A novel programmable lysozyme-based lysis system in Pseudomonas putida for biopolymer production

Indexación: Scopus; Web of Science.Cell lysis is crucial for the microbial production of industrial fatty acids, proteins, biofuels, and biopolymers. In this work, we developed a novel programmable lysis system based on the heterologous expression of lysozyme. The inducible lytic system was tested in two Gram-negative bacterial strains, namely Escherichia coli and Pseudomonas putida KT2440. Before induction, the lytic system did not significantly arrest essential physiological parameters in the recombinant E. coli (ECPi) and P. putida (JBOi) strain such as specific growth rate and biomass yield under standard growth conditions. A different scenario was observed in the recombinant JBOi strain when subjected to PHA-producing conditions, where biomass production was reduced by 25% but the mcl-PHA content was maintained at about 30% of the cell dry weight. Importantly, the genetic construct worked well under PHA-producing conditions (nitrogen-limiting phase), where more than 95% of the cell population presented membrane disruption 16 h post induction, with 75% of the total synthesized biopolymer recovered at the end of the fermentation period. In conclusion, this new lysis system circumvents traditional, costly mechanical and enzymatic cell-disrupting procedures.https://www.nature.com/articles/s41598-017-04741-2.pd

Seating arrangements : impact on the development of speaking abilities in EFL classrooms

Tesis (Pedagogía en Inglés)This research explores how seating arrangements impact on young EFL learners’ development of the speaking skill in Chilean classrooms. The methodological design was a mixed approach using checklists, field notes, and questionnaires to collect data. The participants were 45 students, 28 from 3rd grade, 17 from 8th grade, 2 teachers and 2 researchers. Results show that working in groups have more positive impact for 8th graders, from the students’, teachers’ and researchers’ perspectives. On the contrary, working in pairs was more beneficial for third graders.Esta investigación explora cómo la distribución de las mesas impacta en los estudiantes de nivel básico en el desarrollo de la producción oral en idioma inglés en salas de clases chilenas. El diseño de metodología consiste en un método mixto utilizado lista de cotejo, observaciones y cuestionarios para recolectar información. Los participantes fueron en total 45 alumnos, 28 alumnos de 3ro Básico, 17 de 8vo Básico, 2 profesores y 2 investigadores. Los resultados desde las perspectivas de los estudiantes y profesor, muestran que al trabajar en grupos, tiene un impacto más positivo en los estudiantes de 8vo básico. Por el contrario, trabajar en parejas es más beneficioso para los alumnos de 3ro básico

Datasets for transcriptomics, q-proteomics and phenotype microarrays of polyphosphate metabolism mutants from Escherichia coli

Indexación: Scopus.Author acknowledges Fondecyt Grants 1120209, 1121170 and Anillo ACT-1107Here, we provide the dataset associated with our research article on the polyphosphate metabolism entitled, “Multi-level evaluation of Escherichia coli polyphosphate related mutants using global transcriptomic, proteomic and phenomic analyses”. By integrating different omics levels (transcriptome, proteome and phenome), we were able to study Escherichia coli polyphosphate mutant strains (Δppk1, Δppx, and Δppk1-ppx). We have compiled here all datasets from DNA microarrys, q-proteomic (Isotope-Coded Protein Labeling, ICPL) and phenomic (Phenotype microarray) raw data we have obtained in all polyP metabolism mutants.http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340917300860?via%3Dihu

Cascaded valorization of seaweed using microbial cell factories

Sustainable production from seaweed has grown into an area of intense research and development. Meanwhile, more than 30 million tonnes of seaweed are produced, of which 70% are used as food and 30% have other applications such as feed, fertilizer, chemicals, and energy. Towards biorefining seaweed in an environmentally friendly and economically viable manner, we need efficient approaches that convert its biomass and residuals into added value products. Smart cell factories and fermentation strategies which can be integrated into future seaweed biorefineries are at the heart of the development and therefore receive increasing attention. Here, we review advances in the field including novel fermentation routes from seaweed to chemicals, materials, pharmaceuticals, fuels and energy, and discuss challenges and opportunities

