A first approach to assess the impact of bottom trawling over Vulnerable Marine Ecosystems on the High Seas of the Southwest Atlantic

Versión del edito

The rubric as an element of evaluation: application and analysis in humanistic disciplines

El presente artículo describe el desarrollo de un Proyecto Docente sobre la difusión, implementación y evaluación de la herramienta de la rúbrica de evaluación en asignaturas humanísticas, así como el fomento de la comunicación entre alumnado y profesorado en relación con los procesos e instrumentos de evaluación y aprendizaje por tareas, en base a los objetivos de evaluación por competencias. Las acciones han ido dirigidas a 18 asignaturas, (todas de la rama de humanidades), y en la que han intervenido profesorado de 4 departamentos de la Facultad de Filosofía y Letras de la Universidad de Córdoba. La aplicación de la rúbrica de evaluación en las diversas asignaturas relacionadas con el proyecto afectó a más de 850 alumnos de 5 titulaciones diferentes. Tras un proceso de estudio, elaboración, revisión e implementación, se llegó a una actividad evaluación dirigida tanto a el alumnado como al profesorado, que se resume en un alto grado de satisfacción por ambas partes y en la continuada aplicación de esta herramienta en cursos posteriores.This article describes the development of a Teaching Project on the dissemination, implementation and evaluation of the tool of the rubric of evaluation in humanistic subjects, as well as the promotion of the communication between students and teachers in relation to the processes and instruments of evaluation and learning by tasks, based on the objectives of evaluation by competences. The actions have been directed to 18 subjects, (all of them from the branches of humanities), and in which teachers from 4 departments of the Faculty of Philosophy and Letters of the University of Córdoba have intervened. The application of the rubric of evaluation in the various subjects related to the project affected more than 850 students of 5 different degrees. After a process of study, elaboration, review and implementation, an evaluation activity was reached aimed at both students and teachers, which is summarized in a high degree of satisfaction by both parties and in the continued application of this tool in subsequent courses

Biodiversidad Marina del golfo Ártabro (A Coruña): 50 aniversario del Centro Oceanográfi co de A Coruña.

Hace más de 50 años comenzó su andadura el Centro Oceanográfico de A Coruña. Ocurrió en un vetusto local del puerto, y se denominó por aquel entonces como Laboratorio del Noroeste. Durante este medio siglo este centro ha trabajado básicamente en las áreas de la biología pesquera, la acuicultura marina y la oceanografía multidisciplinar, si bien los equipos de investigación han ido evolucionando a lo largo de este tiempo, abriendo o cerrando líneas de trabajo según las circunstancias. A pesar de haber trabajado en todos los océanos del mundo, incluidos el ártico y el antártico, una parte importante de las investigaciones del oceanográfico coruñés siempre han estado centradas en su entorno cercano: el golfo Ártabro. Desde los años ochenta, este centro coruñés monitorea el ambiente pelágico y bentónico de la ría de A Coruña y su plataforma adyacente. Esto supone una valiosísima serie histórica de datos oceanográficos, cuya utilidad quedó de sobra demostrada durante las catástrofes de los petroleros Aegean Sea y Prestige. La idea de crear este libro surgió justo antes del 50 Aniversario del Centro Oceanográfico de A Coruña (1968-2018). Nace con la intención de recopilar y resumir el conocimiento científico en torno a la biodiversidad marina en el ámbito de trabajo más cercano al centro coruñés. Es intención de este libro el servir como publicación de referencia a todo tipo de estudio sobre la biodiversidad y la oceanografía biológica del golfo Ártabro. Para ello nos servimos de la información obtenida directamente del oceanográfico herculino tanto de sus series históricas, como de otros estudios realizados en la zona. Además, la colaboración en materia de pesca de los centros oceanográficos de A Coruña, Vigo, Santander y Gijón permitió aportar a este volumen el capítulo dedicado a las especies desembarcadas por la flota artesanal en la lonja coruñesa. Por otra parte, los especialistas en bentos duro del Centro de Gijón fueron los encargados de elaborar la parte dedicada a este tipo de fauna. Por último, reseñar la inestimable contribución del Grupo de Investigación BioCost de la Universidade da Coruña, auténticos referentes en el conocimiento de la botánica marina de la zona en cuestión.Versión del edito

Assessment of a New ROS1 Immunohistochemistry Clone (SP384) for the Identification of ROS1 Rearrangements in Patients with Non–Small Cell Lung Carcinoma: the ROSING Study

