On the pile-up effect and priors for L-inf and M/K: response to a comment by Hordyk et al. on "A new approach for estimating stock status from length frequency data" Reply

We thank Hordyk et al. (2019) for pointing out a typographical error in one of our equations, which has meanwhile been fixed in the online version of Froese et al. (2018) and addressed in a corrigendum for the printed version. We agree with Hordyk et al. (2019) that accounting for the pile-up effect in binned LF samples may be appropriate in, for example, tropical species with continuous reproduction, and we have provided for such correction as an option in the latest version of the LBB software. We note, however, that this correction as well as the LBSPR method of Hordyk et al. (2016) proposed by Hordyk et al. (2019) as an alternative to LBB leads to strong overestimation of exploitation and underestimation of stock status when compared with independent assessments of 34 real stocks from temperate and subtropical areas. As for the points raised by Hordyk et al. (2019) with regard to default priors for Linf and M/K, we maintain that these defaults are adequate for a wide range of exploited species. They can be easily replaced by users if better information is available. Warnings not to use LBB if LF samples do not show the typical asymmetric pattern were already provided in the original LBB paper and are repeated here.</p

The second workshop on lists of commercial fish and shellfish species for reporting of MSFD D3 (WKD3Lists2)

WKD3Lists2 created lists of regionally relevant commercial fish and shellfish species (and higher order taxa) for the use of Article 8 reporting by EU member states under Descriptor 3 of the Marine Strategy Framework Directive (MSFD). The regional taxa lists were based on landings data from the Fisheries Dependent Information data base (FDI) provided by EU member states and compiled by the Joint Research Centre (JRC). The taxonomy of landings data was consolidated by regional experts and the consolidated data were combined to obtain absolute and proportional landing weights and values for each (sub)re-gion, which were used to apply dual (weight and vale) selection thresholds to compile (sub)re-gional D3-taxa-lists. Regional D3-taxa-lists were produced for two MSFD regions (Baltic Sea & Black Sea) and eight MSFD subregions: The Greater North Sea, Celtic Seas, the Bay of Biscay and Iberian Coast, Mac-aronesia, Western Mediterranean, the Ionian Sea & Central Mediterranean, the Adriatic Sea and the Aegean-Levantine Sea. To exclude taxa with very low landing weights or value from the final lists, two types of thresh-olds (cumulative and minimum) with differing cut-off values were evaluated (90%, 95%, 98% and 99% for cumulative and 0.1% and 1% for minimum thresholds). Depending on the cut-off value, the number of taxa included varied substantially and in most (sub)regions the application of thresholds reduced the initial number of taxa by more than 50%. WKD3Lists2 did not recommend any threshold type or cut-off value to be applied generically in all (sub)regions, but identified trade-offs between inclusiveness and parsimony of relevant con-tent i.e. higher cut-off values will lead to longer lists including many taxa with relatively low landings weights/values. In some (sub)regions, thresholds with lower cut-off values (90% to 95%) were considered feasible by regional experts (Mediterranean subregions, Bay of Biscay and Iberian Coast, Macaronesia), whereas in other MSFD (sub)regions cut-off values in the range of 98-99% were considered as appropriate (Baltic Sea, Greater North Sea, Celtic Seas). The regional D3-taxa lists by WKD3Lists2 were created without considering the availability of data or assessments i.e. many species are included, for which no assessment information is avail-able. WKD3Lists2 decided on this approach because a representative selection of commercially targeted taxa was considered to indicate knowledge and data gaps in current data collection and assessment schemes. Regional species lists shall be used by EU member states for the national reporting of D3. Stocks and species from the regional lists shall be considered by member states, and additional stocks/species can be added where appropriate (e.g. those stocks/species of national or local of importance that do not appear on the regional lists). x WKD3Lists2 discussed and compiled recommendations on how Member States can complement the regional lists of D3-taxa. A key recommendation is to maintain taxa reported in 2018 under D3, even if they are not part of the regional D3-taxa list for 2024. Wherever possible, Member States should report on stock level. WKD3Lists2 also discussed linkages between D1 and D3-reporting of commercial taxa.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Workshop to scope and preselect indicators for criterion D3C3 under MSFD decision (EU) 2017/848 (WKD3C3SCOPE)