Análisis del decrecimiento de los derrames de los ríos Limay y Chubut

Taking into account, reports issued by the long-term forecast models of the major international climate centers, and IPCC, which coincide in projecting a significant decrease in winter rainfall in the Comahue and Patagonia regions for the period 2080–2100, The current behavior of its main rivers is analyzed. However, one of the greatest difficulties presented by the study of Climate Change in these regions is the shortage of climatological and hydrological series long enough in the instrumental period to apply statistical tests to detect trends and jumps in the average. The Limay River being the most representative of the first region and the Chubut of the second; and given that they have systematic measurements of incomplete and / or discontinuous flows, they are selected to extend and optimize their time series, obtaining estimated values ​​from previous / subsequent periods from the start of their respective measurements and thus make possible the aforementioned detection, among others purposes The reconstruction of the data of the annual z of these rivers is carried out by means of non-linear empirical statistical models. One is achieved that shows a very good statistical performance and goes back to estimate the spillage of two rivers. A measured series of 115 years is currently available for the Limay River, while Chubut has an incomplete series. Hence, the first measurements will be used to reconstruct it. In turn, the latter is used to update the first series from 2011 to 2017. Once the reconstruction of its series was achieved, a trend analysis and detection of Change Points was feasible in order to statistically describe the structure of the decrease in its spills that is verified until now.Teniendo en cuenta los reportes emitidos por los modelos de pronósticos de largo plazo de los grandes centros internacionales sobre la región del Comahue y Patagonia, que coinciden en proyectar para el período 2080–2100 una importante disminución de las precipitaciones invernales en la misma, en este trabajo se verifica si el comportamiento actual de sus principales ríos es compatible con dichos pronósticos. Sin embargo, una de las mayores dificultades que presenta el estudio del cambio climático en dichas regiones, es la escasez de series climatológicas e hidrológicas lo suficientemente largas en el período instrumental como para aplicarles test estadísticos de detección de tendencias y saltos en la media. Siendo el río Limay el más representativo de la primera región y el Chubut de la segunda, dado que cuentan con mediciones regulares de caudales incompletas y/o con datos faltantes, se los seleccionó para extender y optimizar sus series temporales obteniendo valores estimados de periodos anteriores/posteriores desde el inicio de sus respectivas mediciones y así hacer posible la detección aludida, entre otros propósitos.  La reconstrucción de los datos de los derrames anuales (volumen de agua aportado en una temporada) de dichos ríos se realizó mediante modelos estadísticos empíricos no lineales. Se logró uno que muestra una muy buena performance estadística y retrotrae las estimaciones del derrame de sendos ríos. Se dispone, en la actualidad, para el río Limay de una serie medida de 115 años, mientras que el Chubut, tiene una incompleta. De ahí que se hará uso de las mediciones del primero para reconstruirlo. A su vez, a éste último, se lo emplea para actualizar la serie del primero desde 2011 hasta 2017. Una vez lograda la reconstrucción de sus series, resultó viable un análisis de tendencia y detección de cambios abruptos con el objeto de describir estadísticamente la estructura del decrecimiento de sus derrames que se verifica hasta el presente

Biochemistry, genetics and biotechnology of glycerol utilization in Pseudomonas species

Indexación: Scopus.The use of renewable waste feedstocks is an environment-friendly choice contributing to the reduction of waste treatment costs and increasing the economic value of industrial by-products. Glycerol (1,2,3-propanetriol), a simple polyol compound widely distributed in biological systems, constitutes a prime example of a relatively cheap and readily available substrate to be used in bioprocesses. Extensively exploited as an ingredient in the food and pharmaceutical industries, glycerol is also the main by-product of biodiesel production, which has resulted in a progressive drop in substrate price over the years. Consequently, glycerol has become an attractive substrate in biotechnology, and several chemical commodities currently produced from petroleum have been shown to be obtained from this polyol using whole-cell biocatalysts with both wild-type and engineered bacterial strains. Pseudomonas species, endowed with a versatile and rich metabolism, have been adopted for the conversion of glycerol into value-added products (ranging from simple molecules to structurally complex biopolymers, e.g. polyhydroxyalkanoates), and a number of metabolic engineering strategies have been deployed to increase the number of applications of glycerol as a cost-effective substrate. The unique genetic and metabolic features of glycerol-grown Pseudomonas are presented in this review, along with relevant examples of bioprocesses based on this substrate – and the synthetic biology and metabolic engineering strategies implemented in bacteria of this genus aimed at glycerol valorization.https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1751-7915.1340

Editorial: Pathway, Genetic and Process Engineering of Microbes for Biopolymer Synthesis

