Site factors determining epiphytic lichen distribution in a dieback-affected spruce-fir forest on Whiteface Mountain, New York: stemflow chemistry

Epiphytic lichen diversity in a dieback-affected forest of red spruce (Picea rubens Sarg.) and balsam fir (Abies balsamea (L.) Mill.) on Whiteface Mountain, New York, U.S.A., was higher on dead compared with living trees and on fir compared with spruce. Diversity differed more between living and dead spruce than between living and dead fir. Cover of all lichen species that occurred on more than 50% of the sample trees, except for two species, decreased with increasing mean concentration of NO3– in stemflow. Concentrations of NO3– were higher on living spruce compared with dead spruce and with living and dead fir. The negative correlations between lichen cover and NO3– concentration may reflect either a decrease of lichen abundance caused by toxic effects of higher NO3– concentrations or a removal of NO3– from stemflow by epiphytic lichens. Experimental exposure of Hypogymnia physodes to NaNO3 reduced chlorophyll concentrations. This result, together with estimations of lichen and needle biomass, indicates that a dependence of lichen cover on NO3– concentrations in stemflow may be the cause for the negative correlations. The sulphur concentration in stemflow did not affect lichen abundance on Whiteface Mountain. The manganese concentration in stemflow may have an effect on single species

Towards a nomenclatural clarification of the <i>Peltigera ponojensis/monticola</i> clade including metagenomic sequencing of type material and the introduction of <i>P. globulata</i> Miadl. & Magain sp. nov.

peer reviewedPeltigera globulata Miadl. & Magain, a new species in the P. ponojensis/monticola species complex of section Peltigera, is formally described. This clade was previously given the interim designation Peltigera sp. 17. It is found in sun-exposed and xeric habitats at high altitudes in Peru and Ecuador. Peltigera globulata can be easily recognized by its irregularly globulated margins covered mostly by thick, white pruina, somewhat resembling the sorediate thallus margins of P. soredians, another South American species from section Peltigera. The hypervariable region of ITS1 (ITS1-HR), which is in general highly variable among species of section Peltigera, does not have diagnostic value for species identification within the P. ponojensis/monticola complex. Nevertheless, no significant level of gene flow was detected among eight lineages representing a clade of putative species (including P. globulata) within this complex. ITS sequences from the holotype specimens of P. monticola Vitik. (collected in 1979) and P. soredians Vitik. (collected in 1981) and lectotype specimens of P. antarctica C. W. Dodge (collected in 1941) and P. aubertii C. W. Dodge (collected in 1952) were successfully obtained through Sanger and Illumina metagenomic sequencing. BLAST results of these sequences revealed that the type specimen of P. monticola falls within the P. monticola/ponojensis 7 clade, which represents P. monticola s. str., and confirmed that the type specimen of P. aubertii falls within a clade identified previously as P. aubertii based on morphology. The ITS sequence from the type specimen of P. soredians, which superficially resembles P. globulata, confirms its placement in the P. rufescens clade. Finally, we discovered that the name P. antarctica was erroneously applied to a lineage in the P. ponojensis/monticola clade. The ITS sequence from the type specimen of P. antarctica represents a lineage within the P. rufescens clade, which is sister to the P. ponojensis/monticola clade

Coordinated ultrastructural and phylogenomic analyses shed light on the hidden phycobiont diversity of Trebouxia microalgae in Ramalina fraxinea

