Aplicações de metagenômica viral em medicina veterinária : análise de viromas

As novas abordagens metagenômicas virais permitem a detecção imparcial de uma ampla gama de agentes infecciosos de maneira independente da cultura, facilitando o diagnóstico e, consequentemente, o monitoramento de doenças, o que está intimamente atrelado ao conceito “One World, One Health”. Além disso, abrem possibilidades para análises genéticas comparativas e enriquecimento de bancos de dados genômicos. O gênero Hepacivirus (família Flaviviridae) é um exemplo expressivo de gênero viral que cresceu rapidamente com o advento da metagenômica. Desde 1996, quando o gênero Hepacivirus foi criado, o vírus da hepatite C (HCV) era a única espécie conhecida. No entanto, os hepacivírus (HVs) têm sido detectados em diversos animais domésticos e selvagens, incluindo, equinos, cães, roedores, morcegos, bovinos, tubarões, entre outros. O objetivo geral desta tese foi aprofundar o conhecimento acerca da ecologia viral em diferentes hospedeiros, através da metagenômica na ciência veterinária, destacando diferentes subáreas em que a mesma pode ser empregada. O Capitulo 1 aborda a detecção de um hepacivírus bovino (HNV) através da plataforma de sequenciamento de alto desempenho, Illumina MiSeq. As análises revelaram uma sequência com alta divergência nucleotídica quando comparada aos demais HNVs conhecidos mundialmente. Além disso, baseado na classificação proposta na literatura, trata-se de um provável novo genótipo. Esse estudo, intitulado “Highly Divergent Cattle Hepacivirus N in Southern Brazil” foi publicado em 2019, na revista científica Archives of Virology. O Capítulo 2 trata-se de dois estudos de metagenômica realizados para análise de viroma. O primeiro intitulado "New Polyomavirus in Nutria, Myocastor coypus Polyomavirus 1" no qual obtivemos o sequenciamento de genoma completo de uma nova espécie de PyVs em ratão-do-banhado, pertencente ao gênero Alphapolyomavirus, que foi publicado na revista científica Archives of Virology. No segundo estudo, "Liver Virome of Healthy Pigs Reveals Diverse Small ssDNA Viral Genomes", foi analisado o viroma de figados de suínos de um abatedouro. Nesse estudo detectamos, pela primeira vez no Brasil, a presença de alguns vírus como Porcine Circovirus 1 e Porcine Parvovirus 6 e 7, além da ausência de vírus potencialmente zoonóticos. A pesquisa foi publicada na revista científica Infection, Genetics and Evolution em 2020. Concluindo, a metagenômica viral foi aplicada com sucesso na investigação de três importantes estudos para a ciência veterinária. Os resultados contribuíram com a expansão do conhecimento na área, através da descrição e caracterização de novos e conhecidos vírus, além de enriquecer os bancos de dados genômicos, provendo informação para futuras pesquisas.The viral metagenomic approaches, a culture-independent technique, allow the impartial detection of a wide range of pathogens, improving the diagnosis and, consequently, the monitoring of diseases, which is closely linked to the “One World, One Health” concept. Furthermore, open possibilities for comparative genetic analysis and genomic databases enrichment. Hepacivirus genus (family Flaviviridae) is an expressive example of a viral genus that grew with the advent of metagenomics. Since 1996, when the genus Hepacivirus was created, the hepatitis C virus (HCV) was the only known species. However, hepaciviruses (HVs) have been detected in several domestic and wild animals, including, horses, dogs, rodents, bats, cattle, sharks, among others. The main objective of this thesis was improving the knowledge of different hosts viral ecology through metagenomics in veterinary science, highlighting different sub-areas in which it can be applied. Chapter 1 addresses bovine hepacivirus (HNV) detection through the high-throughput sequencing (HTS), using Illumina MiSeq. The analyzes revealed a sequence with high nucleotide divergence when compared to HNVs worldwide known. In addition, based on the ICTV classification, it is a putative new genotype. This study, entitled “Highly Divergent Cattle Hepacivirus N in Southern Brazil” was published in 2019, in the scientific journal Archives of Virology. Chapter 2 is about two metagenomics studies performed for virome analysis. The first one entitled "New Polyomavirus in Nutria, Myocastor coypus Polyomavirus 1" in which we obtained a new PyVs complete genome species of in nutria, belonging to the genus Alphapolyomavirus, which was published in the scientific journal Archives of Virology. In the second research, "Liver Virome of Healthy Pigs Reveals Diverse Small ssDNA Viral Genomes", the swine liver virome of a slaughterhouse was analyzed. In this study, we detected, for the first time in Brazil, the presence of some viruses such as Porcine Circovirus 1 and Porcine Parvovirus 6 and 7, in addition to the absence of potentially zoonotic viruses. In conclusion, viral metagenomics has been successfully applied in important veterinary science studies. The results contributed to the knowledge expansion in the area, through the description and characterization of new and known viruses, in addition to enriching the genomic databases, providing information for future research

