso e insucesso é um tópico de tendência na neurociência. Fundamentalmente, o trabalho desta dissertação respondeu aos objetivos inicialmente definidos. Espera-se, então, que este trabalho leve a novas e interessantes questões, que possam justificar uma análise multivariada das 50 variáveis obtidas. O panorama dos programas de desenvolvimento terapêutico da DP foi investigado e as causas de atrito dos compostos nos distintos estágios do desenvolvimento farmacológico, da fase 1 à fase 4 nos estudos da doença de Parkinson, foram avaliadas criticamente. Com efeito, há uma diminuição do sucesso no desenvolvimento de fármacos e do número de compostos licenciados nos últimos 20 anos. Além disso, falhas no desenvolvimento de medicamentos são observadas em todas as fases do desenvolvimento, incluindo em fases mais tardias, que estão maioritariamente relacionadas a ensaios clínicos não informativos principalmente em estágios iniciais. Duas vias foram comparadas: (i) uma via de sucesso, completando as provas regulatórias e ensaios confirmatórios, com uma taxa de sucesso de 16%, que permitiu o licenciamento e a vigilância e monitorização pós-mercado de 29 medicamentos; e (ii) uma via de insucesso com uma taxa de insucesso de 84%, que levou à suspensão de 158 compostos antes da fase final do programa de desenvolvimento. Finalmente, dos 613 ensaios clínicos em DP realizados entre 1998 e agosto de 2019 e dos 187 compostos, apenas 14 APIs foram finalmente aprovados e comercializados como agentes antiparkinsonianos. A taxa de sucesso específica para agentes antiparkinsonianos é igual a 7% e a taxa de insucesso específica de agentes antiparkinsonianos é igual a 93%.INTRODUCTION: The pathological hallmark of Parkinson’s Disease (PD) is the loss of dopaminergic neurons, most prominently in certain parts of the basal ganglia, and the aggregation of Lewy bodies proteins in remaining nerve cells. The beginning of clinical drug development in PD started with an orally formulation of levodopa in 1967. Since then, clinical trials were essential to understand how safe the treatments are and to bring new compounds to the market with a proven therapeutic effect. Biopharmaceutical companies around the world attempted to develop innovative therapies to achieve unmet medical necessities. Although the numerous advances on drug development in PD, a significant number of clinical trials still fail to produce new and safe medicines. Indeed, less than 10% of the drugs have been approved by regulatory agencies. It is then important to identify factors that contribute to a successful licensing path in regard to PD. Rigorous efforts have been made in the last decades in various areas such as genetic, biochemistry, epigenetic, omics, clinic and imaging to define reliable markers to improve the quality of clinical trials. Can drug related markers improve the pharmacologic approaches for restoring striatal dopamine in a targeted and physiological manner or to prevent ongoing neurodegeneration and progression of disease? OBJECTIVES: The principal aim of this thesis is the description of the landscape of PD therapeutic development programs and critically appraise the causes of compound attrition in the distinct stages of drug development, from phase 1 to phase 4 in Parkinson Disease’s studies. Why is it elevated the frequency of drug development failures? Why have it been a decrease in the number of approved compounds in the last two decades? Are failures in drug development observed in all phases of drug development including late stages? Are failures related with non-informative early stage trials? To answer these questions, the outcome of this thesis is centered in identifying the reasons for development drug success. METHODS: This thesis researched 1304 PD clinical trials. The methodology comprehended a literature research, the design of trial selection parameters, the data extraction, the data analysis, the creation of the PDCard Database and the statistical analysis. For that matter, this study used information from clinical trials relating to Parkinson's disease that were recorded on the 3 platforms: clinicaltrials.gov, World Health Organization (WHO) International Clinical Trials Search Portal (ICTRP) and Australian New Zealand Clinical Trials Registry (ANZCTR). An embedded type database, named PDCard Database, was finally obtained using criteria the data extraction and analysis, totaling a sum of 613 interventional studies of G20 – Parkinson’s disease. Then an exploratory analysis of success and failure paths was conducted, and success and failure rates for each trial phase were calculated. RESULTS: PD drug development registry between 2000 and August 2019 was analyzed, and data published in the PDCard Database. By analyzing the database, it is shown that there is a high frequency of drug development failures and there is a decrease in the number of licensed compounds in the last two decades. For that matter, success and failure paths of the 613 clinical trials and 187 tested compounds, in 77496 total participants, are explored. Fifty variables were (i) categorized (ii) systemized and (iii) organized, based on the SPIRIT guidelines. Each of the variables was added manually and extracted from the original publication of the clinical trial or the clinicaltrials.gov, WHO ICTRP and ANZCTZ. Objectively, the database includes 115 clinical trials in phase 1, 23 clinical trials in phase 1|2, 194 clinical trials in phase 2, 19 clinical trials in phase 2|3, 172 clinical trials in phase 3 and 90 clinical trials in phase 4. 42,90% were multicentered studies, while only 13,38% are monocentered. 74.55% of the studies were randomized and 9,79% are non-randomized studies. 