Early dissemination of OXA-72-producing Acinetobacter baumannii strain in Colombia: a case report

Nosocomial infections caused by carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates have reached epidemic levels in past decades. Currently this microorganism is responsible for outbreaks of difficult eradication and with high mortality rates worldwide. We herein report a rare case of an OXA-72-producing A. baumannii isolate colonizing a 47-year-old male patient with peritonitis due to abdominal stab wound, four years earlier than the first report of this carbapenemase in Acinetobacter pittii in Colombia. Although OXA-72 presents a low prevalence compared with OXA-23, our study demonstrated that A. baumannii isolates carrying the blaOXA-72 gene were present in the hospital environment in Colombia and could act as a reservoir for further spread to other Acinetobacter species, like A. pittii, causing carbapenem-resistance.ColcienciasUniversidad Nacional de ColombiaUniversidad Nacional de Colombia Medical School Microbiology DepartmentUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Disciplina de Infectologia Laboratório ALERTAUniversidad Nacional de Colombia Medical School Medicine DepartmentUNIFESP, Disciplina de Infectologia Laboratório ALERTAColciencias: 11010416355, Agreement 444Universidad Nacional de Colombia: 20201009713SciEL

Caracterización de aislamientos de Pseudomonas aeruginosa productores de carbapenemasas de siete departamentos de Colombia

Introduction: Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen that causes multiple infections in hospitalized patients. This microorganism has developed resistance to several antimicrobial agents, including carbapenems, which are considered to be the last therapeutic option against these infections. Carbapenem resistance of P. aeruginosa is mediated by different mechanisms: Carbapenemases class B (MBL) and A, alterations in the OprD expression and overexpression of the Mex efflux pump.Objective: To describe the presence of carbapenemases in P. aeruginosa isolates from seven Colombian provinces.Materials and methods: A total of 57 P. aeruginosa isolates were collected between September 2012 and March 2013 from national surveillance in Colombia and were sent to the Grupo de Microbiología at the Instituto Nacional de Salud (INS) for evaluation. Iidentification and antimicrobial susceptibility were confirmed through automated method (Vitek®2) and disk diffusion (Kirby-Bauer) according to the Clinical and Laboratory Standards Institute, CLSI, 2013. Phenotypic and genotypic confirmation was determined using the modified Hodge test (MHT), a synergism test using imipenem, EDTA-SMA and meropenem, and conventional PCR to detect the blaKPC, blaVIM, blaIMP and blaNDM genes.Results: Of the 57 isolates, two showed sensitivity to carbapenems. Forty-three isolates were positive for carbapenemases with a high percentage of sensitivity to colistin (76.4%, n=42). The 43 isolates producing carbapenemases showed multiple drug resistance: 72.1% were positive in the MHT and 79.1% showed MBL synergism. PCR amplification confirmed that 33 isolates were positive for blaVIM, nine were positive for blaKPC and one isolate expressed both KPC and VIM carbapenemases. No isolates showed amplified products with blaIMP and blaNDM primers.Conclusions: The most frequent carbapenemase was VIM, followed by KPC in an approximate ratio of 3:1.Introducción. Pseudomonas aeruginosa es un patógeno oportunista causante de múltiples infecciones en pacientes hospitalizados. Este microorganismo desarrolla fácilmente resistencia a diversos antimicrobianos, incluidos los carbapenémicos, considerados como la última opción terapéutica frente a estas infecciones. En P. aeruginosa la resistencia a los carbapenémicos está mediada por diferentes mecanismos: carbapenemasas de clases B (MBL) y A, alteraciones en la expresión de OprD e hiperexpresión de las bombas de expulsión Mex.Objetivo. Describir la presencia de carbapenemasas en aislamientos de P. aeruginosa resistentes a carbapenémicos procedentes de siete departamentos.Materiales y métodos. De septiembre de 2012 a marzo de 2013 se recibieron 57 aislamientos de P. aeruginosa en el Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud. Su identificación y perfil de sensibilidad se confirmó por Vitek2® y técnica de difusión de disco (Kirby-Bauer) y los resultados se interpretaron según las guías del Clinical and Laboratory Standards Institute del 2013. Las carbapenemasas se detectaron fenotípicamente con el test modificado de Hodge y la prueba de sinergia para MBL usando los inhibidores EDTA-SMA, y genotípicamente con PCR convencional para los genes blaKPC, blaVIM, blaIMP y blaNDM.Resultados. De los 57 aislamientos remitidos, dos fueron sensibles a carbapenémicos y, de los 55 restantes, en 43 se confirmó la presencia de carbapenemasas; el mayor porcentaje de sensibilidad se presentó frente a la colistina (96,4 %; n=53). Los 43 aislamientos productores de carbapenemasas presentaron perfil de multirresistencia: 76,7 % fue positivo con el test modificado de Hodge y 79,1 % presentó sinergia con MBL. Treinta y tres aislamientos fueron positivos para blaVIM, nueve para blaKPC y un aislamiento fue productor tanto de carbapenemasas KPC como de VIM. Ningún aislamiento amplificó para blaIMP y blaNDM.Conclusiones. La carbapenemasa más frecuente fue la VIM seguida de la KPC en una relación aproximada de 3:1

