PpCRN7 and PpCRN20 of phythophthora parasitica regulate plant cell death leading to enhancement of host susceptibility

Phytophthora species secrete cytoplasmic effectors from a family named Crinkler (CRN), which are characterised by the presence of conserved specific domains in the N- and C-terminal regions. P. parasitica causes disease in a wide range of host plants, however the role of CRN effectors in these interactions remains unclear. Here, we aimed to: (i) identify candidate CRN encoding genes in P. parasitica genomes; (ii) evaluate the transcriptional expression of PpCRN (Phytophthora parasitica Crinkler candidate) during the P. parasitica interaction with Citrus sunki (high susceptible) and Poncirus trifoliata (resistant); and (iii) functionally characterize two PpCRNs in the model plant Nicotiana benthamiana. Results Our in silico analyses identified 80 putative PpCRN effectors in the genome of P. parasitica isolate 'IAC 01/95.1'. Transcriptional analysis revealed differential gene expression of 20 PpCRN candidates during the interaction with the susceptible Citrus sunki and the resistant Poncirus trifoliata. We have also found that P. parasitica is able to recognize different citrus hosts and accordingly modulates PpCRNs expression. Additionally, two PpCRN effectors, namely PpCRN7 and PpCRN20, were further characterized via transient gene expression in N. benthamiana leaves. The elicitin INF-1-induced Hypersensitivity Response (HR) was increased by an additive effect driven by PpCRN7 expression, whereas PpCRN20 expression suppressed HR response in N. benthamiana leaves. Despite contrasting functions related to HR, both effectors increased the susceptibility of plants to P. parasitica. Conclusions PpCRN7 and PpCRN20 have the ability to increase P. parasitica pathogenicity and may play important roles at different stages of infection. These PpCRN-associated mechanisms are now targets of biotechnological studies aiming to break pathogen's virulence and to promote plant resistance19CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQ445390/2014–0; 465440/2014–

Synthesis of the macrolactone of migrastatin and analogues with potent cell-migration inhibitory activity

The synthesis of the macrolactone core of migrastatin 2, its potent anti-metastasis analogue 34, and ester derivatives 35 and 38 are reported. The approach involves the use of a dihydroxylation reaction to establish the desired C-8 stereocenter followed by a metathesis cyclization reaction. The effects of the compounds on the migration and invasion of human breast cancer cells were evaluated by using the wound-healing and the Boyden-chamber cell-migration and cell-invasion assays. The results revealed a high potency of the macrolactones 2 and 34 and the ester analogues 35 and 38, which suggests they have potential as antimetastatic agents.Fundo de Apoio ao Ensino e Pesquisa da UNICAMP (FAEP-UNICAMP)FAPESPCNPqInstituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fármacos e Medicamentos (INCT-INOFAR

A total transcriptome profiling method for plasma-derived extracellular vesicles: applications for liquid biopsies

