Production and characterization of two medium-chain-length polydroxyalkanoates by engineered strains of Yarrowia lipolytica

Background: The oleaginous yeast Yarrowia lipolytica is an organism of choice for the tailored production of various compounds such as biofuels or biopolymers. When properly engineered, it is capable of producing medium-chain-length polyhydroxyalkanoate (mcl-PHA), a biobased and biodegradable polymer that can be used as bioplastics or biopolymers for environmental and biomedical applications.Results: This study describes the bioproduction and the main properties of two different mcl-PHA polymers. We generated by metabolic engineering, strains of Y. lipolytica capable of accumulating more than 25% (g/g) of mcl-PHA polymers. Depending of the strain genetic background and the culture conditions, we produced (i) a mcl-PHA homopolymer of 3-hydroxydodecanoic acids, with a mass-average molar mass (M-w) of 316,000 g/mol, showing soft thermoplastic properties with potential applications in packaging and (ii) a mcl-PHA copolymer made of 3-hydroxyoctanoic (3HO), decanoic (3HD), dodecanoic (3HDD) and tetradecanoic (3TD) acids with a M-w of 128,000 g/mol, behaving like a thermoplastic elastomer with potential applications in biomedical material.Conclusion: The ability to engineer Y. lipolytica to produce tailored PHAs together with the range of possible applications regarding their biophysical and mechanical properties opens new perspectives in the field of PHA bioproduction

Production of medium chain fatty acid by Yarrowia lipolytica: Combining molecular design and TALEN to engineer the fatty acid synthase

Yarrowia lipolytica is a promising organism for the production of lipids of biotechnological interest and particularly for biofuel. In this study, we engineered lipid biosynthesis through rational engineering of the giant multifunctional Fatty Acid Synthase (FAS) enzyme to modulate fatty acid chain length and produce shorter fatty acids. Based on the hypothesis that the Ketoacyl Synthase (KS) domain, responsible for chain elongation in Yarrowia lipolytica, is directly involved in chain length specificity, a computer-based strategy was undertaken to re-design mutants of the Ketoacyl Synthase. Molecular modelling of this domain in interaction with a C16-acyl substrate enabled identification of a key residue from the fatty acid binding site. This site was then targeted by mutagenesis in order to modify KS fatty acid chain length specificity. To introduce point mutations in this essential gene, we applied, for the first time, the TALEN technology to Yarrowia lipolytica and demonstrated the efficiency of the technique to perform site-directed mutagenesis at a specific genomic locus. Some mutants led to a significant increase of C14 fatty acid. Thanks to the use of an elegant combination of genome editing technology and molecular modelling, this study provides for the first time, evidences that the KS domain of the fungal FASI system is directly involved in fatty acid chain length specificity

Antiviral Activities of Sulfated Polysaccharides Isolated from Sphaerococcus coronopifolius (Rhodophytha, Gigartinales) and Boergeseniella thuyoides (Rhodophyta, Ceramiales)

Water-soluble sulfated polysaccharides isolated from two red algae Sphaerococcus coronopifolius (Gigartinales, Sphaerococcaceae) and Boergeseniella thuyoides (Ceramiales, Rhodomelaceae) collected on the coast of Morocco inhibited in vitro replication of the Human Immunodeficiency Virus (HIV) at 12.5 μg/mL. In addition, polysaccharides were capable of inhibiting the in vitro replication of Herpes simplex virus type 1 (HSV-1) on Vero cells values of EC50 of 4.1 and 17.2 μg/mL, respectively. The adsorption step of HSV-1 to the host cell seems to be the specific target for polysaccharide action. While for HIV-1, these results suggest a direct inhibitory effect on HIV-1 replication by controlling the appearance of the new generations of virus and potential virucidal effect. The polysaccharides from S. coronopifolius (PSC) and B. thuyoides (PBT) were composed of galactose, 3,6-anhydrogalactose, uronics acids, sulfate in ratios of 33.1, 11.0, 7.7 and 24.0% (w/w) and 25.4, 16.0, 3.2, 7.6% (w/w), respectively

Réhabilitation du DPM: Bilan d'activité 2021. Secteur du Tès

Le projet IDHEBARC s’intéresse à l’impact potentiel des travaux maritimes (nettoyage des friches ostréicoles, dragage des ports, …) sur les herbiers de zostères du Bassin d’Arcachon. Ce projet pluriannuel comporte des actions de modélisation hydrosédimentaire visant à cartographier l’intensité des impacts potentiels, et un suivi de l’évolution de l’emprise et du recouvrement des herbiers et de la composition de leur fond sédimentaire. Ce rapport présente les résultats du suivi réalisé dans le secteur du Tès (Bassin d’Arcachon) où des travaux de réhabilitation du Domaine Public Maritime ont été réalisés entre février 2022 et mai 2022

Réhabilitation du Domaine Public Maritime du Bassin d’Arcachon – Secteur de Bourrut : Bilan d’activité 2019

Le projet IDHEBARC s’intéresse à l’impact potentiel des travaux maritimes (nettoyage des friches ostréicoles, dragage des ports, …) sur les herbiers de zostères du Bassin d’Arcachon. Ce rapport traite des premiers résultats du suivi réalisé dans le secteur de Bourrut où des travaux de réhabilitation du Domaine Public Maritime ont été initiés début 2020

IDHEBARC 2022 : Bilan d'activité. Secteur de La Teste de Buch

Le projet IDHEBARC s’intéresse à l’impact potentiel des travaux maritimes (nettoyage des friches ostréicoles, dragage des ports, …) sur les herbiers de zostères du Bassin d’Arcachon. Ce projet pluriannuel comporte des actions de modélisation hydrosédimentaire visant à cartographier l’intensité des impacts potentiels, et un suivi de l’évolution de l’emprise et du recouvrement des herbiers et de la composition de leur fond sédimentaire. Ce rapport présente les premiers résultats du suivi réalisé dans le secteur de La Teste de Buch (Bassin d’Arcachon) où des travaux de dragage ont été réalisés début 2021

Réhabilitation du DPM : Cartographie des herbiers à Zostera noltei avant travaux. Secteur des Moussetes

Le projet IDHEBARC s’intéresse à l’impact potentiel des travaux maritimes (nettoyage des friches ostréicoles, dragage des ports, …) sur les herbiers de zostères du Bassin d’Arcachon. Ce projet pluriannuel comporte des actions de modélisation hydrosédimentaire visant à cartographier l’intensité des impacts potentiels, et un suivi de l’évolution de l’emprise et du recouvrement des herbiers et de la composition de leur fond sédimentaire. Ce rapport présente les résultats de la cartographie des herbiers du secteur des Moussettes avant les travaux de réhabilitation du DPM

Chimie DCE dans les eaux littorales du bassin Adour-Garonne – Substances Hydrophobes. Mise à jour de l’indicateur chimie - Données 2018-2020

Ce rapport rend compte des derniers résultats biotes validées (2018-2020) dans le cadre du suivi des contaminants chimique dans les masses d’eau littorales du bassin Adour Garonne. Une actualisation de l’indicateur chimie par lieu de surveillance est présentée , cette pré-évaluation suit les consignes du REEEL 2018 et prend en compte les nouveaux seuils OSPAR et les Valeurs Guides Environnementales (VGE) récemment révisée