Results of the national surveillance of antimicrobial resistance of Enterobacteriaceae and Gram negative bacilli in health care-associated infections in Colombia, 2012-2014

Introduction: The Colombian National Antimicrobial Resistance Monitoring System for the surveillance of healthcare-associated infections was set up to meet this problem in the third quarter of 2012. Objective: To describe resistance profiles and laboratory-based surveillance based on the information collected by the System. Materials and methods: We conducted a retrospective and descriptive study of the information notified to the Colombian Public Health Surveillance System (Sivigila), and in the Whonet databases covering the period from July 2012 to December 2014 provided by the primary data-generating units in the country, as well as laboratory surveillance results from 1,642 phenotypic and genotypic tests on carbapenemase isolates (927 from Enterobacteriaceae, 614 from Pseudomonas spp. and 101 from Acinetobacter spp.). Results: There was a significant increase in Escherichia coli resistance to third-generation cephalosporins (reaching 26.3% in ICUs and 22.5% in other hospital wards), and Klebsiella pneumoniae resistance to ertapenem also increased (reaching 14.6% in ICUs). Acinetobacter baumannii carbapenem resistance exceeded 50% in ICUs whereas Pseudomonas aeruginosa had lower carbapenem resistance (38.8%). KPC (n = 574) and NDM (n=57) were the most frequently occurring carbapenemases in Enterobacteriaceae, VIM (n=229) and KPC (n=114) in P. aeruginosa, and OXA-23 in A. baumannii (n=87); several carbapenemase combinations were identified, KPC + VIM being the most common in Pseudomonas spp. and Enterobacteriaceae. Conclusion: The data from the surveillance of healthcare-associated infections revealed significant carbapenem resistance profiles and antimicrobial resistance mechanisms circulating in Colombian healthcare institutions

Diseminación de Klebsiella pneumoniae productoras de KPC-3 en hospitales de Bogotá durante un periodo de tres años

Introduction: One of the major worldwide public health problems today are the infections caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE), among which carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP), constitutes one of the most common pathogens causing nosocomial infection.Objective: This study was aimed at describing the dissemination of KPC-3 enzyme-producing Klebsiella pneumoniae in clinical isolates from hospitals in Bogotá.Materials and methods: Eighty-two CRKP isolates collected from 10 hospitals in Bogota from 2008-2010 were analysed; disk diffusion and microdilution were used for phenotypic detection of enzymes and PCR for genotyping. Automated and manual methods were used for determining profiles for antimicrobial susceptibility testing (AST) with 13 agents. PFGE was used for obtaining the isolates’ genetic relationship.Results: This study gives an overview of CRKP to present resistance to multiple antibiotic families. The CRKPs were grouped in different clones, each having different subtypes, and were spread in the 10 hospitals over the three-year period (2008-2010).Conclusions: The dissemination of KPC-3-producing Klebsiella pneumoniae nosocomial isolates in Bogotá highlights the need for strengthening epidemiological surveillance against this type of microorganism and the development of specific priority activities for preventing and controlling such infection. Introducción. Uno de los principales problemas de salud pública a nivel mundial son las infecciones producidas por enterobacterias resistentes a los carbapenémicos, entre las cuales Klebsiella pneumoniae es uno de los patógenos que con mayor frecuencia causa infecciones en el ámbito hospitalario.Objetivo. El objetivo del estudio fue describir la diseminación de aislamientos clínicos de K. pneumoniae productores de la enzima KPC-3 recuperados en hospitales de Bogotá.Materiales y métodos. Se analizaron 82 aislamientos de K. pneumoniae resistentes a antibióticos carbapenémicos recuperados entre el 2008 y el 2010 en 10 hospitales, a los cuales se les realizaron pruebas de detección fenotípica de enzimas por difusión de disco y microdilución, y de detección genotípica por PCR. La determinación de perfiles de sensibilidad frente a 13 antimicrobianos se realizó por métodos automatizados y manuales. La relación genética de los aislamientos se obtuvo por la técnica de PFGE.Resultados. Este estudio presenta el panorama del comportamiento de las enterobacterias resistentes a los carbapenémicos diseminadas en el curso de tres años en 10 hospitales de la ciudad, con características de resistencia a múltiples familias de antibióticos y pertenecientes a varios grupos de clones, cada uno con diferentes subtipos.Conclusiones. La diseminación de aislamientos clínicos de K. pneumoniae productores de enzima KPC-3 en Bogotá plantea la necesidad de fortalecer las acciones de vigilancia epidemiológica frente a este tipo de microorganismos y el desarrollo prioritario de actividades específicas de prevención y control de infecciones

