Synthesis and Characterization of New Near-Infrared Chromophores: Cyanine and Phenoxazine Derivatives

This thesis reports the synthesis of new near infrared dyes in three chapters. The first two chapters outline the synthetic procedure for synthesizing mono- and pentamethine cyanine dyes. The initial chapter encompasses the synthesis of asymmetric monomethine dyes with red-shifted optical properties. The second chapter involves the synthesis and assessment of new symmetrical quinolin-4-yl and phenanthridin-6-yl pentamethine dyes as potential oxidative DNA cleavage agents. The last chapter of the thesis details the synthesis and evaluation of new phenoxizinum dyes as contrast agents for insulunomia, a pancreatic cancer. Furthermore, all new compounds were characterized via NMR and their coherent optical properties were obtained

Ética empresarial, globalización y dirección de recursos humanos.

[email protected] [email protected] mucho tiempo, ética y empresa han sido conceptos que se han movido en planos de la realidad distintos. Hoy en día la situación ha evolucionado. Congresos, conferencias y medios de comunicación se ocupan de nuevo de unir las palabras ética y empresa, en concreto al hablar de ética empresarial. Es a partir de este momento cuando se comienza a experimentar un proceso profundo y acelerado de cambios, sin precedentes en la historia de la humanidad. Este cambio es voraz, complejo, turbulento e imprevisible, que llega de forma avasalladora e impregna todos los segmentos de la sociedad. Tales mutaciones imprimen un dinamismo tecnológico y científico, y las consecuentes revisiones de valores, de forma jamás vista, que alcanzan en pleno nuestra vida cotidiana y el de las organizaciones empresariales.Ethics and companies have been two different concepts representing two different worlds for quite a long time. Nowadays this situation has developed. Congresses, conferences and even mass media make us think of these words, ethics and corporations, as two connected entities, especially by dealing with corporate ethics. From íhat momení on, we started going through a deep and hasty process of changes, unparalleled in the history of mankind. This was a fierce, complex, íroubled and unforeseeable change which overwhelmed ah levels of society. Those mutations provided a íechnological and scientific dynamism which derived in ihe changing of values in an unprecedented way. Those changes reached every single aspectof our daily life, as well as the activity of the organisations

Gamification as a Pedagogical Model to Increase Motivation and Decrease Disruptive Behaviour in Physical Education

The application of gamified learning in physical education is becoming increasingly popular. The aim of this work was to compare the effects of gamification versus traditional methodology to check whether there were differences in the attitudes of the students. A quasi-experimental design study was carried out. The sample consisted of 66 students in Secondary Education. Three questionnaires, POSQ (Perception of Success), BPN (Basic Psychological Needs) and CCDEF (Disruptive Behaviour in Physical Education), were used in both groups before and after carrying out each proposal. Firstly, an independent samples Student’s t-test was performed. The results showed significant final differences in all variables except two: competence (p = 0.068) and aggressiveness (p = 0.136). Secondly, a paired samples t-test was performed. In this case, the control group showed a significant decrease in the variables task orientation (p = 0.004) and autonomy (p < 0.001). According to the experimental group, all variables showed significant differences (p < 0.05), except for two, competence (p = 0.223) and aggressiveness (p = 0.056). Therefore, it was concluded that, with the gamified learning, the students expressed higher levels of task orientation, all BPNs and lower levels of disruptive behaviours than the students who were subjected to the traditional methodology. This kind of intervention can help to improve the quality of education as set out in the SDGs through Quality Education