Hepevírus e hepacivírus em animais de produção : uma abordagem molecular e epidemiológica

Os cinco principais vírus da hepatite humana, denominados de A-E, possuem estruturas genômicas e estratégias de replicação distintas, além de pertencerem a cinco famílias virais diferentes. As infecções pelo vírus da hepatite A (HAV) e vírus da hepatite E (HEV) são, geralmente, agudas e transmitidas por rotas oro fecais. Em contraste, as infecções pelo vírus da hepatite B (HBV), vírus da hepatite C (HCV) e vírus da hepatite D (HDV) podem ser transitórias ou crônicas e são transmitidas por via parenteral. Apesar dessas diferenças, todos possuem importantes características em comum, como replicação e infecção primária no fígado. HEV, que pertence à família Hepeviridae, possui distribuição mundial e é responsável por causar uma hepatite aguda em humanos com grave apresentação clínica em pacientes imunodeprimidos e mulheres grávidas. Os genótipos HEV-3 e HEV-4 são considerados zoonóticos, sendo os suínos os principais portadores assintomáticos e responsáveis pela manutenção dessa rota de transmissão. O HCV, pertencente à família Flaviviridae, era a única espécie de hepacivírus (HVs) conhecida desde 1989. Recentemente, HVs foram descritos em diversas espécies animais e, apesar de não haver evidência de transmissão zoonótica, o estudo dessas espécies homólogas auxilia no entendimento da origem do HCV, além de fornecer possíveis modelos experimentais para estudos de patogenicidade e compreensão de sua biologia. Assim, o presente estudo estrutura-se em dois capítulos. O Capítulo 1 aborda a soroprevalência e diversidade genética de HEV em suínos de subsistência do Estado do Rio Grande do Sul (RS) provenientes de dois inquéritos soroepidemiológicos (2012 e 2014). Através de um ELISA in house para detecção de anticorpos IgG anti-HEV, os resultados mostraram uma alta soroprevalência de HEV nos suínos do RS (80,6% em 2012 e 67,4% em 2014). Além disso, a análise filogenética confirmou a circulação de HEV-3 zoonótico (0,8%), com a presença de três subtipos distintos que apresentaram alta identidade nucleotídica com sequências de HEV isoladas de humanos. O Capítulo 2 aborda a presença de HVs em amostras de soro de bovinos provenientes do Nordeste do Brasil resultando numa frequência de 0,6%. O sequenciamento completo de duas amostras foi realizado e, a partir de sua análise e de todas as sequências de hepacivírus bovinos (HNVs) disponíveis no GenBank, propusemos uma classificação a nível de genótipo e subtipo, resultando em um genótipo (Genótipo 1) e quatro subtipos (A-D). Além disso, baseado na região NS3, foi realizada uma análise filogenética por inferência Bayesiana e análise de tempo de divergência por datação molecular, utilizando o critério de relógio molecular relaxado. Essa análise indicou uma origem em comum entre os HNVs que circulam na Alemanha e no Brasil; e um maior tempo de circulação desse vírus no continente Africano. O entendimento sobre vírus em animais é de extrema importância para a saúde animal e pública e, além disso, tem o objetivo de mapear reservatórios de doenças zoonóticas e auxiliar na compreensão da origem e evolução viral.The five major human hepatitis viruses, named A–E, have distinct genomic structures and replication strategies and belong to five different virus families. Hepatitis A virus (HAV) and hepatitis E virus (HEV) infections are transient and transmitted mainly by oral–fecal routes. In contrast, hepatitis B virus (HBV), hepatitis C virus (HCV), and hepatitis delta virus (HDV) infections may be either transient or chronic and are transmitted by parenteral routes. Despite these differences, all viruses share important features, like primary infection and replication in hepatocytes. HEV, which belongs to Hepeviridae family, are worldwide distributed and responsible to acute human hepatitis with severe clinical presentation in immunocompromised patients and pregnant women. HEV-3 and HEV-4 genotypes are zoonotic, and swine are the mainly asymptomatic reservoirs, responsible for this transmission route maintenance. HCV belongs to the Flaviviridae family, and since 1989, was the only recognized HVs specie. Recently, HVs has been detected in several animal species, and besides no zoonotic transmission evidence, this study helps to understand HCV origin. Besides that, it could provide animal models to pathogenesis and biology HCV studies. Therefore, the present study is structured in two chapters. The Chapter 1 addresses HEV seroprevalence and genetic diversity in backyard pigs from two surveillance studies (2012 and 2014) in Rio Grande do Sul State (RS). Through an in-house ELISA for anti-HEV IgG antibodies detection, the results showed a high HEV seroprevalence in pigs in RS (80.6% em 2012 e 67.4% em 2014). Also, phylogenetic analysis confirmed zoonotic HEV-3 presence and three different subtypes with high nucleotide identity with human HEV sequences. Chapter 2 addresses the presence of HVs in bovine serum samples from Northeastern Brazil resulting in 0.6% frequency. Complete sequencing of two samples was performed, and from its analysis with all bovine hepacivirus (HNVs) sequences available on GenBank, we proposed a genotype and subtype classification, resulting into unique genotype (Genotype 1) and four subtypes (A-D). In addition, based on NS3 region, Bayesian phylogenetic inference analysis and molecular clock dating were performed. The analyses indicated a common origin of the HNV circulating in Germany and Brazil, and a long time of circulation of these viruses in the African continent. The understanding of animal viruses is extremely important for animal and public health, and, in addition, aims to map zoonotic reservoirs and assist in evolution and viral origin understanding

