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    Origin and Evolution of Novel Sequences by Gene Duplication.

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    Gene duplication is a key source of genetic innovation. The recent availability of whole-genome sequences from a number of closely-related species makes it possible to directly investigate how gene duplication influences genomic evolution over time. This thesis utilizes techniques from comparative genomics to elucidate the origin and evolution of novel sequences by gene duplication. First, I explored the evolutionary dynamics of nested genes, which are genes embedded in the introns of other genes. I found that nested genes were primarily gained during metazoan evolution, often via the duplication and insertion of un-nested genes found in other genomic regions. Strikingly, the accumulation of nested genes is driven by a neutral process that is likely due to the presence of many long unsaturated introns in animal genomes. Next, I investigated the origin of long transcripts, or “clusters”, containing Piwi-interacting RNAs (piRNAs), which are small RNAs believed to play a role in transposon silencing. By comparing orthologous regions of rat, mouse, and human genomes, I discovered that 41% of clusters are unique to a particular rodent genome, having arisen via the duplication and insertion of other clusters located on the same chromosomes. Upon further examination, I elucidated the insertion mechanisms of most recently-acquired clusters as ectopic recombination of their flanking repetitive elements. Because the rate of cluster expansion is higher than that of any known gene family, it is likely that this process is driven by positive selection, perhaps caused by the need to silence the ever-expanding repertoire of mammalian transposons. Finally, I studied insertions and deletions produced by nonallelic gene conversion, which is the unidirectional transfer of genetic information between duplicate genes. I uncovered a strong deletion bias in nonallelic gene conversion in textit{Drosophila} and primates. Moreover in both lineages, the rate of nonallelic gene conversion is much faster than that of ordinary mutation, leading to the cooperative shrinkage and eventual disappearance of selectively neutral duplicate genes. Together, this dissertation research encompasses the evolutionary processes both leading to and following gene duplication, shedding light on one of the most important forces in genomic evolution.Ph.D.BioinformaticsUniversity of Michigan, Horace H. Rackham School of Graduate Studieshttp://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/86446/1/rassis_1.pd

    MAPEAMENTO DE PROCESSOS: UMA FERRAMENTA PARA REDU??O DE GAPS EM ATIVIDADES OPERACIONAIS

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    O atual mercado competitivo em que as empresas est?o inseridas as submete a compromissos de melhoria cont?nua em seus produtos e servi?os. Desta forma, faz-se necess?rio olhar internamente para a organiza??o, seus procedimentos e processos administrativos, de modo a promover seu aperfei?oamento e, assim, dar-lhes a oportunidade de se sobressair perante seus concorrentes. ? vista disso, gargalos nas atividades operacionais, sobretudo os atrasos, s?o inadimiss?veis porque as deixam vulner?veis no contexto corporativo. Para tanto, o estudo tem o intuito de, atrav?s de pesquisa aplicada, explorat?ria e de cunho qualitativo, estudar a rotina organizacional do setor financeiro da Companhia Docas da Para?ba e propor solu??es de modo a sanar os gargalos ou gaps existentes, que atrapalham a eficiente gest?o da empresa. O instrumento de coleta de dados foi o question?rio fechado, onde buscou compreender os gargalos processuais nas atividades do setor a partir das opini?es dos funcion?rios sobre temas relevantes do cotidiano da empresa. Buscou tamb?m tra?ar a imagem do setor, por meio das oito imagens organizacionais propostas por Morgan (2002). Ap?s a an?lise do estudo, a imagem departamental tra?ada e apresentada pelos colaboradores foi de um setor com metas e objetivos definidos a serem alcan?ados, sendo capaz de se adaptar rapidamente a mudan?as e com foco no processamento de informa??es, aprendizagem e excel?ncia do setor, bem como de seus colaboradores. Entretanto, ainda assim constatou-se que os gargalos existentes no setor estudado s?o decorrentes da falta de planejamento, que pode ser sanado com a mudan?a da mentalidade dos gestores para a import?ncia desse processo, bem como ? ado??o de fluxogramas das atividades a serem desempenhadas

    EU Representations in Portuguese Media and Populism: Embodying Political Antipodes?

