The late arrival of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in Africa : mitigating pan-continental spread

CITATION: Nachega, J.; Seydi, M. & Zumla, A. 2020. The late arrival of Coronavirus disease 2019 (COVID-19) in Africa: mitigating pan-continental spread. Clinical Infectious Diseases, 71(15): 875–878. doi:10.1093/cid/ciaa353The original publication is available at https://academic.oup.com/cid/The novel coronavirus disease 2019 (COVID-19) has rapidly spread to all 7 continents. Due to yet unknown reasons, the African continent has remained relatively unaffected. We discuss the importance of mitigating pan-continental spread in light of the fragile healthcare systems.https://academic.oup.com/cid/article/71/15/875/5813601Publishers versio

Connaissances, attitudes et pratiques du personnel infirmier du centre hospitalier universitaire de Fann en matière d’infection à VIH

Il s’agissait d’une étude transversale à visée descriptive et analytique visant à étudier les connaissances, attitudes et pratiques des personnels infirmiers dans le but de réduire les comportements à risque  et les attitudes de stigmatisation face à l’infection à VIH au sein de cette population. Les données ont été recueillies sur un questionnaire auto-administré et saisies grâce au logiciel Epi Info version 3.5.1. Le taux de participation était de 90,1%. Les infirmiers à 20,2%  pensaient qu’il faut isoler les patients séropositifs dans les unités de soins. Un bon niveau de connaissances des moyens de prévention sexuelle du VIH-Sida était retrouvé chez 37% de la population. La principale source d’information était les médias. Le niveau de connaissance était statistiquement lié à l’âge.  Les infirmiers sexuellement actifs  déclaraient à 15,3% avoir déjà été traités pour une IST. L’usage systématiquement du préservatif lors des rapports sexuels était pratiqué par 6,5% des infirmiers. Le multipartenariat sexuel et la pratique de rapports sexuels avec un(e) professionnel (le) du sexe  étaient statistiquement liés au sexe (p < 0,001). Les pénétrations anale et buccale étaient retrouvées chez respectivement 2,1 et 18,5% des infirmiers enquêtés. Deux infirmiers ont déclaré un résultat positif au dernier test de dépistage de l’infection à VIH. Il convient de renforcer périodiquement les connaissances du personnel infirmier au travers des médias en vue d’améliorer leurs pratiques et prévenir la transmission du VIH

Utilisation du test GeneXpert pour le diagnostic de la tuberculose au service des maladies infectieuses du CHNU de Fann

Introduction: Nous avons réalisé ce travail pour montrer notre expérience d’utilisation du GeneXpert et évaluer son apport dans la confirmation du diagnostic de la tuberculose. Méthodes: Etude prospective descriptive et analytique de janvier à Décembre 2013. Résultats: Quatre vingt quatorze patients ont bénéficié du geneXpert pour le dépistage de la tuberculose toute localisation confondue. Le geneXpert avait été positif dans 62% des cas. Les images radiologiques fortement évocatrices de tuberculose était associées à un geneXpert positif dans 25% des cas. La recherche de BAAR réalisée chez 55 patients était positive dans 9 cas (16%). Le geneXpert était positif sur 46 frottis négatif (54%)et dans 89% sur les frottis positifs. La prévalence de la tuberculose extrapulmonaire était de 34%. Le taux de positivité était variable en fonction du type de prélèvement. Deux cas de résistance à la rifampicine ont été détectées. Conclusion: Le geneXpert a été d’un grand apport pour le diagnostic de la tuberculose pulmonaire et extrapulmonaire mais la bacilloscopie reste incontournable.Pan African Medical Journal 2016; 2

Connaissances, attitudes et pratiques du personnel infirmier du centre hospitalier universitaire de Fann en matière d’infection à VIH