[EN] The precise boundary delineations between taxa in symbiotic associations are very important for evolutionary and ecophysiological studies. Growing evidence indicates that in many cases, the use of either morphological characters or molecular markers results in diversity underestimation. In lichen symbioses. Trebouxia is the most common genus of lichen phycobionts, however, the diversity within this genus has been poorly studied and as such there is no clear species concept. This study constitutes a multifaceted approach incorporating aspects of ultrastructural characterization by TEM and phylogenomics to evaluate the morphological and genetic diversity of phycobionts within the sexually reproducing lichen Ramalina fraxinea in the context of Mediterranean and temperate populations. Results reveal an association with at least seven different Trebouxia lineages belonging to at least two species. T. decolorans and T. jamesii, and diverse combinations of such lineages coexisting within the same thallus depending on the analysed sample. Some of these lineages are shared by several other non-related lichen taxa. Our findings indicate the existence of a highly diverse assemblage of Trebouxia algae associating with R. fraxinea and suggest a possible incipient speciation within T. decolorans rendering a number of lineages or even actual species. This study stresses the importance of coordinated ultrastructural and molecular analyses to improve estimates of diversity and reveal the coexistence of more than one Trebouxia species within the same thallus. lt is also necessary to have clearer species delimitation criteria within the genus Trebouxia and microalgae in general.This study was funded by the Ministerio de Economia y Competitividad (MINECO CGL2012-40058-0O2-01/02), FEDER, the Generalitat Valenciana (PROMETEOII2013/021, GVA) and the Direccion General de Universidades e Investigacion de la Consejeria de Educacion de la Comunidad de Madrid - Universidad de Alcala (CCG10-UAH/GEN-5904). Drs. Arantxa Matins and Patricia Moya (Universitat de Valencia) made helpful comments on the manuscript.Català, S.; Campo, ED.; Barreno, E.; García-Breijo, F.; Reig Armiñana, J.; Casano, L. (2016). Coordinated ultrastructural and phylogenomic analyses shed light on the hidden phycobiont diversity of Trebouxia microalgae in Ramalina fraxinea. Molecular Phylogenetics and Evolution. 94:765-777. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2015.10.021S7657779

Influence of Short-Term Glucocorticoid Therapy on Regulatory T Cells In Vivo

Background: Pre- and early clinical studies on patients with autoimmune diseases suggested that induction of regulatory T(Treg) cells may contribute to the immunosuppressive effects of glucocorticoids(GCs). Objective: We readdressed the influence of GC therapy on Treg cells in immunocompetent human subjects and naı¨ve mice. Methods: Mice were treated with increasing doses of intravenous dexamethasone followed by oral taper, and Treg cells in spleen and blood were analyzed by FACS. Sixteen patients with sudden hearing loss but without an inflammatory disease received high-dose intravenous prednisolone followed by stepwise dose reduction to low oral prednisolone. Peripheral blood Treg cells were analyzed prior and after a 14 day GC therapy based on different markers. Results: Repeated GC administration to mice for three days dose-dependently decreased the absolute numbers of Treg cells in blood (100 mg dexamethasone/kg body weight: 2.861.86104 cells/ml vs. 336116104 in control mice) and spleen (dexamethasone: 2.861.96105/spleen vs. 956226105/spleen in control mice), which slowly recovered after 14 days taper in spleen but not in blood. The relative frequency of FOXP3+ Treg cells amongst the CD4+ T cells also decreased in a dose dependent manner with the effect being more pronounced in blood than in spleen. The suppressive capacity of Treg cells was unaltered by GC treatment in vitro. In immunocompetent humans, GCs induced mild T cell lymphocytosis. However, it did not change the relative frequency of circulating Treg cells in a relevant manner, although there was some variation depending on the definition of the Treg cells (FOXP3+: 4.061.5% vs 3.461.5%*; AITR+: 0.660.4 vs 0.560.3%, CD127low: 4.061.3 vs 5.063.0%* and CTLA4+: 13.8611.5 vs 15.6612.5%; * p,0.05). Conclusion: Short-term GC therapy does not induce the hitherto supposed increase in circulating Treg cell frequency, neither in immunocompetent humans nor in mice. Thus, it is questionable that the clinical efficacy of GCs is achieved by modulating Treg cell numbers

A multigene phylogenetic synthesis for the class Lecanoromycetes (Ascomycota): 1307 fungi representing 1139 infrageneric taxa, 317 genera and 66 families