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    Mass media mediate different publics, thus being crucial in constructing political reality. By selecting which topics are covered (agenda), which voices are heard, or how social and political issues/actors/dynamics are represented (priming and framing), mass media impacts how political conversations and processes unfold. Acknowledging the increasing mediatisation of politics, this article zooms into media texts of the Portuguese media during a complex political period that included national elections to explore how populism as a term, label, or topic was used and/or co-opted to create and negotiate political EU representations. Building on a historical perspective and using critical thematic analysis, this article argues that populism was used in the media and by the media as a discursive mechanism of political positionality and/or delegitimisation or criticism of political actors, agendas, or moves, thus making populism and the EU co-constitutively used as embodying political antipodes and making the EU work as a discursive buffer concerning populism in the country

    Estudo da biodegradabilidade do algodão, lã e feltro de pêlo de coelho pardo em condições de compostagem à escala laboratorial

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    A presente dissertação tem como objetivo o estudo da biodegradabilidade e avaliação da desintegração de têxteis de origem vegetal e animal, tendo como base as normas NP EN 13432, 2015 para as embalagens e materiais de embalagens, ISO 14855-1, 2005 para a análise da biodegradabilidade, ISO 20200, 2004 para a análise da desintegração dos materiais e EN 16086-1, 2011 para a avaliação dos feitos fitotóxicos do composto. O têxtil de origem vegetal é o algodão, e os de origem animal a lã e feltro. Para o estudo, consideram-se amostras de tecido cujo o rótulo indica uma constituição de 100% do respectivo material, adquiridas em lojas convencionais, e como substâncias de referência amostras cruas. Consideram-se igualmente três amostras diferentes de feltro, provenientes da FEPSA, e as substâncias de referência são duas qualidades de pêlos que dão origem aos feltros, provenientes da Cortadoria Nacional de Pêlo. As amostras dos materiais teste e inóculo são previamente caracterizadas física e quimicamente, para posterior realização de três testes diferentes. O primeiro teste permite estimar a biodegradabilidade das amostras ao medir o dióxido de carbono produzido quando submetidas a condições controladas de compostagem, seguindo-se o teste de fitotoxicidade às mesmas amostras. Em paralelo, realiza-se o teste de desintegração igualmente em condições controladas de compostagem, para observar o grau de desintegração das amostras em determinado intervalo de tempo. A biodegradabilidade das amostras dos materiais teste é de 20%, 13%, 28%, 35% e 36% para o algodão, lã, feltro não tingido, feltro tingido sem goma e feltro tingido com goma, respetivamente. E, quando a biodegradabilidade é em relação à respetiva substância de referência, todas as amotras apresentam biodegradabilidades superiores a 90%, com exceção do feltro não tingido com 88%

    The Human Perception of Green Spaces (GS) and the Research Pattern in the Last Decade: A Systematic Review

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    The growth of urbanization has reduced the availability of green spaces GS and the decrease in these spaces as well as the difficulty in accessing them has impacts on human physical and mental health proven by research that deeply investigates this theme around the world Thus understanding the impacts of GS on human perception within the contemporary scenario is of fundamental importance since the population has been subjected to a high level of stress generated by the high work demand as well as the quarantine scenario imposed by the Covid-19 pandemic Based on this the present research aimed to investigate the implications of GS on self-reported well-being through the perceptions generated by these environments and for that a systematic literature review 2010-2020 was carried out based on selected pre-criteria which were analyzed qualitatively and quantitatively through meta-analysis The results describe and discuss 14 implications of GS for human well-being and mental health 7 demographic differences verified in the way of perceiving these environments and statistical dependencies in the research pattern of certain study variables in the last decade Thus an unprecedented compilation of implications and perceptive differences caused by GS is presented serving as a theoretical contribution to the government planners architects and urbanists in the provision of cities with potential to mitigate stress and favorable to human well-bein

    Sensorial analysis of carrot genotypes grown under organic and conventional conditions