Extracellular vesicles (EVs) are key mediators of intercellular communication. Part of their biological effects can be attributed to the transfer of cargos of diverse types of RNAs, which are promising diagnostic and prognostic biomarkers. EVs found in human biofluids are a valuable source for the development of minimally invasive assays. However, the total transcriptional landscape of EVs is still largely unknown. Here we develop a new method for total transcriptome profiling of plasma-derived EVs by next generation sequencing (NGS) from limited quantities of patient-derived clinical samples, which enables the unbiased characterization of the complete RNA cargo, including both small- and long-RNAs, in a single library preparation step. This approach was applied to RNA extracted from EVs isolated by ultracentrifugation from the plasma of five healthy volunteers. Among the most abundant RNAs identified we found small RNAs such as tRNAs, miRNAs and miscellaneous RNAs, which have largely unknown functions. We also identified protein-coding and long noncoding transcripts, as well as circular RNA species that were also experimentally validated. This method enables, for the first time, the full spectrum of transcriptome data to be obtained from minute patient-derived samples, and will therefore potentially allow the identification of cell-to-cell communication mechanisms and biomarkers.Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado de Sao Paulo (FAPESP)Gillson-Longenbaugh FoundationNational Institutes of Health (NIH/NCATS) through the NIH Common Fund, Office of Strategic Coordination (OSC)AC Camargo Canc Ctr, Lab Med Genom, Sao Paulo, SP, BrazilAC Camargo Canc Ctr, Lab Computat Biol, Sao Paulo, SP, BrazilUniv Sao Paulo, Inst Biomed Sci, Dept Cell & Dev Biol, Sao Paulo, SP, BrazilUniv Fed Sao Paulo, Electron Microscopy Ctr, Sao Paulo, SP, BrazilUniv Texas MD Anderson Canc Ctr, Dept Expt Therapeut, Houston, TX 77030 USAUniv Texas MD Anderson Canc Ctr, Ctr RNA Interference & Non Coding RNAs, Houston, TX 77030 USAUniv New Mexico, Comprehens Canc Ctr, Albuquerque, NM 87131 USAUniv New Mexico, Sch Med, Div Hematol Oncol, Dept Internal Med, Albuquerque, NM 87131 USAUniv New Mexico, Sch Med, Div Mol Med, Dept Internal Med, Albuquerque, NM 87131 USARockefeller Univ, Lab Mol Immunol, 1230 York Ave, New York, NY 10021 USAFMUSP, Lab Neurociencias Alzira Denise Hertzog Silva LIM, Inst Psiquiatria, Sao Paulo, SP, BrazilUniv Fed Sao Paulo, Electron Microscopy Ctr, Sao Paulo, SP, BrazilFAPESP: 2011/09172-3FAPESP: 2014/26897-0Web of Scienc

SOROPREVALÊNCIA PARA HEPATITES B E C EM CAMINHONEIROS QUE TRAFEGAM PELA BR153 PASSANDO PELO ESTADO DE GOIÁS NO CENTRO-OESTE BRASILEIRO

Introdução e objetivos: o hábito de vida dos caminhoneiros os condiciona a percorrer grandes distâncias e passar vários dias distante de sua companheira, o que predispõe a práticas sexuais eventuais, aumentando o risco para doenças sexualmente transmissíveis. O objetivo deste estudo foi verificar a soroprevalência de hepatites B e C entre os caminhoneiros. Metodologia: caminhoneiros foram recrutados em um posto de combustível (BR-153, Km 515) entre fev/2014 e fev/2015. Dados sócio-demográficos foram colhidos mediante questionário estruturado. Foram coletados 10mL de sangue e o soro foi aliquotado para a realização do enzimaimunoensaio anti-HBc total (WienerTM), HBsAg (WirnerTM) e anti-HCV (InterkitTM). Resultados e discussões: Um total de 666 caminhoneiros fez parte do estudo, sendo que 82 (12,3%) apresentaram sorologia positiva para anti-HBc e 5/82 (6,1%) para HBsAg. A mediana de idade dos caminhoneiros com sorologia positiva para hepatite B foi de 46,5 anos, 54,9% eram das regiões Sul/Sudeste e 40,2% passavam entre 15 e 30 dias longe de casa. 100% relataram ser heterossexuais, 55,2% eram casados, 42,7% (n=35) costumavam ter parceiros sexuais eventuais e 23,5% praticam sexo desprotegido, enquanto aqueles que possuem parceiras fixas (n=74), 63,5% alegam que nunca usam ou utilizam às vezes preservativos com suas parceiras. 13/82 alegam já ter recebido transfusão sanguínea, 5 (38,5%) antes de 1988. Houve um caso de hepatite C, em indivíduo do sexo feminino, 25 anos, casada, heterossexual, parceiro fixo e nunca recebeu transfusão sanguínea. Conclusões: a alta prevalência para hepatite B entre os caminhoneiros revela um grupo de comportamento de risco, sendo necessária a conscientização quanto a transmissibilidade das DSTs e a prática de sexo seguro

