Cell-based internal standard for qPCR determinations of antibiotic resistance indicators in environmental water samples

Quantitative PCR (qPCR) has been used to quantify antibiotic resistance genes (ARGs) in water, wastewater, soil, sediment and tissue samples. Concerns regarding the comparability of data obtained in different laboratories has been a major bottleneck to incentivize the compilation of publicly available of ARGs quantifications gathered from different reports. In this study, the influence of the DNA extraction kits (NZY Tissue gDNA Isolation kit or DNeasy PowerWater kit) and of the operator on the DNA extraction yield and on qPCR genes quantification was assessed. Since in wastewater and water samples the matrix effect can affect the DNA recovery and, therefore, gene quantification, an internal standard, consisting in a cloned gene not found in environmental samples, was tested. The aim was to assess how qPCR determinations in wastewater and water samples can be affected by the matrix effect. The results show that the DNA extraction operator did not significantly influence DNA yield. The use of distinct kits resulted in qPCR gene quantifications that did not differ in more than 1 log-unit mL−1. The matrix effect, assessed based on the use of an internal standard, was associated with an underestimation that ranged 0.1–0.9 log gene copy number mL−1 of sample, irrespective of the water type. The reliability on the use of a DNA extraction kit that costs about 3 times less than the most commonly used can be an incentive for the use of DNA based analyses of ARGs in environmental waters. Moreover, the fact that both the DNA extraction operator and the reduced matrix effect have little influence on the final results, are good news, encouraging the compilation of data produced in distinct laboratories. Nevertheless, harmonization efforts are still necessary to minimize bias that may be due associated with other conditions, such as equipment.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Development of an internal standard for quantitative PCR analyses of antibiotic resistance genes

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Genomic analysis of sewage from 101 countries reveals global landscape of antimicrobial resistance

Antimicrobial resistance (AMR) is a major threat to global health. Understanding the emergence, evolution, and transmission of individual antibiotic resistance genes (ARGs) is essential to develop sustainable strategies combatting this threat. Here, we use metagenomic sequencing to analyse ARGs in 757 sewage samples from 243 cities in 101 countries, collected from 2016 to 2019. We find regional patterns in resistomes, and these differ between subsets corresponding to drug classes and are partly driven by taxonomic variation. The genetic environments of 49 common ARGs are highly diverse, with most common ARGs carried by multiple distinct genomic contexts globally and sometimes on plasmids. Analysis of flanking sequence revealed ARG-specific patterns of dispersal limitation and global transmission. Our data furthermore suggest certain geographies are more prone to transmission events and should receive additional attention.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

ANÁLISE DA RACIONALIDADE NAS AÇÕES ESTRATÉGICAS PREVISTAS NO PLANO HU-UFSC 2012

O artigo analisa a racionalidade predominante na elaboração e implementação do Plano-2012, do Planejamento Estratégico elaborado para o Hospital Universitário Prof. Polydoro Ernani de São Thiago, da Universidade Federal de Santa Catarina (HU-UFSC). Foram analisados todos os programas contidos neste documento. O estudo se caracteriza como estudo de caso. A técnica utilizada foi da observação direta intensiva com “entrevista despadronizada ou nãoestruturada”, permitindo “em uma conversa efetuada face-a-face” que os gestores relatassem fatos (LAKATOS; MARCONI, 1992, p. 107). Os dados secundários foram do PEHU-UFSC- 2012. A amostra foi não-probabilística e intencional (FLICK, 2004), pois foram entrevistados apenas os gestores que participaram do processo de decisão estratégica, isto é, os “sujeitos escolhidos por determinados critérios” (RICHARDSON et al., 2007, p. 161). As entrevistas foram gravadas no HU-UFSC, nos meses de agosto e setembro de 2011, totalizando nove gestores entrevistados. Constatou-se que o PEHU-UFSC-2012 não vem sendo implementado com sucesso, pois a racionalidade organizacional e a racional estão distantes de serem perseguidas, ficando a racionalidade política em um nível acima do desejado, causando interesses que conflitam com a gestão de uma unidade hospitalar