The spread of KPC-3 Klebsiella pneumoniae in hospitals in Bogotá over a three-year period (2008-2010)

Introducción. Uno de los principales problemas de salud pública a nivel mundial son las infecciones producidas por enterobacterias resistentes a los carbapenémicos, entre las cuales Klebsiella pneumoniae es uno de los patógenos que con mayor frecuencia causa infecciones en el ámbito hospitalario. Objetivo. El objetivo del estudio fue describir la diseminación de aislamientos clínicos de K. pneumoniae productores de la enzima KPC-3 recuperados en hospitales de Bogotá. Materiales y métodos. Se analizaron 82 aislamientos de K. pneumoniae resistentes a antibióticos carbapenémicos recuperados entre el 2008 y el 2010 en 10 hospitales, a los cuales se les realizaron pruebas de detección fenotípica de enzimas por difusión de disco y microdilución, y de detección genotípica por PCR. La determinación de perfiles de sensibilidad frente a 13 antimicrobianos se realizó por métodos automatizados y manuales. La relación genética de los aislamientos se obtuvo por la técnica de PFGE. Resultados. Este estudio presenta el panorama del comportamiento de las enterobacterias resistentes a los carbapenémicos diseminadas en el curso de tres años en 10 hospitales de la ciudad, con características de resistencia a múltiples familias de antibióticos y pertenecientes a varios grupos de clones, cada uno con diferentes subtipos. Conclusiones. La diseminación de aislamientos clínicos de K. pneumoniae productores de enzima KPC-3 en Bogotá plantea la necesidad de fortalecer las acciones de vigilancia epidemiológica frente a este tipo de microorganismos y el desarrollo prioritario de actividades específicas de prevención y control de infecciones.224-231Introduction: One of the major worldwide public health problems today are the infections caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE), among which carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP), constitutes one of the most common pathogens causing nosocomial infection. Objective: This study was aimed at describing the dissemination of KPC-3 enzyme-producing Klebsiella pneumoniae in clinical isolates from hospitals in Bogotá. Materials and methods: Eighty-two CRKP isolates collected from 10 hospitals in Bogotá from 2008-2010 were analysed; disk diffusion and microdilution were used for phenotypic detection of enzymes and PCR for genotyping. Automated and manual methods were used for determining profiles for antimicrobial susceptibility testing (AST) with 13 agents. PFGE was used for obtaining the isolates’ genetic relationship. Results: This study gives an overview of CRKP patterns in 10 hospitals in Bogota which were found to present resistance to multiple antibiotic families. The CRKPs were grouped in different clones, each having different subtypes, and were spread in the 10 hospitals over the three-year period (2008-2010). Conclusions: The dissemination of KPC-3-producing Klebsiella pneumoniae nosocomial isolates in Bogota highlights the need for strengthening epidemiological surveillance against this type of microorganism and the development of specific priority activities for preventing and controlling such infection

