Comparative analysis of whole flower transcriptomes in the Zingiberales

The advancement of next generation sequencing technologies (NGS) has revolutionized our ability to generate large quantities of data at a genomic scale. Despite great challenges, these new sequencing technologies have empowered scientists to explore various relevant biological questions on non-model organisms, even in the absence of a complete sequenced reference genome. Here, we analyzed whole flower transcriptome libraries from exemplar species across the monocot order Zingiberales, using a comparative approach in order to gain insight into the evolution of the molecular mechanisms underlying flower development in the group. We identified 4,153 coding genes shared by all floral transcriptomes analyzed, and 1,748 genes that are only retrieved in the Zingiberales. We also identified 666 genes that are unique to the ginger lineage, and 2,001 that are only found in the banana group, while in the outgroup species Dichorisandra thyrsiflora J.C. Mikan (Commelinaceae) we retrieved 2,686 unique genes. It is possible that some of these genes underlie lineage-specific molecular mechanisms of floral diversification. We further discuss the nature of these lineage-specific datasets, emphasizing conserved and unique molecular processes with special emphasis in the Zingiberales. We also briefly discuss the strengths and shortcomings of de novo assembly for the study of developmental processes across divergent taxa from a particular order. Although this comparison is based exclusively on coding genes, with particular emphasis in transcription factors, we believe that the careful study of other regulatory mechanisms, such as non-coding RNAs, might reveal new levels of complexity, which were not explored in this work

Distribution of the anther-smut pathogen Microbotryum on species of the Caryophyllaceae

Artículo de publicación ISIUnderstanding disease distributions is of fundamental and applied importance, yet few studies benefit from integrating broad sampling with ecological and phylogenetic data. Here, anther-smut disease, caused by the fungus Microbotryum, was assessed using herbarium specimens of Silene and allied genera of the Caryophyllaceae. • A total of 42 000 herbarium specimens were examined, and plant geographical distributions and morphological and life history characteristics were tested as correlates of disease occurrence. Phylogenetic comparative methods were used to determine the association between disease and plant life-span. • Disease was found on 391 herbarium specimens from 114 species and all continents with native Silene. Anther smut occurred exclusively on perennial plants, consistent with the pathogen requiring living hosts to overwinter. The disease was estimated to occur in 80% of perennial species of Silene and allied genera. The correlation between plant life-span and disease was highly significant while controlling for the plant phylogeny, but the disease was not correlated with differences in floral morphology. • Using resources available in natural history collections, this study illustrates how disease distribution can be determined, not by restriction to a clade of susceptible hosts or to a limited geographical region, but by association with host life-span, a trait that has undergone frequent evolutionary transitions.We acknowledge grant support from the John Simon Guggenheim Memorial Foundation and the National Science Foundation (DEB-0747222) to MEH, the National Science Foundation Minority Postdoctoral Fellowship (DBI-0706721) to JIMA, University of Chile awards PFB-23 and ICM P05-002 to MTKA, and The Swedish Research Council for Environment, Agricultural Sciences and Spatial Planning (FORMAS) support to BO, and Royal Society Incoming Fellowship and Center for Infection, Immunity, and Evolution Advanced Fellowship to ABP

Structural and Functional Loss in Restored Wetland Ecosystems

In restored wetland ecosystems with apparently natural hydrology and biological structure, biogeochemical function may remain degraded, even a century after restoration efforts

Desarrollo y evaluación de métodos de diagnóstico de la tripanosomiasis americana en Colombia, (trypanosoma Cruzi y T. Rangeli), utilizando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR)