Il s’agissait d’une étude transversale à visée descriptive et analytique visant à étudier les connaissances, attitudes et pratiques des personnels infirmiers dans le but de réduire les comportements à risque  et les attitudes de stigmatisation face à l’infection à VIH au sein de cette population. Les données ont été recueillies sur un questionnaire auto-administré et saisies grâce au logiciel Epi Info version 3.5.1. Le taux de participation était de 90,1%. Les infirmiers à 20,2%  pensaient qu’il faut isoler les patients séropositifs dans les unités de soins. Un bon niveau de connaissances des moyens de prévention sexuelle du VIH-Sida était retrouvé chez 37% de la population. La principale source d’information était les médias. Le niveau de connaissance était statistiquement lié à l’âge.  Les infirmiers sexuellement actifs  déclaraient à 15,3% avoir déjà été traités pour une IST. L’usage systématiquement du préservatif lors des rapports sexuels était pratiqué par 6,5% des infirmiers. Le multipartenariat sexuel et la pratique de rapports sexuels avec un(e) professionnel (le) du sexe  étaient statistiquement liés au sexe (p < 0,001). Les pénétrations anale et buccale étaient retrouvées chez respectivement 2,1 et 18,5% des infirmiers enquêtés. Deux infirmiers ont déclaré un résultat positif au dernier test de dépistage de l’infection à VIH. Il convient de renforcer périodiquement les connaissances du personnel infirmier au travers des médias en vue d’améliorer leurs pratiques et prévenir la transmission du VIH

Hepatitis B screening practices and viral control among persons living with HIV in urban Senegal.

Chronic hepatitis B virus (HBV) infection affects >10% of the general population and is the leading cause of liver cirrhosis and cancer in West Africa. Despite current recommendations, HBV is often not tested for in clinical routine in the region. We included all people living with HIV (PLWH) in care between March and July 2019 at Fann University Hospital in Dakar (Senegal) and proposed hepatitis B surface antigen (HBsAg) test to those never tested. All HBsAg-positive underwent HIV and HBV viral load (VL) and liver stiffness measurement. We evaluated, using logistic regression, potential associations between patient characteristics and (a) HBV testing uptake; (b) HIV/HBV co-infection among individual HBsAg tested. We determined the proportion of co-infected who had HBV DNA >20 IU/ml on ART and sequenced HBV polymerase in those with HBV replication.of 1076 PLWH in care, 689 (64.0%) had never had an HBsAg test prior to our HBV testing intervention. Women and individuals >40 years old were less likely to have been previously tested. After HBV testing intervention,107/884 (12.1%) PLWH were HBsAg-positive. Seven of 58 (12.1%) individuals newly diagnosed with HIV/HBV co-infection had a detectable HBV VL, of whom five were HIV-suppressed. Two patients on ART including 3TC and AZT as backbone showed the presence of the triple resistance mutation 180M/204I/80V. In this Senegalese urban HIV clinic, the majority of patients on ART had never been tested for HBV infection. One in ten co-infected individuals had a detectable HBV VL despite HIV suppression, and 8% were not receiving a TDF-containing regimen

Prevalence and Predictors of Liver Fibrosis in People Living with Hepatitis B in Senegal.

Hepatitis B virus (HBV) infection is the first cause of liver cirrhosis and cancer in West Africa. Although the exposure to additional environmental and infectious risk factors may lead to the faster progression of liver disease, few large-scale studies have evaluated the determinants of HBV-related liver fibrosis in the region. We used transient elastography to evaluate the prevalence of liver fibrosis and assessed the association between HBV markers and significant liver fibrosis in a cohort of people living with HBV in Dakar, Senegal. The prevalence of significant liver fibrosis was 12.5% (95% confidence interval [CI] 9.6%-15.9%) among 471 people with HBV mono-infection (pwHBV) and 6.4% (95% CI 2.6%-12.7%) in 110 people with HIV/HBV co-infection (pwHIV/HBV) on tenofovir-containing antiretroviral therapy (p = 0.07). An HBV viral load > 2000 IU/mL was found in 133 (28.3%) pwHBV and 5 (4.7%) pwHIV/HBV, and was associated with significant liver fibrosis (adjusted odds ratio (aOR) 1.95, 95% CI 1.04-3.66). Male participants (aOR 4.32, 95% CI 2.01-8.96) and those with elevated ALT (aOR 4.32, 95% CI 2.01-8.96) were especially at risk of having significant liver fibrosis. Our study shows that people with an HBV viral load above 2000 IU/mL have a two-fold increase in the risk of liver fibrosis and may have to be considered for antiviral therapy, independent of other disease parameters

