Zygostates dasyrhiza (Kraenzl.) Schltr. (Orchidaceae: Oncidiinae), a new record from Rio Grande do Sul, Brazil

Zygostates dasyrhiza (Kraenzl.) Schltr. is here documented for the first time for the state of Rio Grande do Sul, Brazil. A morphological description, data about geographic distribution and habitat, an artificial key to the three Zygostates species native to Rio Grande do Sul, and additional comments about this species are provided.(Zygostates dasyrhiza (Kraenzl.) Schltr. (Orchidaceae: Oncidiinae), novo registro para o Rio Grande do Sul, Brasil) A presença de Zygostates dasyrhiza (Kraenzl.) Schltr. (Orchidaceae: Oncidiinae) é documentada pela primeira vez para o estado do Rio Grande do Sul. Neste trabalho são apresentados a descrição, distribuição geográfica, hábitat e comentários adicionais para a espécie, bem como uma chave artificial para separar as três espécies de Zygostates nativas do Rio Grande do Sul

Evaluation of anti-estrogenic or estrogenic activities of aqueous root extracts of Gunnera manicata L.

Gunnera perpensa (Gunneraceae) is an African plant widely used in traditional medicine. This species is known for its activity involving the female reproductive system, such as inducing or increasing labor, treating female infertility, expelling the placenta and/or preventing post-partum hemorrhage. These properties are probably due to (z)-venusol, a majoritary compound, and its action in conjunction with substances in the whole extract and other natural products. In southern Brazil, a native species Gunnera manicata L. that also belongs to Gunneraceae can be found. In spite of the traditional use of G. perpensa, there is no pharmacological and phytochemical information regarding the South American Gunnera species. Therefore, the aim of this study was to investigate the activity of Brazilian G. manicata aqueous extracts on the reproductive system of immature female Wistar rats through a uterotrophic assay and to verify the presence of (z)-venusol by liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Data were analyzed by analysis of variance (ANOVA) and Bonferroni´s post-hoc test (p< 0.01). Results obtained shown that G. manicata extracts did not present in vivo anti or estrogenic activity. Furthermore, (z)-venusol compound was not found. This study represents the first preliminary screening done on the South American G. manicata species.Gunnera perpensa (Gunneraceae) é uma planta de origem africana extensamente utilizada na medicina tradicional do país. Esta espécie é conhecida por suas atividades no sistema reprodutor feminino, como indução ou aumento do trabalho de parto, tratamento da infertilidade em mulheres, expulsão da placenta e/ou impedimento de hemorragia pós-parto. Tais atividades devem-se, provavelmente, ao sinergismo existente entre o (z)-venusol, composto majoritário, e outros compostos presentes na planta. No sul do Brasil, encontra-se uma espécie nativa, Gunnera manicata L., pertencente à família Gunneraceae. Apesar do uso tradicional de G. perpensa, não há informações farmacológicas e fitoquímicas a respeito da espécie sul Americana de Gunnera. Assim, o objetivo deste estudo foi investigar a atividade de extratos aquosos da espécie brasileira G. manicata no sistema reprodutor de ratas Wistar imaturas através de ensaio uterotrófico e verificar a presença do composto (z)-venusol utilizando-se cromatografia líquida acoplada a espectrômetro de massas em tandem (CL-EM/EM). Para a análise estatística, utilizou-se ANOVA/Bonferroni (

O gênero Corymborkis Thouars (Orchidaceae: Tropidieae) no Rio Grande do Sul, Brasil

Corymborkis embraces about six species distributed in tropical and subtropical regions of Ásia, África and the Americas. This contribution deals with this genus in Rio Grande do Sul State, Southern Brazil, therefore contributing to the knowledge of its orchid flora. This work is based in both, literature and the analysis of herbarium vouchers. Only one species was recorded: Corymborkis flava (Sw.) Kuntze, which dwells at the under storey of forests within the Atlantic Rain Forest Biome. This contribution does also present the synonymies, description, illustrations, geographic distribution as well as comments on habitat and Natural History for this taxon.Corymborkis abrange aproximadamente seis espécies distribuídas principalmente nas regiões tropicais e subtropicais da Ásia, África e das Américas. O presente trabalho trata do estudo taxonômico deste gênero no Rio Grande do Sul, contribuindo, portanto, para o conhecimento da flora do Estado. Este trabalho baseou-se em revisão bibliográfica bem como na análise de espécimes de herbário. Uma única espécie encontra-se no estado: Corymborkis flava (Sw.) Kuntze, a qual ocorre no sub-bosque de formações florestais inseridas dentro do Bioma Mata Atlântica. O trabalho apresenta também as sinonímias, descrição, ilustrações, distribuição geográfica, hábitat e comentários adicionais para este táxon