The Lecanoromycetes is the largest class of lichenized Fungi, and one of the most species-rich classes in the kingdom. Here we provide a multigene phylogenetic synthesis (using three ribosomal RNA-coding and two protein-coding genes) of the Lecanoromycetes based on 642 newly generated and 3329 publicly available sequences representing 1139 taxa, 317 genera, 66 families, 17 orders and five subclasses (four currently recognized: Acarosporomycetidae, Lecanoromycetidae, Ostropomycetidae, Umbilicariomycetidae; and one provisionarily recognized, ‘Candelariomycetidae’). Maximum likelihood phylogenetic analyses on four multigene datasets assembled using a cumulative supermatrix approach with a progressively higher number of species and missing data (5-gene, 5 + 4-gene, 5 + 4 + 3-gene and 5 + 4 + 3 + 2-gene datasets) show that the current classification includes non-monophyletic taxa at various ranks, which need to be recircumscribed and require revisionary treatments based on denser taxon sampling and more loci. Two newly circumscribed orders (Arctomiales and Hymeneliales in the Ostropomycetidae) and three families (Ramboldiaceae and Psilolechiaceae in the Lecanorales, and Strangosporaceae in the Lecanoromycetes inc. sed.) are introduced. The potential resurrection of the families Eigleraceae and Lopadiaceae is considered here to alleviate phylogenetic and classification disparities. An overview of the photobionts associated with the main fungal lineages in the Lecanoromycetes based on available published records is provided. A revised schematic classification at the family level in the phylogenetic context of widely accepted and newly revealed relationships across Lecanoromycetes is included. The cumulative addition of taxa with an increasing amount of missing data (i.e., a cumulative supermatrix approach, starting with taxa for which sequences were available for all five targeted genes and ending with the addition of taxa for which only two genes have been sequenced) revealed relatively stable relationships for many families and orders. However, the increasing number of taxa without the addition of more loci also resulted in an expected substantial loss of phylogenetic resolving power and support (especially for deep phylogenetic relationships), potentially including the misplacements of several taxa. Future phylogenetic analyses should include additional single copy protein-coding markers in order to improve the tree of the Lecanoromycetes. As part of this study, a new module (‘‘Hypha’’) of the freely available Mesquite software was developed to compare and display the internodal support values derived from this cumulative supermatrix approach.Keywords: Classification, Multi-gene phylogeny, Lichenized fungi, Systematics, Cumulative supermatrix, Lecanoromycete

Standortfaktoren für epiphytische Flechten in einem immissionsgeschädigten Fichten-Tannenwald am Whiteface Mountain, New York