SPEECH THERAPY REHABILITATION IN VICTIMS OF SPINAL CORD TRAUMA WITH OROPHARYNGEAL DYSPHAGIA

Objetivo: descrever as estratégias e técnicas de reabilitação utilizadas e os efeitos da abordagem fonoaudiológica em pacientes disfágicos vítimas de trauma raquimedular. Método: trata-se de um estudo retrospectivo e documental. A coleta dos dados foi realizada através de análise documental, no período de julho a dezembro de 2019. Foram incluídos indivíduos admitidos e acompanhados pelo serviço de fonoaudiologia de um hospital referência em trauma do estado da Bahia, portadores de disfagia orofaringea, sem comprometimento do sistema nervoso central prévio ou durante o evento traumático. Os dados coletados foram tabulados no programa Excel (Versão 2007), realizada análise estatística descritiva e as variáveis descritas por frequência absoluta. Resultados: como método terapêutico, no grupo dos sujeitos traqueostomizados, foi utilizada a terapia indireta e direta em 100% da amostra. Já no grupo dos sujeitos não traqueostomizados foi predominante o uso da terapia direta. A maioria da amostra teve a dieta oral liberada já na avaliação fonoaudiológica, exceto os indivíduos traqueostomizados, por apresentarem disfagia grave no início da reabilitação. A maior parte dos sujeitos do grupo dos não traqueostomizados já estava com dieta oral liberada quando admitidos pelos fonoaudiólogos. A alimentação por via oral foi o principal resultado em todos os indivíduos e a decanulação entre os sujeitos traqueostomizados. Conclusão: As estratégias e técnicas utilizadas para a reabilitação através da terapia indireta e direta contribuiu para retirada de SNE, progressão de dieta oral e decanulação nessa população, assim como reduziu os riscos de agravos clínicos como a broncoaspiração, demonstrando eficácia terapêutica.Objective: to describe the rehabilitation strategies and techniques used and the effects of the speech therapy approach in dysphagic patients victims of spinal cord trauma. Method: this is a retrospective and documentary study. Data collection was performed through documentary analysis, from July to December 2019. Included were individuals admitted and followed up by the speech therapy service of a reference hospital in trauma in the state of Bahia, with oropharyngeal dysphagia, without compromising the system central nervous system or during the traumatic event. The data collected were tabulated in the Excel program (Version 2007), a descriptive statistical analysis was performed, and the variables were described by absolute frequency. Results: as a therapeutic method, in the group of tracheostomized subjects, indirect and direct therapy was used in 100% of the sample. In the group of non-tracheostomized subjects, direct therapy was predominant. Most of the sample had their oral diet already released in the speech-language evaluation, except for tracheostomized individuals, as they presented severe dysphagia at the beginning of rehabilitation. Most of the subjects in the group of non-tracheostomized patients were already on an oral diet when admitted by speech therapists. Oral feeding was the main result in all individuals and decannulation among tracheostomized subjects. Conclusion: The strategies and techniques used for rehabilitation through indirect and direct therapy contributed to the removal of SNE, progression of oral diet and decannulation in this population, as well as reducing the risks of clinical problems such as bronchoaspiration, demonstrating therapeutic efficacy

Comparative genomics insights into clinical or environmental methicillin resistant staphylococcus aureus

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O ENDOMARKETING E A ACREDITAÇÃO HOSPITALAR: UM ESTUDO DE CASO NO HOSPITAL UNIVERSITÁRIO DA UFSC (BRASIL)

Este artigo trata da posição de servidores técnico-administrativos e dos servidores prestadores de serviços de atendimento direto a saúde de clientes/pacientes do Hospital Universitário da Universitário Federal de Santa Catarina (HU-UFSC/Brasil). O foco do estudo foi o Manual de Organização Nacional de Acreditação (ONA), do Ministério da Saúde do Brasil. A técnica endomarketing foi o suporte para se compreender os parâmetros que norteiam a implantação da qualidade hospitalar brasileira. O Manual da ONA foi elaborado para balizar a gestão da normalização da assistência de clientes, com três etapas: Nível 1; Nível 2; e, Nível 3. Aplicou-se um questionário estruturado do tipo Likert, de modo probabilístico a 268 servidores do HU-UFSC. O período das coletas foi de janeiro a março de 2012 e tabulados e processados pelo SPSS®. Conclui-se que o HU-UFSC é descrito pelos pesquisados de boa a muito boa qualidade de atendimento e assistência à saúde, mas que requer providências à Acreditação Hospitalar Nível 1, quais sejam: reforçar o comunicação interna, melhoria de inter-relações profissionais dirigentes e servidores, e, a promoção de palestras sobre este modelo de qualidade hospitalar aos servidores técnico administrativos e aos servidores prestadores de serviços de atendimento direto a Saúde do cliente