IP 1105-04-181-95enfermedad de chagas / Julio C. Carranza. ... [et al.]. --En:Congreso Asociacion Colombiana de Ciencias;Biologicas (32 : 1997 : Tolima). -- Cardenas Arroyo, Felipe. trypanosoma (tejeraza) rangeli en el departamento;del Tolima / Gustavo Adolfo Vallejo. ... [et al.]. -- En:Congreso Asociacion Colombiana de Ciencias;Biologicas (32 : 1997 : Tolima). -- Amplificacion multiplex deKADN la deteccion de trypanosoma cryzi y T.;rangeli en vectores y hospederos vertebrados / Gustavo AdolfoVallejo. ...[et al.]. -- En: Congreso Latino;Americano de parasitologia (13 :1997 nov : 17-23 : La Habana).-'- Aislamiento de ADN de trypanosoma cruzi a;(tejeraia) rangeli en el departamento del Tolima. Lozano LeyderE. ...[etal.]. -- En: Congreso Nacional de;Ciencias Biologicas (32 : 1997). -- Amplificacion multiplex dekadn la deteccion de trypanosoma cryzi y t.;rangeli en vectores y hospederos vertebrados / Gustavo AdolfoVallejo. --En: Congreso Latino Americano de;'-- Importancia de didelphis marsupialis Como revertorio detrypanosoma (schizotrypanum) cruzi y trypanosoma;parasitologia (13 : 1997 nov. 17-23 : Cuba, la Habana).--Amplificacion por PCR del kDNA y genes de mini-exon;para el diagnostico directo y caracterizacion de trypanosoma cruzi y T. rangeli en vectores domesticos y;silvestres en tres regiones endemicas de Colombia / Gustavo Adolfo Vallejo... [et al.]. -- En: Congreso;Nacional de Ciencias Biologicas (33 : 1998 oct : 14-17 : Ibague). -- Diagnostico directo y caracterizacion de;tryponosoma cruzi y T. rangeli en Didelphis marsupialis utilizando PCR deregiones de kDNA y genes de;mini-exon / Gustavo Adolfo Vallejo. ... [et al.]. -- En: Congreso Nacionalde Ciencias Biologicas (33 : 1998;oct : 14-17 : Ibague). -- Divergencia genetica entre poblaciones domesticas y silvestres de trypanosoma;rangeli en Colombia, confirmada mediante amplificacion aleatoriade DNA (RAPDs) / Gustavo Adolfo Vallejo. ...;[et al.]. -- En: Congreso Nacional de Ciencias Biologicas(33:1998 oct :14-17 : Ibague). -- Diferencias en;las secuencias de los mini circulos de kDNA en sub-poblacionesde trypanosoma rangeli en Colombia / Gustavo;Adolfo Vallejo. ... [et al.]. -- En: Congreso Nacional deCiencias Biologicas (33 : 1998 oct : 14-17 :;Ibague). -- Poblaciones de triatominos en el departamentodelTolima y supapel en la transmision de la;ARTICULO(S) EN REVISTA: Implementacion de un programa de controlde la transmision vectorial de la;(Nov. 1996); p. 296. -- Two major sub-population of trypanosomarangely inColombia defined by sub specific;kDNA probes / Gustavo Adolfo Vallejo. ... [et al.]. -- En:Memorias do instituto Oswaldo Cruz. -- Vol. 92;(Nov. 1997); p. 192. -- Implementacion de un programa de controlde la transmision vectorial de la enfermedad;de chagas en el municipio de Coyaima, Tolima / Gustavo AdolfoVallejo. ...[et al.]. -- En: Biomedica. -- Vol.;17 (nov. 1997); p. 94-96. -- ISSN 01204157. -- Aplicacionde lareaccion en cadena de la polimerasa (PCR) para;el diagnostico y caracterizacion de trypanosoma cruzi y T.rangeli en reservorios en un area endemica del;departamento del Tolima / Gustavo Adolfo Vallejo. ... [etal.].'-- en: Acta Medica Colombiana. -- Vol. 23, no.;4 (jul.