Gravidez com implantação na cicatriz de cesariana anterior

Introdução: Gravidez com implantação na cicatriz de cesariana anterior é um tipo de gravidez ectópica cada vez mais prevalente, devido ao aumento de cesarianas realizadas em todo o mundo. Tem uma incidência que varia entre 1:1800 a 1:2216 de todas as gravidezes e corresponde a 6,1% das gravidezes ectópicas em pacientes que realizaram pelo menos uma cesariana. Caracteriza-se, habitualmente, por uma implantação na cicatriz de cesariana anterior, devido a defeitos na correta cicatrização da mesma. É diagnosticada através da presença de antecedentes de cesariana prévia, com base nos níveis de ß-hCG e de acordo com os achados ecográficos identificados. Está associada a um elevado risco de efeitos adversos tais como hemorragia severa, rotura uterina e histerectomia. Objetivos: Esta dissertação tem como intuito abordar os diferentes métodos terapêuticos da gravidez com implantação na cicatriz de cesariana anterior, dando destaque ao tratamento expectante, com o objetivo de compreender a possibilidade de gerar um feto viável através desta gravidez ectópica, mas também perceber como se pode uniformizar as técnicas terapêuticas entre os diferentes especialistas. Metodologia: Foi efetuada pesquisa bibliográfica na plataforma PubMed entre setembro de 2021 e março de 2022. Resultados: Apesar desta condição ser relativamente incomum, existem diversos estudos sobre as melhores técnicas terapêuticas e abordagens perante os casos de gravidez de cicatriz de cesariana, distinguindo-se terapêuticas médicas, cirúrgicas e expectantes tanto para gravidezes evolutivas como para gravidezes não evolutivas. Em grávidas hemodinamicamente estáveis é aconselhado tratamento médico ou minimamente invasivo e, caso as gestantes não queiram interromper a gravidez, é tentado o tratamento expectante, explicando os riscos e efeitos adversos associados à continuação desta gravidez ectópica. Histerectomia é uma abordagem cirúrgica utilizada geralmente em último caso, em doentes que se apresentam com instabilidade hemodinâmica. Conclusão: A gravidez com implantação na cicatriz de cesariana anterior tem cada vez mais importância para a comunidade médica, tendo aumentado os conhecimentos sobre a sua patogénese, diagnóstico e tratamento, verificando-se a necessidade de estabelecer critérios uniformes para o seguimento e tratamento destas gravidezes ectópicas.Introduction: Caesarean scar pregnancy is an increasingly prevalent type of ectopic pregnancy, consequence of the increase in caesarean sections performed worldwide. It has an incidence between 1:1800 to 1:2216 of all pregnancies and corresponds to 6.1% of ectopic pregnancies in patients who underwent at least one caesarean section. It is usually characterized by implantation in the scar of a previous caesarean section, due to defects in its correct healing. The diagnostic is made through the presence of a history of previous caesarean section, based on the levels of ß-hCG and according to the ultrasound findings. It is associated with a high risk of adverse effects such as severe bleeding, uterine rupture and hysterectomy. Objectives: This dissertation aims to approach the different therapeutic methods of caesarean scar pregnancy emphasizing the expectant treatment, understanding the possibility of generating a viable fetus through this ectopic pregnancy, and also understanding how to standardize therapeutic techniques among different specialists. Methodology: The literature review was based on the PubMed platform between September 2021 and March 2022. Results: Although this condition is relatively uncommon, there are several studies on the best therapeutic techniques and approaches in cases of caesarean scar pregnancy, distinguishing medical, surgical and expectant therapies for both evolving and nonprogressive pregnancies. In hemodynamically stable pregnant women, medical or minimally invasive treatment is recommended and, if pregnant women do not want to terminate the pregnancy, expectant treatment should be tried, explaining the risks and adverse effects associated with the continuation of this ectopic pregnancy. A hysterectomy is a surgical approach generally used as a last resort, in patients who present with hemodynamic instability. Conclusion: Caesarean scar pregnancy is increasingly highlighted by the medical community, having increased knowledge about its pathogenesis, diagnosis and treatment, verifying the need to establish uniform criteria for the follow-up and treatment of these ectopic pregnancies