Introduction: The ROS1 gene rearrangement has become an important biomarker in NSCLC. The College of American Pathologists/International Association for the Study of Lung Cancer/Association for Molecular Pathology testing guidelines support the use of ROS1 immunohistochemistry (IHC) as a screening test, followed by confirmation with fluorescence in situ hybridization (FISH) or a molecular test in all positive results. We have evaluated a novel anti-ROS1 IHC antibody (SP384) in a large multicenter series to obtain real-world data. Methods: A total of 43 ROS1 FISH-positive and 193 ROS1 FISH-negative NSCLC samples were studied. All specimens were screened by using two antibodies (clone D4D6 from Cell Signaling Technology and clone SP384 from Ventana Medical Systems), and the different interpretation criteria were compared with break-apart FISH (Vysis). FISH-positive samples were also analyzed with next-generation sequencing (Oncomine Dx Target Test Panel, Thermo Fisher Scientific). Results: An H-score of 150 or higher or the presence of at least 70% of tumor cells with an intensity of staining of 2+ or higher by the SP384 clone was the optimal cutoff value (both with 93% sensitivity and 100% specificity). The D4D6 clone showed similar results, with an H-score of at least 100 (91% sensitivity and 100% specificity). ROS1 expression in normal lung was more frequent with use of the SP384 clone (p < 0.0001). The ezrin gene (EZR)-ROS1 variant was associated with membranous staining and an isolated green signal FISH pattern (p = 0.001 and p = 0.017, respectively). Conclusions: The new SP384 ROS1 IHC clone showed excellent sensitivity without compromising specificity, so it is another excellent analytical option for the proposed testing algorithm

Database of spatial distribution of non indigenous species in Spanish marine waters

Research in marine Spanish waters are focused on several actions to achieve an effectively management on protected areas, with the active participation of the stakeholders and research as basic tools for decision-making. Among these actions, there is one about the knowledge and control on NIS. One of its objectives is the creation of NIS factsheets, which are going to be added to the National Marine Biodiversity Geographical System (GIS) providing complementary information about taxonomic classification, common names, taxonomic synonyms, species illustrations, identification morphological characters, habitat in the native and introduced regions, biological and ecological traits, GenBank DNA sequences, world distribution, first record and evolution in the introduced areas, likely pathways of introduction, effects in the habitats and interaction with native species, and potential management measures to apply. The database will also provide data for (1) the European online platforms, (2) the environmental assessment for the Descriptor 2 (D2-NIS) of the EU Marine Strategy Framework Directive (MSFD), as well as (3) supporting decisions made by stakeholders. It is the result of extensive collaboration among scientist, manager’s and citizen science in the Spanish North-Atlantic, South-Atlantic, Gibraltar Strait-Alboran, Levantine-Balearic and Canary Islands marine divisions, providing an updated overview of the spatial distribution of relevant extended and invasive NIS of recent and established NIS introduced by maritime transport and aquaculture pathways, as well as on cryptogenic or native species in expansion due to the climatic water warming trend

Estudio de los Ecosistemas Marinos Vulnerables en aguas internacionales del Atlántico Sudoccidental