-ago. 1998); p. 241. -- ISSN 01202448. -- Trypanosoma cruzi DNA inhuman mummies / Gustavo Adolfo;Vallejo. -- En: The Lancet. -- Vol. 349, no. 9062 (May. 1997);p. 1370. --PONENCIA(S) EN CONGRESO: Estudios;comparativos entre las secuencias de kDNA de trypanosoma cruziytrypanosoma rangeli y su aplicacion en el;diagnostico molecular de la trypanosomiasis americana / GustavoAdolfo Vallejo. -- En: Congreso Latino;moleculares empleados en la identificacion y caracterizacion dehemoparasitos de importancia medica / Gustavo;Adolfo Vallejo. -- En Memorias del curso de Postgrado (1997 jul: 7-11 : Medellin). -- Preferencias;partir de tejido humano momificado hace 4000 años en el nortedechile / Gustavo Adolfo Vallejo. ... [et al.].;Americano de parasitologia (13 : 1997 nov. 17-23 : Cuba, la Habana). -- Preferencias alimenticias de vectores;de la enfermedad de chagas capturados en ambientes domesticos,peri domesticos y silvestres en el municipio de;Coyaima Tolima / Lozano Leyder E. ... [et al.]. -- En: CongresoNacional de Ciencias Biologicas (32 : 1997).; En: Congreso Latino Americano de parasitologia (13 :1997 nov: 17-23 :La Habana). -- Fundamentos;enfermedad de Changas en el municipio de Coyaima, Tolima /Gustavo AdolfoVallejo. ... [et al.]. -- En:;Biomedica. -- Vol. 17, no. 2 (1997); p. 94-96. -- ISSN 0124157.'-- trypanosoma cruzi DNA in human mummies /;Felipe Guhl. ... [et al.]. -- En: Memorias do Instituto OswaldoCruz. -- Vol. 92, no. 1 (1997); p. 250. --;ISSN 00740276. -- Estudios comparativos entre las secuencias dekDNA de trypanosoma cruzi y trypanosoma;rangeli y su aplicacion en el diagnostico molecular de latripanosomiasisamericana / Gustavo Adolfo Vallejo.; En: Actualites biologiques. -- Vol. 20, no. 68 (1998);p. 4-356. -- Detection of trypanosoma cruzi and;tripanosoma rangeli in vector and mammalian hosts by polimeraseChain reaction amplification of kinetoplast;minicircle DNA / Gustavo Adolfo Vallejo. ... [et al.]. --En:Memorias doinstituto Oswaldo Cruz. -- Vol. 91;departamento del Tolima / Gustavo Adolfo Vallejo. ... [etal.].'-- en: congreso Nacional de Ciencias;Biologicas (33 : 1998 oct : 14-17 : Ibague). -- CAPITULO(S) ENLIBRO: PCRduplex para el diagnostico de la;alimenticias de vectores de la enfermedad de chagas capturadosen ambientes domesticos, peridomesticos y;silvestres en el municipio de Coyaima-Tolima / Gustavo AdolfoVallejo. ...[et al.]. -- En: Congreso Nacional;de Ciencias Biologicas (33 : 1998 oct : 14-17 : Ibague). -'- Caracterizacion ecologica, morfometrica y;molecular de poblaciones domesticas y silvestres de Rhodnius enel departamento del Tolima / Gustavo Adolfo;Vallejo. ... [et al.]. -- En: Congreso Nacional de Ciencias Biologicas (33: 1998 oct : 14-17 : Ibague). --;Diferencias moleculares entre cepas de trypanosoma rangeliaisladas en ciclos domesticos y silvestres en el;tripanosomosis americana / Gustavo Adolfo Vallejo. -- p. 214124.'-- en: control de tripanosomosis americana y;leishmaniosis aspectos biologicos, geneticos y moleculares/ editores Felipe Guhl, Carlos A. Jaramillo. --;Bogotá : Universidad de los Andes. -- 163 p. -- 28 cm

Did the butterfly species Heliconius heuripa originate throughinter specific hybridization

IP 1204-05-510-93v.1. Informe final -- v.2.-v.4. Anexos.Rusell E. Naisbit, Camilo Salazar, Ziheng H. Yang and James Mallet. -- En:Evolution. -- Vol. 55, no. 8;(2001); p. 1631-1638. -- PONENCIA(S) EN CONGRESO: Zonas dehibridacion demariposas de Heliconius como;refugios de patrones de coloracion novedosos contra la seleccionmimeticaestabilizadora. -- p. 61. -- En:;Memorias XXVI congreso / Congreso de la Sociedad Colombiana deEntomologia(26 : 1999 jul. 28-30 : Bogotá). --;Bogotá : Socolen, 1999. -- p.;ARTICULO(S) EN REVISTA: Sex-linked hybrid sterility in a butterfly / ChrisD. Jiggins, Mauricio Linares