Tuberculose intestinale révélée par une occlusion intestinale aigüe au cours d’une réaction paradoxale au traitement anti-tuberculeux chez un patient immunocompétent: à propos d’un cas et revue de la littérature

La tuberculose intestinale représente 3 à 5% de toutes les localisations viscérales. Malgré l'efficacité démontrée des anti-tuberculeux, des cas d'exacerbation du tableau clinique initial ont été décrits à l'initiation du traitement. Ces réactions dites «paradoxales» sont cependant rarement rapportées chez les immunocompétents et beaucoup moins sous forme d'occlusion intestinale. Nous rapportons un cas de tuberculose intestinale révélée par une occlusion intestinale aigüe au cours d'une réaction paradoxale aux anti-tuberculeux. Il s'agit d'un patient de 26 ans, immunocompétent qui a présenté un syndrome occlusif à un mois de traitement d'une tuberculose pleuro-pulmonaire. La tomodensitométrie (TDM) abdominale était en faveur d'une occlusion intestinale grêlique. La laparotomie objectivait une masse intra-péritonéale avec de multiples adhérences. L'examen anatomopathologique de la pièce opératoire était en faveur d'une tuberculose intestinale. L'évolution était favorable après la poursuite du traitement anti-tuberculeux initial

Facteurs associés à la dissociation immunovirologique chez les patients infectés par le VIH-1 sous traitement antirétroviral hautement actif au Centre de Traitement Ambulatoire (CTA) de Dakar

Introduction: L'objectif de ce travail était d'évaluer les différents facteurs associés à la dissociation immunovirologique malgré un traitement antirétroviral hautement actif et efficace.Méthodes: Il s'agissait d'une étude de cohorte historique, descriptive et analytique faite à partir de dossiers de patients infectés par le VIH-1; sous traitement antirétroviral depuis au moins 12 mois, suivis dans la cohorte du CTA de 2001 à 2011 et ayant une charge virale indétectable depuis 6 mois.Résultats: Durant cette période d'étude de 10 ans, la prévalence de la DIV était de 19,3%. Le sexe féminin était prédominant avec un sexe ratio de 1,9. La dissociation immunovirologique a été plus fréquemment rencontrée chez les patients de sexe masculin (29,7% vs 14,1%) avec une différence statistiquement significative (p = 0,00006). L'âge médian était de 44 ans ± 10 ans. Un antécédent de tuberculose a été retrouvé dans environ un tiers des cas (31,4%). La dissociation immunovirologique était significativement plus fréquente chez les patients ayant un antécédent de tuberculose (p = 0,00005). La plupart des patients (68%) était au stade SIDA 3 ou 4 de l'OMS. Les patients ayant une dissociation immunovirologique étaient plus souvent aux stades 3 et 4 de l'OMS (p = 0,0001). La dénutrition a été notée dans plus de la moitié des cas (56,2%) et la dissociation immunovirologique prédominait chez les patients dénutris (p=0,005). Le taux moyen de lymphocytes TCD4+ était de 86,7± 83 cellules / mm3. La dissociation immunovirologique était plus fréquente chez les patients ayant un taux de lymphocytes TCD4 bas à l'initiation avec une différence statistiquement significative (p = 0,00000). En analyse multivariée; Seuls l'âge supérieur ou égal à 43 ans, le taux de CD4 initial < 100 c/mm3 et le sexe masculin étaient significativement associés à cette dissociation immunovirologique.Conclusion: Les principaux facteurs associés à la dissociation immunovirologique étant évalués, d'autres études portant sur ce groupe mériteraient d'être envisagées afin de connaitre l'impact de cette réponse immunologique partielle sur la survenue d'infections opportunistes ou bien la mise en place d'une trithérapie spécifique uniquement dans le but d'avoir une restauration immunologique optimale.Mots clés: Dissociation, immunovirologique, VIH, DakarEnglish Title: Factors associated with immunovirologic dissociation in HIV-1-infected patients under highly active antiretroviral therapy in the Ambulatory Treatment Center (ATC) in DakarEnglish AbstractIntroduction: the objective of this work is to evaluate the different factors associated with immunovirologic dissociation despite highly active and effective antiretroviral treatment.Methods: we conducted a retrospective, cohort, descriptive and analytical study of the medical records of HIV-1 infected patients having received at least 12 months of antiretroviral therapy, followed in the ATC cohort from 2001 to 2011 and with undetectable viral load in the last 6 months.Results: during this 10-year study period, the prevalence of IVD was 19.3%. Female sex was predominant, with a sex ratio of 1.9. Immunovirologic dissociation was more frequent in male patients (29.7% vs 14.1%) with a statistically significant difference (p = 0,00006). The average age was 44 years ± 10 years. A history of tuberculosis was found in about a third of the cases (31.4%). Immunovirologic dissociation was significantly more frequent in patients with a history of tuberculosis (p = 0.00005). Most patients (68%) had AIDS at WHO clinical stages 3 or 4. Patients with immunovirologic dissociation were more often in WHO clinical stages 3 and 4 (p = 0.0001). More than half of the cases (56.2%) were found to be malnourished and immunovirologic dissociation was prevalent in malnourished patients (p=0.005). The mean CD4+ T lymphocytes counts was 86.7± 83 cells / mm3. Immunovirologic dissociation was more frequent in patients with initial low CD4+ T lymphocyte counts and with a statistically significant difference (p = 0.00000). By multivariate analysis, only age greater than or equal to 43 years, CD4 initial counts < 100 c/mm3 and male sex were significantly associated with this immunovirologic dissociation.Conclusion: our study assessed the main factors associated with immunovirologic dissociation. Other studies of this nature would also merit consideration in order to highlight the impact of this partial immune response on the emergence of opportunistic infections or the implementation of a specific tritherapy for the sole purpose of producing fully successful immune restoration.Keywords: Dissociation, immunovirologic, HIV, Daka