The workshop to scope and preselect indicators for Descriptor 3 criterion 3 under MSFD Commission Decision (EU) 2017/848 (WKD3C3SCOPE) provided a platform for experts from the EU member states and relevant regional bodies to meet and support development and progress the assessment methodology, based on a request by the EC (DGENV). WKD3C3SCOPE is the first of a series of three workshops (WKD3C3THRESHOLDS and WKSIMULD3) to provide guidance in relation to operational indicators for MSFD D3C3. The workshop was organized as a series of presentations with intermittent group discussions. On the first day of the workshop the participants discussed what defines a ‘healthy population structure’ for species with different life history traits (ToR a). During the following days, the group discussed and identified relevant D3C3 indicators (ToR b) and developed criteria to select among the identified D3C3 indicators to allow further testing and setting of thresholds at WKD3C3THRESHOLDS (ToR c). The participants found that overall, healthy fish stocks are characterized by high productivity, wide age and size structuring in the population, and the ability to quickly recover from disturbances. The groups noted that environmental factors, along with stock biomass and fishing pressure, influence the productivity and health of a stock, with environment playing a particularly large role in the recruitment of short-lived stocks. It was suggested that the age structure of a stock might be more relevant for evaluating the health of long-lived stocks. However, it was acknowledged that not all stocks have sufficient data to evaluate all proposed indicators, and a single indicator is unlikely to suffice for all stocks. Data availability, species- specific factors and regional or sub-regional variation are thus also important considerations. In relation to ToR b, the participants presented their work on potential indicators including: recruitment time-series, proportion of fish larger than the mean size of first sexual maturation, F rec/Fbar, length distribution L 90, relative proportion of old fish above A 90, indicators of spawner quality, and SSB/R. A discussion on pros/cons, benefits to the population of high or low indicator values, benefits supported by empirical evidence, applicability to data-poor stocks and benefits supported by simulation/theoretical considerations followed the presentations. Finally, in relation to ToR c, the difficulty emerged in ranking the indicators alone without considering the data used to estimate them and a new set of evaluation criteria for use in WKD3C3THRESHOLDS were defined. Based on the outputs of the meeting a list of indicators to be further evaluated has been drafted, which also emphasizes the stocks for which studies have empirically demonstrated effects on productivity. In addition to the listed indicators, indicators of genetic diversity and proportion of fish with parasite infestation were mentioned but to the knowledge of the participants, widespread data for these are currently not publicly available.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Workshop on the production of abundance estimates for sensitive species (WKABSENS). ICES Scientific Reports, 3:96.

The Workshop on the production of annual estimates of abundance of sensitive species (WKABSENS) met to define sensitive species, collate ICES assessments of abundance where these are available, and estimate indices of their abundance per swept-area where not, for the OSPAR area. The analyses identified 140 potentially sensitive species or species complexes, among which 10 are diadromous and three are coastal, 20 have uncertain species ID and nine were identified as sensitive in only one of the sources examined. Among the sensitive species and species complexes, there was sufficient data to provide abundance indices for 50 species, of which 16 had existing stock assessments whereas the workshop derived abundance estimates for the remaining 34 species from survey data. Three statistical modelling approaches (binomial, General Additive Models (GAMs) and VAST) and were explored and the final abundance indices were calculated using GAMs. The species were divided into stocks before estimating abundance indices where these could be identified from the spatial distribution of the species in the survey. The group considered that a similar analysis using data from additional surveys, commercial indices or data from bycatch observers can potentially provide improved abundance estimates for species with variable or low catchability, such as deep-water and pelagic species

Parental effects on early life-history traits of haddock Melanogrammus aeglefinus (L.)

In a 5x3 factorial crossing experiment paternal and maternal influences on early life history traits of haddock (Melanogrammus aeglefinus) were investigated. Female effects on egg size, dry weight, lipid content, survival and hatch rate were revealed. Paternal influence on egg traits was only evident through interaction with mother animal. Larvae on first and on fifth day post hatch were sampled to determine parental effects on morphometric traits (standard length, somatic area, yolk/yolk sac area, eye diameter, body depth and jaw length). From differences in somatic and yolk area between day O ph and day 5 ph yolk utilization efficiency was computed. For all morphometric traits maternal influences were evident, whereas paternal effects could only be demonstrated for body size related traits (standard length, somatic area, body depth). Coefficients of variation were largest for yolk related traits, possibly indicating an artefact attributable to preservation, as the shrinkage effect due to formalin preservation was most profound on yolk area. Growth rates for larval standard length were significantly influenced by both parental sides. Yolk utilization efficiency showed no direct parental effect, but a significant interaction between maternity and paternity was detected. Evidence for compensatory growth during the first five days of larval stage was not found, suggesting that size compensation demonstrated by other authors might take place during later life stages. Correlations between larval fitness determined as time to starvation and larval morphology were only significant for standard length

Neue Erkenntnisse über die Ökologie des Flußbarsches Perca fluviatilis und der Trüsche Lota lota unter besonderer Berücksichtigung der frühen, pelagischen Lebensstadien