Perfil de sensibilidad antimicrobiana de microorganismos causantes de infecciones urinarias adquiridas en la comunidad en pacientes con diabetes mellitus en Colombia

Introduction: Urinary tract infection is the most common pathology in diabetic patients, and an important determinant of morbidity and mortality among them. The increasing resistance of uropathogens acquired in the community to commonly used antibiotics is alarming.Objective: To identify the profile of antibiotic susceptibility of uropathogens responsible for communityacquired infections among diabetic patients in hospitals in Colombia.Materials and methods: We conducted a descriptive study in a subgroup of diabetic patients in the framework of a larger study in adults with urinary tract infection acquired in the community. Over one year, we collected Escherichia coli, Klebsiella spp. and Proteus mirabilis isolates from nine hospitals in Colombia. Their susceptibility profile was determined using microbiological and molecular methods to establish the presence of extended-spectrum AmpC betalactamases and KPC carbapenemases.Results: We collected 68 isolates (58 E. coli, nine Klebsiella spp. and one Proteus mirabilis). Four (6.9%) of the E. coli isolates expressed extended spectrum betalactamases, two (3.4%) of them belonged to the phylogenetic group B2 and to ST131 clone and expressed the TEM-1 and CTM-X-15 betalactamases. The AmpC phenotype was found in four (6.9%) of the E. coli isolates, three of which produced TEM-1 and CMY-2 betalactamases. One K. pneumoniae isolate expressed the KPC-3 carbapenemase. Conclusion: The presence of extended spectrum betalactamases and carbapenemases in uropathogens responsible for community-acquired infection was confirmed in diabetic patients.Introducción. La infección de las vías urinarias es la más frecuente en pacientes diabéticos, y es un factor determinante de la morbilidad y la mortalidad en este grupo de pacientes. El aumento de la resistencia de los microorganismos adquiridos en la comunidad a los antibióticos comúnmente utilizados para combatirla es alarmante.Objetivo. Determinar el perfil de sensibilidad a los antibióticos de los microorganismos responsables de infecciones urinarias adquiridas en la comunidad en pacientes diabéticos atendidos en algunos hospitales de Colombia.Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo de un subgrupo de pacientes diabéticos en el marco de una investigación en adultos con infección de origen comunitario de las vías urinarias. Durante un año, se recolectaron aislamientos de Escherichia coli, Klebsiella spp. y Proteus mirabilis en nueve hospitales de Colombia y se determinó su perfil de sensibilidad mediante métodos microbiológicos y moleculares, para establecer la presencia de betalactamasas de espectro extendido del tipo AmpC y de carbapenemasas del tipo KPC.Resultados. Se recolectaron 68 aislamientos (58 de E. coli, nueve de Klebsiella spp. y uno de P. mirabilis). Cuatro (6,9 %) de los aislamientos de E. coli expresaron dichas betalactamasas, en dos (3,4 %) de ellos, pertenecientes al grupo filogenético B2 y al clon ST131, se detectaron las betalactamasas TEM-1 y CTM-X-15. En otros cuatro (6,9 %) aislamientos de E. coli se encontró el fenotipo AmpC, y en tres de ellos se produjeron las betalactamasas TEM-1 y CMY-2. Un aislamiento de K. pneumoniae expresó la carbapenemasa KPC-3.Conclusión. Se confirmó la presencia de cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido y carbapenemasas en microorganismos responsables de infección urinaria adquirida en la comunidad en pacientes diabéticos

Anti-microbial sensitivity of enterobacteria identified in community-acquired urinary tract infection in pregnant women in 9 Colombian hospitals