O gênero Capanemia Barb. Rodr. (Oncidiinae: Orchidaceae) na Região Sul do Brasil

Capanemia includes seven predominantly Brazilian epiphyte orchids, distributed by Uruguay, Paraguay, Northeastern Argentina, part of Bolivia and mainly areas of the South and Southeastern regions of Brazil, in humid forest between 450 to 1.400 m of altitude. A few species reach Uruguay, Paraguay, Northeastern Argentina and part of Bolivia. This work is focused in the species that occur in Southern Brazil and presents relevant synonymies, an artificial key for the identification of the species, descriptions, illustrations, geographic distribution, new record, habitat and additional comments for all the Southern Brazilian species.O gênero Capanemia abrange sete espécies de orquídeas epífitas distribuídas do Uruguai, Paraguai, extremo Nordeste da Argentina, parte da Bolívia e principalmente em florestas das regiões Sul e Sudeste do Brasil, entre 450 e 1.400 m de altitude. Este trabalho se restringe a revisar as espécies ocorrentes na região Sul do Brasil e apresentar sinonímias relevantes, uma chave analítica para a identificação das espécies, descrições, ilustrações, distribuição geográfica, novas citações, habitat e comentários adicionais para todas as espécies da região

Morfología y morfometría de dos especies de banderitas (orchidaceae: masdevallia) en colombia

Masdevallia coccinea y Masdevallia ignea (Orchidaceae) son orquídeas ornamentales y muy apreciadas por cultivadores aficionados y coleccionistas (Leathers, 2007). En Colombia, la presión de colecta sobre estas especies ha sido enorme y pocas poblaciones naturales sobreviven en los departamentos de Boyacá (Arcabuco- Paramo de Berlín, Duitama) y Santander (entre Málaga y Bucaramanga), estas poblaciones son reducidas y de difícil acceso.  Razón por la cual se encuentran en el apéndice II de CITES. Poco se sabe sobre su biología reproductiva, sistema reproductivo y polinización y parte de lo que consta en la literatura es incompleto (Van der Pijl y Dodson, 1966).En este marco el objetivo general del proyecto fue estudiar la biología  floral de Masdevallia coccinea y Masdevallia ignea en condiciones de semicultivo al aire libre en la Finca Villa Rosa ubicada en el Municipio de Guasca, Cundinamarca.  La biología floral se analizó por medio de fotografía digital, pruebas histoquímicas,  morfometría y MEB. Los resultados principales de la biología floral funcional mostraron que los sépalos dorsal y lateral fueron más largos en M. coccinea en comparación a M.  ignea, pero las coloraciones de las partes florales de esta última fueron más intensas y su labelo fue más largo. En las dos especies el labelo estuvo articulado a la columna y no se encontró presencia de glándulas con estructuras secretoras como néctarios ni osmoforos

Generic realignments in Maxillariinae (Orchidaceae)

Un reciente análisis filogenético de cuatro regiones de ADN para ca. 354 especies de la subtribu Maxillariinae indican fuertemente que el género Maxillaria, en su circunscripción tradicional, es altamente polifilético. Presentamos una nueva clasificación filogenética para Maxillariinae que reconoce 17 géneros. Los cambios necesarios incluyen: 1) la resurrección de los géneros Camaridium, Heterotaxis, y Ornithidium; 2) el reconocimiento de los recientes segregados genéricos Brasiliorchis (=Maxillaria sección Repentes), Christensonella (=Maxillaria sección Urceolatae), Nitidobulbon (en prensa), y una Sauvetrea recircunscrita (=Maxillaria sección Trigonae); 3) la adopción de los nuevos géneros Inti (=Maxillaria sección Polyphyllae), Mapinguari, Maxillariella (=Maxillaria secciones Ebulbes y Erectae), y Rhetinantha; 4) transferencias de Maxillaria sección Reflexae a Ornithidium, y Maxillaria sección Rufescens a Mormolyca; y 5) puesta en sinonimia de los géneros Adamanthus, Pseudomaxillaria, Psittacoglossum y Sepalosaccus (bajo Camaridium), Anthosiphon (bajo Cryptocentrum), Chrysocycnis (bajo Mormolyca), Dicrypta, Marsupiaria y Pentulops (bajo Heterotaxis), y Laricorchis, Neo-Urbania, y Siagonanthus (bajo Ornithidium). Algunos sinónimos nuevos al nivel de especie también son presentados.A recent phylogenetic analysis of four DNA regions for ca. 354 species of core Maxillariinae strongly indicate that the genus Maxillaria, as traditionally circumscribed, is grossly polyphyletic. We present a new phylogenetic classification for core Maxillariinae that recognizes 17 genera. Necessary realignments include: 1) resurrection of the genera Camaridium, Heterotaxis, and Ornithidium; 2) recognition of the recent segregates Brasiliorchis (=Maxillaria sect. Repentes), Christensonella (=Maxillaria sect. Urceolatae), Nitidobulbon (in press), and a recircumscribed Sauvetrea (=Maxillaria sect. Trigonae); 3) adoption of the new genera Inti (=Maxillaria sect. Polyphyllae), Mapinguari, Maxillariella (=Maxillaria sections Ebulbes and Erectae), and Rhetinantha; 4) transfers from Maxillaria sect. Reflexae to Ornithidium, and Maxillaria sect. Rufescens to Mormolyca; and 5) synonymizing of the genera Adamanthus, Pseudomaxillaria, Psittacoglossum, and Sepalosaccus (under Camaridium), Anthosiphon (under Cryptocentrum), Chrysocycnis (under Mormolyca), Dicrypta, Marsupiaria, and Pentulops (under Heterotaxis), and Laricorchis, Neo-urbania, and Siagonanthus (under Ornithidium). Some new synonyms at the specific level are also presented.National Science Foundation/[DEB-0234064]/NSF/Estados UnidosFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo/[01/08958-1]/FAPESP/BrasilConsejo Nacional de Ciencia y Tecnología/[]/CONACYT/MéxicoRoyal Botanic Gardens, Kew/[]//InglaterraAmerican Orchid Society/[]/AOS/Estados UnidosUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Agroalimentarias::Jardín Botánico Lankester (JBL