SOROPREVALÊNCIA PARA HIV E SÍFILIS EM CAMINHONEIROS QUE TRAFEGAM PELA BR153 NO CENTRO-OESTE BRASILEIRO

Introdução e objetivos: O longo período fora de casa favorece o comportamento de risco para DSTs, como aids e sífilis entre caminhoneiros. Sendo assim, o objetivo desse trabalho foi verificar a soroprevalência para HIV-1/2 e sífilis entre os caminhoneiros. Metodologia: Os caminhoneiros foram recrutados em um posto de combustível na BR-153, Km 15, Goiás, entre fev/2014 e fev/2015 (CEP #065/2013). Um questionário estruturado sobre os dados sócio demográficos foi realizado e foram colhidos 10 mL de sangue para realização da sorologia mediante ensaio imunoenzimatico para anti-HIV-1/2 (Interkit™) e para anti-Treponema pallidum (Tp) (Symbiosys™) e se positivos, realizados o sequenciamento do gene pol (protease e transcriptase reversa) para identificar mutações de resistência aos antirretrovirais (ARV) e os subtipos do HIV-1, e o VDRL, respectivamente. Resultados e discussões: Dos 666 caminhoneiros, 0,9 %(n=6) apresentaram sorologia positiva para HIV-1, sendo dois do subtipo C, uma BF e uma B, dessas, nenhuma apresentou resistência aos ARV e duas não amplificaram. 3/6 caminhoneiros HIV-1+ afirmaram relacionamento com parceiros ocasionais e 1/3 afirmou prática de sexo desprotegido. A soroprevalência para sífilis foi de 10,4% (69/666), 16/69 (23,2%) apresentaram VDLR positivo, 29/69 relataram ter relacionamento com parceiros ocasionais sendo que 10,1 % (n=7) afirmaram não usar preservativo. Entre os que passam de 15 a 30 dias fora de casa a soroprevalência para sífilis foi maior (p<0,05). Conclusão: O longo período fora de casa, que reflete a ausência familiar, foi um fator preponderante para maior prevalência da sífilis e a infecção pelo HIV-1 de diferentes subtipos demonstra que os caminhoneiros continuam dentro de uma rede de transmissibilidade contribuindo para a disseminação das DSTs em todo o país devido sua grande mobilidade geográfica

DarkCideS 1.0, a global database for bats in karsts and caves

Tanalgo, Krizler C., Tabora, John Aries G., de Oliveira, Hernani Fernandes Magalhães, Haelewaters, Danny, Beranek, Chad T., Otálora-Ardila, Aída, Bernard, Enrico, Gonçalves, Fernando, Eriksson, Alan, Donnelly, Melissa, González, Joel Monzón, Ramos, Humberto Fernández, Rivas, Alberto Clark, Webala, Paul W., Deleva, Stanimira, Dalhoumi, Ridha, Maula, Jaycelle, Lizarro, Dennis, Aguirre, Luis F., Bouillard, Nils, Quibod, Ma. Niña Regina M., Barros, Jennifer, Turcios-Casco, Manfredo Alejandro, Martínez, Marcio, Ordoñez-Mazier, Diego Iván, Orellana, José Alejandro Soler, Ordoñez-Trejo, Eduardo J., Ordoñez, Danny, Chornelia, Ada, Lu, Jian Mei, Xing, Chen, Baniya, Sanjeev, Muylaert, Renata L., Dias-Silva, Leonardo Henrique, Ruadreo, Nittaya, Hughes, Alice Catherine (2022): DarkCideS 1.0, a global database for bats in karsts and caves. Scientific Data 9 (1): 155, DOI: 10.1038/s41597-022-01234-4, URL: http://dx.doi.org/10.1038/s41597-022-01234-