Introducción: La infección del tracto urinario adquirida en la comunidad, es la patología infecciosa más frecuente durante el embarazo y un factor de riesgo importante para parto pretérmino y bajo peso al nacer; se desconoce la frecuencia de la resistencia a las diferentes alternativas terapéuticas en Colombia. Métodos: Se realizó un estudio descriptivo de infecciones urinarias de la comunidad que requirieron hospitalización y se analizó el subgrupo de gestantes. Se recolectaron durante 12 meses aislamientos de Escherichia coli, Klebsiella spp .y Proteus mirabilis en 9 hospitales de Colombia y se determinó su perfil de susceptibilidad, por microdilución en caldo y pruebas de difusión por gradiente, y se caracterizó la presencia de betalactamasas de espectro extendido, con métodos microbiológicos y moleculares. Resultados: Se recogieron 74 aislamientos (64 de E. coli, 7 de Klebsiella spp. y 3 de P. mirabilis) en 73 pacientes. En 58% de las pacientes se reportó uso previo de antibióticos. La resistencia a ampicilina/sulbactam, cefazolina y ceftriaxona fue de 15,6%, 17,2% y 4,7%, respectivamente. Tres aislamientos, dos de E. coli y uno de Klebsiella spp., expresaron betalactamasas de espectro extendido (3,1%, en E. coli y 14,3% Klebsiella spp.) Un aislamiento de E. coli expresó enzimas tipo AmpC. Conclusión: Se confirmó la presencia de cepas resistentes a cefalosporinas de tercera generación en enterobacterias responsables de infección del tracto urinario adquirida en la comunidad en embarazadas, producida por enzimas de tipo beta lactamasas de espectro extendido tipo CTX M-15 y AmpC.Objective: To identify sensitivity profiles of the main anti-microbial agents used in the management of community-acquired urinary tract infection in pregnant women, and to make the molecular characterisation in order to confirm the existence of bacterial resistance in this population group.Materials and methods: Descriptive cross-sectional study that included pregnant women with community-acquired urinary tract infection requiring admission to hospital. They were part of a study conducted in the general population. The microbiological results of the urine cultures were analysed. Isolates of Escherichia coli, Klebsiella spp. and Proteus mirabilis were identified over a period of 12 months in 9 Colombian hospitals, and their sensi-tivity profiles were determined using microdilution broth and gradient diffusion tests, and the presence of extended spectrum beta-lactamases was charac-terised using microbiological and molecular methods. The sociodemographic and clinical characteristics of these patients are presented.Results: Overall, 74 isolates were collected (64 E. coli, 7 Klebsiella spp. and 3 P. mirabilis isolates) in 73 patients. Prior use of antibiotics was documented in 58% of the patients. Resistance to ampicillin/sulbactam, cefazolin and ceftriaxone was 15.6%, 17.2% and 4.7%, respectively. There was extended spectrum beta-lactamase expression in three of the isolates, 2 of E. coli and 1 of Klebsiella spp. (3.1% E. coli and 14.3% Klebsiella spp.) One E. coli isolate expressed enzymes of the AmpC type.Conclusion: The presence of resistant strains to antibiotics used as first-line empirical treatment and to third-generation cephalosporins was confirmed in enterobacteria responsible for community-acquired urinary tract infection in pregnant women, produced by type CTX M-15 and AmpC extended spectrum betalactamase enzymes.Key words: Urinary tract infections, pregnancy, enterobacteria, microbial drug resistance, beta-lactamases

Perfil de sensibilidad antimicrobiana de microorganismos causantes de infecciones urinarias adquiridas en la comunidad en pacientes con diabetes mellitus en Colombia

Introducción. La infección de las vías urinarias es la más frecuente en pacientes diabéticos, y es un factor determinante de la morbilidad y la mortalidad en este grupo de pacientes. El aumento de la resistencia de los microorganismos adquiridos en la comunidad a los antibióticos comúnmente utilizados para combatirla es alarmante. Objetivo. Determinar el perfil de sensibilidad a los antibióticos de los microorganismos responsables de infecciones urinarias adquiridas en la comunidad en pacientes diabéticos atendidos en algunos hospitales de Colombia. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo de un subgrupo de pacientes diabéticos en el marco de una investigación en adultos con infección de origen comunitario de las vías urinarias. Durante un año, se recolectaron aislamientos de Escherichia coli, Klebsiella spp. y Proteus mirabilis en nueve hospitales de Colombia y se determinó su perfil de sensibilidad mediante métodos microbiológicos y moleculares, para establecer la presencia de betalactamasas de espectro extendido del tipo AmpC y de carbapenemasas del tipo KPC. Resultados. Se recolectaron 68 aislamientos (58 de E. coli, nueve de Klebsiella spp. y uno de P. mirabilis). Cuatro (6,9 %) de los aislamientos de E. coli expresaron dichas betalactamasas, en dos (3,4 %) de ellos, pertenecientes al grupo filogenético B2 y al clon ST131, se detectaron las betalactamasas TEM-1 y CTM-X-15. En otros cuatro (6,9 %) aislamientos de E. coli se encontró el fenotipo AmpC, y en tres de ellos se produjeron las betalactamasas TEM-1 y CMY-2. Un aislamiento de K. pneumoniae expresó la carbapenemasa KPC-3. Conclusión. Se confirmó la presencia de cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido y carbapenemasas en microorganismos responsables de infección urinaria adquirida en la comunidad en pacientes diabéticos.Q4Q3Artículo original353-36