O turismo como alternativa para recuperação de áreas degradadas pela mineração

The great increment in the production mining would provokeinterferences in the environment drastically promoting the suppression of the vegetation, modifying the landscape and disturbing the ecosystem totally. The recovery of those areas is a demand of the effective environmental legislation that it is discussed in this article starting from a revision bibliographical. This study approaches as theme the several forms of recovery of areas environmental damaged for the mining, as, for instance, the techniques of handling of native species and, it also demonstrates, as main objective of this article, that the tourist activities is a great alternative for recovery of those areas. It is ended that the tourism can change the picture of environmental and commercial depreciation of the degraded area, improving the quality of the communities, generating new jobs and joining cultural value to the place.O grande incremento na produção minerária provoca interferências no meio ambiente promovendo a supressão da vegetação, alterando drasticamente a paisagem e perturbando totalmente o ecossistema. A recuperação dessas áreas é umaexigência da legislação ambiental vigente que é discutida neste artigo a partir de uma revisão bibliográfica. Este estudo aborda como tema as diversas formas de recuperação de áreas ambientalmente danificadas pela mineração, como, por exemplo, as técnicas de manejo de espécies nativas e, demonstra também, como principal objetivo deste artigo,que a atividade turística é uma ótima alternativa para recuperação dessas áreas. Conclui-se que o turismo pode reverter o quadro de desvalorização ambiental e comercial daregião degradada, melhorando a qualidade de vida da omunidade do entorno, gerando novos empregos e agregando valor cultural para a localidade

A ATUAÇÃO DOS ÓRGÃOS DE CONTROLE SOBRE A ÁREA DE GESTÃO DE PESSOAS DE UMA INSTITUIÇÃO FEDERAL DE ENSINO SUPERIOR

O controle no setor público – um dos mecanismos da governança pública – tem a finalidade de avaliar, direcionar e monitorar a atuação da gestão, com intuito de garantir que ela aja sempre visando ao interesse comum. A Administração Pública, no âmbito do Poder Executivo Federal, está sujeita a diversas formas de controle, como as realizadas pelo Tribunal de Contas da União (TCU) e pelo Ministério da Transparência, Fiscalização e Controle (MTFC). A presente pesquisa - de natureza descritiva e qualitativa - objetiva descrever a atuação destes órgãos sobre a área de gestão de pessoas e é desenvolvida por meio de um estudo de caso na Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC), o qual abrange o período compreendido entre os anos de 2011 a 2015. As atividades que fazem parte do escopo da pesquisa são: a apreciação de atos de pessoal a cargo do TCU, a análise do MTFC sobre os processos de pessoal e as trilhas de auditoria de pessoal realizadas pelo MTFC. Afinal, pondera-se que o conhecimento desta atuação pode acarretar o aprimoramento da gestão, bem assim, acredita-se que propagar o conhecimento sobre a estrutura de controle que cerca a Administração Pública é uma forma de fomentar o controle social

“A África está aqui!”: Desconstrução de concepções etnocêntricas na História afrobrasileira