In einem Abies balsamea-Picea rubens-Bestand am Whiteface Mountain im US-Bundesstaat New York wurde die epiphytische Diversität der Flechtenvegetation zwischen gesunden und immissionsgeschädigten Rotfichten (Picea rubens) sowie zwischen Rotfichte und Balsamtanne (Abies balsamea) miteinander verglichen. Die geschädigten Rotfichten sind flechtenreicher als die gesunden und die Balsamtannen sind flechtenreicher als die Rotfichten. Arthonia caesia war die dominante Flechtenart auf lebenden Tannen sowie auf lebenden und toten Fichten. Tote Tannen waren hingegen überwiegend mit Hypogymnia physodes besiedelt.Die Elementgehalte des Stammablaufs und der Borke wurden daraufhin untersucht, ob sie für diese Verbreitungsunterschiede verantwortlich sein könnten. Im Stammablauf lebender Tannen zeigten sich im Vergleich zu den lebenden Fichten höhere Gehalte an P, S, K, Na, Mn, Al und Cu. Lebende Fichten hatten hingegen höhere NO3- und H+ Gehalte im Stammablauf. Eine geringere Assimilationsrate der lebenden Fichten im Vergleich zu den lebenden Tannen könnte für die höheren Mengen an NO3- im Stammablauf der letztgenannten Art verantwortlich sein. NO3-, Ca, Mn, Al und H+ waren höher konzentriert im Stammablauf toter Fichten als im Stammablauf toter Tannen. Konzentrationen der Elemente S, Na, Fe und Al sowie die Leitfähigkeit waren höher im Stammablauf lebender Fichten als die im Stammablauf toter Fichten. Lebende Tannen wiesen höhere Gehalte an Mn und Cu auf als tote. Eine reduzierte Interzeptionsrate, hervorgerufen durch eine geringere Nadelmasse auf den toten als auf den lebenden Bäumen, kann als Hauptgrund für die Elementverteilug angesehen werden. 1999 wurde für NO3- im Stammablauf ein signifikant höherer mittlerer Gehalt auf lebenden als auf toten Rotfichten nachgewiesen; dies traf jedoch nicht für die Tannen zu.Lebende Tannen wiesen höhere Elementkonzentrationen von N, K, Mg, Mn, Zn, Cu und H+ in der Borke auf als lebende Fichten, wohingegen Fe höhere Gehalte in der Borke lebender Fichten aufwies. Ein ähnliches Bild ergab sich für den Vergleich toter Tannen und Fichten, wobei alle Elemente (bis auf Zn) in der Borke der Balsamtannen höher konzentriert waren. Die Bilanz der Elementkonzentration in der Borke wird durch 1) die Ionenaufnahme aus dem Boden, durch 2) die trockene Deposition, durch 3) die Auswaschung von Ionen durch den Stammablauf und 4) durch die Aufnahme von Ionen aus dem Stammablauf beeinflußt. Die Wichtigkeit des Einflusses der einzelnen Faktoren auf die Bilanz hängt vom Element selber und von der Baumart ab. Es kann vermutet werden, daß aufgrund der langsameren Schälung der Tannenborke höhere Elementgehalte erreicht werden als in der Fichte, deren Borke sich deutlich schneller erneuert. Für die Verteilung von Zn kann keine Erklärung gegeben werden.Die meisten Elemente in der Borke unterschieden sich in ihrem Gehalt zwischen toten und lebenden Bäumen. K, Ca, Mg, Mn, Zn und H+ waren im Vergleich zu den lebenden Bäumen in der Borke toter Fichten höher konzentriert, wohingegen lediglich N und Ca in der Borke toter Tannen einen höheren Gehalt aufwiesen. Diese Elementverteilung kann entweder auf einen Einfluß des Stammablaufes oder auf einen Einfluß des Stoffwechsels in den lebenden Untersuchungsbäumen hinweisen.Der Gehalt von NO3- im Stammablauf ist negativ mit der Deckung einer Reihe von Flechtenarten korreliert. ANOVA zeigte den stärksten Einfluß von NO3- auf die Deckung von Flavopunctelia soredica, Hypogymnia physodes, Platismatia glauca und Usnea spec. Zusätzlich zeigten sich bei Flechten der Art Hypogymnia physodes, die mit NO3--Konzentrationen zwischen 100 µmol l-1 und 10 mmol l-1 behandelt wurden, geringere Chlorophyll a- und Chlorophyll b-Gehalte als bei den Kontrollen, wohingegen der Ergosterolgehalt keine Unterschiede aufwies. Das Chlorophyll a : Ergosterol-Verhältnis war verglichen mit den Kontrollen bei den NO3--Varianten geringer.Korrelationen von S, Ca, Mg, Mn und Fe mit der Flechtendeckung waren wahrscheinlich zufällig. ANOVA zeigte keinen signifikanten Einfluß der Elemente Ca, Mg und Fe auf die Flechtendeckung, und S sowie Mn korrelierten nur schwach mit den Arten Micarea prasina und Cladonia coniocraea (im Fall von S) sowie Mycoblastus sanguinarius und Parmelia saxatilis (im Fall von Mn). Kausale Zusammenhänge können in beiden Fällen ausgeschlossen werden: Einige der Flechtenarten kommen auch im Harz bei höheren S- und Mn-Konzentrationen vor. Weiterhin konnte von unserer Arbeitsgruppe durch Inkubationsversuche experimentell gezeigt werden, daß Mn zwar die Soredienkeimung von Hypogymnia physodes negativ beeinflußt, dies aber erst bei höheren Konzentrationen als bei den im Stammablauf des Whiteface Mountain gemessenen.Wie mit Hilfe der Korrelationsanalyse gezeigt werden konnte, waren die Elementkonzentrationen in der Borke (Mn und Fe) von geringer Bedeutung für die Flechtendeckung. Hohe Mn-Gehalte in der Tannenborke, wie sie am Whiteface Mountain nachgewiesen wurden, beeinflussen die Flechten nicht, da das Mn in den Zellen immobilisiert als Kristall vorliegt.Das Mikroklima unterschied sich nicht zwischen den untersuchten Baumarten oder zwischen toten und lebenden Bäumen. Ein Grund kann in dem dichten Tannenjungwuchs gesehen werden, der im Wald am Whiteface Mountain dominiert. Die mikroklimatischen Parameter korrelierten schwach mit einzelnen Flechtenarten. Loxospora ochrophaea korrelierte negativ mit der Evaporation; Bryoria nadvornikiana korrelierte schwach negativ mit der Evaporation und dem Licht. Arthonia caesia kam häufiger auf den Bäumen mit dem niedrigsten Lichteinfall vor als auf Bäumen mit dem höchsten Lichteinfall. Die Deckung der Flechten Bryoria capillaris und B. furcellata, Evernia mesomorpha, Lecidea nylanderi, Pseudevernia consocians sowie Usnea spec. war positiv mit dem Licht korreliert. Aus diesem Ergebnis kann geschlossen werden, daß obwohl das Mikroklima einzelne Arten beeinflußt, ein alleiniger Einfluß der mikroklimatischen Parameter jedoch ausgeschlossen werden kann.Generell kann festgehalten werden, daß die Ergebnisse mit unserer Hypothese übereinstimmen, daß durch eine geringere Nadelmasse auf toten Bäumen eine reduzierte Schadstoffkonzentration auf der Borkenoberfläche erreicht wird, die das Vorkommen einer höher diversen Flechtenvegetation auf toten als auf lebenden Bäumen ermöglicht. Weiterhin besteht die Möglichkeit, daß NO3- einen Einfluß auf die Flechtendeckung besitzt, was die Verbreitungsverhältnisse im untersuchten Bestand erklären könnte. Allerdings kann die Möglichkeit einer geringeren Assimilationsrate lebender Fichten im Vergleich zu den Tannen nicht ausgeschlossen werden, wonach die Epiphyten selbst für die Verteilung der NO3--Konzentration im Stammablauf der Untersuchungsbäume verantwortlich wären. Ein Einfluß des Mikroklimas auf die Flechtenverbreitung kann für einzelne Arten nicht ausgeschlossen werden, wohingegen ein Einfluß des Borkengehaltes eine untergeordnete Rolle spielt