Resultados de la vigilancia nacional de la resistencia antimicrobiana de enterobacterias y bacilos Gram negativos no fermentadores en infecciones asociadas a la atención de salud, Colombia, 2012-2014

Introduction: The Colombian National Antimicrobial Resistance Monitoring System for the surveillance of healthcare-associated infections was set up to meet this problem in the third quarter of 2012.Objective: To describe resistance profiles and laboratory-based surveillance based on the information collected by the System.Materials and methods: We conducted a retrospective and descriptive study of the information notified to the Colombian Public Health Surveillance System (Sivigila), and in the Whonet databases covering the period from July 2012 to December 2014 provided by the primary data-generating units in the country, as well as laboratory surveillance results from 1,642 phenotypic and genotypic tests on carbapenemase isolates (927 from Enterobacteriaceae, 614 from Pseudomonas spp. and 101 from Acinetobacter spp.).Results: There was a significant increase in Escherichia coli resistance to third-generation cephalosporins (reaching 26.3% in ICUs and 22.5% in other hospital wards), and Klebsiella pneumoniae resistance to ertapenem also increased (reaching 14.6% in ICUs). Acinetobacter baumannii carbapenem resistance exceeded 50% in ICUs whereas Pseudomonas aeruginosa had lower carbapenem resistance (38.8%). KPC (n = 574) and NDM (n=57) were the most frequently occurring carbapenemases in Enterobacteriaceae, VIM (n=229) and KPC (n=114) in P. aeruginosa, and OXA-23 in A. baumannii (n=87); several carbapenemase combinations were identified, KPC + VIM being the most common in Pseudomonas spp. and Enterobacteriaceae.Conclusion: The data from the surveillance of healthcare-associated infections revealed significant carbapenem resistance profiles and antimicrobial resistance mechanisms circulating in Colombian healthcare institutions.Introducción. En el tercer trimestre de 2012, comenzó a operar el Sistema Nacional de Vigilancia de Resistencia Antimicrobiana en las infecciones asociadas a la atención en salud, con el fin de recabar y analizar la información referente al problema en Colombia.Objetivo. Describir los perfiles de resistencia y los resultados de la vigilancia por el laboratorio con base en los datos recolectados en el Sistema.Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo y retrospectivo con base en la información del Sistema Nacional de Vigilancia en Salud Pública, Sivigila, 1 de septiembre de 2012 a 31 de diciembre de 2014, así como de las bases de datos Whonet con los datos notificados por las unidades primarias generadoras de datos y los resultados de la confirmación por el laboratorio de la caracterización fenotípica y genotípica de la resistencia a carbapenemasas en 1.642 aislamientos (927 de enterobacterias, 614 de Pseudomonas spp. y 101 de Acinetobacter spp.).Resultados. La resistencia de Escherichia coli a las cefalosporinas de tercera generación presentó un incremento significativo, alcanzando 26,3 % en unidades de cuidados intensivos y 22,5 % en otras áreas de hospitalización. La resistencia a ertapenem de Klebsiella pneumoniae registró un incremento y alcanzó 14,6 % en unidades de cuidados intensivos. La resistencia de Acinetobacter baumannii a los carbapenémicos superó el 50 % en dichas unidades, en tanto que en Pseudomonas aeruginosa se presentaron porcentajes más bajos (38,8 %). Las carbapenemasas más frecuentes en enterobacterias fueron la KPC (n=574), seguida de la NDM (n=57); en P. aeruginosa, la VIM (n=229) y la KPC (n=114), y en A. baumannii, la OXA-23 (n=87). Se detectaron varias combinaciones de carbapenemasas, siendo la de KPC y VIM la más frecuente en Pseudomonas spp., y en enterobacterias.Conclusión. La información obtenida a partir del Sistema Nacional de Vigilancia ha permitido conocer los perfiles y los mecanismos de resistencia a carbapenémicos de las cepas que están circulando en las instituciones de salud del país

Caracterización de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en aislamientos clínicos colombianos de Salmonella enterica no tifoidea 1997 – 2022.