O gênero Cattleya Lindl. (Orchidaceae: Laeliinae) no Rio Grande do Sul, Brasil

Cattleya presents about 120 species distributed in tropical and subtropical regions of the Americas. In its current delimitation, Cattleya also encompasses the Brazilian species formerly placed within the genera Laelia and Sophronitis, as well as the species of a number of recently segregated genera. This contribution deals with this genus in Rio Grande do Sul State, Southern Brazil, therefore contributing to the knowledge of its orchid flora. This work is based in literature and in the analysis of herbarium vouchers as well as in specimens collected during fieldwork in several localities of Rio Grande do Sul. Five native species were recorded: Cattleya cernua, C. coccinea, C. intermedia, C. purpurata and C. tigrina. All these species dwell within the Atlantic Rain Forest biome. This contribution does present an artificial key for the species, the synonymies, descriptions, illustrations, geographic distribution and comments on habitat and natural history of the species.Cattleya abrange aproximadamente 120 espécies distribuídas principalmente nas regiões tropicais e subtropicais das Américas. Em sua delimitação atual, Cattleya inclui também as espécies brasileiras outrora inseridas nos gêneros Laelia e Sophronitis, bem como as espécies de gêneros mais recentemente segregados. O presente trabalho trata do estudo taxonômico desse gênero no Rio Grande do Sul, contribuindo, portanto, para o conhecimento da flora do estado. Este trabalho baseou-se em revisão bibliográfica bem como na análise de espécimes de herbário e coletas efetuadas em diversas regiões do Rio Grande do Sul. Cinco espécies ocorrem no estado: Cattleya cernua, C. coccinea, C. intermedia, C. purpurata e C. tigrina. Todas essas espécies crescem em formações florestais inseridas no bioma Mata Atlântica. Este trabalho apresenta uma chave artificial para identificar as espécies, sinonímias, descrições, ilustrações, distribuição geográfica, hábitat e comentários adicionais dos táxons analisados

Generic realignments in Maxillariinae (Orchidaceae): Corrigenda et adenda

UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Agroalimentarias::Jardín Botánico Lankester (JBL

Modeling Structure-Function Relationships in Synthetic DNA Sequences using Attribute Grammars

Recognizing that certain biological functions can be associated with specific DNA sequences has led various fields of biology to adopt the notion of the genetic part. This concept provides a finer level of granularity than the traditional notion of the gene. However, a method of formally relating how a set of parts relates to a function has not yet emerged. Synthetic biology both demands such a formalism and provides an ideal setting for testing hypotheses about relationships between DNA sequences and phenotypes beyond the gene-centric methods used in genetics. Attribute grammars are used in computer science to translate the text of a program source code into the computational operations it represents. By associating attributes with parts, modifying the value of these attributes using rules that describe the structure of DNA sequences, and using a multi-pass compilation process, it is possible to translate DNA sequences into molecular interaction network models. These capabilities are illustrated by simple example grammars expressing how gene expression rates are dependent upon single or multiple parts. The translation process is validated by systematically generating, translating, and simulating the phenotype of all the sequences in the design space generated by a small library of genetic parts. Attribute grammars represent a flexible framework connecting parts with models of biological function. They will be instrumental for building mathematical models of libraries of genetic constructs synthesized to characterize the function of genetic parts. This formalism is also expected to provide a solid foundation for the development of computer assisted design applications for synthetic biology