Characterisation of the pathogenetic-relevant role of SF1 in adrenocortical carcinoma

Tumore der Nebennieren stellen häufige Tumore dar, welche bei mindestens 3 % der Population über 50-Jähriger vorkommen. Im Gegensatz dazu ist das Nebennierenrindenkarzinom mit einer Inzidenz von 1-2 Einwohner pro Million ein sehr seltener Tumor. Da seine Prognose allerdings ungünstig, und diese maßgeblich davon abhängt wie fortgeschritten der Tumor bei Diagnosestellung ist, ist es wichtig, dass die richtige Diagnose frühzeitig gestellt wird. Bis heute ist kein zuverlässiger immunhistochemischer Nebennierenrindenkarzinom-spezifischer Marker etabliert um das Nebennierenrindenkarzinom von anderen retroperitonealen Tumoren zu differenzieren. Sasano et al. schlug bereits 1995 erstmalig den Transkriptionsfaktor Steroidogenic Factor 1 (SF1) als Marker zur Differenzierung von Nebennierenrinden- und Nicht-Nebennierenrindentumoren vor. Allerdings wurde die diagnostische Wertigkeit bisher nur in sehr kleinen Fallserien mit insgesamt nur 17 Nebennierenrindenkarzinomen untersucht. In der vorliegenden Arbeit wurde die SF1 Protein-Expression bei 163 Nebennierenrindenkarzinomen, 52 Nebennierenrinden-Adenomen, 12 normalen steroidogenen Geweben (6 Nebennieren und 6 Ovare), sowie 73 Nicht-Steroidtumoren immunhistochemisch untersucht. Hierbei zeigte sich, das SF1 bei 158 von 161 evaluierbaren Nebennierenrindenkarzinomen und bei allen Proben von normalen und gutartigen Geweben (n=64) nachweisbar war. Im Gegensatz dazu war keine der 73 Nicht-Steroidgeweben SF1 positiv, so dass die diagnostische Genauigkeit extrem gut ist (Sensitivität: 98.6 %, Spezifität: 100 %, positive und negative predictive value jeweils 100 % und 97.3 %). In einem zweiten Schritt wurde untersucht ob die Protein-Expression von SF1 beim Nebennierenrindenkarzinom auch prognostische Bedeutung hat. Hierbei zeigte sich, dass Patienten mit Tumoren mit starker SF1 Färbung (30 %) ein deutlich schlechteres tumorstadium-adjustiertes Rezidiffreies- und Gesamt-Überleben haben als Patienten mit geringer SF1 Expression (hazard ratio: 2.45). Zusätzlich zu den immunhistochemischen Untersuchungen wurden FISH Analysen durchgeführt. Hierbei zeigte sich allerdings keine signifikante Korrelation zwischen SF1 Gendosis und der SF1 Protein-Expression, so dass zu vermuten ist, dass SF1 maßgeblich auf Transkriptions- und Translationsebene reguliert wird. In einem Versuch diese Frage zu beantworten wurden zwei mutmaßliche SF1 Interaktionspartner, FATE1 und DAX1, genauer immunhistochemisch untersucht. Hierbei wurde deutlich, dass FATE1 bei 62 von 141 evaluierbaren Nebenierenrindenkarzinomen und 12 von 62 normalen und gutartigen Geweben nachweisbar war. Im Gegensatz hierzu waren alle 9 Nicht-Steroidgewebe FATE1 negativ. Dies zeigt, das FATE1 nicht zur Diagnostik nutzbar ist (Sensitivität: 61 %, Spezifität: 100 %, positive und negative predictive value 100 % bzw. 14 %). Die DAX1 Analyse zeigte, dass alle 20 normalen und gutartigen Gewebe eine positive DAX1 Färbereaktion zeigten. Von 126 Nebennierenrindenkarzinomen waren 71 DAX1 positiv. Von den 8 untersuchten Nicht-Steroidgeweben waren 6 DAX1 positiv. Diese Ergebnisse belegen, dass auch DAX1 keine diagnostische Genauigkeit besitzt (Sensitivität: 56 %, Spezifität: 25 %, positive und negative predictive value 92 % bzw. 4 %). Die Untersuchung der prognostischen Fähigkeiten von FATE1 und DAX1 zeigte, dass Patienten mit Tumoren mit starker FATE1 Färbung (39 %) ein schlechteres tumorstadium-adjustiertes Gesamt- aber nicht Rezidiffreies-Überleben haben als Patienten mit niedriger FATE1 Protein-Expression (hazard ratio: 2.01). Weiterhin wurde deutlich, dass DAX1 keine deutlichen prognostischen Fähigkeiten besitzt. Zusammenfassend läßt sich aus der vorliegenden Arbeit folgern, das SF1 aktuell der beste diagnostische Marker zur Diagnose von Tumoren der Nebennierenrinde