Regulation of the Activity of Integrins During the Cell Cycle

I compared the expression and activity of integrins in HeLa cells between interphase and mitosis. Cultures enriched in mitotic cells (>90%) were obtained by thymidine and nocodazole blocks. Early synchronisation experiments suggested that serum improved the rate of exit from metaphase in nocodazole-blocked cells. This was confirmed by quantification of postmetaphase cells at different times after release of the nocodazole block. Immunoprecipitation and immunoblotting showed that HeLa cells express at least three integrin subunits, probably alpha5, alphav and beta1. However, I could not detect beta3 subunits. Flow cytometry showed that integrins in HeLa cells were not expressed differently in mitosis and interphase. However, I found that, in spreading assays, cells arrested in metaphase with the microtubule inhibitor nocodazole were unable to spread on fibronectin, whereas control interphase cells spread normally in the presence of nocodazole. I could just detect spreading of mitotic cells on fibronectin if 1mM Mn2+ was present in the medium, or on glass surfaces in growth medium if the metaphase block was continued for 3-4 hours. Immunofluorescence showed that integrins were redistributed in this limited spreading, as well as in the process of respreading of non blocked, mitotic cells. Analysis of fibronectin receptor activity using affinity chromatography of detergent extracts on the cell binding fragment of fibronectin showed that the mitotic receptor partially loses its activity. No phosphorylation of either mitotic or interphase receptors could be detected by immunoprecipitation from 32P-labelled cells. I further investigated integrin phosphorylation and activity in cellular rounding caused by the phosphatase inhibitor calyculin A (CL-A), as it offered a possible model for cellular rounding at mitosis. Although fully spread HeLa cells did not respond to CL-A at concentreitions reported to specifically stimulate CDK activity (i.e. 1-2nM), cellular rounding was achieved at ~50nM CL-A. Fibronectin receptor activity was lost from CL-A-treated cells, to a much larger extent than from mitotic cells, but again no phosphorylation was detected. Interestingly, low concentrations of CL-A (0.5-2nM) caused small but significant improvement of cell spreading, both on haemoglobin and on fibronectin, at the early stages (i.e. less than 30 min.). However, this effect was reversed on the long term. Analysis of the biosynthesis of integrins during the cell cycle was also carried out using immunoprecipitation from [35]S-labelled cells. Asynchronous cultures were compared with cell populations enriched in Gl+S phases. The evidence suggests that, although there is a basal level of synthesis throughout the cell cycle, there may be a peak of synthesis in G2, especially of alpha subunits. The results also show the presence of a large cytoplasmic pool of beta subunit

Soluciones bioinformáticas para el análisis de datos ómicos, descubrimiento de conocimiento y diagnóstico genético en Sparus aurata y otros organismos biológicos