Indexación ScopusTogether with the climate crisis, the heavy accumulation in oceans and soils of persistent pollutants, like polycyclic aromatics hydrocarbons and synthetic plastics, are the main drivers to impact nature and threaten human survival. It is particularly striking that most industrial polymers still originate from petrochemical sources—nearly 99% of the overall worldwide production. The result is materials that remain intact for centuries once deposited in the environment. Relying on non-renewable fossil chemicals limits our ability to establish a circular economy that promises to curb current emissions and contribute moderately to the global carbon cycle without surpassing its carrying capacity. For decades, commercial biopolymers have also been produced by microbial fermentation since nature has endowed many bacteria from urban sites to extreme environments (Orellana-Saez et al., 2019) with the enzymatic machinery to assemble these macromolecules. Despite the rapid pace of innovation, microbial biopolymers are still expensive to synthesize because the generally oxygen-intensive fermentation processes, downstream processing, and carbon feedstock cost boost production expenses (Oliveira et al., 2020). The biopolymers must additionally possess specific mechanical and physical properties to be processed industrially into products with a variety of applications (Moradali and Rehm, 2020).https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fbioe.2020.618383/ful

Reporte sobre el efecto de helada tardía en el rendimiento de la variedad de almendra Guara durante el ciclo productivo 2016-2017 en el departamento de Pocito provincia de San Juan

El almendro (Prunus amygdalus Batsch) es considerado tradicionalmente como la especie frutal de floración más temprana y como consecuencia de esto, su cultivo se ha visto limitado a las regiones que presentan reducidos peligros de heladas. A decir de Socias ¡ Company et. al. (2009), las heladas de finales de invierno y principios de primavera pueden dañar e incluso destruir completamente la cosecha de almendras. El cultivo del almendro en la provincia de San Juan, se desarrolla en el Valle de Tulum donde se encuentra expuesto a condiciones climáticas adversas como heladas tardías y viento Zonda. Estas condiciones agroclimáticas locales, exigen la búsqueda de materiales vegetales de buen comportamiento ante estas adversidades, que junto a la aplicación de avanzadas tecnologías de cultivo y marcos de plantación intensivos (400 a 650 árboles por ha), permitan obtener mayores rendimientos y la viabilidad económica de la plantación. Este reporte se refiere al efecto de la helada tardía en el rendimiento de la variedad de almendra Guara durante el ciclo productivo 2016-2017 en el departamento de Pocito Provincia de San Juan.EEA San JuanFil: Castro, Viviana Laura. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria San Juan; Argentina.Fil: Alday Poblete, Silvina Esther. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria San Juan; Argentina

Análisis preliminar del comportamiento de la variedad de almendro Guara bajo condiciones de viento Zonda en el departamento de Pocito, provincia de San Juan

El cultivo del almendro en la provincia de San Juan se desarrolla en el Valle del Tulum. Al comienzo las principales variedades cultivadas eran las americanas de cáscara blanda. En el año 2003 se introdujo en la EEA San Juan INTA, la variedad Guara (obtenida por el CITA Zaragoza, España 1987). Esta variedad es de cáscara dura, floración tardía, autógama, de elevada densidad floral, de alta capacidad productiva, de producción regular y más resistente ante las heladas tardías (Felipe, 2000). Estas características incrementaron las expectativas de alcanzar mayores rendimientos. Una característica climática relevante de esta zona es que entre mayo y noviembre suele desarrollarse al este de la Cordillera de los Andes, un viento caracterizado por su extrema sequedad y elevada temperatura, el cual recibe el nombre de viento Zonda (Pereyra, 2000). Los daños que provoca el viento Zonda en la fruticultura de la región de Cuyo se deben a la sequedad atmosférica que genera, a la brusca elevación de temperatura y a los efectos destructivos de su fuerza. Según los registros entre 1958-2002 de la estación agrometeorológica de la Facultad de Ciencias Agrarias UNCuyo, el 47% del total de casos de viento Zonda se presenta entre agosto y la primera semana de septiembre (Caretta et al., 2004). En la floración de los almendros los procesos de la polinización, fecundación y cuajado del fruto están condicionados por la temperatura y la humedad siendo determinantes para obtener una cosecha económicamente aceptable. Se estudió el comportamiento de la variedad Guara, ante condiciones meteorológicas adversas como las que se presentan durante la ocurrencia de una situación de tipo Zonda. Se analizó el resultado productivo de este cultivar en el ciclo 2015-2016, cuando se presentaron varios días de viento Zonda en el momento de plena floración, y se comparó con el rendimiento obtenido bajo las condiciones meteorológicas registradas para el mismo período en el ciclo 2014-2015.EEA San JuanFil: Castro, Viviana Laura. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria San Juan; Argentina.Fil: Alday, Silvina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria San Juan; Argentina