ist und damit Eingang in die histopathologische Routine-Diagnostik von Nebennierentumoren finden wird. Zusätzlich ist die SF1 Expression ein sehr guter prognostischer Marker beim Nebennierenrindenkarzinom, wobei sich die prognostische Aussage durch zusätzliche Färbung von FATE1 und DAX1 nur unwesentlich verbessern läßt.Adrenal tumors are common tumors which are present in at least 3 % in the human population over their 5th decade. However, adrenocortical carcinoma (ACC) is a rare malignancy which shows an approximate anual incidence of 1-2 per million. Prognosis of ACC is generally poor and depends strongly on the tumor stage. Thus, early and correct diagnosis is important. Until now, no reliable immunohistochemical ACC-specific marker has been established for its differentiation from other retroperitoneal tumors. Already in 1995, Sasano et al. suggested the transcription factor Steroidogenic Factor 1 (SF1) as useful marker for differentiation of adrenocortical and non-adrenocortical tumors. Up to now, SF1's value as diagnostic marker for ACC was investigated only in small series of in a total of 17 samples. In our work, SF1 expression was investigated by immunohistochemistry in 163 ACC, 52 adrenocortical adenomas, 12 normal steroidogenic tissues (6 adrenal glands and 6 ovaries), as well as 73 non-steroidogenic tumors. SF1 protein expression was shown in 158 of a total of 161 evaluable ACC, as well as all normal and benign steroidogenic tissues. In contrast, no SF1 protein was detectable in the non-steroidogenic tumors. Thus, SF1 protein expression is a highly specific diagnostic tool (sensitivity: 98.6 %, specificity: 100 %, positive and negative predictive value: 100 % and 97.3 %, respectively). In a second step, SF1 protein expression was investigated as a prognostic tool in ACC. As shown by us, ACCs presenting strong SF1 immunoreactivity (30 %) showed a strong correlation with overall and recurrence-free patients survival than ACCs presenting low SF1 protein expression (hazard ratio: 2.45). Moreover, FISH analyses were performed which revealed no significant correlation of SF1 gene dosis and SF1 protein expression, suggesting a regulatory mechanism at transcriptional and translational level. To investigate the hypothesis, we investigated two putative interaction partners of SF1, namely FATE1 and DAX1 protein, by immunohistochemistry. FATE1 protein was expressed in 62 of a total of 141 evaluable ACC as well as 12 of a total of 62 normal and benign steroidogenic tissues. In contrast, all non-steroidogenic tissues were FATE1 negative (n=9). Thus, FATE1 is no valuable diagnostic tool (sensitivity: 61 %, specificity: 100 %, positive and negative predictive value: 100 % and 14 %, respectively). DAX1 immunohistochemistry showed that all normal and benign steroidogenic tissues (n=20) were DAX1 positive as well as 71 of a total of 126 ACC samples. Furthermore, 6 out of a total of 8 non-steroidogenic tissues stained DAX1 positive, showing that DAX1 protein is no diagnostic tool (sensitivity: 50 %, specificity: 25 %, positive and negative predictive value: 92 % and 4 %, respectively). Investigation of the prognostic value of FATE1 and DAX1 revealed that patients with tumors characterized by strong FATE1 immunoreactivity (39 %) had a worse outcome in overall but not recurrence-free survival than patients showing low FATE1 expression (hazard ratio: 2.01). DAX1 protein expression has no prognostic value in ACC. In summary, we showed that SF1 is currently the best available diagnostic marker for differentiation of adrenocortical tumors from other retroperitoneal tumors, and that it will be suitable for histopathological diagnostic routine. Furthermore, SF1 expression is a well-suited prognostical tool in adrenocortical carcinoma which is only marginally enhanced by subsequent staining of FATE1 and DAX1 protein