67,86% are completed studies, 11,91% are studies in recruiting phase, 9,62% are studies that are not recruiting, 8,16% are terminated studies and 2,45% are withdrawn studies. It is presented that failures in drug development are observed in all phases of drug development including late stages. Effectively, from all the terminated study causes of all studies, in Phase 1 the most important was first milestone was not met. In Phase 2, lack of efficiency was the primary cause. In Phase 2|3, the main reason was that it was unlikely to provide evidence of significant effect. In Phase 3, lack of efficacy was the main reason for terminating the study. Therefore, failures are mostly related with non informative early stage trials. The majority of the studies (79,93%) have recruited adult or older adult subjects. Only 10.77% of clinical trials studies included healthy subjects. Most of the diseases studied in clinical trials are diseases of the nervous system (IV), totaling 265 studies. Otherwise, 264 of the clinical trials were studying the efficacy and safety of the drug itself, without specifying PD as a condition to the study. The majority of the trials are designed for treatment purpose. Efficacy is the predominating gold at all phases of development in the study population. As the main outcome of this thesis was identifying the reasons for development drug success or failure, two types of paths were compared: the success rate vs the failure rate. The success rate is higher in PostMarketing Surveillance (PMS), i.e. in phase 4 licensed compounds, and is minimum in the transition of the API from phases 2 and 1|2 to phase 3, i.e. before regulatory proofing. Henceforth, 613 clinical trials in PD conducted from 1998 to 2019, and 187 compounds were vastly studied. From these 187 compounds, only 29 passed confirmatory trials and were finally considered successful paths, that allowed drug licensing. Boehringer Ingelheim, Sandoz and GlaxoSmithKline were the big pharma that conducted more studies completing the full drug development program, including postmarketing surveillance of molecules in phase 4. From all the 29 compounds that were tested, 12 were considered new molecular entities. The new molecular entities that were more studied were rasagiline (30,77%), followed by rotigotine, ropinirole and pramipexole. From all the successful 29 approved compounds, 75,44% were tested in a sample of subjects with all stages of PD. Clinical trials that used quadruple blinding (47,22%) are the ones that produced more licensed compounds that passed confirmatory trials, followed by double blinding (38,89%). The parallel assignment (59,65%) was the type of design that produced more approved compounds, followed by single group assignment (26,32%) and crossover assignment (12,28%). The studies (76,79%) that used oral as a preferred route of administration, and tablets as a preferred drug formulation are the ones that approved more compounds passing confirmatory trials. Dopamine receptor modulators, like pure levodopa and levodopa combinations, represent 52,63% of the success path in the last 20 years. In second, monoamine oxidase modulators (19,30%), like selegiline and rasagiline, were tested in PD drug development. Thirdly, adrenergic receptor modulators (5,26%), like droxidopa and mirabegron, and catechol o-methyltransferase modulators (5,26%), like entacapone and opicapone, were approved compounds that passed confirmatory trials by the regulatory authorities. From the 29 licensed compounds that passed confirmatory trials, 26,32% of the studies conducted were for non-parkinsonians drugs, while 73,68% of the studies conducted were for antiparkinsonian agents. In the past 20 years, and reviewing the successful path, 15 antiparkinsonian agents primarily passed phase 3 and thus showed regulatory proof. After NDA process and approval, only 14 APIs were registered for PD and, subsequently, completed successfully the postmarketing surveillance studies. The successful antiparkinsonian agents are amantadine, apomorphine, carbidopa/levodopa, levodopa, levodopa/carbidopa/entacapone, entacapone, opicapone, pramipexole, rasagiline, rivastigmine, ropinirole, rotigotine, safinamide and selegiline. Those 14 different antiparkinsonian agents were marketed by 16 different sponsors, in 20 different formulations. Novartis was the big pharma licensing more compounds. Contrasting the success paths, the failure paths that forced the suspension of trial before the final phase of the development program are also described. In the last 20 years, the reasons were mainly due to efficacy, safety and financing. Thirty-five compounds failed to succeed phase 3, and six compounds failed to succeed phase 4. The majority of studies that failed to be approved (34%) do not publish the reasons for terminating or withdrawing the clinical trial. CONCLUSION: The thesis reviewed the state of the art of clinical drug development in Parkinson’s Disease from 1998 to 2019. The problematic of exploring the causes for success/unsuccess is a trending topic in neuroscience. Fundamentally, the work of this dissertation responded to the initially defined objectives. It is then expected that this work will lead to new and interesting questions, which might justify a future multivariate analysis of the 50 obtained variables. The landscape of PD therapeutic development programs was probed and the causes of compound attrition in the distinct stages of drug development, from phase 1 to phase 4 in Parkinson Disease’s studies were critically appraised. Indeed, there is a decrease on the success of drug development and in the number of approved compounds that passed confirmatory trials in the last 20 years. Moreover, failures in drug development are observed in all phases of development including late stages, but are mostly related with non-informative early stage trials. Two paths were compared: (i) a successful pathway, passing regulatory proof and confirmatory trials, with a success rate of 16%, that