Im Rahmen dieser Doktorarbeit wurden neue Erkenntnisse über die Ökologie des Flußbarschs Perca fluviatilis L. und der Trüsche Lota lota (L.) im Bodensee gewonnen. Fünf Untersuchungen über 1) die Laichtiefenpräferenz von Flußbarschweibchen, 2) die oberflächennahe Verteilung von juvenilen Flußbarschen, 3) die tagesperiodische Vertikalwanderung von larvalen und juvenilen Trüschen, 4) die Ultimatfaktoren dieser Vertikalwanderungen und 5) die Nahrungsüberlappung zwischen einsömmrigen Flußbarschen und Trüschen im Pelagial ermöglichen ein vertieftes Verständnis für die Verteilung und die Bestandsentwicklung beider Arten im Bodensee.1) Anhand eines Experiments mit künstlichen Laichsubstraten wurde die bevorzugte Laichtiefe von Flußbarschen im Frühjahr 2007 untersucht. In diesem Experiment wurden Laichsubstrate zwischen 0.5 und 15 m Tiefe an zwei Stellen mit unterschiedlicher Wellenexposition ausgebracht. Die gesamte Anzahl an Laichbändern war zwischen den beiden Versuchsstandorten gleich, jedoch war die Hauptlaichtiefe an der wellenexponierten Stelle war tiefer (5 m) als an der geschützten Stelle (2 m). Die Wassertemperaturen an beiden Versuchsstandorten konnten die unterschiedliche Laichbandverteilung nicht erklären, der Einfluß von Wellenexposition bietet jedoch eine mechanistische Erklärung. An beiden Versuchsstandorten wurden große Laichbänder generell in größeren Tiefen gefunden und mehr große Laichbänder wurden an der geschützten Versuchsstelle beobachtet. Unter der Annahme, daß größere Laichbänder hydrodynamischem Stress stärker ausgesetzt sind als kleine Laichbänder, legen die Ergebnisse dieses Experiments nahe, daß große Weibchen grundsätzlich tiefere Laichplätze bevorzugen. Dort ist der Einfluß von Oberflächenwellen stark abgeschwächt. Flußbarsche scheinen daher ihre Laichplätze auch in Abhängigkeit von hydrodynamischem Stress auszuwählen.2) Die oberflächennahe Verteilung von einsömmrigen Flußbarschen wurde mit einem nach oben gerichteten Echolotschwinger beobachtet (einem zirkulären Schwinger mit 7° Öffnungswinkel an SIMRAD EK 60). Die Flußbarsche schlossen sich am Tag zwischen der Oberfläche und 5 m Tiefe in engen Schwärmen zusammen und verteilten sich nachts gleichmäßig unterhalb der Wasseroberfläche. Die Schwarmbildung begann im späten Juni und fiel in die Zeit, in der die Flußbarsche vom larvalen zum juvenilen Habitus metamorphosierten. Im Juli, als die Barsche zum letzten Mal im Pelagial beobachtet wurden, betrug die durchschnittliche Schwarmbreite 6.60 m und die durchschnittliche Schwarmhöhe 2.35 m. Aufwärtsgerichtetes Echoloten erwies sich als eine effektive Methode zur Beobachtung der kleinräumigen Fischverteilung unterhalb der Oberfläche und könnte als ergänzende Methode zur Bestandserhebung tiefer gehende Erkenntnisse über die Verteilung, das Verhalten und die Abundanz von oberflächennahen Fischen liefern.3) Tagesperiodische Vertikalmigration (DVM) mit einer Amplitude von 50 m und mehr ist ein bekanntes Phänomen, das bei vielen marinen Fischlarven beobachtet wurde. In dieser Arbeit wird erstmals die detaillierte Verteilung larvaler und juveniler Trüschen, den einzigen Süßwassergadiden der Nordhemisphäre, im Laufe ihrer DVM beschrieben. Das Verhalten der Jungtrüschen im Pelagial des Bodensees wurde mit einem Splitbeam-Echolot untersucht und mit der Lichtintensität über der Oberfläche und in der Durchschnittstiefe der Trüschen korreliert. Trüschenlarven konnten von Anfang Mai bis Ende August im Bodenseepelagial beobachtet werden. Ab Anfang Juni, nachdem sich eine temperaturgeschichtete Wassersäule ausgebildet hatte, zeigten die Trüschen ein ausgeprägtes DVM - Verhalten. Die Amplitude der DVM nahm kontinuierlich zu und erreichte bis Ende August 70 m. Die Trüschen begannen ihren Aufstieg an die Oberfläche nach Sonnenuntergang und stiegen in der Morgendämmerung wieder zu ihrer Tagestiefe hinab. Während ihres Wachstums von Mai bis August verbrachten die Trüschen den Tag in zunehmend dunklen Wassertiefen: Im Mai verbrachten sie den Tag bei Lichtintensitäten > 40 W m-2, aber ab Ende Juni mieden sie Lichtintensitäten > 0.1 W m-2. Ab dieser Zeit erlebten die Trüschen die höchsten Lichtintensitäten während der Abend- und Morgendämmerung, was