O trabalho parte das atividades realizadas na disciplina de Estágio III, do curso de História, da Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA). O estágio ocorreu no Clube Social 24 de Agosto, localizado em Jaguarão, em 2013, e teve como objetivo construir instrumentos metodológicos para o desempenho de uma ação docente que percebesse o ensino de História presente em diferentes espaços. A proposta prática foi surgindo a partir da pesquisa do acervo da instituição, em que foram analisadas fontes escritas, bibliográficas e atas, bem como por meio do diálogo com os membros do clube. Visando demonstrar e mediar o conhecimento sobre a cultura afrodescendente, confeccionamos uma exposição na Escola Estadual de Ensino Fundamental Pio XII, intitulada “A África está aqui! Um pouco das histórias do Clube 24”. Posteriormente, realizamos uma oficina de máscaras africanas, com o intuito de aproximarmos os alunos de uma prática usual dessa cultura. A intenção das ações foi fazer com todos tivessem maior contato com a cultura afro, desenvolvendo uma percepção crítica para desconstruir concepções etnocêntricas legitimadas por um ensino de História tradicional. Conseguimos alcançar alguns dos objetivos, como a problematização das crianças em relação ao tema, visto que a todo o momento surgiram várias perguntas, por exemplo, sobre o que era um quilombo e o que era um continente, além delas relacionarem a capoeira com as suas vidas. Nesse sentido, verificamos a relevância desse trabalho para auxiliar na construção de cidadãos pensantes e preocupados com questões sociais e étnico-raciais

Oral Health-Related Quality of life and its association with malocclusion and self-perception of dental aesthetics in Adolescents / Qualidade de vida relacionada à saúde bucal e sua associação com má oclusão e autopercepção da estética dentária em adolescentes

Introduction: Studies have shown that malocclusions can have a negative impact on the quality of life and self-esteem of adolescents. This study aimed to verify the association between Oral Health-Related Quality of Life, malocclusion and self-perceived dental aesthetics in Brazilian adolescents.  Methods: A cross-sectional study was conducted with a sample of 580 students between 12 and 15 years old. The oral health-related quality of life (OHRQoL) was evaluated using Child OIDP, malocclusion was determined by DAI, self-perceived dental aesthetics was evaluated using the OASIS, and IOTN-AC assessed the self-perceived orthodontic treatment need. The statistical analysis involved descriptive and inferential methods, such as Pearson’s chi-square test or Fisher’s exact test and multiple logistic regressions, with significance level of 5%.  Results: The prevalence of oral impact was high (73.4%), 49.1% presented malocclusion and 25.0% had a highly desirable orthodontic treatment need. Negative self-perception of dental aesthetics was observed in 50.0% of adolescents and 13.1% thought they needed orthodontic treatment. The impact on quality of life was associated to gender, self-perceived dental aesthetic (p<0.001), malocclusion + self-perceived dental aesthetic (p<0.001) and self-perceived orthodontic treatment need (p=0.045). The logistic regression results indicated that being female and having negative self-perception of dental aesthetics are directly involved in the quality of life of adolescents. Conclusion: Being female and having a negative self-perception of one’s dental aesthetics are risk factors for impacting negatively on oral health related quality of life

Evaluation of Piezoresistivity Properties of Sputtered ZnO Thin Films

Zinc oxide (ZnO) thin films were deposited by RF reactive magnetron sputtering on silicon (100) substrates under different experimental conditions. ZnO films were studied before and after annealing treatment at 600 degrees C. the crystallinity, electrical resistivity, stoichiometry, thickness, and elastic modulus of the films were investigated. ZnO piezoresistors were produced using microelectronics processes, such as photolithography, lift-off, and reactive ion etching (RIE). Cantilever method was used to determine the gauge factor, and measurements of Temperature Coefficient of Resistance (TCR) were performed on a hotplate. the optimization of the deposition conditions produced ZnO thin films with controlled stoichiometry (ZnO), crystalline microstructure (phase wurzite, 002), high elastic modulus (156 GPa), and low electrical resistivity (0.072 ohm.cm), which are good properties for application as piezoresistive pressure microsensor. in addition, the ZnO piezoresistors had a GF of 2.6 on the deformation in the plane (100) and TCR of -1610 ppm/K up to 250 degrees C.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Inst Tecnol Aeronaut ITA, Sao Jose Dos Campos, SP, BrazilFac Tecnol São Paulo FATEC SP, São Paulo, BrazilUniversidade Federal de São Paulo UNIFESP, Sao Jose Dos Campos, SP, BrazilUniversidade Federal de São Paulo UNIFESP, Sao Jose Dos Campos, SP, BrazilWeb of Scienc