Application of extreme value theory to seismology

Tese de mestrado, Estatística e Investigação Operacional (Estatística), 2023, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasThe occurrence of earthquakes is an issue with an extreme importance for the society due to the effects that they can cause. There are specific areas in the world with great seismic activity, like the Pacific fire Ring, that includes North and South America the Kamchatka Peninsula and some islands in the western Pacific ocean. The main goal of this study is to model high magnitude earthquakes. For this purpose the data from the ISG-GEM Catalogue was chosen to study the moment magnitude, . Only severe earthquakes were considered ( > 6). From the available types of magnitude, was the one selected to study due to the fact that for very large earthquakes it gives the most reliable estimate of earthquake size and it provides an estimate of the earthquake size valid over the complete range of magnitudes. Similar studies were developed in a worldwide perspective (Pisarenko et al., 2014) and in specific regions, such as China (Ma, Bai, and Meng, 2021) and the Ecuadorian coast (García-Bustos et al., 2018). In a first approach a worldwide study was conducted, followed by a study of a specific region with high seismic activity (Japan). Extreme Value Theory provides the appropriate methods for modeling earthquakes with high magnitudes. In this master thesis, for both data sets, a study of some of the available variables from the ISG-GEM catalogue, being the moment magnitude the main one, was conducted. Earthquakes with high magnitude, for both the worldwide and the Japan data sets, were modelled using the Block Maxima and the Peaks Over Threshold methods. The main purpose was to estimate the tail probabilities and extreme quantiles. For both the worldwide and the Japan data sets, applying the Block Maxima method, the Generalized Extreme Value distribution was adjusted to the data, as well as a Gumbel model. Methods to compare and evaluate the statistical models were performed in order to choose the best one. Extreme quantiles were also calculated. When considering the Peaks Over Threshold method, for both the worldwide and the Japan data sets, the Generalized Pareto Distribution was adjusted to the data, as well as a Exponential model. Goodness-of-fit tests were performed and quality measures of statistical model were calculated in order to choose the best model. Extreme quantiles were also calculated

Cursos EFA: alternativas curriculares no distrito de Lisboa: percursos de investigação

Colóquio realizado em Cabo Verde, Praia, de 6-7 de julho de 2017A presente investigação tem como objetivos: a) Analisar criticamente o panorama nacional e internacional ao nível das políticas de educação e formação de adultos; b) Caracterizar perspetivas de professores face aos conteúdos dos cursos EFA de nível secundário, e as suas práticas de gestão curricular dos mesmos; c) Descrever o perfil de formação inicial e contínua dos professores dos cursos EFA de nível secundário, bem como as perspetivas desses professores sobre as suas necessidades de formação, e D) Compreender as práticas docentes levadas a cabo pelos professores dos cursos EFA de nível secundário e a sua relação com os resultados dos formandos; contextualizando-se no Distrito de Lisboa. Propomo-nos apresentar o projeto de investigação em curso, com destaque para o design metodológico e o processo e resultado da elaboração e validação de instrumentos de recolha de dados, concretamente, entrevistas semiestruturadas a diversos atores, e inquérito por questionário a professores de cursoThe research we present aims to: a) Analyze critically the national and international panorama in the policies of adult education and training; b) Characterize teachers’ perspectives regarding the contents of secondary level Adult Education and Training (EFA) courses, and their curricular management practices; c) Describe the initial and continuing teacher training profile of the secondary level EFA courses’ teachers, as well as the teachers perspective on their training needs; and d) Understand the teaching practices carried out by the EFA courses teachers and their relation with the results of the trainees; in the context of the District of Lisbon (Portugal). We propose to present the ongoing research project, highlighting the methodological design and the process and result of the elaboration and validation of data collection instruments, namely: semistructured interviews with several actors and questionnaire survey to teachers of secondary level scholar EFA courses.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Executive compensation: does firm performance impact executive salaries? the cases of Uk, Portugal, Spain and Sweden and Denmark