mit optimierten Fressbedingungen während den Dämmerungsstunden zusammenhängen könnte. Die Ergebnisse dieser Studie legen nahe, das einsömmrige Trüschen die DVM-Amplitude im Laufe ihrer pelagischen Phase erhöhen, um einem steigendem Prädationsrisiko, welches in Zusammenhang mit ihrer zunehmenden Körpergröße und -Pigmentierung stehen mag, entgegen zu wirken.4) Als Ultimatfaktoren von DVM werden grundsätzlich drei verschiedene Hypothesen diskutiert: Die Vermeidung von Räubern, die Optimierung der Nahrungsaufnahme durch das Verfolgen der Beute oder die Optimierung des bioenergetischen Budgets. Um zu klären, welche dieser drei Möglichkeiten die DVM der einsömmrigen Trüschen im Bodensee begünstigt, wurde die Tiefenverteilung der Trüschen mit der vertikalen Verteilung von potentiellen Räubern, Beutezooplankton und Wassertemperaturen verglichen. Die Trüschen zeigten starke räumliche Überlappung mit ihrer Beute, jedoch nicht mit potentiellen Räubern. Mageninhaltsanalysen von Jungtrüschen legen nahe, dass der größte Teil der Nahrungsaufnahme während des Aufstiegs in der Abenddämmerung erfolgt und somit die Aufenthaltstiefe der Trüschen am Tag nicht ursächlich durch ihre Beute bedingt ist. Mit zunehmender Tiefe waren die Trüschen kälteren Wassertemperaturen ausgesetzt, so dass sie einen Temperaturgradienten von bis zu 19 °C während ihrer DVM erfuhren. Die DVM der pelagischen Trüschen im Bodensee kann daher eine Mehrfachanpassung an die Lebensbedingungen in einem geschichteten See der gemäßigten Zone darstellen, indem die Trüschen den Kontakt zu Räubern während des Tages vermeiden und ihre metabolischen Kosten durch den Aufenthalt im kühlen Hypolimnion reduzieren.5) Die Nahrungsüberlappung zwischen Flussbarschen und Trüschen wurde in Verbindung mit der Maulspaltengröße analysiert und als Schätzwert für potentielle Ressourcenkonkurrenz verwendet. Aufgrund ihres schnelleren Wachstums und ihrer größeren Ausgangsgröße überwanden Flussbarsche die Maulspaltenlimitierung für diverse Beutetaxa stets früher als Trüschen. Ab Mitte Juni fraßen Flussbarsche alle klassifizierten Beutetaxa, jedoch wiesen verringerte intraspezifische Similaritätswerte der SIMPER-Analyse auf eine individuelle Nahrungs-Spezialisierung der Barsche hin. Im Gegensatz dazu ähnelten sich die Mageninhalte der Trüschen bis Ende August zu fast 50 %, so dass alle Trüschen auf cyclopoide Copepoden und Daphnien als gemeinsame Nahrungsressource angewiesen waren. Während der pelagischen Koexistenz von Flussbarsch und Trüsche kommen Flussbarsche fast 100 mal häufiger vor als Trüschen. Daher sind Flussbarsche stärker durch intraspezifische als interspezifische Konkurrenz beeinflusst. Trüschen hingegen können durch DVM die Konkurrenz zu den Flußbarschen verringern, bleiben dabei jedoch auf wandernde Beutetaxa beschränkt

The influence of light on the diel vertical migration of young-of-the-year burbot Lota lota in Lake Constance

The diel vertical distribution of young-of-the-year (YOY) burbot Lota lota in the pelagic zone of Lake Constance was compared to light intensity at the surface and to the light intensity at their mean depth. Lota lota larvae inhabited the pelagic zone of Lake Constance from the beginning of May until the end of August. From early June, after the stratification of the water column, fish performed diel vertical migrations (DVM) between the hypolimnion and epilimnion. The amplitude of DVM increased constantly during the summer and reached 70 m by the end of August. Lota lota started their ascent to the surface after sunset and descended into the hypolimnion after sunrise. As the YOY fish grew from May to August, they experienced decreasing diel maximum light intensities: in May and early June L. lota spent the day at light intensities >40 W m-², but they never experienced light intensities >01 W m-² after the end of June. From this time, L. lota experienced the brightest light intensities during dusk and dawn, suggesting feeding opportunities at crepuscular hours. The present study implies, that YOY L. lota in the pelagic zone of Lake Contance increased their DVMamplitude during the summer to counteract a perceived predation risk related to body size and pigmentation