En este libro, basado en la mejor información científica disponible hasta la fecha, se presentan los resultados y conclusiones de una serie de trece campañas de investigación multidisciplinar realizadas entre octubre de 2007 y abril de 2010 por los componentes del Grupo ATLANTIS a bordo del B/O MIGUEL OLIVER, propiedad de la Secretaría General de Pesca (SGP). El estudio surge a raíz de la solicitud por parte de la SGP (anteriormente denominada Secretaría General del Mar) al Instituto Español de Oceanografía (IEO), para la realización de una serie de campañas de investigación multidisciplinar en aguas internacionales del Atlántico Sudoccidental, dirigidas al estudio de los Ecosistemas Marinos Vulnerables (EMVs) y de las posibles interacciones con las actividades pesqueras. El objetivo final de dichas campañas era el estudio y la identificación cuantitativa, cualitativa y geográfica de los EMVs y de los grupos taxonómicos de organismos sensibles que pudieran existir en la zona de estudio, incluyendo la propuesta de posibles zonas marinas a proteger, para una explotación sostenible de los recursos pesqueros en el ámbito del respeto a los EMVs. Los resultados que se presentan en este libro comprenden los obtenidos a través de los trabajos de geología, geomorfología, bentos, pesca, oceanografía física y análisis de contaminantes en la zona de aguas internacionales del Atlántico Sudoccidental comprendida entre los paralelos 42º y 48ºS, y la isobata de los 1500 m de profundidad (Figura 2.2). Entre estos resultados se incluye el cartografiado y una batimetría detallada de la zona, la descripción del substrato geológico y de los aspectos bentónicos, el análisis de la distribución y abundancia de las especies de mayor interés comercial, la huella de la pesquería, la identificación y descripción preliminar de los EMVs, y la propuesta de Zonas de Protección, basada en criterios Geológicos, Geomorfológicos y Biológicos. Toda esta información ha sido incorporada para su tratamiento en una plataforma SIG (Sistema de Información Geográfica) y los resultados obtenidos y presentados en este libro vienen acompañados de abundante información gráfica, como imágenes batimétricas en 3D, fotografías de bentos (infauna y epifauna), imágenes tomadas con un ROV (Remotely Operated Vehicle) y con una cámara digital submarina, así como una serie de mapas de distribución, capturas y densidad de las principales especies de interés pesquero. Se incluye también un mapa con la huella de la pesquería (1989-2010) que permita observar la incidencia de las Zonas de Protección propuestas en el área en la que faena habitualmente la flota española de arrastre de fondo. Como información adicional a la obtenida en las trece campañas de investigación, también se ha utilizado la base de datos creada con la información recogida por el Programa de Observadores del IEO entre los años 1989-2010, referente a datos comerciales, biológicos, oceanográficos y físicos (batimetría, temperatura superficial del mar y temperatura del fondo). Entre octubre de 2007 y abril de 2010 se han realizado un total de trece campañas de investigación multidisciplinar, que se han concretado en los siguientes trabajos: • 347 días efectivos de mar • Prospección de una superficie total de 59.105 km2 • Realización de un total de 91.905 km de perfiles geofísicos • 102 muestreos con draga de roca • 209 muestreos con draga box corer • 519 estaciones de CTD • 413 lances de pesca • 413 muestras de sedimentos con el colector de red • Recogida de varios miles de lotes de muestras de bentos que representan varios centenares de miles de especímenes y/o colonias • Realización de miles de fotografías de especies bentónicas, centenares de imágenes digitales de alta resolución y decenas de horas de vídeo realizadas con el ROV del barco Entre los principales resultados de los trabajos de investigación multidisciplinar presentados en este libro hay que destacar la identificación, descripción y delimitación de los EMVs, siguiendo criterios biológicos, geológicos y mixtos; la identificación de los principales grupos bentónicos indicadores de EMVs; la determinación de los valores que representan una captura significativa de los distintos taxones considerados como vulnerables según criterios de la ONU y OSPAR, y finalmente, la propuesta de áreas marinas que deberían ser consideradas como candidatas a ser protegidas. En total se proponen nueve polígonos de diferente superficie para su valoración como zonas de protección (Figura 7.5) y se hace referencia a la incidencia que el cierre de dichas zonas podría tener sobre la actividad de la flota, es decir, el grado de solapamiento entre las zonas de protección y la huella de la pesquería (Figura 7.6). Todos estos resultados se presentan acompañados de abundantes gráficas, figuras y mapas.Instituto Español de OceanografíaVersión del edito

Exploring occurrence and molecular diversity of betaine lipids across taxonomy of marine microalgae

Betaine lipids (BL) from ten microalgae species of the kingdoms Plantae and Chromista were identified and quantified by HPLC/ESI-TOF-MS. Diacylgyceryl-N-trimethylhomoserine (DGTS) was detected in Trebouxiophyceae and Eustigmatophyceae species, whereas Tetraselmis suecica was described as the first green algae containing diacylglyceryl-hydroxymethyl-N,N,N-trimethyl-beta-alanine (DGTA). DGTA molecular species where also characterized in Cryptophyceae species as well as in the Bacillariophyceae diatom Phaeodactylum tricornutum. The Mediophyceae diatom Chaetoceros gracilis had no DGTA, but contained diacylglyceryl-carboxyhydroxymethylcholine (DGCC). A principal coordinate (PCO) analysis of microalgae species revealed the existence of three main clusters around each BL type. The first PCO axis (43.9% of total variation) grouped Chlorophyceae, Trebouxiophyceae and Eustigmatophyceae species and positively correlated with DGTS. The second PCO axis (27.8% of total variation) segregated DGTA from DGCC containing species. Cryptophyceae, Bacillariophyceae and Chlorodendrophyceae were the more closely associated species to DGTA. Mediophyceae and Dinophyceae species contained DGCC as the only BL. Molecular diversity varied from the simplest DGCC composition in Gyrodinium dorsum to the highest spectrum of ten different molecular species detected for DGTA (Rhodomonas baltica) and DGCC (C. gracilis). The fatty acid profile of DGTS was very dissimilar to that of the whole lipid cell content. DGTS from Nannochloropsis gaditana was highly unsaturated respecting to total lipids, whereas in Picochlorum atomus DGTS unsaturation was nearly one half to that of total lipids. Dissimilarity between DGTA and total lipid fatty acid profile was minimum among all BL and DGTA fatty acid unsaturation was the maximum observed in the study. New DGCC molecular species enriched in 20:5 were described in Mediophyceae diatoms. Multivariate microalgae ordination using BL as descriptors revealed a higher chemotaxonomic potential than that based on their respective BL fatty acid profile. Nevertheless, taxonomic resolution was improved when fatty acids from the whole cell lipid pool were used