The dissertation researches the impact that key performance measures, notably, ROA and ROE, Turnover, Net Dividend Yield, have on executives’ compensation, focusing on three specific regions, the United Kingdom, Sweden and Denmark, and Portugal and Spain. The method used was to apply an econometric regression model –OLS–, with selected corrections, due to heteroscedasticity by means of a robust regression. The sample consisted of 98 FTSE100 Companies, 62 OMX Nordic companies, and 40 companies from IBEX and PSI20 combined. The results obtained showed there is little evidence of the relation of firm performance with compensation, but that there is a strong relationship between these variables and company size, which is most significant in the UK. Also, there are marked differences amongst the regions, namely the significance that Net Dividend Yield has in the region of Iberia, and the non-significance of most variables for the Nordic regio

Can we profit from natural disasters? : the role of catastrophe bonds

We study the profitability of catastrophe bonds from January 2001 to June 2014. Our empirical analysis finds positive returns on catastrophe bonds and shows that they increase right after the Atlantic hurricane season and suffer a major downturn with the occurrence of significant catastrophes. Additionally, seasonality is found, especially during the month of September. When compared with stock and government bond benchmarks, returns on catastrophe bonds show considerably better results. However, when compared to the high yield bond benchmark, they present a similar performance. Finally, when tested for different predetermined variables, both traditional stock and bond market variables as well as liquidity risk do not explain catastrophe bond performance

Web 2.0 shaping the future of retail : the rise of social commerce through instagram in the portuguese market

Supersonic change is the most accurate expression to describe the current Digital context: throughout the past years, through the constant innovation, the Digital has gained a massive relevance in our lives being present in every phase of our day fulfilling informational, social or functional needs. Bringing together Digital and Business is not only the recognition of an incredibly powerful channel, but also an unavoidable step. Within this reflection, Social Media Networks arise as the new platforms to explore business opportunities for e-commerce practices, creating a new way of buying for customers. Instagram, is currently emerging as the most relevant player within the social commerce scene, introducing recently ‘buy buttons’, offering its users shopping experiences while scrolling through feeds. The present paper wishes to conclude which are the underlying motivations that drive the Portuguese consumers to resort to Instagram to purchase FCA, as well as assess which are the discouragements that keep him from doing so, presenting and building on the contextualization of the current market landscape and the consumer behaviour patterns already recognized. The results obtained were supported by an interview and survey research and show that, within different levels of relevance, convenience, peers feedback and consumer-brand relationship work as drivers of the purchase decision, while lack of trust and sensory experience work as obstacles to it.Mudança supersónica é a expressão mais adequada para descrever o atual contexto do Digital: nos últimos anos, mediante constante inovação, o Digital ganhou extrema relevância na nossa vida, estando presente em cada fase do nosso dia, suprindo necessidades de informação, sociais ou funcionais. Conciliar o Digital com os Negócios, consiste não só no reconhecimento de uma oportunidade incrivelmente poderosa, como também de um passo inevitável. Dentro desta corrente de pensamento, as Redes Sociais estão atualmente a emergir como as novas plataformas para explorar oportunidades de negócio para práticas de e-commerce, criando uma nova forma de comprar para o cliente. O Instagram, atualmente emerge como o player mais relevante no cenário de compra através de redes sociais, introduzindo recentemente ‘botões de compra’, oferecendo aos seus utilizadores experiências de compra enquanto deslizam pelo seu feed. A presente investigação pretende concluir quais são as motivações subjacentes que impulsionam os consumidores portugueses a recorrer ao Instagram para a compra de roupas ou acessórios femininos, assim como avaliar quais os elementos desencorajadores que o impedem de o fazer, apresentando e construindo sobre a contextualização do cenário atual de mercado e os padrões de comportamento do consumidor. Os resultados obtidos foram suportados por entrevistas e questionários online e mostraram que, ainda que em diferentes níveis de relevância, a conveniência, feedback dos pares e relação marca-consumidor funcionam como elementos motivadores da decisão de compra, enquanto que a ausência de confiança e de experiência sensorial funcionam como obstáculos