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The chromatin remodeller BPTF is a novel and critical c-MYC co-factor
Tesis doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 23-07-2015c-MYC is a major oncogene involved in human cancer. Here, I have identified BPTF as a novel interactor of c-MYC required for its biological functions. This interaction is crucial for c-MYC transcriptional activity: BPTF knock-down leads to a decrease in c-MYC binding to DNA, changes in chromatin accessibility, and impaired activation of the c-MYC transcriptional program. In murine embryonic fibroblasts, BPTF is necessary for c-MYC-driven proliferation, G1-S progression, and replication stress, but not for c-MYC-induced apoptosis. Moreover, BPTF is critical for reprogramming of somatic cells into induced pluripotent stem cells using the four Yamanaka factors. In agreement with these findings, BPTF is required for the proliferation of c-MYC-addicted cancer cells and in human tumors its expression positively correlates with the activation of c-MYC gene signatures.
To determine whether BPTF is required for the oncogenic effects of c-MYC, we used two genetic mouse models: Ela-Myc and E -Myc. Ela-Myc mice develop aggressive acinar and ductal tumors. While BPTF is dispensable for normal pancreatic development and differentiation, its embryonic inactivation in ElaMyc mice is associated with extensive loss of acinar cells. Moreover, deletion of BPTF in young Ela-Myc via activation of the Ptf1a-CreERT2 recombinase results in a significant delay in tumor onset and a corresponding extension in disease-free survival. c-MYC overexpression in the B cell lineage (E -Myc) leads to the development of Burkitt-like lymphomas. Inactivation of one Bptf allele does not impair B cell maturation but completely blocks lymphoma development. These findings underscore the importance of a more detailed study of BPTF function in mammals and highlight the potential of exploiting the c-MYC:BPTF axis in cancer therapy.c-MYC es uno de los principales oncogenes implicados en el cáncer humano. En el presente trabajo he identificado a BPTF como un nuevo interactor de c-MYC que además es requerido para sus funciones biológicas. Esta interacción es crucial para la actividad transcripcional de c-MYC: el knock-down de BPTF se acompaña de una disminución de la unión de c-MYC al DNA, cambios en la accesibilidad de la cromatina y de una inadecuada activación del programa transcripcional de cMYC. En fibroblastos embrionarios de ratón, BPTF es necesario para la proliferación, progresión G1-S y estrés replicativo dirigidos por c-MYC, pero no para la apoptosis instruida por el mismo. Además, BPTF es crítico para la reprogramación de células somáticas a células madre pluripotentes por medio de los cuatro factores descritos por Yamanaka. De acuerdo con estas observaciones, BPTF es necesario para la proliferación de líneas cancerosas adictas a c-MYC, y en tumores humanos su expresión correlaciona positivamente con la activación de los programas de expresión génica dirigidos por c-MYC.
Con el objetivo de determinar si BPTF es necesario para los efectos oncogénicos de c-MYC, hemos usado dos modelos genéticos de ratón: Ela-Myc y E -Myc. Los ratones Ela-Myc desarrollan tumores acinares y ductales muy agresivos. Aunque BPTF es dispensable para la diferenciación y desarrollo pancreáticos normales, su inactivación embrionaria en ratones Ela-Myc se asocia con una extensa pérdida de células acinares. Además, la depleción de BPTF en ratones Ela-Myc jóvenes por medio de la recombinasa Ptf1a-CreERT2 resulta en un retraso significativo en la aparición de los tumores y en una consiguiente extensión de la supervivencia libre de enfermedad. La sobre-expresión de c-MYC en el compartimento de células B conduce al desarrollo de linfomas que reproducen la enfermedad del Linfoma de Burkitt. La inactivación de una sola copia de Bptf no afecta a la maduración de las células B pero bloquea por completo la formación de tumores. Estas observaciones destacan la importancia de un estudio más detallado de la función de BPTF en mamíferos y subrayan el potencial de explotar el eje c-MYC:BPTF como blanco terapéutico en cáncer.The work was supported by grants from Ministerio de Economía y Competitividad, Madrid, Spain (grants Consolíder ONCOBIO, Consolider INESGEN, SAF2010-21517 and SAF2011-15934-E), Instituto de Salud Carlos III (grants G03/174, 00/0745, PI051436, PI061614, G03/174, PI080440, PI120425 and Red Temática de Investigación Cooperativa en Cáncer (RTICC)), Asociación Española Contra el Cáncer, EUFP7-201663 and 201333, and US National Institutes of Health grant RO1 CA089715
Global hyperactivation of enhancers stabilizes human and mouse naïve pluripotency through inhibition of CDK8/19 Mediator kinases
Pluripotent stem cells (PSCs) transition between cell states in vitro and reflect developmental changes in the early embryo. PSCs can be stabilized in the naïve state by blocking extracellular differentiation stimuli, particularly FGF-MEK signaling. Here, we report that multiple features of the naïve state in human and mouse PSCs can be recapitulated without affecting FGF-MEK-signaling or global DNA methylation. Mechanistically, chemical inhibition of CDK8 and CDK19 kinases removes their ability to repress the Mediator complex at enhancers. Thus CDK8/19 inhibition increases Mediator-driven recruitment of RNA Pol II to promoters and enhancers. This efficiently stabilizes the naïve transcriptional program and confers resistance to enhancer perturbation by BRD4 inhibition.
Moreover, naïve pluripotency during embryonic development coincides with a reduction in CDK8/19. We conclude that global hyperactivation of enhancers drives naïve pluripotency, and this can be achieved in vitro by inhibiting CDK8/19 kinase activity. These principles may apply to other contexts of cellular plasticity