Liver Disease and Treatment Needs of Asymptomatic Persons Living With Hepatitis B in Senegal.

The prevalence of active hepatitis B among asymptomatic persons remains unclear in Africa. Of 1206 newly diagnosed persons in Senegal, 12.3% had significant fibrosis and 31.3% had hepatitis B virus (HBV) DNA levels >2000 IU/mL. Overall, 128 (12.9%) were eligible for antiviral therapy. Generalized HBV screening allowed the identification of a large population requiring HBV care

Factors associated with verbal fluency in older adults living with HIV in West Africa: a longitudinal study

OBJECTIVE: Verbal fluency decline, observed both in aging and HIV infection, has been related to lower quality of life. This study aimed to evaluate the factors associated with verbal fluency in people living with HIV (PLHIV) aged ≥60 years living in West Africa. METHODS: In this longitudinal study, PLHIV aged ≥60 years, on antiretroviral therapy (ART) for ≥6 months were included in three clinics (two in Côte d'Ivoire, one in Senegal) participating in the West Africa International epidemiological Databases to Evaluate AIDS (IeDEA) collaboration. Verbal fluency was evaluated with the Isaacs Set Test at 60 seconds at baseline and 2 years later. Factors associated with verbal fluency baseline performance and annual rates of changes were evaluated using multivariate linear regression models. RESULTS: 97 PLHIV were included with 41 of them (42%) having a 2-year follow-up visit. The median age was 64 (62-67), 45.4% were female, and 89.7% had an undetectable viral load. The median annual change in verbal fluency scores was -0.9 (IQR: -2.7 - 1.8). Low baseline verbal fluency performance and its decline were associated with older age and being a female. Low educational level was associated with low baseline verbal fluency performance but not with its decline. Verbal fluency decline was also associated with marital status and hypertension. CONCLUSIONS: Among older West African PLHIV, usual socio-demographic variables and hypertension were the main factors associated with low verbal fluency performance and/or its decline. Interventions that focus on supporting cardiometabolic health are highly recommended to prevent cognitive disorders in PLHIV. This article is protected by copyright. All rights reserved