Esta tesis ha sido financiada por el Ministerio de Ciencia e Innovación a través de la ayuda “DI-17-09134” para contratos para la formación de doctores en empresas (Doctorados Industriales).Con el incremento de datos generados mediante el uso de las tecnologías de secuenciación, es necesario el diseño de protocolos y herramientas que permitan el análisis y la integración de los mismos con el objetivo de entender y comprender los sistemas biológicos que forman parte de cada estudio en particular. Estas herramientas, además, es preferible que sean intuitivas y de fácil manejo para los usuarios, de manera que puedan ser utilizadas por cualquier investigador y no solamente por aquellos que sean expertos o tengan un conocimiento más avanzado en el campo de la bioinformática. En esta tesis se presentan una serie de herramientas destinadas al análisis de datos procedentes de secuenciación para dar soporte a los estudios llevados a cabo en colaboración con distintas instituciones como son el Instituto de Acuicultura Torre de la Sal (IATS-CSIC), el Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Salamanca (IRNASA), la Fundación Jiménez Díaz, el Museo Nacional de Ciencias Naturales de CSIC y el Hospital General Universitario de Valencia. En primer lugar, se desarrolló e implementó un flujo de trabajo para el ensamblaje de novo y anotación de genomas eucariotas ricos en duplicaciones, el cual se incluyó en la herramienta DeNovoSeq. Este protocolo fue testado ensamblando de novo y anotando el genoma de Sparus aurata (dorada) a partir de datos de secuenciación aportados por el IATS-CSIC. Como resultado, este protocolo no solo permitió la obtención de un borrador de alta calidad del genoma de la dorada y con un tamaño (1,24 Gb) más próximo al esperado según el análisis de k-mer realizado, sino que permitió establecer una hipótesis sobre el origen de la mayor parte de las expansiones sufridas por el genoma de esta especie, sugiriendo que estas derivan de las actividades de los elementos genéticos móviles y de la respuesta inmunitaria como procesos para la adaptabilidad de la especie. En segundo lugar, se rediseñó y adaptó un pipeline, llamado VQS-haplotyper, a partir de un pipeline creado por Mercedes Guerrero-Murillo y Josep Gregori i Font, y basado en el paquete de R llamada QSutils, para la identificación y cuantificación de cuasiespecies en muestras procedentes de pacientes infectados por un virus concreto. En este caso, se utilizaron muestras de pacientes infectados por el virus SARS-CoV-2 proporcionadas por la Fundación Jiménez Díaz. La modificación del pipeline original nos permitió obtener los cambios de nucleótidos y deleciones que caracterizaban los haplotipos presentes en las muestras para una abundancia relativa mínima de 0,5% y 0,1%, obteniendo un total de 105 y 1.154 mutaciones y/o deleciones, respectivamente. De esta manera, VQS-haplotyper es capaz de detectar pequeños cambios en la secuencia de un virus que pueden influir en las características del mismo. En tercer lugar, se desarrollaron e implementaron dos protocolos para el análisis de datos RNA-seq, incluyendo el análisis de enriquecimiento de términos GO y rutas metabólicas, uno a partir de datos procedentes de secuenciación de novo, es decir, sin genoma de referencia disponible, y otro a partir de datos procedentes de resecuenciación, es decir, con genoma de referencia disponible. Estos dos protocolos se implementaron para dar soporte a diversos estudios utilizando muestras de las siguientes especies: Ornithodoros erraticus y Ornithorodos moubata, proporcionadas por el IRNASA; Anisakis pegreffii, Anisakis simplex s.s. y sus híbridos, proporcionadas por el Museo Nacional de Ciencias Naturales de CSIC; Homo sapiens, proporcionadas por el Hospital General Universitario de Valencia. Complementariamente al protocolo para el análisis RNA-seq sin genoma de referencia disponible, ha sido necesario desarrollar un protocolo para el ensamblaje de novo de transcriptomas consenso contra el que, posteriormente, se mapeen las lecturas. Ambas implementaciones han permitido conocer las diferencias entre distintas condiciones de estudio o entre distintas especies. Con ello, es posible establecer potenciales antígenos que puedan ser diana para posibles terapias o vacunas, dilucidar posibles relaciones y diferencias entre distintas especies o descubrir biomarcadores de, por ejemplo, cáncer. Por último, en colaboración con el IATS-CSIC, desarrollamos SAMBA (Structure-Learning of Aquaculture Microbiomes Using a Bayesian-Network Approach), una implementación informática de un modelo de red bayesiano para investigar cómo se relacionan entre sí los pan-microbiomas de los peces y todas las demás variables de un sistema acuícola concreto. SAMBA se basa en un modelo entrenable de red bayesiana que aprende la estructura de red de un sistema de acuicultura utilizando información de distintas variables bióticas y abióticas de importancia en la piscicultura, con especial atención a los datos microbianos proporcionados por la secuenciación de amplicones 16S. SAMBA acepta variables tanto cualitativas como cuantitativas y trata de forma convincente las diferencias en la composición microbiana derivadas de la variación técnica o biológica entre microbiomas de distintos especímenes. Para ello, SAMBA contiene una variedad de herramientas para preanalizar los datos y elegir una distribución para construir y entrenar el modelo de red bayesiana. Una vez creado y validado el modelo, el usuario puede interrogarlo y obtener información sobre el sistema modelizado en dos modos diferentes: “Report” y “Prediction”. En el modo “Report”, SAMBA informa de cómo el pan-microbioma y todas las demás variables que intervienen en el sistema de acuicultura modelizado se influyen mutuamente y cuáles son las probabilidades de cada relación. En el modo “Prediction”, la aplicación predice cómo cambiarían probablemente la diversidad y el perfil funcional del pan-microbioma en función de cualquier cambio realizado en otras variables. Finalmente, SAMBA implementa un completo editor gráfico de redes que permite navegar, editar y exportar los resultados. El funcionamiento de SAMBA ha sido testado y validado utilizando estándares de comunidades microbianas y comunidades de microbiota intestinal de doradas de piscifactoría (Sparus aurata) procedentes de diferentes ensayos de