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    Foi realizada análise sensorial em genótipos de cenoura Alvorada, Brasília RL, Brasília Bionatur, Kuronan, Nantes e Carandaí, produzidos em sistema orgânico e convencional no Distrito Federal. No teste de comparação pareada 1, foram utilizadas raízes de Alvorada, Brasília e Nantes servidas cruas para 33 consumidores na CEASA (DF). Não foi observada diferença estatística significativa entre as amostras para preferência do consumidor. No teste de comparação pareada 2, foi utilizada a cv. Brasília, cozida no vapor e servida a 24 pessoas de um edifício residencial, em Taguatinga (DF). As amostras provenientes do sistema orgânico foram preferidas pelos consumidores. Para o teste de ordenação 1 e 2, doze pessoas não treinadas provaram amostras de Alvorada, Brasília RL, Brasília Bionatur, Kuronan, Nantes e Carandaí cozidas em água. Alvorada proveniente do sistema orgânico foi preferida pelos consumidores. No teste de comparação pareada 3, realizado em área aberta na Universidade de Brasília, foi utilizada a cv. Alvorada cozida em água e servida a 36 consumidores. Não foi observada diferença estatística significativa para preferência entre sistemas de cultivo. No teste de comparação pareada 4, realizado no restaurante da Embrapa Hortaliças, Alvorada cozida a vapor foi servida a 39 consumidores. Amostras provenientes do sistema orgânico foram preferidas pelos consumidores. Alvorada proveniente do sistema de cultivo orgânico e preparada no vapor foi preferida pelos consumidores em detrimento do mesmo material, cru ou cozido em água. _______________________________________________________________________________ ABSTRACTSensorial analysis was carried out in carrot genotypes Alvorada, Brasília RL, Brasília Bionatur, Kuronan, Nantes and Carandaí, grown under organic and conventional systems in Distrito Federal, Brazil. For the paired comparison test 1, uncooked samples of 'Alvorada', 'Brasília' and 'Nantes' were given to 33 consumers. There was no statistical difference among genotypes or crop system for the consumer's preference. For the paired comparison test 2, vapor cooked samples of 'Brasília' were given to 24 consumers in a residence. Samples from the organic crop system were preferred by consumers. For the ranking tests 1 and 2, 12 persons not previously trained were selected to evaluate samples of 'Alvorada', 'Brasília RL', 'Brasília Bionatur', 'Kuronan', 'Nantes' and 'Carandaí' cooked in water. 'Alvorada' samples from the organic crop system were preferred by consumers. For the paired comparison test 3, carried out at the University of Brasilia open area, samples of 'Alvorada' cooked in water were given to 36 consumers. There were no observed statistical differences between samples for consumer's preference. For the paired comparison test 4, carried out at Embrapa Hortaliça's restaurant, vapor cooked samples of 'Alvorada' were given to 39 persons. Samples from the organic crop system were preferred by consumers. Vapor cooked 'Alvorada' from the organic crop system was preferred by the consumers in comparison to 'Alvorada' uncooked or cooked in water

    Jean Piaget e a educação internacional: práticas pedagógicas de construção de um método de compreensão e reciprocidade nas crianças

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    The current paper displays the proposal of international education carried out by Jean Piaget in the middle of the 1930s. Having this in mind, we analyzed some of the author’s publications aiming at identifying his conception of an international cooperation spirit and the procedure to develop it in schools. We identified how the socio-historical context, marked by war and nationalism influenced the construction of knowledge about education and psychology. Because the author assumed the leadership of important international educational institutions concerned with the development of peace in schools, the author addresses the issue of education in a way both objective and scientific. International education would have as its main objective to foster the emergence of understanding and the placement of reciprocity before peers and foreigners. The method to be employed in schools should take advantage of the tendencies towards internal solidarity and the practice of rules of cooperation and methods of self-government.Keywords: Jean Piaget, international education, International Bureau of Education.Esse artigo apresenta a proposta de educação internacional elaborada por Jean Piaget em meados de 1930. Para isso, analisamos publicações do autor visando identificar sua concepção de espírito de cooperação internacional e a maneira de desenvolvê-lo nas escolas. Identificamos como o contexto sócio-histórico, marcado pela guerra e pelos nacionalismos, influenciou a construção de conhecimentos sobre educação e sobre psicologia. Por ter assumido a direção de importantes instituições internacionais de educação preocupadas com a promoção da paz pelas escolas, o autor aborda a problemática da educação de forma objetiva e científica. A educação internacional teria como objetivo principal propiciar a emergência da compreensão e da posição de reciprocidade diante dos pares e dos estrangeiros. O método a ser empregado, nas escolas, deveria aproveitar-se das tendências à solidariedade interna e à prática das regras de cooperação e dos métodos do self-government.Palavras-chave: Jean Piaget, educação internacional, Bureau Internacional de Educação
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