Introduction: Salmonella spp., is a zoonotic pathogen transmitted to humans through contaminated water or food. The presence of extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) is a growing public health problem because these enzymes are resistant to third and fourth generation cephalosporins.Objective: To characterize ESBL in Salmonella spp. isolates received by the Acute Diarrheal Disease/Foodborne Disease surveillance program of the Microbiology Group of the National Institute of Health.Materials and methods: Between 1997 and June 2022, 444 Salmonella spp. isolates were obtained, resistant to at least one of the cephalosporins. The ESBL phenotypic detection was performed by the double disk test. DNA extraction was carried out by boiling and with PCR the detection of blaCTX-M, blaSHV and blaTEM type genes was carried out.Results: All the isolates were positive for the ESBL test. The genes identified were: blaCTX-M + blaTEM (n=200), blaCTX-M (n=177), blaSHV (n=16), blaSHV + blaCTX-M (n=6), blaTEM (n=13) y blaSHV + blaCTX-M + blaTEM (n=3) finally, 26 isolates were negative for all evaluated genes. Positive ESBL isolates are identified in Bogotá and 21 departments additionally; Choco, Magdalena, Meta, Bolívar, Casanare, Cesar, Córdoba, Quindío, Atlántico, Tolima, Cauca, Cundinamarca, Huila, Boyacá, Caldas, Norte de Santander, Risaralda, Antioquia, Nariño, Santander y Valle del Cauca.Conclusion: Resistance to third generation cephalosporins in Salmonella spp. isolates was mainly caused by blaCTX-M and resistance to Ampicillin, Tetracycline, Chloramphenicol and Trimethoprim-sulfamethoxazole was present in 44% (197/444). The most frequent ESBL carrier serotypes were S. Typhimurium and S. Infantis.Introducción. Salmonella spp., es un patógeno zoonótico transmitido al humano a través de agua o alimentos contaminados. La presencia de betalactamasas de espectro extendido (BLEE), es un creciente problema para la salud pública debido a que estas enzimas confieren resistencia a cefalosporinas de tercera y cuarta generación.Objetivo. Caracterizar BLEE en aislamientos de Salmonella spp., recibidos por el programa de vigilancia Enfermedad Diarreica Aguda/Enfermedad Transmitida por Alimentos, del Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud.Materiales y métodos. Entre 1997 y junio de 2022, se recibieron 444 aislamientos de Salmonella spp. resistentes a por lo menos una de las cefalosporinas de tercera generación. La detección fenotípica de BLEE se realizó por la prueba de doble disco. La extracción de ADN se realizó por ebullición y con PCR se realizó la detección de genes tipo blaCTX-M, blaSHV y blaTEM.Resultados. Todos los aislamientos fueron positivos para prueba BLEE. Los genes identificados fueron: blaCTX-M + blaTEM (n=200), blaCTX-M (n=177), blaSHV (n=16), blaSHV + blaCTX-M (n=6), blaTEM (n=13) y blaSHV + blaCTX-M + blaTEM (n=3) y 26 aislamientos fueron negativos para los genes evaluados. Los aislamientos BLEE positivos se identificaron en la ciudad de Bogotá, así como en 21 departamentos; Choco, Magdalena, Meta, Bolívar, Casanare, Cesar, Córdoba, Quindío, Atlántico, Tolima, Cauca, Cundinamarca, Huila, Boyacá, Caldas, Norte de Santander, Risaralda, Antioquia, Nariño, Santander y Valle del Cauca.Conclusión. La resistencia a cefalosporinas de tercera generación en aislamientos de Salmonella spp., fue dada principalmente por blaCTX-M y presentaron resistencia a Ampicilina, Tetraciclina, Cloranfenicol y Trimetroprim-sulfametoxazol en 44% (197/444). Los serotipos más frecuentemente portadores de BLEE fueron S. Typhimurium y S. Infantis