alimentación, arrojando un valor de precisión en todos los casos superior al 0,62. En definitiva, esta tesis ha contribuido no solamente con el desarrollo de protocolos y herramientas que permiten y facilitan el análisis y la integración de diferentes datos NGS, sino que, además, ha contribuido con nuevo conocimiento biológico en diversos campos de estudio.With the increase in data generated through the use of sequencing technologies, there is a need to design protocols and tools that allow the analysis and integration of these data in order to understand and comprehend the biological systems that are part of each particular study. These tools, moreover, should preferably be intuitive and user-friendly, so that they can be employed by any researcher and not only by those that are experts or have a more advanced knowledge in the field of bioinformatics. This thesis presents a series of tools for the analysis of sequencing data so as to provide support for the studies carried out in collaboration with different institutions such as Instituto de Acuicultura Torre de la Sal (IATS-CSIC), Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Salamanca (IRNASA), Fundación Jiménez Díaz, Museo Nacional de Ciencias Naturales de CSIC and Hospital General Universitario de Valencia. Firstly, a workflow for de novo assembly and annotation of duplication-rich eukaryotic genomes was developed and implemented, and was included in the DeNovoSeq tool. This protocol was tested by de novo assembly and annotation of the Sparus aurata (gilthead sea bream) genome from sequencing data provided by the IATS-CSIC. As a result, this protocol not only allowed us to obtain a high quality draft of the gilthead sea bream genome with a size (1.24 Gb) closer to the expected size according to the k-mer analysis performed, but also allowed us to establish a hypothesis about the origin of most of the expansions suffered by the genome of this species. This suggests that they derive from the activities of the mobile genetic elements and the immune response as processes for the adaptability of the species. Secondly, a pipeline, called VQS-haplotyper, was adapted and redesigned from a pipeline created by Mercedes Guerrero-Murillo and Josep Gregori i Font, and based on the R package called QSutils, to identify and quantify quasispecies in samples from patients infected by a specific virus. In this case, samples from patients infected by the SARS-CoV-2 virus provided by the Fundación Jiménez Díaz were used. The modification of the original pipeline allowed us to obtain nucleotide changes and deletions that characterized the haplotypes present in the samples for a minimum relative abundance of 0.5% and 0.1%, obtaining a total of 105 and 1,154 mutations and/or deletions, respectively. In this way, VQS-haplotyper is able to detect small changes in the sequence of a virus that can influence its characteristics. Thirdly, two protocols were developed and implemented to analyze RNA-seq data, including the enrichment analysis of GO terms and metabolic pathways, one from de novo sequencing data, i.e. with no reference genome available, and the other from resequencing data, i.e. with reference genome available. These two protocols were implemented to provide support for several studies using samples from the following species: Ornithodoros erraticus and Ornithodors moubata, provided by the IRNASA; Anisakis pegreffii, Anisakis simplex s.s. and their hybrids, provided by the Museo Nacional de Ciencias Naturales de CSIC and Homo sapiens, provided by the Hospital General Universitario de Valencia. Complementary to the protocol for RNA-seq analysis with no reference genome available, it has been necessary to develop a protocol for the de novo assembly of consensus transcriptomes against which, subsequently, the reads are mapped. Both implementations have provided insight into the differences between distinct study conditions or between distinct species. With this, it is viable to establish potential antigens that could be targets for possible therapies or vaccines, to elucidate possible relationships and differences between different species or to discover biomarkers of, for example, cancer. Finally, in collaboration with the IATS-CSIC, we developed SAMBA (Structure-Learning of Aquaculture Microbiomes Using a Bayesian-Network Approach), a computer implementation of a Bayesian network model to investigate how fish pan-microbiomes and all other variables in a given aquaculture system are related to each other. SAMBA is powered by a Bayesian network trainable model that learns the network structure of an aquaculture system using information from distinct biotic and abiotic variables of importance in fish farming, with special focus on microbial data provided from 16S amplicon sequencing. SAMBA accepts both qualitative and quantitative variables and convincingly deals with the differences in microbial composition derived by the technical or biological variation among microbiomes of distinct specimens. To this end, SAMBA is implemented with a variety of tools to pre-analyze the data and choose a distribution to build and train the Bayesian network model. Once the model has been created and validated, the user can interrogate the model and obtain information about the modelled system in two different modes: Report and Prediction. Using the Report mode SAMBA reports how the pan-microbiome and all other variables involved in the modelled aquaculture system influence each other and what the conditional probabilities of each relation are. Under the Prediction mode, the application predicts how the diversity and functional profile of the pan-microbiome would likely change depending on any alteration made on other variables. Finally, SAMBA implements a comprehensive graphical network editor allowing the user to navigate, edit and export outcomes. The performance of SAMBA has been tested and validated using microbial community standards and gut microbiota communities of farmed gilthead sea bream (Sparus aurata) from different feeding trials, giving an accuracy value in all cases higher than 0.62. In conclusion, this thesis has not only contributed to the development of protocols and tools that allow us to facilitate the analysis and integration of different NGS data, but has also contributed with new biological knowledge in various fields of study