Digitization Coordination at the Museum of Comparative Zoology and Harvard University Herbaria

&lt;p&gt;Museum of Comparative Zoology: Overview of MCZBase, the organization of MCZ, importance of digitization, coordination of operations in collections, investment and leadership.&lt;/p&gt; &lt;p&gt;Harvard University Herbaria (HUH): Overview, importance of digitization, coordination of operations in collections, investment and leadership.&lt;/p&gt; &lt;p&gt;Community priorities.&lt;/p&gt

Morphological and physiological reactions of young deciduous trees (Quercus robur L., Q-petraea [Matt.] Liebl., Fagus sylvatica L.) to waterlogging

One-year-old seedlings of Quercus robur L., Q. petraea (Matt.) Liebl. and Fagus sylvatica L. were cultivated in lysimeters and subjected to waterlogging for 17 weeks, interrupted by a five-week drainage period during summer. The growth of Q. robur was less affected by waterlogging than that of Q. petraea and Fagus. Waterlogging resulted in the formation of adventitious roots in Q. robur and Q. petraea, but not in Fagus. In contrast to Fagus, Q. robur and, to a lesser extent, Q. petraea were able to generate roots even below the water table. The hydraulic conductance of the excised root systems, the stomatal conductance and, in Fagus, the leaf water potential and the leaf-mass related hydraulic conductance were decreased by waterlogging. The decrease in the hydraulic conductance was largest in Fagus, and smallest in Q. robur. The roots of Fagus responded to anaerobic conditions with an increase in ethanol concentration. The measurements of nitrate reductase activities in roots and leaves provided no indications of a persistent contribution of NO3- metabolism to the alleviation of waterlogging-induced stress. It is concluded that Q. robur and, to a lesser extent, Q. petraea can tolerate waterlogging periods better than Fagus due to a different pattern of root formation, and to a better adjustment of leaf biomass production to the hydraulic conductivity of the root system