Qualidade das calçadas, estudo de caso na região central de Palmas/TO

The main objective of the present work was to carry out a study on the assessment of the quality of sidewalks on the streets of quadra 104 Sul in the central region of Palmas/TO. Despite being a planned city, Palmas also faces problems related to the quality of physical services for pedestrians, which motivated the research. Thus, the development of the study took place in stages, based on bibliographical research, which served to support the theoretical framework that dealt with urban mobility and sustainability; the urban space for pedestrians, especially on the sidewalks; and the methodologies used to assess the quality of sidewalks. Then, based on the methodology of Ferreira and Sanches (2001), a field research was carried out, with the characterization and technical evaluation of the chosen location, with the ordering and analysis of the data obtained after the application of an online questionnaire. It was possible to identify that only as sidewalks on streets SE 01 (A) and SE 01 (B) did they obtain a good level of service with concrete block paving, tactile flooring for the visually impaired, appropriate width and good separation for pedestrians and vehicles. The other streets, however, only have a regular level, as they were identified on the sidewalks, such as parked vehicles, garbage and vegetation, lack of pavements and damaged pavements, thus compromising the safety and circulation of pedestrians. Finally, the need for public sector actions and investments to improve these spaces was demonstrated, as well as new studies with methodologies that apply different indicators to seek alternatives that improve not only the quality of sidewalks on the quadra 104 sul, but also of others other roads that give access to the central area of Palmas- TO.O presente trabalho teve como objetivo precípuo fazer um estudo sobre a avaliação da qualidade das calçadas das ruas da quadra 104 sul na região central de Palmas/TO. Apesar de se tratar de uma cidade planejada, Palmas também enfrenta problemas relacionados à qualidade dos espaços destinados aos pedestres, o que motivou a realização da pesquisa. Assim, o desenvolvimento do estudo se deu em etapas, partindo da pesquisa bibliográfica, que serviu para embasar o referencial teórico que tratou sobre a mobilidade urbana e sustentabilidade; o espaço urbano para pedestres, com ênfase nas calçadas; e as metodologias utilizadas para avaliar a qualidade das calçadas. Na sequência, com base na metodologia de Ferreira e Sanches (2001), foi realizada a pesquisa de campo, com a caracterização e avaliação técnica do local escolhido, com a ordenação e análise dos dados obtidos após a aplicação de questionário on-line. Foi possível identificar que apenas as calçadas das ruas SE 01(A) e SE 01(B) obtiveram um bom nível de serviço com calçamento de bloco de concreto, piso tátil para deficientes visuais, largura apropriada e boa separação para pedestres e veículos. As demais ruas, porém, apresentaram um nível apenas regular, pois foram identificados obstáculos sobre as calçadas, tais como veículos estacionados, lixo e vegetação, falta de calçamentos e calçamentos danificados, comprometendo assim a segurança e a circulação dos pedestres. Enfim, restou demonstrada a necessidade de ações e investimentos do setor público com vistas à melhoria desses espaços, bem como novos estudos com metodologias que apliquem indicadores diferentes para buscar alternativas que melhorem não só a qualidade das calçadas da quadra 104 sul, mas também de outras vias que dão acesso à área central de Palmas- TO

Avaliação do consumo alimentar e dos níveis séricos de fósforo e potássio em portadores de doença renal crônica / Assessment of food consumption and serum levels of phosphorus and potassium in patients with chronic kidney disease

Objetivo: avaliar o consumo alimentar e os níveis séricos de fósforo e potássio em portadores de doença renal crônica. Métodos: Tratou-se de um estudo transversal, quantitativo e descritivo, realizado na unidade de nefrologia do Hospital Regional de Taguatinga. O consumo alimentar de fósforo e potássio dos participantes foi obtido por meio da análise de um recordatório alimentar das 24 horas anteriores ao dia da entrevista e de um questionário de frequência alimentar. Os níveis séricos desses micronutrientes foram coletados nos prontuários físicos e/ou eletrônicos. Resultados: A média de ingestão alimentar de fósforo e potássio foi 706,32±250,40 mg/dia e 1598,22±441,15 mg/dia, respectivamente. A maioria dos participantes apresentaram hiperfosfatemia (n=17, 57%) e níveis adequados de potássio (n=19, 63%), em relação ao padrão de referência. Conclusão: A ingestão alimentar de fósforo e potássio não se associou com os níveis séricos dos mesmos na amostra estudada