Materias primas para la fabricación de clinker de cemento portland en el área de Madrid.

En Madrid y su area de influencia se ha incrementado la demanda de materiales de construcción, como consecuencia del espectacular desarrollo de las obras de infraestructura y de la edificación. Los problemas derivados del impacto ambiental y la futura expansión y/o renovación de las plantas de fabricación de cemento portland, aconsejan una investigación en el area, de las materias primas para la fabricación de clinker. Los materiales aflorantes en la cuenca Terciaria sobre la que se asienta Madrid, han sido divididos en tres unidades estratigráficas, con importantes diferencias litológicas. La Unidad Superior, presenta un volumen de mas de 1500 Mt de calizas de buena calidad para ser usadas como componente principal . La Unidad Inferior o Salina, esta formada localmente por sedimentos lutítico-arcillosos, que pueden ser usados en función de su naturaleza mineralógica y química, como un buen componente secundario. Estos materiales constituyen la materia prima para la fabricación de cerámica basta, por lo que en algunas zonas ambos tipos de uso deben de coexistir. Los yesos detríticos y primarios de la Unidad Intermedia, pueden ser usados como componente regulador de fraguado. Los modelos de dosificación elaborados muestran que no es necesaria la adición de un tercer componente al crudo del portland, para obtener una composición química adecuada

Percepción de salud apoyo social, relacionados a la responsabilidad en salud de la persona adulta mayor

"A nivel mundial el envejecimiento se considera un desafío para los sistemas de salud, el declive en el organismo a través de cambios moleculares trae consigo una disfunción de órganos y sistemas ocasionando enfermedades crónicas como la Hipertensión Arterial Sistémica. En México existen 6.8 millones de personas adultas mayores con esta enfermedad, lo que sitúa a este fenómeno como un tema de interés público. Por ello, nuestro objetivo será determinar la relación entre la percepción de salud y el apoyo social con la responsabilidad en salud de la persona con hipertensión arterial sistémica"

Infraestructura para la comunicación entre componentes Java en el estilo arquitectónico C2

En este trabajo se describe el diseñno y la implementación de una infraestructura para la comunicación entre componentes que sigan el estilo arquitectóonico C2 sobre una plataforma Java. Un requisito de esta infraestructura es que componentes y conectores se ejecuten cada uno en su propia máquina virtual (JVM) en el mismo nodo o en nodos diferentes. Se ha diseñado un conjunto de clases que proporcionan mecanismos para la comunicación entre componentes y conectores C2. Como parte del trabajo, se han evaluado las tecnologías disponibles para Java que permiten construir la infraestructura, habiéndose elegido la invocación remota a método (RMI) como la base para la comunicación entre los componentes del sistem

Earthen Architecture in childhood awareness for sustainable development

The work presented has been developed within the framework of the educational and diffusion activities promoted by the UNESCO Chair of Earthen Architecture, constructive cultures and sustainable development at its headquarters in the UPV (directed by F. Vegas and C. Mileto) in collaboration with the UPV Nursery School and UPV Summer School. Within this framework, we structured some activities focused on knowledge, promotion and development of earth as material associated with a wide range of constructive, sustainable and ecological techniques, being a former resort yet contemporary, linked to different cultures. The proposed workshops are an educational resource based on active methodologies ("learning by doing") because the students are who learn to build the various earthen techniques their own hands, actively and collaboratively to achieve a common goal, a small building which all participants are encouraging teamwork and collective participation.El trabajo presentado se ha desarrollado en el marco de las actividades didácticas y de difusión fomentadas por la Cátedra UNESCO de Arquitectura de tierra, culturas constructivas y desarrollo sostenible en su sede de la UPV (dirigida por F. Vegas y C. Mileto) y en colaboración con la Escuela Infantil UPV y la Escuela de Verano UPV. En este marco se han estructurado una serie de actividades centradas en el conocimiento, fomento y desarrollo de la tierra como material asociado a un amplio abanico de técnicas constructivas, sostenibles, ecológicas, tratándose de un recurso antiguo y a la vez contemporáneo, vinculado a diversas culturas. Los talleres propuestos constituyen un recurso pedagógico basado en las metodologías activas (“learning by doing”) ya que son los alumnos los que aprenden a construir las diversas técnicas de tierra con sus propias manos, de forma activa y colaborativa para conseguir un objetivo común, una pequeña construcción de la que todos sean partícipes, fomentando el trabajo en equipo y la participación colectiva

IX Campaña de excavaciones arqueológicas en el yacimiento romano de L’Horta Vella (Bétera, Valencia)

Resutados de la campaña de 2009